生物拓撲圖怎麼看懂

❶ 如何看網路拓撲結構圖

路由器可以充當伺服器，可以管理網路數據，一般區域網內只需要一個路由，而交換機根據機器的數量有多個。

❷ 請問宇觀,拓撲學是怎樣的概念

宇觀 通常把質量范圍在10-15克,尺度范圍在
10-5厘米以上的物質客體及其現象的總和稱為宏觀
世界,一般容易觀察的物質層次.無機界包括地球上所有
的物體、包圍在地球表面的空氣層,有對流層、平流層、電
離層和擴散層,還有太陽系內的恆星、行星、衛星、彗星
等.有機界包括人在內的動物、植物種群、生物群落、生態
系統、生物圈,還有人類社會等.宏觀世界一般服從經典
力學規律,但是不同質的宏觀世界具有不同的運行規律.
如生物界還具有生命運動的規律；天體現象服從天體運
行規律,社會運動服從社會規律等等.學術界有一種意見
認為,應該拋開物質客體自身的屬性,從認識論的觀點,
根據主體對客體的變革特徵和觀測特徵來定義宏觀世
界,那麼就是指人們可以直接觀測,且能以物質手段加以
變革的時空區域.而可以觀測到,但還不能以物質手段加
以影響和變革的時空區域則為宇觀世界.它們不同於宏
觀規模的物質過程,具有高密度、高溫度、高壓、大質量、
大尺度、大時標等特徵,運動速度大到接近光速,萬有引
力起主要作用並服從相對論力學規律,包括星系、星系
團、總星系,距地球100億光年的宇宙太空.60年代以來,
人類對宇宙觀測研究獲得的一系列重要發現,如脈沖星、
類星體、微波背景輻射、星際分子等都屬宇觀世界.宇觀
概念就是在總結現代天文學發展基礎上提出的新概念,
由我國著名天文學家戴文賽於1962年首次提出,他在《宇
觀的物質過程》一書中指出：「大質量加大尺度,既是宇觀
過程的特徵,又是它的條件.」
拓撲學的英文名是Topology,直譯是地誌學,也就是和研究地形、地貌相類似的有關學科.我國早期曾經翻譯成「形勢幾何學」、「連續幾何學」、「一對一的連續變換群下的幾何學」,但是,這幾種譯名都不大好理解,1956年統一的《數學名詞》把它確定為拓撲學,這是按音譯過來的.
拓撲性拓撲學是幾何學的一個分支,但是這種幾何學又和通常的平面幾何、立體幾何不同.通常的平面幾何或立體幾何研究的對象是點、線、面之間的位置關系以及它們的度量性質.拓撲學對於研究對象的長短、大小、面積、體積等度量性質和數量關系都無關.
在拓撲學里不討論兩個圖形全等的概念,但是討論拓撲等價的概念.比如,盡管圓和方形、三角形的形狀、大小不同,在拓撲變換下,它們都是等價圖形.左圖的三樣東西就是拓撲等價的,換句話講,就是從拓撲學的角度看,它們是完全一樣的.
在一個球面上任選一些點用不相交的線把它們連接起來,這樣球面就被這些線分成許多塊.在拓撲變換下,點、線、塊的數目仍和原來的數目一樣,這就是拓撲等價.一般地說,對於任意形狀的閉曲面,只要不把曲面撕裂或割破,他的變換就是拓撲變幻,就存在拓撲等價.
應該指出,環面不具有這個性質.比如像左圖那樣,把環面切開,它不至於分成許多塊,只是變成一個彎曲的圓桶形,對於這種情況,我們就說球面不能拓撲的變成環面.所以球面和環面在拓撲學中是不同的曲面.
直線上的點和線的結合關系、順序關系,在拓撲變換下不變,這是拓撲性質.在拓撲學中曲線和曲面的閉合性質也是拓撲性質.
在宇宙學中, 暗物質(Dark Matter)是指那些不發射任何光及電磁輻射的物質.人們目前只能通過引力產生的效應得知宇宙中有大量暗物質的存在.暗物質存在的最早證據來源於對球狀星系旋轉速度的觀測.現代天文學通過引力透鏡、宇宙中大尺度結構形成、微波背景輻射等研究表明：我們目前所認知的部分大概只佔宇宙的4％,暗物質佔了宇宙的23%,還有73%是一種導致宇宙加速膨脹的暗能量.暗物質的存在可以解決大爆炸理論中的不自洽性,對結構形成也非常關鍵.暗物質很有可能是一種（或幾種）粒子物理標准模型以外的新粒子.對暗物質和暗能量的研究是現代宇宙學和粒子物理的重要課題.
重子(baryon)是由三個誇克（或者三個反誇克組成反重子）組成的基本粒子.最常見的重子有質子和中子（合稱為核子）,其它重子有比這兩個粒子重的粒子（所謂的超子）.重子這個稱呼是指其質量相對重於輕子和介於兩者之間的介子起的.
重子是強相互作用的費米子,也就是說它們遵守費米-狄拉克統計和泡利不兼容原理,通過組成它們的誇克它們參加強相互作用.同時它們也參加弱相互作用和引力.帶電荷的重子也參加電磁力作用.
重子與由一個誇克和一個反誇克組成的介子一起被合稱為強子.強子是所有強相互作用的粒子的總稱.
質子是唯一獨立穩定的重子.中子假如不與其它中子或者質子一起組成原子核的話不穩定,會衰變.

❸ DNA的結構與功能的關系,詳細一些

沃森和克里克發現，DNA是雙螺旋結構。DNA蘊藏了大量的遺傳信息。有A、T、C、G四種鹼基，雙鏈互補，雙鏈DNA可以進行自我的復制，也可以指導RNA（單鏈）的合成。而mRNA、tRNA、rRNA又參與了蛋白質的合成，蛋白質是生命活動的物質承擔者，在生物體中發揮著重要的作用。

❹ 生物拓撲學研究內容是什麼

生物拓撲學應該是主要研究生物大分子（特別是DNA，RNA 和 蛋白質）在空間結構上纏繞的問題。目前，研究得最清楚的，也是最多的，應該是DNA的拓撲結構問題。因為DNA是雙螺旋，所以當DNA復制、轉錄和折疊的時候都會涉及到拓撲結構發生變化的問題，例如形成超螺旋。這些超螺旋的形成，往往對DNA的復制和轉錄是不利的，要解開才能進一步的復制和轉錄。生物體中有專門的拓撲異構酶來解決這類拓撲結構問題。DNA拓撲異構酶有兩類，I型和II型。具體的有什麼區別，你可以網路的。要是想了解的更深，你可以上pubmed資料庫搜索相關的review。其實除了DNA，近年來，也有報道發現RNA拓撲異構酶。因為RNA是單鏈的，所以，一直以來人們認為它們不存在拓撲問題。但是，生物體是復雜的。RNA也存在很多拓撲問題，例如在mRNA翻譯的時候，兩端往往是有核糖體結合的，這樣就成了一個環，也會存在拓撲結構的問題。還有rRNA中也存在拓撲結構的問題。環狀RNA也會存在拓撲結構的問題。

❺ 拓撲是什麼意思

拓撲學是數學中一個重要的、基礎性的分支。它最初是幾何學的一個分支，主要研究幾何圖形在連續變形下保持不變的性質，現在已成為研究連續性現象的重要的數學分支。

拓撲學起初叫形勢分析學，是萊布尼茨1679年提出的名詞。十九世紀中期，黎曼在復函數的研究中強調研究函數和積分就必須研究形勢分析學。從此開始了現代拓撲學的系統研究。

連續性和離散性是自然界與社會現象中普遍存在的。拓撲學對連續性數學是帶有根本意義的，對於離散性數學也起著巨大的推動作用。拓撲學的基本內容已經成為現代數學的常識。拓撲學的概念和方法在物理學、生物學、化學等學科中都有直接、廣泛的應用。
拓撲學的由來

幾何拓撲學是十九世紀形成的一門數學分支，它屬於幾何學的范疇。有關拓撲學的一些內容早在十八世紀就出現了。那時候發現一些孤立的問題，後來在拓撲學的形成中占著重要的地位。
在數學上，關於哥尼斯堡七橋問題、多面體的歐拉定理、四色問題等都是拓撲學發展史的重要問題。
哥尼斯堡（今俄羅斯加里寧格勒）是東普魯士的首都，普萊格爾河橫貫其中。十八世紀在這條河上建有七座橋，將河中間的兩個島和河岸聯結起來。人們閑暇時經常在這上邊散步，一天有人提出：能不能每座橋都只走一遍，最後又回到原來的位置。這個問題看起來很簡單有很有趣的問題吸引了大家，很多人在嘗試各種各樣的走法，但誰也沒有做到。看來要得到一個明確、理想的答案還不那麼容易。
1736年，有人帶著這個問題找到了當時的大數學家歐拉，歐拉經過一番思考，很快就用一種獨特的方法給出了解答。歐拉把這個問題首先簡化，他把兩座小島和河的兩岸分別看作四個點，而把七座橋看作這四個點之間的連線。那麼這個問題就簡化成，能不能用一筆就把這個圖形畫出來。經過進一步的分析，歐拉得出結論——不可能每座橋都走一遍，最後回到原來的位置。並且給出了所有能夠一筆畫出來的圖形所應具有的條件。這是拓撲學的「先聲」。
在拓撲學的發展歷史中，還有一個著名而且重要的關於多面體的定理也和歐拉有關。這個定理內容是：如果一個凸多面體的頂點數是v、棱數是e、面數是f，那麼它們總有這樣的關系：f+v-e=2。
根據多面體的歐拉定理，可以得出這樣一個有趣的事實：只存在五種正多面體。它們是正四面體、正六面體、正八面體、正十二面體、正二十面體。
著名的「四色問題」也是與拓撲學發展有關的問題。四色問題又稱四色猜想，是世界近代三大數學難題之一。
四色猜想的提出來自英國。1852年，畢業於倫敦大學的弗南西斯.格思里來到一家科研單位搞地圖著色工作時，發現了一種有趣的現象：「看來，每幅地圖都可以用四種顏色著色，使得有共同邊界的國家都被著上不同的顏色。」
1872年，英國當時最著名的數學家凱利正式向倫敦數學學會提出了這個問題，於是四色猜想成了世界數學界關注的問題。世界上許多一流的數學家都紛紛參加了四色猜想的大會戰。1878～1880年兩年間，著名律師兼數學家肯普和泰勒兩人分別提交了證明四色猜想的論文，宣布證明了四色定理。但後來數學家赫伍德以自己的精確計算指出肯普的證明是錯誤的。不久，泰勒的證明也被人們否定了。於是，人們開始認識到，這個貌似容易的題目，其實是一個可與費馬猜想相媲美的難題。
進入20世紀以來，科學家們對四色猜想的證明基本上是按照肯普的想法在進行。電子計算機問世以後，由於演算速度迅速提高，加之人機對話的出現，大大加快了對四色猜想證明的進程。1976年，美國數學家阿佩爾與哈肯在美國伊利諾斯大學的兩台不同的電子計算機上，用了1200個小時，作了100億判斷，終於完成了四色定理的證明。不過不少數學家並不滿足於計算機取得的成就，他們認為應該有一種簡捷明快的書面證明方法。
上面的幾個例子所講的都是一些和幾何圖形有關的問題，但這些問題又與傳統的幾何學不同，而是一些新的幾何概念。這些就是「拓撲學」的先聲。
什麼是拓撲學？
拓撲學的英文名是Topology，直譯是地誌學，也就是和研究地形、地貌相類似的有關學科。我國早期曾經翻譯成「形勢幾何學」、「連續幾何學」、「一對一的連續變換群下的幾何學」，但是，這幾種譯名都不大好理解，1956年統一的《數學名詞》把它確定為拓撲學，這是按音譯過來的。
拓撲學是幾何學的一個分支，但是這種幾何學又和通常的平面幾何、立體幾何不同。通常的平面幾何或立體幾何研究的對象是點、線、面之間的位置關系以及它們的度量性質。拓撲學對於研究對象的長短、大小、面積、體積等度量性質和數量關系都無關。
舉例來說，在通常的平面幾何里，把平面上的一個圖形搬到另一個圖形上，如果完全重合，那麼這兩個圖形叫做全等形。但是，在拓撲學里所研究的圖形，在運動中無論它的大小或者形狀都發生變化。在拓撲學里沒有不能彎曲的元素，每一個圖形的大小、形狀都可以改變。例如，前面講的歐拉在解決哥尼斯堡七橋問題的時候，他畫的圖形就不考慮它的大小、形狀，僅考慮點和線的個數。這些就是拓撲學思考問題的出發點。
拓撲性質有那些呢？首先我們介紹拓撲等價，這是比較容易理解的一個拓撲性質。
在拓撲學里不討論兩個圖形全等的概念，但是討論拓撲等價的概念。比如，盡管圓和方形、三角形的形狀、大小不同，在拓撲變換下，它們都是等價圖形。左圖的三樣東西就是拓撲等價的，換句話講，就是從拓撲學的角度看，它們是完全一樣的。
在一個球面上任選一些點用不相交的線把它們連接起來，這樣球面就被這些線分成許多塊。在拓撲變換下，點、線、塊的數目仍和原來的數目一樣，這就是拓撲等價。一般地說，對於任意形狀的閉曲面，只要不把曲面撕裂或割破，他的變換就是拓撲變幻，就存在拓撲等價。
應該指出，環面不具有這個性質。比如像左圖那樣，把環面切開，它不至於分成許多塊，只是變成一個彎曲的圓桶形，對於這種情況，我們就說球面不能拓撲的變成環面。所以球面和環面在拓撲學中是不同的曲面。
直線上的點和線的結合關系、順序關系，在拓撲變換下不變，這是拓撲性質。在拓撲學中曲線和曲面的閉合性質也是拓撲性質。
我們通常講的平面、曲面通常有兩個面，就像一張紙有兩個面一樣。但德國數學家莫比烏斯(1790～1868)在1858年發現了莫比烏斯曲面。這種曲面就不能用不同的顏色來塗滿兩個側面。
拓撲變換的不變性、不變數還有很多，這里不在介紹。
拓撲學建立後，由於其它數學學科的發展需要，它也得到了迅速的發展。特別是黎曼創立黎曼幾何以後，他把拓撲學概念作為分析函數論的基礎，更加促進了拓撲學的進展。
二十世紀以來，集合論被引進了拓撲學，為拓撲學開拓了新的面貌。拓撲學的研究就變成了關於任意點集的對應的概念。拓撲學中一些需要精確化描述的問題都可以應用集合來論述。
因為大量自然現象具有連續性，所以拓撲學具有廣泛聯系各種實際事物的可能性。通過拓撲學的研究，可以闡明空間的集合結構，從而掌握空間之間的函數關系。本世紀三十年代以後，數學家對拓撲學的研究更加深入，提出了許多全新的概念。比如，一致性結構概念、抽象距概念和近似空間概念等等。有一門數學分支叫做微分幾何，是用微分工具來研究取線、曲面等在一點附近的彎曲情況，而拓撲學是研究曲面的全局聯系的情況，因此，這兩門學科應該存在某種本質的聯系。1945年，美籍中國數學家陳省身建立了代數拓撲和微分幾何的聯系，並推進了整體幾何學的發展。
拓撲學發展到今天，在理論上已經十分明顯分成了兩個分支。一個分支是偏重於用分析的方法來研究的，叫做點集拓撲學，或者叫做分析拓撲學。另一個分支是偏重於用代數方法來研究的，叫做代數拓撲。現在，這兩個分支又有統一的趨勢。
拓撲學在泛函分析、李群論、微分幾何、微分方程額其他許多數學分支中都有廣泛的應用。
參考資料：
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❻ 怎麼用gephi輸入一個鄰接矩陣畫出拓撲圖

用gephi輸入一個鄰接矩陣畫出拓撲圖方法如下：

1. //Ford-Fulkerson
2. //鄰接矩陣BFS
3. #include<stdio.h>
4. #include<string.h>
5. #include<algorithm>
6. usingnamespacestd;
7. #defineMAXN205
8. #defineinf2100000000
9. intc[MAXN][MAXN];
10. intpass[MAXN];
11. intbfs_max_flow(intn,ints,intt)
12. {
13. intpre[MAXN],low[MAXN],head,tail,que[1000],i,maxflow=0;
14. while(1)
15. {
16. memset(pre,-1,sizeof(pre));
17. head=tail=0;
18. low[s]=inf;que[tail++]=s;
19. pre[s]=0;
20. while(head<tail)
21. {
22. intx=que[head++];
23. for(i=1;i<=n;++i)
24. if((c[x][i])&&(pre[i]==-1))
25. {
26. que[tail++]=i;
27. low[i]=low[x]<c[x][i]?low[x]:c[x][i];
28. pre[i]=x;
29. }
30. if(pre[t]!=-1)
31. {
32. x=t;
33. while(x!=s)
34. {
35. c[x][pre[x]]+=low[t];
36. c[pre[x]][x]-=low[t];
37. x=pre[x];
38. }
39. break;
40. }
41. }
42. if(pre[t]!=-1)maxflow+=low[t];
43. elsereturnmaxflow;
44. }
45. }
46. intmain()
47. {
48. intn,m,i,a,b,d;
49. while(scanf("%d%d",&n,&m)!=EOF)
50. {
51. memset(c,0,sizeof(c));
52. for(i=1;i<=n;++i)
53. {
54. scanf("%d%d%d",&a,&b,&d);
55. c[a][b]+=d;
56. }
57. printf("%d/n",bfs_max_flow(m,1,m));
58. }
59. }
60. //Ford-Fulkerson
61. //鄰接矩陣DFS
62. #include<stdio.h>
63. #include<string.h>
64. #include<algorithm>
65. usingnamespacestd;
66. #defineMAXN205
67. #defineinf2100000000
68. intc[MAXN][MAXN];
69. intpass[MAXN];
70. intdfs(intn,ints,intt,intlow)
71. {
72. inti,flow;
73. if(s==t)returnlow;
74. if(pass[s])return0;
75. pass[s]=1;
76. for(i=1;i<=n;++i)
77. {
78. if((c[s][i])&&(flow=dfs(n,i,t,low<c[s][i]?low:c[s][i])))
79. {
80. c[s][i]-=flow;
81. c[i][s]+=flow;
82. returnflow;
83. }
84. }

85. return0;

    Gephi是一款開源免費跨平台基於JVM的復雜網路分析軟體, 其主要用於各種網路和復雜系統，動態和分層圖的交互可視化與探測開源工具。可用作：探索性數據分析，鏈接分析，社交網路分析，生物網路分析等。