A. 請問ORF與CDS的區別是什麼
CDS就是編碼區,不多解釋了。
ORF,開放閱讀框,實際上我們得到了一段序列後,在研究中,特別是生物信息學,發現三個三個密碼子閱讀後,他可以編碼某種蛋白質,但是實際上他在自然條件下會不會編碼蛋白質,是不一定的,我們是不清楚的。比如I型內含子中有編碼內切核酸酶的ORF。據我們老師說ORF不含終止密碼,但是我看到網上有些人說含有終止密碼,我不確定。
B. 基因的cds和orf的區別
CDS是Coding sequence,蛋白編碼序列.
ORF是open reading frame,開放閱讀框.
⑴開放閱讀框是不被終止子打斷的一段核酸序列,可能包含編碼蛋白的鹼基序列;不是所有開放閱讀框都能被表達出蛋白產物,或者能表達出佔有優勢或者能產生生物學功能的蛋白.
⑵CDS,就是編碼一段蛋白產物的序列.
⑶cds必定在一個ORF里,但也可能包括很多ORF.
⑷反之,每個ORFf不一定都有CDS.
PS:網路上的說法略有出入,我改了改
C. 解釋CDS、cDNA、EST、mRNA、ORF間的區別
ORF的英文展開是open reading frame(開放閱讀框)。
CDS的英文展開是coding sequences (編碼區)。
ORF是理論上的氨基酸編碼區,一般是在分析DNA核酸圖譜中(主要是利用電腦程序)得到的。程序會自動在DNA序列中尋找啟動因子(ATG或AUG),然後按每3個核酸一組,一直延伸尋找下去,直到碰到終止因子(TAA或TAG)。程序把這個區域當成ORF區,認為理論上可以編碼一組氨基酸。
但問題是,在一個整體核酸序列中尋找ATG並不靠譜。因為尋找到的ATG很可能是兩個氨基酸編碼片段的尾和頭的混合體。比如AACGCATGCAGC.
看上面這個小序列,如果以T為中心,會有三種編碼組合的可能。即
(1)ATG(T在中心)電腦程序發現的啟動因子的組合
(2)CAT(T在最右側)
(3)TGC(T在最左側)本例中實際核酸編碼的組合。
這就是ORF三種框架的來源。實際上,DNA序列可以按六種框架閱讀和翻譯(每條鏈三種,對應六種不同的三聯密碼子)。
所以,我們說ORF只是理論上的編碼區,與真實的情景可能並不一樣。
而CDS是檢查cDNA後得到的編碼組合序列,和實際情景比較接近。
D. ORF在基因中有什麼作用
ORF是開放閱讀框,里邊所包含的DNA序列是否能編碼蛋白質是不清楚的,如果一旦發現ORF里的DNA可以編碼蛋白質,那它就變成了一個基因。所以每一個開放閱讀框都是潛在的基因(也許是真基因只是人們還沒研究出來,也有可能這個OFR壓根兒也就不編碼蛋白質)
E. 請問CDS和ORF有什麼區別謝謝回答詳細一點。
1、含義不同。
ORF的英文展開是open reading frame(開放閱讀框)。 CDS的英文展開是coding sequences (編碼區)。
2、來源不同。
ORF只是理論上的編碼區,與真實的情景可能並不一樣。 而CDS是檢查cDNA後得到的編碼組合序列,和實際情景比較接近。
(5)生物中orf是什麼擴展閱讀:
ORF三種框架的來源:
(1)ATG(T在中心)電腦程序發現的啟動因子的組合
(2)CAT(T在最右側)
(3)TGC(T在最左側)本例中實際核酸編碼的組合。
F. 什麼是ORF表達載體
表達載體,指在ORF前有轉錄
啟動子
,ORF後有
轉錄終止子
,這樣ORF可表達為蛋白質;另有些附加原件,如
復制子
,篩選
標記基因
,
報告基因
等。
G. 什麼是orf在基因注釋中orf有何意義
如果你是基因組序列的話,並不能用NCBI裡面的那個ORF finder工具,該工具只是簡單的將你所輸入的序列按6種可能的閱讀框進行翻譯,然後輸出編碼最長氨基酸的那種閱讀框,你是基因組序列,你得先知道該基因編碼的mRMA序列,你知道了cDNA序列你才能進一步分析該基因中的外顯子和內含子,甚至該基因的啟動子,找cDNA序列,可以用ncbi的blast搜索
H. 基因的cds和orf的區別
CDS是Coding sequence,蛋白編碼序列。
ORF是open reading frame,開放閱讀框。
⑴開放閱讀框是不被終止子打斷的一段核酸序列,可能包含編碼蛋白的鹼基序列;不是所有開放閱讀框都能被表達出蛋白產物,或者能表達出佔有優勢或者能產生生物學功能的蛋白。
⑵CDS,就是編碼一段蛋白產物的序列。
⑶cds必定在一個ORF里,但也可能包括很多ORF。
⑷反之,每個ORFf不一定都有CDS。
PS:網路上的說法略有出入,我改了改