Ⅰ 什麼是啟動子的保守性
什麼是啟動子的保守性
想要弄懂這個問題首先要了解保守性的概念.
保守性指的是在生物進化過程中基因的變異很小,保守區域指的是進化過程中不同生物體都保留下來的相似性很高的DNA序列.
啟動子的保守性,也就是不同生物體啟動子那段DNA序列的相似性.
啟動子保守性體具體現————
合成開始位點的上游大約10bp和35bp處有兩個共同的順序,稱為-10和-35序列.這兩個序列的共同順序如下,-35區「AATGTGTGGAAT」,-10區「TTGACATATATT」.大多數啟動子均有共同順序(consensus sequence),只有少數幾個核苷酸的差別.
Ⅱ 生物化學中的「保守」指的是什麼
保守是指在生物進化的過程中，某些生物大分子或細胞結構等基本沒有變化或變化不明顯，較穩定地存在。比如染色體中的組蛋白（各個真核生物的組蛋白基本相同）。
保守意味著其形態、結構或功能已經達到趨於完美的地步，不需要再大幅度改變，這也證明了生物的同源性。
望採納，謝謝。
Ⅲ 生物化學中DNA的保真性跟保守性一樣嗎
不一樣。保真性是說DNA上的遺傳信息不容易發生改變，比如復制時的校對、突變修復等機制，保證其穩定遺傳。這是說整條DNA，或者說整個基因組都不容易突變。保守性是指DNA上的某一段序列，在進化中相對於其它區域更加穩定。保守性說明這段序列更加重要，涉及生命過程中的關鍵事件，突變容易導致不利後果。
Ⅳ 【求助/交流】有沒有人幫我解釋一下什麼是基因的保守性
susizheng(站內聯系TA)保守個人理解就是沒有差別或差別很小吧。 基因的保守區域個人認為指不同來源的同一個基因在某些區域沒有差別或者差別很小，這些區域一般在基因的首和尾。甄偉(站內聯系TA)保守性指的是在生物進化過程中基因的變異很小，主要是指近緣物種之間，保守區域指的是，基因序列中的一段基因變異性小liyong1981(站內聯系TA)保守的一般比較重要滴，不會輕易突變滴，很可能引起致死效應滴，一般某一種群，近緣物種有相同的某些基因序列，在形態學，胚胎學，等等起著至關重要的作用～:cool::secret:聽雪看山(站內聯系TA):tiger28:謝謝解答問題的朋友們，偶明白啦！！
Ⅳ 何為蛋白質的保守性
比如說人血紅蛋白的氨基酸序列和猴子的血紅蛋白氨基酸序列差不了多少
就是說這種蛋白在進化中是高度保守的(不怎麼變),通過他們的比較我們可以確定人類與其它物種親緣關系的遠近~
當然蛋白質的氨基酸序列是由基因決定的
補充,反駁一下樓上的:1 分子人類學研究方法及原理
分子人類學這一概念最早於1962年由Sarich和Wilson用不同結構的生物分子研究人類進化時提出[1]，指的是通過分子生物學手段對不同人群中同源蛋白質、核酸等生物大分子進行序列分異度比對來研究人類的起源和進化等人類學問題的方法。在分子人類學研究早期，由於針對核酸研究的分子生物學實驗技術和有關資料庫還處於探索和構建階段，蛋白質是當時分子人類學研究中的主要載體
早在20世紀初，Reichert和Brown[2]比較分析了不同綱目生物的血紅蛋白序列，發現血紅蛋白序列的差異與物種之間親緣關系的遠近有著直接聯系
Ⅵ 在生物學中，「高度保守」是什麼意思
通俗點講，就是在長時間的生物進化中，序列變化極小甚至沒有改變。
高度保守序列一般對生物體有著極其重要甚至不可替代的功能。比如細胞色素c，即使在親緣關系很遠的物種中序列差異也不大。
Ⅶ 生物信息學筆記-術語篇
它是一種度量兩個變數間相關程度的方法。它是一個介於 1 和 -1 之間的值，其中，1 表示變數完全正相關， 0 表示無關，-1 表示完全負相關。
r值就是皮爾遜相關系數的大小，代表了相關的強度，即兩個變數共變性的程度，取值范圍為（-1,1）。
p值是顯著性，與皮爾遜相關顯著性檢驗有關，P<0.05時表示相關顯著，即在當前的樣本下可以明顯的觀察到兩變數的相關，兩個變數的相關有統計學意義。
能提供有關數據位置和分散情況的關鍵信息，尤其在比較不同的母體數據時更可表現其差異。
如上圖所示，標示了圖中每條線表示的含義，其中應用到了分位值（數）的概念。
隨訪研究，如對 某人群進行跟蹤，直至出現一個特殊事件或終點，如死亡、癌症復發等，對所有研究對象從某特定時間點開始追蹤，記錄出現特殊事件的時間。通常，當所有研究對 象出現該事件時研究才結束，但也有些研究對象可能失訪，或者研究提前結束，這樣就有一些對象的結局未知，對這些對象記錄跟蹤的時間（截尾數據）。
假設檢驗 是推斷統計中的一項重要內容。用SAS、SPSS等專業統計軟體進行假設檢驗，在假設檢驗中常見到P值( P-Value，Probability，Pr)，P值是進行檢驗決策的另一個依據。
P值即概率，反映某一事件發生的可能性大小。統計學根據顯著性檢驗方法所得到的P 值，一般以P < 0.05 為顯著， P<0.01 為非常顯著，其含義是樣本間的差異由抽樣誤差所致的概率小於0.05 或0.01。實際上，P值不能賦予數據任何重要性，只能說明某事件發生的機率。
主要包含六個數據節點，將一組數據從大到小排列，分別計算出他的上邊緣，上 四分位數 Q3， 中位數 ，下四分位數Q1，下邊緣，還有一個 異常值 。
是表示這兩組之間的生存率是否有差異。
因為一般生存分析研究的都是一個實驗組的治療方法之類的， 一個對照組的傳統方法之類。通過生存分析對比，可以發現兩組生存率之間是否存在差異，繼而說明兩種實驗處理是否有差異，或者哪種處理更有效
是整體比較，比如你的生存時間是5年的，那自然是比較整體5年下來的生存率，如果你的生存時間是10年的跟蹤數據，那自然是比較整體10年下來的生存率。
生存分析比較的生存率，本來就是一個整體一段時間持續下來的生存率，而不是單個時間點的生存率
數據標准化是指：數值減去均值，再除以標准差;所謂中心化， 是指變數減去它的均值.
又稱蛋白質印跡(Western blotting)，是一種藉助特異性抗體鑒定抗原的有效方法。該方法是在凝膠電泳和固相免疫測定技術基礎上發展起來的一種新的免疫生化技術，既具有凝膠電泳的高解析度又具備固相免疫測定的高特異性和高靈敏性，可檢測1－5ng的中等大小蛋白。其優點是方法簡便、標本可長期保存、結果便於比較，故被廣泛應用於分子生物學等領域，成為一種常用的一種研究方法。
保守性一般是在進化理論中應用較多，「保守性好」指的是發生突變的幾率低。以蛋白為例，一般用於進化或物種親緣關系分析的蛋白都含有可變部分——非保守區，和穩定部分——保守區。
順式作用元件(cis-acting element)是指DNA分子上對基因表達有調節活性的特定核苷酸序列。順式作用元件的活性隻影響同一DNA分子上的基因。這種DNA序列多位於基因上游或內含子中。
真核基因的順式作用元件按其功能可以分為：啟動子、增強子和靜止子。
啟動子的結構和功能
啟動子是轉錄因子和RNA聚合酶的結合位點，位於受其調控的基因上游，鄰近基因轉錄起始點，是基因的一部分。
增強子的結構和功能
增強子（enhancer），又稱強化子（transcriptional enhancer），是一種遠端調控元件，至少距轉錄起始點上游100bp以上，通常位於－700～－1000處，所以又稱為上游激活序列(upstream activator sequence, UAS)。
增強子也要通過與特定的蛋白質因子(轉錄因子)結合而實現其對轉錄的增強作用。
靜止子
是一種類似增強子但起負調控作用的順式作用元件。有人稱為沉默基因。靜止子與相應的反式作用因子結合後，可以使正調控系統失去作用。
不論是啟動子還是增強子序列，他們的轉錄調節功能都是通過與特定的DNA結合蛋白的相互作用而實現的。
真核生物的RNA聚合酶與原核生物的RNA聚合酶不同，它本身不能啟動轉錄，純化了的真核生物RNA聚合酶在體外是不能啟動轉錄的。因此必須事先有一套轉錄因子裝配到啟動子上，RNA聚合酶才能啟動轉錄。
這些轉錄因子一般並不是RNA聚合酶的組成成分。
能直接或間接識別各種順式調控元件並與之結合從而調控基因轉錄效率的各種蛋白質分子稱為反式作用因子 (trans-acting factor)。
能激活真核生物基因轉錄的蛋白質稱為轉錄因子(transcription factor, TF)。轉錄因子是參與正調控的反式作用因子，是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需要的輔助因子。
是根據抗原抗體的特異性結合檢測復雜樣品中的某種蛋白的方法。
將混合抗原樣品在凝膠板上進行單向或雙向電泳分離, 然後取 固定化 基質膜與凝膠相貼。在印跡紙的自然吸附力、 電場力 或其它外力作用下, 使凝膠中的單一抗原組份轉移到印跡紙上, 並且固相化。最後應用免疫覆蓋液技術如免疫同位素探針或免疫酶探針等, 對抗原固定化 基質 膜進行檢測和分析。
有時稱為短干擾RNA（short interfering RNA）或沉默RNA（silencing RNA），是一個長20到25個 核苷酸 的雙股RNA，在生物學上有許多不同的用途。
CpG表示核苷酸對，其中G在DNA鏈中緊隨C後。CpG對很少出現在人類基因中。然而，在許多基因的 啟動子 （promotor）或 轉錄起始位點 （transcription start site，TSS）區域周圍， 甲基化 經常被抑制。這些區域包含濃度相對較高的CpG對，與染色體一起稱作 CpG島 ，其長度通常在幾百到幾千核苷酸的長度內變化。
CpG雙核苷酸在人類基因組中的分布很不均一，而在基因組的某些區段，CpG保持或高於正常概率，這些區段被稱作CpG島，在哺乳動物基因組中的1~2kb的DNA片段，它富含非甲基化的CpG雙倍體。
所謂陰性和陽性指的是細胞生存下來的條件。陽性選擇指的是只有反應的細胞才能生存，否則凋亡。陰性選擇指的是只有不反應的細胞才能生存，否則凋亡。
對於B細胞來說
陰性選擇指的是只有在骨髓發育中不予自身抗原反應的B細胞才能生存；陽性選擇指的是在外周在體細胞高頻突變的過程中能高親和力識別T細胞提呈的B細胞才能增殖。B細胞是先陰選後陽選
對於T細胞來說
陽性選擇指的是只有在胸腺皮質發育中識別MHC分子的T細胞才能生存；陰性選擇指的是只有在胸腺髓質發育中不予自身抗原反應的T細胞才能生存；T細胞是先陽選後陰選
一般指基因組中由短的重復單元(一般為1～6個鹼基)組成的DNA串聯重復序列。
微衛星DNA符合孟德爾遺傳模式，共顯性表達，廣泛分布於真核生物的基因組中，包括編碼區和非編碼區.研究表明，可能是DNA復制過程中的「鏈滑」(strand slippage)現象造成微衛星DNA多態性信息容量(polymorphic information content, PIC)較高.
由於微衛星具有數量多、在基因組內分布均勻、多態性信息豐富、易於檢測等優點被作為優良的遺傳標記(genetic marker)而得到廣泛應用。
根據重復單元的構成與分布,微衛星DNA序列被分為3種類型：單一型(pure)，復合型(compound)和間斷型(interrupted), 例如:
單一型:ATATATATATATATATATATATAT
復合型: ATATATCACACACACACACAC
間斷型: ATATATCA ATATATCA ATATATA
某一物種的染色體圖譜（也就是我們所知的連鎖圖譜），顯示所知的基因和/或遺傳標記的相對位置，而不是在每條染色體上特殊的物理位置。由遺傳重組測驗結果推算出來的、在一條染色體上可以發生的突變座位的直線排列（基因位點的排列）圖。
遺傳圖譜即遺傳連鎖圖譜，是基因組研究中的一個重要組成部分，它是指基因組中基因以及專一的多態性標記之間相對位置的圖譜。即通過兩點測驗和三點測驗對統計的各種帶型個體數進行連鎖分析計算，建立連鎖群。也可從第二個標記開始，測驗與前一個標記是否協同分離。根據分離資料，用最大似然法估計不同標記位點間的重組率數值並轉換成遺傳距離，連鎖的遺傳標記間距離，一般用cM表示，IcM為同源染色體配對期望交換值1%的染色體長度。隨著計算機技術的發展，目前已有多個構建遺傳圖譜的軟體，研究者用的較多的軟體主要有MapMaker及 JoinMap 3.0 。
在某些情況下，待檢驗樣本中不含待測物質或者含有但是濃度很低，為了證明自己建立的方法能對樣本中待測物質進行有效的檢測，可在待檢樣本中加入一定量的待測物質（外標）來進行該方法檢測能力的驗證。有時，這種加入外標的物質，也可用作為陽性對照。
In genetics, a mosaic, or mosaicism describes the presence of two or more populations of cells with different genotypes in one indivial, who has developed from a single fertilized egg.Mosaicism has been reported to be present in as high as 70% of cleavage stage embryos and 90% of blastocyst-stage embryos derived from in vitro fertilization.
WGA是一組對全部基因組序列進行 非選擇性擴增的技術，其目的是在沒有序列傾向性的前提下大幅度增加 DNA 的總量。其中最具代表性方法是 DOP-PCR 和 PEP-PCR。 DOP-PCR 和 PEP-PCR 的基本原理都是通過其隨機引物與基因組 DNA 多處退火從而使大部分基因組序列得到擴增。DOP-PCR 的引物是由其 3′和 5′端的特異核苷酸序列和中間的 6 個核苷酸構成的隨機引物組成。PEP-PCR 的引物是由15 個隨機核苷酸組成的完全隨 機引物。
Ⅷ 如何知道基因是否是高度保守性的
保守性一般是在進化理論中應用較多，「保守性好」指的是發生突變的幾率低隨著遺傳學和分子生物學的進步，進化方面的研究已經遠遠超過物種外在表型的水平了。科學家研究遺傳物質，一般是DNA的序列發現，分類學上親緣關系較近的物種的基因信息之間的差異也較小，而親緣關系較遠的物種間基因信息之間的差異也較大。同時由於DNA經過轉錄和翻譯表達蛋白，故蛋白質中的氨基酸序列與DNA含的遺傳信息也存在很多相關性。故對不同物種間同種蛋白的氨基酸序列分析也是用於研究進化問題的有力方法。以蛋白為例，一般用於進化或物種親緣關系分析的蛋白都含有可變部分——非保守區，和穩定部分——保守區。對於進化上相關的物種，同種蛋白的保守區序列高度相似（前提是都含有此種蛋白）；而非保守區序列因物種間差異的增大而逐漸明顯，這是變異加自然選擇在分子水平的結果。並且科學家通過計算非保守區序列的變換特點發現，自然變異幾率基本固定，故還能從含同一蛋白的不同物種間計算它們在進化中大致的相差年代。故更准確地說，要分析不同物種間差異性，更多要分析其生物大分子的非保守區序列差異