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ngs病原微生物檢測是什麼意思

發布時間:2022-08-26 04:52:27

『壹』 ngs是什麼意思

ngs是高通量測序技術。
高通量測序技術(High-throughputsequencing)又稱「下一代」測序技術(「Next-generation」,sequencingtechnology),簡稱「Ngs」,以能一次並行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。
高通量測序技術是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(Colony)進行延伸反應,檢測對應的信號,最終獲取序列信息。

『貳』 NGS 檢測干什麼用的

NGS 檢測:高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱「下一代」測序技術("Next-generation" sequencing technology),以能一次並行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。

1、高通量測序在精準醫學的應用:

包括疾病基因的篩查,大規模測病人和正常人的基因,通過基因比較,得出與疾病可能相關的基因,後續再診斷這一疾病,即可篩查病人是否有這些基因的突變。比如乳腺癌,現已有較成熟的基因篩查方法。

2、古基因組學的應用:

對於已經滅絕的生物,可通過考古獲得的動物毛發、骨骼對該物種測序,還可通過樣品中微生物基因組分析,判斷該物種當時的生活環境。

如猛獁象線粒體基因組的測序,發現猛獁象基因復雜度低,存在高度不穩定性,可能這導致了該物種適應環境能力低,在一部分程度上導致了該物種的滅絕。

(2)ngs病原微生物檢測是什麼意思擴展閱讀:

高通量測序技術的誕生可以說是基因組學研究領域一個具有里程碑意義的事件。該技術使得核酸測序的單鹼基成本與第一代測序技術相比急劇下降, 以人類基因組測序為例, 上世紀末進行的人類基因組計劃花費 30 億美元解碼了人類生命密碼;

而第二代測序使得人類基因組測序已進入萬(美)元基因組時代。如此低廉的單鹼基測序成本使得我們可以實施更多物種的基因組計劃從而解密更多生物物種的基因組遺傳密碼。同時在已完成基因組序列測定的物種中, 對該物種的其他品種進行大規模地全基因組重測序也成為了可能。

『叄』 第二代測序技術(NGS)是什麼,有什麼優勢


NGS又叫高通量測序,當傳統的癌症治療不起作用,或者醫生不能確定患者的癌症起源(原發灶)時,NGS(二代測序)可以幫助確定腫瘤中的基因突變,這些突變可能與某些針對特定變異的葯物相匹配。NGS主要優勢是通量大,可以得到海量的數據,高通量最小的數據量單位是G,而一代測序一次只能產生1K的數據。

NGS對晚期癌症患者的用處有多大,有研究表明:
1、在80.5%的患者中發現了潛在的可操作的基因組變異;
2、在接受測序指導治療的132名患者中,37.1%的患者取得了臨床獲益,19.7%的患者獲得了超級應答(定義為將他們的疾病控制至少一年);
3、對於原發灶不明癌患者,在近一半(50.9%)的病例中,NGS解決了組織溯源問題,為醫生提供更好的線索,了解哪些標准療法和靶向療法可能會有所幫助;
4、在15.8%的癌症患者中發現了潛在的可遺傳胚系致病變異(增加患癌風險),其中4.8%與靶向治療相關。

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『肆』 NGS究竟是一項怎樣的技術

就是高通量基因測序,能夠一次測序很多基因。甚至是一個人的全部的基因序列都能一次檢測出來。相比第一代測序第二代測序在大規模測序方面有著無可匹敵的優勢,壓縮成本很厲害。但是對於少量檢測成本有很高。很多基因檢測公司都在做二代測序服務。

『伍』 呼吸科ngs是什麼

高通量測序 ,又叫「下一代」測序技術(NGS),是通過並行測序的方法,一次對幾十萬到幾百萬條DNA進行序列測定,廣泛應用於腫瘤、病原學、遺傳等領域。對於感染送檢標本,通過分析其中微生物的DNA或RNA含量與豐度判斷致病菌,顯著提高病原檢測的敏感度,縮短了檢測時間,對罕見病原體感染的診斷具有優勢,可用於臨床疑難感染病原體檢測。
先來看看NGS能做什麼?

全基因測序(WGS)、全外顯子測序(WES)在理論上可用於檢測基因突變、拷貝數變異(CNV)、純合狀態(LOH)、單親二體(UPD),延伸開來還可用於易位、倒位等染色體結構異常的判斷。內容太多,就先挑幾個最重要的來准備吧。

1、基因突變,NGS的最基本應用。

WES可能出錯的地方:探針覆蓋不全、測序深度不足、測序錯誤、重復序列、同源序列等。

基本的技術准備:Sanger測序。

雖然看起來NGS老牛氣了,簡直啥都能幹。不過老話說得好,十八般武藝樣樣都通,難免樣樣稀鬆。WES一次能查出來幾萬個位點,總有一些不那麼靠譜的,像測序深度太低或者測序的末端,還有第一外顯子等探針比較少的地方,還有一些是內含子上較遠的位置,在WES裡面都是有可能出錯的。所以,WES的結果依然需要Sanger測序來驗證。而且,NGS也不是包打天下的,對於WES探針未覆蓋到的區域,或者重復序列之類的結構特別之處,WES都會歇菜,還需要Sanger測序來補充。所以Sanger測序的作為技術儲備是必不可少的。

除此以外,還有Sanger測序的升級版,比如需要Long Range PCR+Sanger測序,用於分析SMA、HLA等同源序列的區域;Sanger測序的精簡版,毛細管電泳,用於亨廷頓、脆X等STR區域檢測等。這些技術也得准備好,要知道患者可不會按著你的檢測目錄來生病,等病人都來了再手忙腳亂地到處找方案容易忙中出錯。

必要的知識儲備:遺傳學知識和文獻檢索技能。

常見病大家都熟,便宜、快速又准確的檢測方法也很多。所以能攤上NGS的,都是少見或者罕見的疾病。可是少見病和罕見病見得少啊,都不熟,這個時候,充分的知識儲備、完善的文獻檢索技能、還有謹慎的態度,就很重要了。

『陸』 ngs基因檢測什麼意思Ngs和基因檢測是一樣的嗎

摘要 可以是外周血,也可以是手術中活檢

『柒』 什麼叫病原微生物檢測

病原微生物檢測是直接檢測病原微生物,或其抗原、代謝產物、核酸等。

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