⑴ 如何對一株細菌作出種屬的鑒定
（1）常規鑒定 常規鑒定內容有形態特徵和理化特性。形態特徵包括顯微形態和培養特徵；理化特性包括營養類型、碳氮源利用能力、各種代謝反應、酶反應和血清學反應等。（2）BIOLOG碳源自動分析鑒定 BIOLOG鑒定系統以微生物對不同碳源的利用情況為基礎，檢測微生物的特徵指紋圖譜，建立與微生物種類相對應的資料庫。通過軟體將待測微生物與資料庫參比，得出鑒定結果。（3）分子生物學鑒定 提取細菌基因組DNA，然後PCR擴增16srDNA片段並測序，將結果與GeneBank或者Eztaxon對比分析，一般序列相似度在97%以上就可以認為是同種細菌，該方法也是目前微生物分類學研究普遍採用的鑒定方法。——源自網路
⑵ 微生物的菌種鑒定方法與步驟（鑒定到「株」一級）
首先如果你的菌株是自然界中分離得到，就只能鑒定到種，不能鑒定到株，因為多多少少和其他株系的細菌有區別，即便你做了一些特徵的鑒定，發現和某一株細菌一模一樣，你也沒有理由說你的細菌就是那一株細菌，因為你不可能把所有的特徵都做完，株和株之間的關系就相當於不同的人之間的關系，世界上不可能有完全相同的兩個人。除非你知道你的細菌本來就是某一株細菌擴增出來的（而且要保證沒有變異，否則就是一個新株），可是這樣就沒必要鑒定了。
菌種鑒定一般就只要提取基因組DNA，然後PCR擴增16srDNA片段，上GeneBank或者Eztaxon對比即可。一般序列相似度在97%以上就可以認為是同種細菌（當然也有例外，DNA序列僅僅是一個參考指標）。
⑶ 如何利用pcr技術來研究環境微生物
使用聚合酶鏈式反應-變性梯度凝膠電泳技術(PCR-DGGE)考查了天津某再生水處理廠膜生物反應器(Membrane
Bioreactor,簡稱MBR)培養馴化直至正常運行全過程中總細菌群落結構的演替情況.結果表明,在MBR環境中,接種的傳統活性污泥中的微生物群落在幾天內發生了較大的變化,在進污水馴化時,微生物群落也遭受了沖擊,最後經過培養馴化趨於穩定,一些菌種逐漸成長為頂級優勢微生物,在反應器內占據主導地位.最終該反應器逐漸形成了自己獨有的微生物群落生態系統.另外,對該微生物群落的部分優勢總細菌進行了克隆測序和系統發育樹分析,通過鑒定獲得的10條總細菌的16S
rDNA序列,它們分別與氣單胞菌屬、假單胞菌、亞硝酸菌屬、叢毛單胞菌屬和桿菌的同源性在97%以上,這些優勢微生物在MBR反應器去除有機物的過程中起到了關鍵的作用.