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生物有哪些序列

發布時間:2022-10-30 15:01:28

『壹』 真核生物的DNA序列可分為幾種類型

DNA序列
部分DNA序列DNA序列或基因序列使用一串字母表示的真實的或者假設的攜帶基因信息的DNA分子的一級結構。
可能的字母只有A, C, G和T,分別代表組成DNA的四種核苷酸-腺嘌呤, 胞嘧啶, 鳥嘌呤, 胸腺嘧啶。典型的他們無間隔的排列在一起,例如序列AAAGTCTGAC。任意長度大於4的一串核苷酸被稱作一個序列。 關於它的生物功能,則依賴於上下文的序列,一個序列可能被正讀,反讀;包含編碼 或者無編碼。DNA序列也可能包含"junk DNA".

『貳』 真核生物DNA的鹼基序列在組成上有哪些特

真核生物的DNA序列表現為鹼基ACGT的序列
原核生物的DNA序列表現為鹼基ACGU的序列
真核生物DNA只存在少量的稀有鹼基
原核生物的DNA中,稀有鹼基種類和數量相對校多
真核生物DNA僅有少量的重復序列和基因
原核生物的染色體分子量較小,基因組含有大量單一重復序列和基因
真核生物基因組存在大量的非編碼序列.包括內含子和外顯子、.基因家族和假基因、重復DNA序列.真核生物的基因組的重復順序不但大量,而且存在復雜譜系.
原核生物不存在大量非編碼區
真核生物的大部分DNA序列集中在染色體上.除了核染色體以外,還存在細胞器DNA,如線粒體和葉綠體的DNA,為雙鏈環狀,可自主復制.有的真核細胞中也存在質粒,如酵母和植物.
原核生物的細胞中除了主染色體以外,還含有各種質粒和轉座因子.質粒常為雙鏈環狀DNA,可獨立復制,有的既可以游離於細胞質中,也可以整合到染色體上.轉座因子一般都是整合在基因組中.

『叄』 真核生物結構基因包含哪些序列

包括編碼區和非編碼區,編碼區又分為內含子和外顯子。在一個基因中,非編碼序列包括非編碼區和內含子部分。

『肆』 高中生物短序列是什麼

基因組中由寡核苷酸串聯,重復排列的DNA序列,構成數量可變的串聯重復序列,其中,微衛星DNA又稱為短串聯重復片列,是一種可遺傳的不穩定的且具有高度多態性的短核苷酸重復序列,具有種類多,分布廣,高度多態性等特點,這種多態性標志已廣泛用於遺傳病及親子鑒定等.
短序列比對中,一般常用的演算法主要有三個:
(1) 空位種子片段索引法,如MAQ、ELAND等,首先將讀段切分,並選取其中一段或幾段作為種子建立搜索索引,再通過查找索引、延展匹配來實現讀段定位,通過輪換種子考慮允許出現錯配(mismatch)的各種可能的位置組合;
(2) Burrows Wheeler轉換法,如Bowtie、BWA、SOAP2等,通過B-W轉換將基因組序列按一定規則壓縮並建立索引,再通過查找和回溯來定位讀段,在查找時可通過鹼基替代來實現允許的錯配;
(3) Smith-Waterman動態規劃演算法,如BFAST,SHRiMP等,利用初始條件和迭代關系式計算兩個序列的所有可能的比對分值,並將結果存放於一個矩陣中,利用動態規劃的方法回溯尋找最優的比對結果。

『伍』 真核生物基因組中的DNA重復序列主要有哪些類型

1.高度重復序列
重復幾百萬次,一般是少於10個核苷酸殘基組成的短片段。如異染色質上的衛星DNA。它們是不翻譯的片段。
2.中度重復序列
重復次數為幾十次到幾千次。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白質(如組蛋白、肌動蛋白、角蛋白等)的基因。
3.單一序列
在整個基因組中只出現一次或少數幾次的序列(也稱為單拷貝序列或單拷貝基因),在小鼠中約占基因組的70%。如珠蛋白基因、卵清蛋白基因、絲心蛋白基因等。實驗證明,所有真核生物染色體可能均含重復序列而原核生物一般只含單一序列。高度和中度重復序列的含量隨真核生物物種的不同而變化。

『陸』 基因有哪些存在形式,真核生物DNA序列有哪些種類

DNA序列
部分DNA序列DNA序列或基因序列使用一串字母表示的真實的或者假設的攜帶基因信息的DNA分子的一級結構.
可能的字母只有A, C, G和T,分別代表組成DNA的四種核苷酸-腺嘌呤, 胞嘧啶, 鳥嘌呤, 胸腺嘧啶.典型的他們無間隔的排列在一起,例如序列AAAGTCTGAC.

『柒』 原核生物啟動子的保護共有序列是什麼

動子都存在保守的共同序列,包括RNA聚合酶識別位點和結合位點。
(1)、-10序列在轉錄起點上游大約-10處,有一個6bp的保守序列TATAAT,稱Pribnow框。此段序列出現在-4到-13bp之間,每個位點的保守性在45%-100%。
頻度:T89A89T50A65A65T100
據預測,Pribnow框中,一開始的TA和第6位最保守的T在結合RNA聚合酶時起十分重要的作用。
目前認為,Pribnow框決定轉錄方向。酶在此部位與DNA結合形成穩定的復合物,Pribnow框中DNA序列在轉錄方向上解開,形成開放型起始結構,它是RNA聚合酶牢固的結合位點,是啟動子的關鍵部位。
RNA聚合酶的結合,誘導富含AT的Pribnow框的雙鏈解開,然後進一步擴大成17個核苷酸長度的泡狀物,在泡狀物中RNA聚合酶從模板鏈開始轉錄RNA產物。
(2)、-35序列
只含-10序列的DNA不能轉錄,在-10序列上游還有一個保守序列,其中心約在-35位置,稱為-35序列,此序列為RNA酶的識別區域。
各鹼基出現頻率如下:T85T83G81A61C69A52,其中TTG十分保守。
-35序列的功能:它是原核RNA聚合酶全酶依靠σ因子的初始識別位點。因此,-35序列對RNA聚合酶全酶有很高的親和性。-35序列的核苷酸結構,在很大程度上決定了啟動子的強度,RNA聚合酶易識別強的啟動子。
-35序列提供RNA聚合酶識別信號,
-10序列有助於DNA局部雙鏈解開,啟動子結構的不對稱性決定了轉錄的方向。

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