如何發現新的生物標記物

Ⅰ 王鐵冠的介紹

王鐵冠發現、鑒定和命名了三個新生物標志物系列（13α正烷基-三環萜烷、甲基三環萜烷和甲基四環萜烷）。其中13α(正烷基)–三環萜烷系列是迄今唯一由中國學者命名的生物標志物，已被美國科學信息研究所(ISI)文獻庫收錄； 建立了低熟油氣成因的系統理論，及時推廣低熟油理論，取得顯著效益。建立有機地球化學與煤岩學結合的煤系烴源岩研究方法，系統提出烴源岩的I-III型顯微組分的非均質性組成，富氫組分「分期生油」的理論。首次論證含硫非烴二苯並噻吩類，作為新分子標志物示蹤石油運移的機理，用以反演石油運移優勢通道，展現油藏充注途徑；運用流體包裹體測溫，結合數值模擬，確定油藏成藏期次與時間；在不同岩性油藏中，重建油田的成藏歷史，預測烴源灶方位，確定有利勘探方向，產生顯著經濟效益。
檢測發現了約100個新的同系物或異物體化合物，補充、完善了文獻中已知的7個系列。在理論研究上，他建立了4類生物標志的成因演化模式，並總結了有關生物標志的成因、演化和分布規律；首次提出並創建了生物標志物相對定量組合判斷生源構成和沉積環境條件的研究方法，還在沉積環境、古植物化學、事件地層學和油氣運移等多個方向上，探索了分子生物標志物的研究意義。這些都屬於該學科的前沿創新成果，有關論文的SCI他人引用達119篇次。
王鐵冠教授是我國最早研究煤成油的專家之一，建立有機地球化學與煤岩學相結合的有效烴源岩研究方法，確證「成煤過程中也可能伴隨有『生油』過程」，煤中瀝青是「由煤或高等植物成因液態烴類衍生物」，被美國化學文摘（CA）和地質文摘（Geo Ref）資料庫收錄；提出煤系烴源岩「分期生油」理念，最早論證滲出瀝青體作為石油生成和初次運移的直接標志，為解決煤成油研究的重大爭議問題提供了充分依據，推動了煤成油理論的發展；最先從生烴機理、資源分布規律等方面全面系統地研究了低熟油理論問題，創造性地建立五種原始母質早期生烴機理和模式，彌補了國際上「乾酪根晚期熱降解生烴」理論的缺陷，發展了陸相生油和石油地質理論，開拓了油氣勘探領域，出版了國內外第一部《低熟油氣形成機理與分布》專著；他是國內率先向研究生開設「分子有機地球化學」，主講「油藏地球化學」為國家培養了一批高層次研究人才，其中碩士生20名，博士生9名。
發表論文174篇(含英文42篇)，合撰專著13部，譯著6部，完成科研報告40份。論著被SCI、EI各收錄31篇，SCI引用達321次。曾獲得「李四光地質科學獎」（地質研究者獎）、中國科學技術發展基金會「孫越崎能源大獎」、中國石油天然氣總公司「鐵人科技成就獎」（銀獎）、國家自然科學獎（二等獎）和科技進步獎（三等獎）以及10項部級科技進步獎。

Ⅱ 尋找產後抑鬱症的生物標志物

預防產婦精神疾病，特別是產後抑鬱症(PPD)，有可能帶來深遠的個人和 社會 結局。越來越多的證據表明，母親的心理 健康 會顯著影響孩子的身體、智力和 情感 發展。產後抑鬱症已被證明會導致暴露兒童的智商降低、語言發展緩慢、注意力缺陷/多動障礙的發病率增加，以及出現行為問題和精神疾病的風險增加。

此外，不良童年經歷(ACE)研究發現，童年時期遭受虐待或家庭功能障礙之間存在強烈的分級關系，而這反過來又與導致成人死亡的多種風險因素有關。ACE研究對家庭中的精神障礙進行了篩查，但許多其他的ACE可能與不良的孕產婦精神 健康 有關，包括葯物濫用、離婚和家庭虐待率的增加。

總之，以孕產婦心理 健康 為目標可以改善家庭中每個人的心理和身體結果，並有可能改善整個社區的狀況。雖然改善孕產婦心理 健康 比預防產後抑鬱症更重要，但如果從預防產後抑鬱症開始，我們至少可以改善母親及其子女的認知和心理 健康 結果。

產後抑鬱症的危險因素

那麼我們如何預防產後抑鬱症呢?

一種可能是，識別在個體水平上強烈預測PPD的標志物或因素，最好是在症狀出現之前。這些統稱為生物標志物：可測量的物質，其存在可指示或預測疾病的發病和結局。

PPD可能是比較容易研究的精神疾病之一，因為你可以識別高危人群並預測疾病何時發生。如果有100個孕婦，其中大約10到15個會在分娩後的最初幾周變得抑鬱。如果這些孕婦有情緒障礙病史，並且沒有服用精神葯物，這個比例甚至更高。通過追蹤孕婦，同時收集潛在的生物標記物，然後確定誰在產後生病，就可以確定預測日後疾病的生物標記物。

有許多因素與PPD的發展相關，例如，懷孕前有精神病史，有包括PPD在內的精神疾病家族史，以及懷孕時抑鬱，這些都與PPD的發展有關。這些都增加了患PPD的幾率，但具體個體的確切風險很難量化。這同樣適用於各種環境風險因素，如 社會 經濟地位、不良生活事件和產科結果(如早產)。作為精神 健康 提供者，我們可以在患者中篩查這些因素，並知道一個人的個人或家族病史增加了風險，但我們不能預測她是否會患產後抑鬱症。

要實現更個性化的預測，也許最有希望的PPD生物標志物是表觀遺傳學。結合環境影響和基因功能，表觀遺傳學檢測DNA的變化，這些變化不會改變DNA序列本身，但它們會開啟或關閉基因的功能。

這一領域的很多文獻都集中在DNA甲基化上，它可以被壓力、葯物使用和激素等環境因素改變。表觀遺傳改變有可能解釋一些精神疾病，這可能是環境壓力觸發的潛在生物易感性的結果。

就產後抑鬱症而言，一種可能是懷孕期間的激素變化導致特定基因的表觀遺傳變化，這些基因要麼是產後抑鬱症的標志，要麼是潛在原因。

尋找個性化生物標志物

Jennifer L. Payne及同事發表了一系列研究，確定了PPD的2個表觀遺傳生物標志物。在第一篇文章中，研究者最初在小鼠的海馬中發現了對高劑量雌激素有反應的基因位點。他們將這些基因位點與患有情緒障礙的孕婦血液樣本中的DNA甲基化差異進行交叉參照，這些孕婦在孕期和產後都進行了前瞻性隨訪。

TTC9B和HP1BP3基因的確切功能目前尚不清楚，但生物信息學分析表明，兩者都可能參與介導大腦突觸可塑性，並與雌激素信號傳導有關。有趣的是，沒有HP1BP3基因功能的小鼠表現出母性關愛受損，導致幼鼠存活率急劇下降，這表明該基因在母性行為中發揮作用。進一步研究這兩個基因的功能及其在PPD中的作用，可能最終有助於闡明PPD的生物學基礎。

總結性思考

研究者正在更大的樣本中驗證這些生物標記物，並檢查當生物標記物的預測與產後精神病學的實際情況不匹配時，可能涉及哪些因素。

下一個重要的科學步驟是嘗試預防研究。當女性在懷孕期間有這些生物標記物時，產後抑鬱症是否可以預防？或者有了這些生物標記物，產後抑鬱症的發展就不可避免嗎？如果產後抑鬱症可以預防，是否有一些干預措施比其他措施更有效？

Ⅲ 如何判斷某蛋白質是否適合作為生物標志物

生物學標志又稱生物標志物或生物學標記。 生物學標志是指外源化學物通過生物學屏障並進入組織或體液後，對該外源化學物或其

所致生物學後果的測定指標，可分為接觸標志、效應標志和易感性標志。

接觸生物學標志是測定組織、體液或排泄物中吸收的外源化學物、其代謝物或與內源性物質的反應產物，作為吸收劑量或靶劑量的指標，提供關於暴露於外源化學物的信息。接觸生物學標志包括內劑量(如化學物原型或其代謝物)和生物效應劑量(如蛋白質加合物、DNA加合物等)兩類標志物。接觸生物學標志如與外劑量相關或與毒效應強度相關，可用於評價接觸水平或建立生物閾限值。

效應生物學標志指機體中可檢測的生化、生理、行為或其他改變的指標，包括早期生物效應標志、結構和(或)功能改變標志、疾病標志3類，反映與不同靶劑量的外源化學物或其代謝物有關聯的健康有害效應的信息。

易感性生物學標志是關於個體對外源化學物的生物敏感性的指標，即反映機體先天具有或後天獲得的對接觸外源性物質產生反應能力的指標。如化學物接觸者體內代謝酶、修復酶及靶分子相關的基因多態性，屬遺傳易感性標志物。環境因素作為應激原時，機體的神經、內分泌和免疫系統的反應及適應能力，亦可影響機體的易感性。易感性生物學標志可用以篩檢易感人群，保護高危人群。

Ⅳ 如何利用計算機方法篩選出生物標志物

類似於分子探針吧，比如說熒游標記或者放射標記過的抗原抗體，互補DNA之類的，到人體能夠精確的反映病理位置。臨床檢驗中一般用來在樣本中篩選致病因子

Ⅳ OCT如何拍到生物標記物

OCT拍到生物標記物的方法如下：通過整合來自整個體積的信息,自動預測OCT橫截面中生物標志物的存在。通過添加雙向LSTM來融合卷積神經網路的輸出來預測各個生物標記物。因此,為了避免使用逐像素注釋來訓練方法,而是提供細粒度的生物標記信息。

Ⅵ 生物醫學上的標志物，給個定義

生物標志物(Biomarker)是指可以標記系統、器官、組織、細胞及亞細胞結構或功能的改變或可能發生的改變的生化指標，具有非常廣泛的用途。生物標志物可用於疾病診斷、判斷疾病分期或者用來評價新葯或新療法在目標人群中的安全性及有效性。
對於疾病研究，生物標志物一般是指可供客觀測定和評價的一個普通生理或病理或治療過程中的某種特徵性的生化指標，通過對它的測定可以獲知機體當前所處的生物學過程中的進程。 檢查一種疾病特異性的生物標志物，對於疾病的鑒定、早期診斷及預防、治療過程中的監控可能起到幫助作用。尋找和發現有價值的生物標志物已經成為目前研究的一個重要熱點。
自1994年蛋白質組概念提出，定量蛋白質組學已經成為蛋白質組學研究的熱點和中心。定量蛋白質組學便是檢測正常與疾病狀態下組織全部表達蛋白質在量上的差別。定量蛋白質組學中的蛋白質定量技術也成為發現生物標志物的重要途徑。
生物標志物是生物體受到嚴重損害之前，在不同生物學水平(分子、細胞、個體等)上因受環境污染物影響而異常化的信號指標。它可以對嚴重毒性傷害提供早期警報。這種信號指標可以是細胞分子結構和功能的變化、可以是某一生化代謝過程的變化或生成異常的代謝產物或其含量，可以是某一生理活動或某一生理活性物質的異常表現，可以是個體表現出的異常現象，可以是種群或群落的異常變化，可以是生態系統的異常變化。
選擇原則
1.所選擇的生物標志物必須具有一定的特異性。
2.所選擇的生物標志物必須具有足夠的靈敏度，即所選標志物的水平與外接觸水平要有劑量一反應關系，在無害效應接觸水平下仍能維持這種關系。
3.所選擇的生物標志物分析的重復性及個體差異都在可接受的范圍內。
4.所選擇的生物標物要有足夠的穩定性，便於樣品的運送、保存、分析。
5.取樣時最好對人體無損生，能為受試者所接受。

Ⅶ OCT如何拍到生物標記物

OCT拍到生物標記物的方法：通過整合來自整個體積的信息，自動預測OCT橫截面中生物標志物的存在。我們通過添加雙向LSTM來融合卷積神經網路的輸出來預測各個生物標記物。因此，我們避免使用逐像素注釋來訓練我們的方法，而是提供細粒度的生物標記信息。

Ⅷ 如何利用生物信息尋找生物標志物

如何利用生物信息尋找生物標志物
1.具有一定的敏感性，敏感性應高於一般生物檢測指標，低劑量下就可測出，可微量操作;
2.具有反應的時間效應。反應要有一定的穩定時間，同時要快速; 3.效應標志物在分子和生化水平上的效應要與高級生物學水平上的效應（如生長、繁殖）緊密相聯，各級水平上的效應要有因果關系; 4.具有一定野外應用價值;
5.要求選取對受試生物損害較小的指標，技術易於掌握；
6.具有特異性與預警性（如AchE);

Ⅸ （五）生物標志物色譜-質譜分析

1.基本原理

生物標志物是指發現於地質體中的化學性質穩定、碳骨架結構具有明顯生物起源特徵的有機化合物。如甾類和萜類化合物烷。這類生物標志化合物一般用色譜-質譜（GC-MS）或色譜-質譜-質譜（GC-MS-MS）連用儀分析鑒定，這種連用儀的特點是充分發揮GC的高分離效能和MS的高鑒別能力之特長，這樣即使有些化合物分不開，靠質量碎片也能把其鑒別出來。

樣品注入GC氣化室，氣化後隨載氣進入毛細柱，分離成的單一組分，依次進入MS離子源。當化合物進入離子源時，用能量為70eV或低於70eV的電子束轟擊，化合物就會失去一個電子變成等質量的分子離子，不同質量的分子離子或碎片離子（A⁺、B⁺、C⁺等）可在多個軌道中運行，經離子光學系統將其聚焦成具有一定速度的離子束，射入連續改變磁場強度的質量分析器，使具有不同質量的離子按從小到大的順序進行方向、能量聚焦，並通過收集狹縫射到電子倍增器上，放大後被計算機採集下來，經數據系統處理，即可得到定性用的質譜圖或質量碎片圖。

2.樣品要求

測定甾烷、萜烷的飽和烴組分，應按有機質族組分柱層析分析方法獲取；當正構烷烴含量高時，會影響檢測效果，應採用尿素絡合或分子篩除去。

色譜進樣方式為樣品直接或用溶劑稀釋後分流或無分流進樣。質譜離化方式為電子轟擊；解析度大於500 或全質量范圍為一個質量單位，掃描方式為全掃描或多離子檢測（MID）。

3.地質應用

色譜-質諧分析鑒定所提供的萜烷、甾烷有機地化指標，是目前公認的可靠和有效的有機地化參數，主要用於生油岩評價（類型、成熟度）、油源對比、原油運移、生物降解、原油類型的劃分、沉積環境的研究等方面，都取得了明顯效果，有效地指導了油氣勘探工作。

Ⅹ 如何建立有效生物標志物

如何建立有效生物標志物
現代生物技術是以DNA重組技術的建立為標志。
傳統生物技術的技術特徵是釀造技術，近代生物技術的技術特徵是微生物發酵技術，現代生物技術的技術特徵就是以基因工程為首要標志。

重組DNA技術（recombinantDNAtechnique）又稱遺傳工程，在體外重新組合脫氧核糖核酸（DNA）分子，並使它們在適當的細胞中增殖的遺傳操作。這種操作可把特定的基因組合到載體上，並使之在受體細胞中增殖和表達。因此它不受親緣關系限制，為遺傳育種和分子遺傳學研究開辟了嶄新的途徑。