⑴ 生物化學中的螺旋構象與多肽鏈之間的計算怎麼算
蛋白質中常見的二級結構,肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結構,螺旋是靠鏈內氫鍵維持的.每個氨基酸殘基(第n個)的羰基與多肽鏈C端方向的第4個殘基(第4+n個)的醯胺氮形成氫鍵.在古典的右手α-螺旋結構中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升0.15nm.
①肽鏈骨架圍繞一個軸以螺旋的方式伸展;
②螺旋形成是自發的,肽鏈骨架上由n位氨基酸殘基上的-C=O與n+4位殘基上的-NH之間形成的氫鍵起著穩定的作用;被氫鍵封閉的環含有13個原子,因此α螺旋也稱為3.6/13螺旋;
③每隔3.6個殘基,螺旋上升一圈;每一個氨基酸殘基環繞螺旋軸100°,螺距為0.54nm,即每個氨基酸殘基沿軸上升0.15nm;螺旋的半徑是0.23nm;Φ角和Ψ角分別為-57°和-48°。
⑵ 【生物化學】一個含有78個氨基酸殘基組成的α螺旋肽鏈 其軸長是 ,怎樣計算
典型的蛋白質α-螺旋結構中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升0.15nm。
因此,78個氨基酸的α-螺旋肽鏈,共沿螺旋軸上升0.15*(78/3.6)= 37.5 nm