❶ 【求助】想知道某種微生物代謝產物的產生基因並對該基因進行研究,該如何操作論文也行
如果是已知的物質的話,就要去查找資料,可以上NCBI上檢索或看相關英文文獻。
如果是新發現的物質就比較麻煩了,這方面的話可以從該物質的結構上入手。
比如該物質是個聚酮化合物(有好多次級代謝產物是屬於聚酮化合物的),那麼合成該物質的基因簇中必然含有一個PKS或NRPS基因,進而根據PKS或NRPS基因的保守區域對基因組進行比對,找出相應的PKS或NRPS基因,再通過對PKS或NRPS基因的功能結構域分析,排除幾個干擾項,最後則是通過基因敲除或RNAi的方法來准確定位。
上述例子是我聽講座聽到的,所以只能講個大概。
相關文獻的話,有很多。你可以找幾個相同結構的物質,然後檢索中文綜述,從綜述中可以找到該物質的研究進展。
我這有篇關於美伐他汀的文章,可以參考下:
《美伐他汀生物合成基因簇的研究進展》
❷ 哪個網站可以查到已經全測序的微生物基因組有多少種了
基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特徵及行為合理,如癌症或白血病,運動天賦,酒量等。基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術,是下一個改變世界的技術。
基因組大小(size of genome)是指單倍體細胞核中的所含的DNA的總量.在可以進行基因組測序之前,生物學家是用質量來衡量不同生物之間基因組的大小.通常使用的單位為pg(10e-12),這個值簡稱為C-value.通過簡單的換算就可以知道大概的鹼基的數量.不過,對於已經測序的基因組,直接數數就可以了,如 vihole所述.不過對於目前測序的基因組還是很少,估計在1千左右,而現存物種按照最保守的估計也有200萬種(Ref 1),因此C-value在估計基因含量和生物復雜度方面還是有非常大的應用潛力.
❸ 怎麼在基因庫下載微生物的DNA序列
基因庫是一個虛擬的概念。指一個種群里所有個體的所有基因。
基因文庫是貯存某物種基因的一個微生物群體。比如,我們可以把人類的所有基因用限制酶切割後,用DNA連接酶將這些基因片斷和運載體連接,導入到細菌細胞,然後大量培養這些細菌細胞,就形成了一個基因文庫。這些基因文庫含有某物種的全部種類的基因,又叫基因組文庫。所以,基因文庫包括基因組文庫。
❹ 如何查找一個基因參與的代謝通路
代謝通路:目前在通路資料庫(PATHWAYdatabase)中代謝通路是建立得最好的,有大約90個參考代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或EC號組成的網路。
利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有的代謝通路:
先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的基因。
然後合理地安排EC號。
最後將基因組中的基因和參照通路中用EC號編號的基因產物結合起來。
❺ 人體腸道微生物OTU數據在哪裡下載
人體腸道中龐大而復雜的微生物群落對人體自身代謝表型有深遠的影響。腸道微生物群落在亞種或菌株水平上表現出極大的多樣性。利用微生物分子生態學、元基因組學和代謝組學研究方法,發現腸道微生物與宿主表現出共進化的特點,腸道微生物群落及其基因組為宿主提供了互補的遺傳和代謝功能,表現出互惠共生關系。但是,腸道微生物群落中影響宿主代謝表型的關鍵功能菌鑒定及其作用模式問題仍然懸而未決,綜合運用多種高通量研究方法和多維數據分析方法可能成為解決這個問題的突破口。
❻ 怎麼在ncbi中查詢關於代謝綜合征的基因表達譜
佳學基因,人類基因信息解讀和應用專家。有各種代謝綜合征基因解碼基因檢測,檢測是在基因解碼研究中心進行的。
❼ 微生物屬的生理環境在哪裡查
微生物菌種查詢網或者查文獻 。
1 、調整期:細菌代謝活躍,大量合成細胞分裂所需的酶類、ATP以及其他細胞成分 2 、對數期:細菌代謝旺盛,個體的形態和生理特性比較穩定 (調整期和對數期的細菌幾乎不存在種內斗爭) 3 、穩定期:有害代謝產物積累,新增細胞數目與死亡細胞數目達到動態平衡,次級代謝產物大量積累,形成芽孢 (穩定期的細菌種內斗爭最激烈) 4 、衰亡期:細菌數目急劇下降,出現畸形細菌 (衰亡期的細菌和無機環境的斗爭最激烈)。