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三大生物資料庫是什麼

發布時間:2022-10-08 09:57:16

A. 世界上三大文獻檢索資料庫是哪幾個

SCI--Science Citation Index《科學引文索引》 - EI—Engineering Index《工程索引》 - ISTP—Index to Scientific & Technical Proceedings 《科技會議錄索引》 - SCI SCI(《科學引文索引》,英文全稱為Science Citation Index)是美國科學情報研究所(In stitute for Scientific Information,簡稱ISI)出版的一部世界著名的期刊文獻檢索工具,其出版形式包括印刷版期刊和光碟版及聯機資料庫,現在還發行了互聯網上Web版資料庫。 SCI收錄全世界出版的數、理、化、農、林、醫、生命科學、天文、地理、環境、材料、工程技術等自然科學各學科的核心期刊約3500種。ISI通過它嚴格的選刊標准和評估程序挑選刊源,而且每年略有增減,從而做到SCI收錄的文獻能全面覆蓋全世界最重要和最有影響力的研究成果。ScI所謂最有影響力的研究成果,指的是報道這些成果的文獻大量地被其它文獻引用。為此,作為一部檢索工具,SCI一反其它檢索工具通過主題或分類途徑檢索文獻的常規做法,而設置了獨特的「引文索引」(Citation Index)。即通過先期的文獻被當前文獻的引用,來說明文獻之間的相關性及先前文獻對當前文獻的影響力。 SCI以上做法上的特點,使得SCI不僅作為一部文獻檢索工具使用,而且成為科研評價和的一種依據。科研機構被SCI收錄的論文總量,反映整個機構的科研、尤其是基礎研究的水平;個人的論文被SCI收錄的數量及被引用次數,反映他的研究能力與學術水平。 此外,ISI每年還出版JCR(《期刊引用報告》,全稱Journal Citation Reports)。JCR對包括SCI收錄的3500種期刊在內的4700種期刊之間的引用和被引用數據進行統計、運算,並針對每種期刊定義了影響因子(Impact Factor)等指數加以報道。一種期刊的影響因子,指的是該刊前二年發表的文獻在當前年的平均被引用次數。一種刊物的影響因子越高,也即其刊載的文獻被引用率越高,一方面說明這些文獻報道的研究成果影響力大,另一方面也反映該刊物的學術水平高。因此,JCR以其大量的期刊統計數據及計算的影響因子等指數,而成為一種期刊評價工具。圖書館可根據JCR提供的數據制定期刊引進政策;論文作者可根據期刊的影響因子排名決定投稿方向。 EI Ei Compendex是全世界最早的工程文摘來源。Ei Compendex資料庫每年新增的50萬條文摘索引信息分別來自5100種工程期刊、會議文集和技術報告。Ei Compendex收錄的文獻涵蓋了所有的工程領域,其中大約22%為會議文獻,90%的文獻語種是英文。Ei公司在1992年開始收錄中國期刊。1998年Ei在清華大學圖書館建立了Ei中國鏡像站。 SCI、SSCI 簡介 目前,在國際科學界,如何正確評價基礎科學研究成果已引起越來越廣泛的關注。而被SCI、SSCI收錄的科技論文的多寡則被看作衡量一個國家的基礎科學研究水平、科技實力和科技論文水平高低的重要評價指標。那麼,究竟什麼是SCI和SSCI呢?我們根據所掌握的資料,簡介如下: 一、SCI簡介-- SCI即《科學引文索引》(Science Citation Index),是由美國科學信息研究所(Institute for Scientific Information 簡稱ISI)創建的,收錄文獻的作者、題目、源期刊、摘要、關鍵詞,不僅可以從文獻引證的角度評估文章的學術價值,還可以迅速方便地組建研究課題的參考文獻網路。SCI創刊於1961年。經過40年的發展完善,已從開始時單一的印刷型發展成為功能強大的電子化、集成化、網路化的大型多學科、綜合性檢索系統。-- SCI從來源期刊數量劃分為SCI和SCI-E。SCI指來源刊為3500多種的SCI印刷版和SCI光碟版(SCI Compact Disc Edition, 簡稱SCI CDE),SCI-E(SCI Expanded)是SCI的擴展庫,收錄了5600多種來源期刊,可通過國際聯機或網際網路進行檢索。SCI涵蓋學科超過100個,主要涉及農業、生物及環境科學;工程技術及應用科學;醫學與生命科學;物理及化學;行為科學。-- 二、SSCI簡介-- SSCI即社會科學引文索引(Social Sciences Citation Index),為SCI的姊妹篇,亦由美國科學信息研究所創建,是目前世界上可以用來對不同國家和地區的社會科學論文的數量進行統計分析的大型檢索工具。1999年SSCI全文收錄1809種世界最重要的社會科學期刊,內容覆蓋包括人類學、法律、經濟、歷史、地理、心理學等55個領域。收錄文獻類型包括:研究論文,書評,專題討論,社論,人物自傳,書信等。選擇收錄(Selectively Covered)期刊為1300多種。 三、SCI、SSCI交叉關系-- SSCI對其收錄期刊范圍的說明中明確告知該資料庫中有一部分內容與SCI重復,這是因為學科之間本身有交叉,是社會科學與自然科學相結合的跨學科的研究在文獻中的自然反映。 另外,SSCI從3400餘種自然科學期刊中,通過計算機檢索文章主題和引文後,生成一個與社會科學有關的文獻目錄,此目錄再經ISI編委會審核,選擇與社會科學密切相關的文獻加入SSCI。因此SSCI也收錄了相當數量的自然科學文獻,二者的交叉關系更為密切。 EI簡介 EI是美國《工程索引》(The Engineering Index)的簡稱。EI創刊於1884年,由美國工程情報公司(Engineering Information Co.)出版發行。EI是工程技術領域內的一部綜合性檢索工具,報道內容包括:電類、自動控制類、動力、機械、儀表、材料科學、農業、生物工程、數理、醫學、化工、食品、計算機、能源、地質、環境等學科。- ISTP簡介 ISTP是Index to Scientific & Technical Proceedings的縮寫,是美國科學情報研究所的網路資料庫Web of Science Proceedings中兩個資料庫(ISTP和ISSHP)之一。專門收錄世界各種重要的自然科學及技術方面的會議,包括一般性會議、座談會、研究會、討論會、發表會等的會議文獻,涉及學科基本與SCI相同。 ISTP收錄論文的多少與科技人員參加的重要國際學術會議多少或提交、發表論文的多少有關。我國科技人員在國外舉辦的國際會議上發表的論文占被收錄論文總數的64.44%。 在ISTP、 EI、 SCI這三大檢索系統中,SCI最能反映基礎學科研究水平和論文質量,該檢索系統收錄的科技期刊比較全面,可以說它是集中各個學科高質優秀論文的精萃,該檢索系統歷來成為世界科技界密切注視的中心和焦點。

B. 生物信息資料庫分為哪四大類

按大小可以分為1.公共資料庫
2. 從公共資料庫中取數據做進一步處理的專業資料庫,提供更多的分析工具
按功能分可以有
基因庫GENEBANK,蛋白庫UNIPROT, 結構庫PDB, 功能分類 GO庫,通路庫 KEGG。

不用專注於4這個數字。隨著科研的進步還會有更多的資料庫出來。

C. 通常說的三大生物信息學資料庫指

EMBL DDBJ GenBank

D. 全世界三大免費資料庫是什麼

一.三大檢索工具及相關資料庫介紹

1.三大檢索工具簡

科技部下屬的「中國科學技術信息研究所」從 1987 年起,每年以國外四大檢索工具 SCI 、ISTP 、Ei、ISR 為數據源進行學術排行。由於 ISR(《科學評論索引》) 收錄的論文與 SCI 有較多重復,且收錄我國的論文偏少因此,1993年起不再把 ISR 作為論文的統計源。而其中的 SCI 、ISTP 、 Ei 資料庫就是圖書情報界常說的國外三大檢索工具。

SCI ,即《科學引文索引》,是自然科學領域基礎理論學科方面的重要期刊文摘索引資料庫。它創建於1961 年,創始人為美國科學情報研究所所長 Eugene Garfield(1925.9.15).利用它,可以檢索數學、物理學、化學、天文學、生物學、醫學、農業科學以及計算機科學、材料科學等學科方面自 1945 年以來重要的學術成果信息;SCI 還被國內外學術界當做制定學科發展規劃和進行學術排名的重要依據。

ISTP ,即《科學技術會議錄索引》,創刊於 1978 年,由美國科學情報研究所編制,主要收錄國際上著名的科技會議文獻。它所收錄的數據包括農業、環境科學、生物化學、分子生物學、生物技術、醫學、工程、計算機科學 、化學、物理學等學科。從 1990-2003 年間, ISTP 和 ISSHP( 後文將要講到 ISSHP) 共收錄了 60 , 000 個會議的近 300 萬篇論文的信息。

Ei,即《工程索引》,創刊於 1884 年,由 Elsevier Engineering Information Inc. 編輯出版。主要收錄工程技術領域的論文(主要為科技期刊和會議錄論文 ) ,數據覆蓋了核技術、生物工程、交通運輸、化學和工藝工程、照明和光學技術、農業工程和食品技術、計算機和數據處理、應用物理、電子和通信、控制工程、土木工程、機械工程、材料工程、石油、宇航、汽車工程等學科領域。

2.與三大檢索工具相關的其它資料庫介紹
SSCI,即《社會科學引文索引》,創刊於 1969 年,收錄數據從 1956 年至今;是社會科學領域重要的期刊文摘索引資料庫。數據覆蓋了歷史學、政治學、法學、語言學、哲學、心理學、圖書情報學、公共衛生等社會科學領域。

A&HCI,即《藝術與人文科學引文索引》,創刊於 1976 年,收錄數據從 1975 年至今;是藝術與人文科學領域重要的期刊文摘索引資料庫。數據覆蓋了考古學、建築學、藝術、文學、哲學、宗教、歷史等社會科學領域。

ISSHP ,即《社會科學和人文會議錄索引》,創刊於 1979 年,數據涵蓋了社會科學、藝術與人文科學領域的會議文獻。這些學科包括:哲學、心理學、社會學、經濟學、管理學、藝術、文學、歷史學、公共衛生等領域。
xiaoxinsue 2006-06-03 10:35
二.如何利用三大檢索工具等資料庫檢索相關主題文獻

1.利用SCI、SSCI、A&HCI資料庫檢索相關主題文獻

(1) 通過往TOPIC檢索入口輸入檢索主題詞獲得相關主題文獻

(2) 通過往TOPIC檢索入口輸入檢索主題詞,然後對檢索結果進一步分析獲得相關主題文獻

(3) 通過往TOPIC和SOURCE TITLE檢索入口同時輸入檢索主題詞獲得相關主題文獻

例子:往TOPIC中輸入"nano*",同時往SOURCE TITLE 中輸入"ARTIFICIAL CELLS BLOOD SUBSTITUTES AND IMMOBILIZATION BIOTECHNOLOGY or BIO-MEDICAL MATERIALS AND ENGINEERING or BIOMATERIALS or CELLULAR POLYMERS or DENTAL MATERIALS or JOURNAL OF BIOACTIVE AND COMPATIBLE POLYMERS or JOURNAL OF BIOMATERIALS SCIENCE-POLYMER EDITION or JOURNAL OF BIOMATERIALS APPLICATIONS or JOURNAL OF BIOMEDICAL MATERIALS RESEARCH or JOURNAL OF MATERIALS SCIENCE-MATERIALS IN MEDICINE or MACROMOLECULAR BIOSCIENCE", 利用上面的檢索式,可以檢索出SCI網路版2002年資料庫收錄"MATERIALS SCIENCE, BIOMATERIALS"類的文章102篇。

2.利用ISTP資料庫檢索相關主題文獻

可以通過TOPIC、SOURCE TITLE、CONFERENCE相結合的方式來檢索

3.利用Ei資料庫檢索相關主題文獻

例子:檢索醫學領域中含有 "pipe" 的文獻
如果僅僅用 "pipe" 檢索在所有欄位中檢索,會命中 4 萬多條記錄;即使同時限制在 TITLE 中檢索,結果也有 1 萬多條,數據冗餘太大。這時,可以考慮從學科的角度進行限制檢索:

先檢索到從 Ei Thesaurus 中檢索醫學類目:

Medicine : 461.6 , Medical care : 461.7 , Medical imaging : 461.1 , Medical problems ,

Medical supplies : 462.1 , Medical computing : 723.5 , Medical diagnosis , Medical ecation ,

Medical equipment , Medical monitoring : 462.2

利用 "Expert Search" : (461.1 wn CL OR 461.6 wn CL OR 461.7 wn CL OR 462.1 wn CL OR 723.5 wn CL) AND (pipe wn TI) 命中 500 多條記錄,因 723.5 類與計算機應用有關,命中記錄中有許多看不出是與醫學有關的,可以考慮將該類去掉檢索。結果就比較令人滿意。

4.利用 SCOPUS 資料庫檢索相關主題文獻

該資料庫提供了學科限制,因而相對容易。
三.如何利用三大檢索工具等資料庫檢索論文收錄情況
1.利用三大檢索工具等資料庫檢索單位 / 集體論文收錄情況
以清華大學為例
(1)利用 SCI 資料庫檢索單位 / 集體論文收錄情況

(tsinghua univ or tsing hua univ or qinghua univ or qing hua univ or 100084) same (peoples r china or beijing or bei jing)

(2)利用 ISTP 資料庫檢索單位 / 集體論文收錄情況

(tsinghua univ or tsing hua univ or qinghua univ or qing hua univ or 100084) same (peoples r china or beijing or bei jing)

(3)利用 Ei 資料庫檢索單位 / 集體論文收錄情況

利用作者索引或用復雜檢索,但效果均不好。

(4)利用 SCOPUS 資料庫檢索單位 / 集體論文收錄情況

AFFIL(100084 AND tsinghua)

(5)利用 CSSCI 、《中國期刊網》、《中文科技期刊資料庫》檢索單位 / 集體論文收錄情況

三個資料庫均提供機構檢索入口,可以查找單位 / 集體論文收錄情況。
2.利用三大檢索工具等資料庫檢索個人論文收錄情況
以周遠翔老師的論文為例子 ( 見附錄 ) :
(1)利用 SCI 資料庫檢索個人論文收錄情況

作者的文獻 ( 文章或報告 ) 共有 104 篇,在這些文章中,他的合作者包括以下八人: N. Yoshimura, 關志成, H. Katoh, 嚴萍,梁曦東,李光范, M. Nifuku, Atsushi Satake

構建檢索式: (zhou yx or yunxiang z) and (Yoshimura n or guan zc or cheng g or Katoh h or yan p or ping y or liang xd or xidong l or li gf or guangfan l or Nifuku m or Satake a or Atsushi S)

在 AUTHOR 欄位中輸入上述檢索式,命中 9 條記錄。與作者提供的論文核對後發現:這 9 條記錄全是作者本人的論文。

還有幾篇文獻是作者單獨完成的,對於這些文獻,需要單獨處理。

(2)利用 ISTP 資料庫檢索個人論文收錄情況

與檢索 SCI 資料庫類似,用同樣的檢索式和同樣的方法即可。

在 AUTHOR 欄位中輸入上述檢索式,命中 14 條記錄。與作者提供的論文核對後發現:這 14 條記錄全是作者本人的論文。比作者事先查好的 12 篇還多 2 篇。

(3)利用 Ei 資料庫檢索個人論文收錄情況

在高級檢索中輸入 (Ei 資料庫作者標引與 SCI 有很大不同: Ei 一般要將姓和名寫全,而 SCI 是要求姓寫全,名用第一個字母 ) :

(zhou, y.x. wn AU OR zhou, yuanxiang wn AU OR yuanxiang, z. OR yuanxiang, zhou OR zhou, y.-x. wn AU OR zhou, yx wn AU) AND (Yoshimura wn AU OR guan, z.c. wn AU OR guan, z.-c. wn AU OR cheng, g wn AU OR guan, cheng wn AU OR guan, zc wn AU OR Katoh wn AU OR yan, p wn AU OR yan, ping wn AU OR ping, y. wn AU OR ping, yan wn AU OR liang, x.-d. wn AU OR liang, x.d. wn AU OR liang, xd wn AU OR xidong, liang wn AU OR liang, xidong wn AU OR xidong, l. wn AU OR li, gf wn AU OR li, g.f. wn AU OR li, g.-f. wn AU OR guangfan, l. wn AU OR guangfan, li wn AU OR li, guangfan wn AU OR Nifuku wn AU OR Satake wn AU OR Atsushi wn AU)

命中 19 條記錄,這與讀者自己檢索的 27 條記錄相差 8 條。

後經檢查,發現漏檢的 8 條記錄中,有 7 條作者是 "zhou, y" ,有一條是 "zhou, yuanxing" 。所以,用上述檢索式會漏掉一部分記錄;因而我們應再修改一下檢索式:

把上述檢索式修改為: (zhou, y* wn AU OR yuanxiang, z. OR yuanxiang, zhou) AND (Yoshimura wn AU OR guan, z.c. wn AU OR guan, z.-c. wn AU OR cheng, g wn AU OR guan, cheng wn AU OR guan, zc wn AU OR Katoh wn AU OR yan, p wn AU OR yan, ping wn AU OR ping, y. wn AU OR ping, yan wn AU OR liang, x.-d. wn AU OR liang, x.d. wn AU OR liang, xd wn AU OR xidong, liang wn AU OR liang, xidong wn AU OR xidong, l. wn AU OR li, gf wn AU OR li, g.f. wn AU OR li, g.-f. wn AU OR guangfan, l. wn AU OR guangfan, li wn AU OR li, guangfan wn AU OR Nifuku wn AU OR Satake wn AU OR Atsushi wn AU) 命中 34 條記錄,從中找出了作者有 27 篇文獻被 Ei 資料庫收錄。

需要說明的是:利用第一個檢索式基本上可以比較准確地檢索到作者的文獻。只所以利用第二個檢索式,是考慮到 Ei 資料庫在數據標引過程中可能出現的小的差錯,可以基本上沒有遺漏地檢索出作者所有被 Ei 資料庫收錄的文獻。

(4)利用 SCOPUS 資料庫檢索個人論文收錄情況

(5) 利用 CSSCI 、《中國期刊網》、《中文科技期刊資料庫》檢索個人論文收錄情況

xiaoxinsue 2006-06-03 10:35
四.如何檢索論文被引用情況
1.檢索單位 / 集體論文被引用情況
(1)利用 SCI 、 SSCI 、 A&HCI 檢索論文被引用情況
從收錄的角度檢索,例子:

(tsinghua univ or tsing hua univ or qinghua univ or qing hua univ or 100084) same (peoples r china or beijing or bei jing)

(2)利用 SCOPUS 檢索論文被引用情況

(3)利用《中國期刊網》檢索論文被引用情況

備註: CSSCI 、《中國科技論文引文統計分析資料庫》均沒有提供按單位 / 集體檢索論文被引用情況的入口。
2.檢索個人論文被引用情況
(1) 利用SCI、SSCI、A&HCI檢索論文被引用情況 從收錄的角度檢索,例子:

(2) 利用SCOPUS檢索論文被引用情況

(3) 利用CSSCI、《中國科技論文引文統計分析資料庫》、《中國期刊網》檢索論文被引用情況

五.核心期刊投稿導引
1.期刊評價及評價工具
關於期刊評價,目前國內學術界有兩種觀點:一是核心期刊評價法,二是期刊綜合評價梯度法。前者簡稱「 0/1 法則」,後者簡稱「綜合法則」。兩種法則都是以傳統的情報學文獻離散定律、引文分析定律等為理論依據的。只是「綜合法則」涵蓋了「 0/1 法則」,更加強調梯度的概念。 期刊評價的工具,國外以 JCR(Journal Citation Reports) 為代表,國內以《中文核心期刊要目總覽》、《中國科技期刊引證報告》和《中國學術期刊綜合引證報告》為代表。《中文核心期刊要目總覽》和《中國科技期刊引證報告》是「0/1 法則」評價的結果,《中國學術期刊綜合引證報告》是「綜合法則」評價的結果。
2. 核心期刊的內涵及國內、國際核心期刊外延的界定
核心期刊的概念可以用一句話來概括:某一學科中高水平、高影響力的期刊。不難看出,核心期刊有兩個主要特性:一是學科性,二是學術性。

一般情況下,核心期刊都是在某一個學科範圍內來界定的某一個學科的核心期刊,到另一個學科就不一定是核心期刊 ( 當然,綜合性學科的核心期刊,如 NATURE 、 SCIENCE 等例外 ) 。

核心期刊的學術性主要要是以期刊影響因子來測定的。關於影響因子,有兩種統計方法:一種是三年統計法,一種是中期統計法。按三年統計法得出的結果就是目前我們常說的影響因子 (IF: Impact Factor :某一種期刊在第三年得到的引文數與該刊前兩年的總論文數之比。 ) ,按中期統計法得出的結果叫 「 中期影響因子」(MIF: Median Impact Factor 某一種期刊的引文累計達到 1/2 時,引文數與此時的總論文數之比 ) 。
3.如何向國內、國際核心期刊投稿

投國際刊物,請參考 JCR( 包括科技版和社科版 ) ,選擇自己想要找的學科類目,按照影響因子排序,挑選適合的刊物。然後在《烏利希國際期刊指南》網站查找刊物的地址或網站信息,登陸刊物的網站,查找在線投稿信息。

投國內刊物,請參考《中文核心期刊要目總覽》和《中國科技期刊引證報告》,從中選擇自己想要找的學科類別,然後按照影響力,挑選適合的刊物。投稿地址信息可以參考工具書《中文核心期刊要目總覽》,也可以登錄「中國期刊網」,查找刊物的投稿信息。

在向核心期刊投稿的過程中,需要注意的事項:

(1)盡量不要投增刊。

(2) 單位署名要規范。寫清華大學要同時寫上 Beijing, Peoples Republic of China. 這在 SCI 中尤其要注意。

六.SCI 收錄期刊
SCI收錄全世界出版的數、理、化、農、林、醫、生命科學、天文、地理、環境、材料、工程技術等自然科學各學科的核心期刊約3500種。美國科學情報研究所通過它嚴格的選刊標准和評估程序挑選刊源,而且每年略有增減,從而做到SCI收錄的文獻能全面覆蓋全世界最重要和最有影響力的研究成果。

ISI所謂最有影響力的研究成果,指的是報道這些成果的文獻大量地被其它文獻引用。為此,作為一部檢索工具,SCI一反其它檢索工具通過主題或分類途徑檢索文獻的常規做法,而設置了獨特的"引文索引"(Citation Index)。即通過先期的文獻被當前文獻的引用,來說明文獻之間的相關性及先前文獻對當前文獻的影響力。

SCI 以上做法上的特點,使得 SCI 不僅作為一部文獻檢索工具使用,而且成為科研評價和的一種依據。科研機構被 SCI 收錄的論文總量,反映整個機構的科研、尤其是基礎研究的水平;個人的論文被 SCI 收錄的數量及被引用次數,反映他的研究能力與學術水平。

SCI 的出版形式包括印刷版期刊和光碟版及聯機資料庫,現在還發行了互聯網上 Web 版資料庫。個人通過網路就可以對 sci 期刊目錄進行搜索和查找,相關鏈接如下:

SCI 收錄期刊 ( 按字母 ) :

http://www.isinet.com/cgi-bin/jrnlst/jlresults.cgi?PC=K

SCI 收錄期刊 ( 按分類 ) :

http://www.isinet.com/cgi-bin/jrnlst/jlsubcatg.cgi?PC=K

七.EI 投稿指南
為了適應我國科學技術的快速發展,為我國科技工作者向 EI 收錄期刊投稿提供方便,本指南收集了 EI 收錄的科技期刊中近 1900 余種刊物的最新投稿信息,其中包括通信地址、電話號碼、電子郵件地址和網站的網址等。

使用說明
(1) 本目錄按中國科學院圖書分類法排列。

(2)各來源期刊款目的著錄格式如下:

375C0005 ① ISSN 0306-4573 ②

Information Processing&Management. ③

1963. 6/yr ④ Editor-in-chief:Tefko Saracevic,School of Communication Information and Library Studies Rutgers University 4

Huntington Street New Brunswick,NJ 08903 USA. ⑤

E-mail:[email protected]

http://www.elsevier.nl/inca/publications/store/2/4/4/ ⑥

《信息處理與管理》刊載信息處理、傳播、儲存、利用、檢索和管理,包括:計算機和自動化技術在圖書館信息工作中的應用以及信息政策等方面的研究論文、評論和簡訊。 ⑦

註: ① 中圖公司報刊刊號 ② 國際標准刊號 ③ 刊名 ④ 創刊年及出版周期(或全年期數) ⑤ 編委或編輯部或出版機構名稱、地址、電話、傳真 ⑥ 電子郵件地址和網址 ⑦ 譯名和內容簡介(中文或英文)

(3)指南中部分縮寫解釋

ISSN:International Standard Serial Number 國際標准刊號 Pub:Publisher 出版者

E. 國家基因庫:人類存儲健康信息的「生命銀行」

深圳市大鵬新區大鵬街道下沙片區禾塘仔,這里依山傍海,環境優美,背山面海的幾棟白色的建築並不起眼,但令人難以置信的是,龐大的數據如同螺旋一般,每天從這里源源不斷地湧出。這些白色的梯田造型的建築就是中國首個獲批籌建的國家基因庫,也是目前全球最大的綜合性基因庫。

國家基因庫項目一期佔地面積4.75萬平方米,擁有基因測序房、超級計算房以及冷凍資源房,相較於其龐大的建築規模,它豐富的內容更是令人瞠目結舌:國家基因庫目前已存儲多種生物資源樣本1000萬份,可檢索生物信息條目數已經超過一個億,我國更是計劃把它打造成為中國的諾亞方舟,建立一個巨大的生物活體庫,保護和保存世界約三十萬種植物、百萬種動物、近千萬種微生物活體資源。如此大手筆、高規格的項目究竟什麼來頭?建立國家基因庫的意義何在?下面就讓我們一起走進關於國家基因庫的專業解讀。

「科普中國」是中國科協攜同社會各方利用信息化手段開展科學傳播的科學權威品牌。

本文由科普中國融合創作出品,轉載請註明出處。

F. 國際上三個大的生物信息中心有哪些

一 美國國家生物技術信息中心NCBI(National Center for
Biotechnology Information)
NCBI是一個極具人性化的網站,網站的主頁清晰的闡明了NCBI所做的工作及相關領域最新的熱點內容,新聞等。為了方便使用者更加熟練使用網站資源,NCBI在主頁清晰的標注了站點導航,非常便於初學者熟悉和掌握NCBI的站內資源。
另外,NCBI將其網站資源列於主頁左側,其中包括:SITE MAP, About NCBI, GenBank, Literature
databases, Molecular databases, Genomic biology, Tools, Research at
NCBI, Software engineering, Ecation, FTP site, Contact
information等等。
二EBI(European
Bioinformatics Institute)歐洲生物信息研究所The European
Bioinformatics Institute(EBI)是目前國際上幾個重要分子生物信息網站之一,位置座落於英國The Wellcome Trust
Genome Campus。EBI的任務就是確保分子生物與基因體的研究信息可以公開並且免費提供給科學社群,以促進科學進步。
EBI所提供的服務包括建立/維護資料庫、提供分子生物相關信息服務、執行分子生物與計算分子生物研究;所服務的對象與研究人員擴及各產業,包括分子生物、基因體、醫學與農業學術研究、農業、生物技術、化學與制葯工業。
三DDBJ(DNAData Bank of
Japan)日本核酸資料庫
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)
設立在日本國家遺傳研究所(NIG),於1986年開始DNA資料庫的構建工作。從一開始,DDBJ就作為國際性DNA資料庫之一,發揮著重要的作用。它
首先反映的是日本國內資料庫的資源,並與NCBI,EBI進行頻繁的國際性合作。DNA序列中蘊含了大量的數據資源,比起其它生物學數據,它在闡述進化方面的作用更為直接。因此,探求DNA資料庫,不僅是在生命科學方面的研究,更是為人類的發展謀福利。
DDBJ是日本唯一的DNA資料庫,它從研究者那裡收集DNA 序列並且給數據提交者一個國際公認的編碼。DDBJ
主要從日本研究者那裡收集數據,當然,它也接受外國研究者的數據並給以編碼。

G. 生物學資料庫都有哪些

分子生物學資料庫大全:核酸資料庫、基因表達資料庫、蛋白資料庫、糖資料庫、專利資料庫等國際頂尖資料庫列表可以在生物幫那裡找到的,我一般找資料,最新資訊都是到那裡的,他們比較專業,權威,也比較全面,技術文檔,視頻,產品都蠻豐富的。年來大量生物學實驗的數據積累,形成了當前數以百計的生物信息資料庫。它們各自按一定的目標收集和整理生物學實驗數據,並提供相關的數據查詢、數據處理的服務。

H. 國際著名的三大蛋白質資料庫

國際著名的三大蛋白質資料庫有UniProt資料庫、The Human Protein Atlas資料庫、PhosphoSitePlus資料庫。

1、UniProt資料庫

蛋白組學常用資料庫UniProt(全稱UniProt Protein Resource),建立於1986年,由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白質資料庫聯合成立的,其信息量豐富、資源廣泛,是目前公認的首選免費蛋白質資料庫。

2、The Human Protein Atlas資料庫

The Human Protein Atlas內含近30000種人類蛋白質的組織和細胞分布信息,並提供免費查詢。

瑞典Knut&Alice Wallenberg基金會利用免疫組化技術,檢查每一種蛋白質在人類48種正常組織,20種腫瘤組織,47個細胞系和12種血液細胞內的分布和表達,其結果用至少576張免疫組化染色圖表示,並經專業人員校對和標引,保證染色結果具有充分的代表性。

3、PhosphoSitePlus資料庫

PhosphoSitePlus資料庫是一個由CST和NIH聯合開發的免費資源資料庫,總結歸納了海量通過科學研究發現的蛋白修飾位點,包括磷酸化、甲基化、乙醯化、泛素化等,並且包括一些CST公司發現但未發表的蛋白修飾位點。

該資料庫是動態的、開放的、高度互動並持續更新的。它有助於研究PTMs在正常和病理細胞/組織中的作用,同時它也是發現新的疾病標志物和葯物靶點的有力工具。


性能及歷史

蛋白質資料庫(HPDB),建於2005年5月,動態展示生物大分子立體結構,滑鼠點擊放大分子結構、原子定位、測定原子之間距離,可用於教學或科研。服務對象是能夠熟練使用中文的生命科學、醫學、葯學、農學、林學等領域的大中專學生、教師及科技工作者。

分子結構特徵描述採用漢語,同時提供英文原文以供考證。對於善於使用英文的讀者,我們提倡直接訪問RCSB PDB,一來可以減少網路擁擠,二來可以減少由於HPDB的翻譯不妥帶來的不便。

蛋白質資料庫(HPDB)對每個蛋白質分子結構說明部分做了中文翻譯(最新加入資料庫的分子除外),內容包括分子結構定性描述、樣品的來源、表達載體、宿主、化學分析方法、分子結構組成成分等。這些信息並同蛋白質分子結構數據存儲於資料庫,因此HPDB支持中文查詢。

蛋白質資料庫(HPDB)雖然翻譯了「分子結構說明」部分,但為了保證數據的可靠性和准確性,HPDB對一級結構序列及大分子結構坐標數據等未做任何改動,資料庫保持RCSB PDB核實後的原始實驗數據文件,並保持PDB文件格式和蛋白質分子編號。

I. 分子生物信息資料庫的介紹

分子生物信息資料庫種類繁多。歸納起來,大體可以分為4個大類,即基因組資料庫、核酸和蛋白質一級結構序列資料庫、生物大分子(主要是蛋白質)三維空間結構資料庫、以上述3類資料庫和文獻資料為基礎構建的二次資料庫。

J. 世界上的三大文獻檢索資料庫是哪幾個

世界上的三大文獻檢索資料庫是SCI(科學引文索引 )、EI(工程索引 )、ISTP(科技會議錄索引 ) 。

1、SCI即《科學引文索引》(Science Citation Index),是由美國科學信息研究所(Institute for Scientific Information 簡稱ISI)創建的,收錄文獻的作者、題目、源期刊、摘要、關鍵詞,不僅可以從文獻引證的角度評估文章的學術價值,還可以迅速方便地組建研究課題的參考文獻網路。

SCI創刊於1961年。經過40年的發展完善,已從開始時單一的印刷型發展成為功能強大的電子化、集成化、網路化的大型多學科、綜合性檢索系統。--

2、EI是美國《工程索引》(The Engineering Index)的簡稱。EI創刊於1884年,由美國工程情報公司(Engineering Information Co.)出版發行。

EI是工程技術領域內的一部綜合性檢索工具,報道內容包括:電類、自動控制類、動力、機械、儀表、材料科學、農業、生物工程、數理、醫學、化工、食品、計算機、能源、地質、環境等學科。

3、ISTP是Index to Scientific & Technical Proceedings的縮寫,是美國科學情報研究所的網路資料庫Web of Science Proceedings中兩個資料庫(ISTP和ISSHP)之一。

專門收錄世界各種重要的自然科學及技術方面的會議,包括一般性會議、座談會、研究會、討論會、發表會等的會議文獻,涉及學科基本與SCI相同。

重視程度:

在國際科學界,如何正確評價基礎科學研究成果已引起越來越廣泛的關注。而被SCI、SSCI收錄的科技論文的多寡則被看作衡量一個國家的基礎科學研究水平、科技實力和科技論文水平高低的重要評價指標。

在ISTP、 EI、 SCI這三大檢索系統中,SCI最能反映基礎學科研究水平和論文質量,該檢索系統收錄的科技期刊比較全面,可以說它是集中各個學科高質優秀論文的精粹,該檢索系統歷來成為世界科技界密切注視的中心和焦點。

以上內容參考:網路——三大檢索

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