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有哪些查詢生物信息的網站

發布時間:2023-02-02 00:50:46

⑴ 誰能提供一下生物文獻方面的網站 謝啦!!!

免費的有很多,比如生物谷,生物探索、大分子生物醫葯網等等,文獻資料都比較多的

⑵ 國內有哪些好的生物資訊網站

中國科學院微生物研究所
中國科學院水生生物研究所
中國科學院生物物理研究所
中國科學院遺傳與發育生物研究所
中國科學院成都生物研究所
中國科學院南京地質古生物研究所
中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所
中國農業科學院生物技術研究所
中國科學院西北高原生物研究所
中國科學院病原生物研究所
中國科學院青島生物能源與過程研究所
中國醫學科學院生物醫學工程研究所
上海生物製品研究所
長春生物製品研究所
武漢生物製品研究所
北京生物製品研究所
蘭州生物製品研究所
成都生物製品研究所
廣東省微生物研究所
山東省科學院生物研究所
陝西省微生物研究所
安徽省生物研究所
雲南省微生物研究所
湖南省生物研究所
江蘇省生物研究所
福建省生物研究所
吉林省生物研究所
河北省生物研究所
河南省生物研究所
山西省生物研究所
貴州省生物研究所
遼寧省生物研究所
甘肅省生物研究所
海南省生物研究所
浙江省生物研究所
福州大學生物工程研究所
北京大學系統生物醫學研究所
西安交通大學生物工程醫學研究所
南京大學生物物理研究所

⑶ 學習生物信息學有哪些比較好的網站或論壇

首先,生物信息學這個概念太大了,沒有詳細的方向。
1.如你想走序列分析可以參考NCBI,RDP,這兩個網站是做生物分子研究最常用的,下面這個裡面的推薦網站可以看看,建議不要都去研究(如果你精力有限的話,學好NCBI這個是基礎),http://blog.renren.com/share/221052439/453520050和http://www.cnblogs.com/emanlee/archive/2011/08/07/2130360.html。
2.論壇的話:生物秀,小木蟲,生物信息學天空,丁香園等等

建議根據自己的需要或者研究方向,專門去攻破一項,比如核苷酸,比如蛋白質等等。要想全部學習構建完整系統的生物信息學框架,我個人覺得相對比較難。以上僅供參考,自己斟酌。加油。

⑷ 請問有哪些關於生物方面較好的網站,有專家的聯系方式那是最好的了

http://www.bioon.com/生物谷www.ebiotrade.com生物通www.bioguider.com生物導航網www.bio-equip.com中國生物器材網www.bio-soft.net生物軟體網www.biosino.org中國生物信息www.shengwu.com.cn中國生物教學網cmbi.bjmu.e.cn中國醫學生物信息網www.biotech.org.cn中國生物技術信息網www.ibioo.com綠谷生物網

⑸ 國際上三個大的生物信息中心有哪些

一 美國國家生物技術信息中心NCBI(National Center for
Biotechnology Information)
NCBI是一個極具人性化的網站,網站的主頁清晰的闡明了NCBI所做的工作及相關領域最新的熱點內容,新聞等。為了方便使用者更加熟練使用網站資源,NCBI在主頁清晰的標注了站點導航,非常便於初學者熟悉和掌握NCBI的站內資源。
另外,NCBI將其網站資源列於主頁左側,其中包括:SITE MAP, About NCBI, GenBank, Literature
databases, Molecular databases, Genomic biology, Tools, Research at
NCBI, Software engineering, Ecation, FTP site, Contact
information等等。
二EBI(European
Bioinformatics Institute)歐洲生物信息研究所The European
Bioinformatics Institute(EBI)是目前國際上幾個重要分子生物信息網站之一,位置座落於英國The Wellcome Trust
Genome Campus。EBI的任務就是確保分子生物與基因體的研究信息可以公開並且免費提供給科學社群,以促進科學進步。
EBI所提供的服務包括建立/維護資料庫、提供分子生物相關信息服務、執行分子生物與計算分子生物研究;所服務的對象與研究人員擴及各產業,包括分子生物、基因體、醫學與農業學術研究、農業、生物技術、化學與制葯工業。
三DDBJ(DNAData Bank of
Japan)日本核酸資料庫
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)
設立在日本國家遺傳研究所(NIG),於1986年開始DNA資料庫的構建工作。從一開始,DDBJ就作為國際性DNA資料庫之一,發揮著重要的作用。它
首先反映的是日本國內資料庫的資源,並與NCBI,EBI進行頻繁的國際性合作。DNA序列中蘊含了大量的數據資源,比起其它生物學數據,它在闡述進化方面的作用更為直接。因此,探求DNA資料庫,不僅是在生命科學方面的研究,更是為人類的發展謀福利。
DDBJ是日本唯一的DNA資料庫,它從研究者那裡收集DNA 序列並且給數據提交者一個國際公認的編碼。DDBJ
主要從日本研究者那裡收集數據,當然,它也接受外國研究者的數據並給以編碼。

⑹ 國外與生物信息學相關的網站有哪些

國外與生物信息學相關的網站有哪些
生物信息學高度依賴於網路。實際上,你需要的幾乎所有資源,都可以從網上下到。你需要關注你研究領域所需要的那些,而不是全部的資源。

我原來常用的:

NCBI:持有INSDC的節點。網站上有核酸、蛋白、基因名、基因組名等等的搜索工具,以及BLAST序列比對搜索工具,PUBMED文獻資料庫,Taxonomy數據,COG蛋白家族庫等等。FTP可以下到它全部的資料庫,BLAST的單機程序,以及各種工具程序。

EBI:和NCBI類似,歐洲搞的對等物。感覺EBI網站比NCBI要清楚簡潔。另外EBI網站整合了更多的工具,比如多序列比對。

Uniprot:全蛋白庫。NCBI和EBI的蛋白庫來源於此。目前包括兩部分:SwissProt是人工校對過的,TrEMBL是自動校對的。

Pfam:蛋白家族庫。可以使用配套的HMMER進行搜索。比BLAST能找到更遠緣的東西,而且找到的東西是結構域。
Rfam:RNA的,類似Pfam。

RDP:16S rRNA庫。除了序列,它還有一個基於K-mer naive Bayesian model的rdp classifier,可以對輸入序列進行物種分類,效率和准確性較直接使用BLAST更高。
GreenGenes:也是16S庫,不過它只收集比較全的序列。它提供了一個16S的標准化比對,並基於這個東西搞了個物種分類工具。

EMBOSS:一個工具包,提供了幾百個進行序列操作的工具。

BioPerl、BioPython:Perl和Python的生物學模塊。
R:類似matlab的語言,有一大堆的生物學包。

SOAP:華大基因搞的高通量測序工具包,有de-novo拼接的,有mapping的,還有一些後續分析的。
bowtie:一個用於序列mapping的軟體。
samtools:用於操縱、分析高通量序列mapping的結果。功能非常靈活,但有點復雜。
fastx toolkit:用來操縱高通量測序序列的工具包。

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