A. 微生物基因組提取的方法有哪幾種
常見的RNA提取方法有苯酚法、陰離子去污劑法、LiCl一尿素法、改良的Gomez法、異硫氫酸胍法、CTAB法、熱硼酸法及改良熱硼酸法、TRIZOL試劑快速提取法。
RNA提取時,就變性劑的選擇來說,CTAB(CTAB法)比異硫氰酸胍(RIZOL試劑法)和SDS(改良熱硼酸法)更有效;就CTAB法來說,由於以CTAB為變性劑,同時加入PVP和β一巰基乙醇共同作用變性蛋白、抑制RNase的活性,使用無水乙醇或異丙醇沉澱雜蛋白和總核酸等,然後再選擇性地分離出RNA。
B. 獲取目的基因的方法到底有幾種,PCR技術也是獲取目的基因的途徑嗎
書上給的:
基因工程流程的第一步就是獲得目的DNA片段,如何獲得目的DNA片段就成為基因工程的關鍵問題。所需目的基因的來源,不外乎是分離自然存在的基因或人工合成基因。常用的方法有PCR法、化學合成法、cDNA法及建立基因文庫的方法來篩選
直接獲取
1.從基因文庫中獲取 這個沒什麼就是現成的基因儲存在受體菌上你用的時候提取出來就好了(基因組文庫法 就是原教材中的用限制性內切酶直接獲取。利用λ噬菌體載體構建基因組文庫的一般操作程序如下:① 選用特定限制性內切酶, DNA進行部分酶解,得到DNA限制性片段② 選用適當的限制性內切酶酶解λ噬菌體載體DNA。③ 經適當處理,將基因組DNA限制性片段與λ噬菌體載體進行體外重組。④ 利用體外包裝系統將重組體包裝成完整的顆粒。⑤ 以重組噬菌體顆粒侵染大腸桿菌,形成大量噬菌斑,從而形成含有整個DNA的重組DNA群體,即文庫。)經典解釋
2.cDNA文庫法(即原教材中提到的逆轉錄法)。cDNA文庫,是指匯集以某生物成熟mRNA為模板逆轉錄而成的cDNA序列的重組DNA群體。雖然可用基因組文庫法來獲取真核生物的目的基因,但是由於高等真核生物基因組DNA文庫比其cDNA文庫大得多,相關工作量同樣大得多。更為重要的是,在真核生物基因組中合有大量的間隔序列或內含子,但在大腸桿菌等原核生物中沒有類似序列的存在,所以大腸桿菌不能從真核生物基因的初級轉錄本中去除間隔序列,即不能表達真核生物DNA。而在真核生物成熟mRNA中已不存在間隔序列(已在拼接過程中被去除),所以可以以真核生物成熟mRNA為模板,逆轉錄而成的cDNA可被大腸桿菌表達。因此,在基因工程中,cDNA文庫法是從真核生物細胞中分離目的基因的常用方法。
3.直接分離基因最常用的方法是「鳥槍法」,又叫「散彈射擊法」。這種方法有如用獵槍發射的散彈打鳥,無論哪一顆彈粒擊中目標,都能把鳥打下來。鳥槍法的具體做法是:用限制酶(即限制性內切酶)將供體細胞中的DNA切成許多片段,將這些片段分別載入運載體,然後通過運載體分別轉入不同的受體細胞,讓供體細胞所提供的DNA(外源DNA)的所有片段分別在受體細胞中大量復制(在遺傳學中叫做擴增),從中找出含有目的基因的細胞,再用一定的方法吧帶有目的基因的DNA片段分離出來。如許多抗蟲,抗病毒的基因都可以用上述方法獲得。
用「鳥槍法」獲取目的基因的優點是操作簡便,缺點是工作量大,具有一定的盲目性。
人工合成
1.(主要是序列已知的基因)。主要是通過DNA自動合成儀,通過固相亞磷酸醯胺法合成,具體過程可以網上查詢,反正是可以按照已知序列將核苷酸一個一個連接上去成為核苷酸序列,一般適於分子較小而不易獲得的基因。對於大的基因一般是先用化學合成法合成引物,再利用引物獲得目的基因。
2.聚合酶鏈反應(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是80年代中期發展起來的體外核酸擴增技術。它具有特異、敏感、產率高、快速、簡便、重復性好、易自動化等突出優點;能在一個試管內將所要研究 的目的基因或某一DNA片段於數小時內擴增至十萬乃至百萬倍,使肉眼能直接觀察和判斷;可從一根毛發、一滴血、甚至一個細胞中擴增出足量的DNA供分析研 究和檢測鑒定。過去幾天幾星期才能做到的事情,用PCR幾小時便可完成。PCR技術是生物醫學領域中的一項革命性創舉和里程碑
他只是給目的基因的擴增
C. 微生物中存在一個有價值的基因怎麼把它提取出來
先查看文獻,看別人有沒有公布這段基因,如果沒有的話,就根據這段基因的功能,在NCBI網站上查找對應物種的這個基因的編號,如果能找到的話,就會得到相應序列信息。再根據這個微生物基因組中這段基因上下游序列設計引物,用提取的gDNA作為模板進行PCR,順利的話就可以擴增出來,最後將擴增產物跑電泳回收,送到測序公司測序,以確定是不是跟NCBI上一樣的序列。這樣就完成了基因的獲取工作了。如果這個微生物的全基因組沒有被測過的話,那你可以選擇全基因組測序得到完成圖,不過,這有點難度。
D. 提取DNA的方法有哪些
DNA提取的幾種方法
(1).濃鹽法
利用RNP和DNP在電解溶液中溶解度不同,將二者分離,常用的方法是用1M 氯 納提取化鈉抽提,得到的DNP粘液與含有少量辛醇的 氯仿一起搖盪,使乳化,再離心除去蛋白質,此時蛋白質凝膠停留在水相及氯仿相中間,而DNA位於上層水相中,用2倍體積95%乙醇可將DNA 鈉鹽沉澱出來.
也可用0.15 MNaCL液反復洗滌細胞破碎液除去RNP,再以1MNaCL提取脫氧核糖蛋白,再按氯仿---異醇法除去蛋白.
兩種方法比較,後種方法使核酸降解可能少一些.
以稀鹽酸溶液提取DNA 時,加入適量去污劑,如SDS可有助於蛋白質與DNA 的分離.在提取過程中為抑制組織中的DNase對DNA 的降解作用,在氯化鈉溶液中加入檸檬酸鈉作為金屬離子的烙合劑.通常用.15MNaCL,0.015M檸檬鈉,並稱SSC溶液,提取DNA.
(2).陰離子去污劑法:
用SDS或二甲苯酸鈉等去污劑使蛋白質變性,可以直接從生物材料中提取DNA .由於細胞中DNA與蛋白質之間常借靜電引力或配位鍵結合,因為陰離子去污劑能夠破壞這種價鍵,所以常用陰離子去污劑提取DNA.
(3).苯酚抽提法:
苯酚作為蛋白變性劑,同時抑制了DNase的降解作用.用苯酚處理勻漿液時,由於蛋白與DNA 聯結鍵已斷,蛋白分子表面又含有很多極性基團與苯酚相似相溶.蛋白分子溶於酚相,而DNA溶於水相.離心分層後取出水層,多次重復操作,再合並含DNA 的水相,利用核酸不溶於醇的性質,用乙醇沉澱DNA .此時DNA是十分粘稠的物質,可用玻璃漫漫繞成一團,取出.此法的特點是使提取的DNA保持天然狀態 .
( 4).水抽提法:
利用核酸溶解於水的性質,將組織細胞破碎後,用低鹽溶液除去RNA,然後將沉澱溶於水中,使DNA充分溶解於水中,離心後收集上清液.在上清中加入固體氯化鈉調節至2.6M.加入2倍體積95%乙醇,立即用攪拌法攪出.然後分別用66% 80%和95%乙醇以及丙銅洗滌,最後在空氣中乾燥,既得DNA樣品.此法提取的DNA中蛋白質含量較高,故一般不用.為除蛋白可將此法加以改良,在提取過程中加入SDS.
E. 如何提取自己的dna
提取DNA需要先獲取體細胞,而且是具有細胞核的細胞,紅細胞不可以。可以通過血液(白細胞)或者上皮細胞來提取,有專門的基因組提取試劑盒。
F. 獲取真核生物的基因常用的方法有哪些
1.從基因文庫中獲取目的基因
2.利用PCR技術擴增目的基因
3.人工合成(化學合成)
G. DNA怎麼提取
DNA提取主要是CTAB方法,其他的方法還有物理方式如玻璃珠法、超聲波法、研磨法、凍融法。化學方式如異硫氰酸胍法、鹼裂解法。生物方式:酶法。根據核酸分離純化方式的不同有;硅質材料、陰離子交換樹脂等。
提取DNA總的原則:
1.保證核酸一級結構的完整性;
2.核酸樣品中不應存在對酶有抑製作用的有機溶劑和過高濃度的金屬離子;
3.其他生物大分子如蛋白質、多糖和脂類分子的污染應降低到最低程度;
4.其他核酸分子,如RNA,也應盡量去除。
例如 : 用酶法提取
DNA提取分為三個基本步驟,每個步驟的具體方法可根據樣品種類、影響提取的物質以及後續步驟的不同而有區別。
工具/原料: 研磨棒、研磨儀或者組織破碎儀 , 氯仿:異戊醇(24:1)或者蛋白酶 , RNA酶 , 酒精 , 冰箱
方法/步驟 :
使用研磨儀、研磨棒或者使用超聲破碎細胞的方法破碎細胞,加入去污劑,如sds等,除去膜脂。
去除細胞內的蛋白質,包括與DNA結合的組蛋白,通過加入蛋白酶,醋酸鹽沉澱,或者酚/氯仿抽提等方法去除。
加入RNA酶去除RNA,如實驗不嚴密,可省略此步。
沉澱DNA,需在冷乙醇或異丙醇中沉澱,放在冰箱-20℃沉澱30分鍾以上,原理是DNA在醇中不可溶而黏在一起發生沉澱。
總結: DNA提取方法有下面⑦種
一.酚抽提法:先用蛋酶K、SDS破碎細胞,消化蛋白,然後用酚和酚-氯DNA大小為100-150kb
二.甲醯胺解聚法:破碎細胞同上,然後用高濃度甲醯胺解聚蛋白質與DNA的結合,再透析獲得DNA可得DNA200kb左右。
三.玻璃棒纏繞法:用鹽酸胍裂解細胞,將裂解物鋪於乙醇上,然後用帶鉤或U型玻璃棒在界面輕攪,DNA沉澱液繞於玻棒。生成DNA約80kb。
四.異丙醇沉澱法:基本同1法,僅用二倍容積異丙醇替代乙醇,可去除小分子RNA(在異丙醇中可溶狀態)
五.表面活性劑快速制備法:用Triton X-100A或NP40表面活性劑破碎細胞,然後用蛋白酶K或酚去除蛋白,乙醇沉澱或透析。
六.加熱法快速制備:加熱96℃-100℃,五分鍾,然後離心後取上清,可用於PCR反應。
七.鹼變性快速制備:先用NaOH作用20分鍾,再加HCI中和,離心後取上清,含少量DNA。
H. 目的基因概念 不同時期的都要 還有提取目的基因的方法
目的基因是指准備導入受體細胞內的,以研究或應用為目的所需要的外源基因稱目的基因。獲得目的基因的方法很多,但也是十分困難的一步。目前獲得目的基因有4條途徑:1.從生物基因組群體中分離目的基因
原核生物基因組較小,基因容易定位,用限制性內切酶將基因組切成若干段後,用帶有標記的核酸探針,從中選出目的基因。真核生物一般通過基因組文庫的方法獲得目的基因。2.人工合成目的基因DNA片段
人工合成目的基因DNA片段有化學合成和酶促合成法兩條途徑。一般是採用DNA合成儀來合成長度不是很大的DNA片段。3.PCR反應合成DNA
聚合酶鏈式反應(PCR)是以DNA變性、復制的某些特性為原理設計的。通過PCR技術獲取所需要的特異DNA片段在實際應用用得非常多,但是前提條件是必須對目的基因有一定的了解,需要設計引物。4.mRNA差異顯示法獲得目的基因
mRNA差異顯示(mRNA
differential
display,
DD)是1992年由哈佛醫學院Peng
Liang等人建立的。原理是先用PCR技術擴增所有的mRNA、生成cDNA群體,再用測序凝膠電泳獲取所需要的目的基因,然後再次用PCR擴增。簡單的講,就是從基因的轉錄產物mRNA來反轉錄成cDNA作為目的基因。5、用機械的方法,例如超聲波把基因組打成片段。