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生物標志物有哪些

發布時間:2022-02-25 09:34:01

Ⅰ 基因層面的分子生物標志物有哪些

摘要 生物標志物(Biomarker)是指可以標記系統、器官、組織、細胞及亞細胞結構或功能的改變或可能發生的改變的生化指標,具有非常廣泛的用途,目前生物標志物可用於疾病診斷、判斷疾病分期或者用來評價新葯或新療法在目標人群中的安全性及有效性。

Ⅱ rna分子生物標志物有哪幾種類型與dna分子生物標志物相比有何優勢

生物大分子在人體內主要指核酸和蛋白質;是由生物單分子構成的,像氨基酸、脂肪酸等都叫做生物單分子。人體內DNA和RNA由核苷酸長鏈構成,DNA雙鏈,RNA單鏈。核苷酸鏈是由核苷酸構成的。人體內核苷酸種類DNA:腺嘌呤脫氧核糖核苷酸、鳥嘌呤脫氧核糖核苷酸、胞嘧啶脫氧核糖核苷酸、胸腺嘧啶脫氧核糖核苷酸;RNA有:腺嘌呤核糖核苷酸、鳥嘌呤核糖核苷酸、胞嘧啶核糖核苷酸、尿嘧啶核糖核苷酸。mRNA通過穿越核孔進出細胞核。核孔有選擇性的。mRNA(即信使RNA)、某些蛋白質。某些病毒的DNA(高中階段不涉及)

Ⅲ 生物醫學上的標志物,給個定義

生物標志物(Biomarker)是指可以標記系統、器官、組織、細胞及亞細胞結構或功能的改變或可能發生的改變的生化指標,具有非常廣泛的用途。生物標志物可用於疾病診斷、判斷疾病分期或者用來評價新葯或新療法在目標人群中的安全性及有效性。
對於疾病研究,生物標志物一般是指可供客觀測定和評價的一個普通生理或病理或治療過程中的某種特徵性的生化指標,通過對它的測定可以獲知機體當前所處的生物學過程中的進程。 檢查一種疾病特異性的生物標志物,對於疾病的鑒定、早期診斷及預防、治療過程中的監控可能起到幫助作用。尋找和發現有價值的生物標志物已經成為目前研究的一個重要熱點。
自1994年蛋白質組概念提出,定量蛋白質組學已經成為蛋白質組學研究的熱點和中心。定量蛋白質組學便是檢測正常與疾病狀態下組織全部表達蛋白質在量上的差別。定量蛋白質組學中的蛋白質定量技術也成為發現生物標志物的重要途徑。
生物標志物是生物體受到嚴重損害之前,在不同生物學水平(分子、細胞、個體等)上因受環境污染物影響而異常化的信號指標。它可以對嚴重毒性傷害提供早期警報。這種信號指標可以是細胞分子結構和功能的變化、可以是某一生化代謝過程的變化或生成異常的代謝產物或其含量,可以是某一生理活動或某一生理活性物質的異常表現,可以是個體表現出的異常現象,可以是種群或群落的異常變化,可以是生態系統的異常變化。
選擇原則
1.所選擇的生物標志物必須具有一定的特異性。
2.所選擇的生物標志物必須具有足夠的靈敏度,即所選標志物的水平與外接觸水平要有劑量一反應關系,在無害效應接觸水平下仍能維持這種關系。
3.所選擇的生物標志物分析的重復性及個體差異都在可接受的范圍內。
4.所選擇的生物標物要有足夠的穩定性,便於樣品的運送、保存、分析。
5.取樣時最好對人體無損生,能為受試者所接受。

Ⅳ 常見的生物標志物有哪些

常見的生物標志物一般來說比如打油漆或者說是給他腳板一些東西,大部分標記的方法都是通過這兩種方式給他進行一些標記。

Ⅳ 什麼是生物標志物檢測

1.具有一定的敏感性,敏感性應高於一般生物檢測指標,低劑量下就可測出,可微量操作;
2.具有反應的時間效應。反應要有一定的穩定時間,同時要快速; 3.效應標志物在分子和生化水平上的效應要與高級生物學水平上的效應(如生長、繁殖)緊密相聯,各級水平上的效應要有因果關系; 4.具有一定野外應用價值;
5.要求選取對受試生物損害較小的指標,技術易於掌握;
6.具有特異性與預警性(如AchE);

Ⅵ 生物標志物分布與組成

鹽湖盆地特殊的沉積環境及生態條件和有機質生源構成,決定了由這一特定環境形成的烴源岩生成的原油常具有特殊的生物標志物組合,這在鏈烷烴和環狀生物標志物的分布與組成上均充分得到了印證。

一、鏈烷烴系列

與鹽湖盆地的烴源岩一樣,未—低熟原油中的鏈烷烴主要包括正構烷烴和類異戊二烯烷烴,其他支鏈烷烴的豐度相對較低。

1.正構烷烴系列

圖5-3 江漢鹽湖盆地未—低熟油正構烷烴系列碳數分布

圖5-3是江漢鹽湖盆地不同未—低熟油中正構烷烴系列碳數分布圖。依據其分布特徵可分成三大類,其一是以產自光明台構造潛一段未成熟油為代表,正構烷烴系列呈現出雙峰態分布,前峰群主峰碳數為nC15和nC17,後峰群主峰碳數為nC28,且前後兩峰群豐度相當,這類原油中正構烷烴系列的奇偶優勢不明顯,OEP 和CPI值介於1~1.16 之間,且具有輕重比低(<1.0)的特徵(表5-3);其二是以產自廣華構造的潛一段未成熟油為代表,這類原油中的正構烷烴系列基本呈單峰態,主峰碳數nC17,且有一定的偶碳優勢,CPI、OEP值小於1.0,輕重比也相對較高(>1.0);其三是以產自王場油田的高含硫的重質原油為代表,其正構烷烴系列也呈現出雙峰態分布,前主峰為nC17,後主峰為nC28,且前主峰群的相對豐度明顯低於後峰群,其輕重比異常低。另一最顯著的特點是這類原油nC20~nC30之間正構烷烴具有強烈的偶碳優勢,其CPI值<0.7,OEP值小於0.8,而表徵偶碳優勢強弱的CPI1值則高達1.70。這一系列的特徵均表明這類原油比較特殊,其烴源岩的性質及形成的環境均不同於該盆地一般意義上的未—低熟油。

表5-3 江漢鹽湖盆地未—低熟油中鏈烷烴地比參數

未—低熟油中正構烷烴系列的分布特徵主要是由其烴源岩的性質和有機質生源構成決定,雙峰態正構烷烴的分布特徵一般認為指示了低等生物藻類和陸源有機質的雙重貢獻。但對於

以上沒有明顯奇碳優勢的正構烷烴而言,它不一定來源於陸源有機質,而更可能來源於鹽湖環境中的某些低等生物如藻類等。這是因為鹽湖盆地有相當一部分烴源岩中的直鏈脂肪酸、醇、酮系列均不具明顯的偶碳優勢(見第三章),而與陸源有機質有關的直鏈脂肪酸、醇、酮常具明顯的偶碳優勢。換言之,由這些不具偶碳優勢的直鏈脂肪酸、醇、酮生成的正構烷烴顯然也不會出現碳數優勢(奇碳或偶碳優勢),而那些具有偶碳優勢的直鏈脂肪酸、醇、酮生成的正構烷烴應具有碳數優勢。就江漢鹽湖盆地未—低熟而言,正構烷烴系列具有偶碳優勢的原油並不十分普遍,大部分原油中的正構烷烴系列均不具明顯的偶碳優勢,而且未—低熟原油中正構烷烴是否具偶碳優勢,似乎與其成熟度的相對高低無關,如光明台和廣華構造的潛一段原油C2920S/(20S+20R)≤0.25,但其正構烷烴並沒有明顯的偶碳優勢,而產自王場油田的潛一段原油其C2920S/(20S+20R)值為0.35,但其正構烷烴具明顯的偶碳優勢。由此可見,盡管偶碳優勢的正構烷烴分布特徵常與鹽湖相沉積有關,但鹽湖相的沉積或由此沉積生成的原油其正構烷烴並不一定具有偶碳優勢。鹽湖環境原油和烴源岩中偶碳優勢正構烷烴的形成可能還需要某些特殊的地質-地球化學條件,而早期成岩階段硫與有機質鍵合形成富硫結構大分子可能是偶碳優勢正構烷烴形成的內在原因。

2.類異戊二烯烷烴

與鹽湖盆地烴源岩相似,鹽湖盆地的未—低熟油具有強的植烷優勢和異常低的姥植比。就江漢鹽湖盆地而言,極大多數未—低熟油的Pr/Ph比值<0.30,而 Ph/nC18值>4.0,Pr/nC17值<1.0(見表5-2)。但仔細對比不同構造位置產出的未—低熟油其類異戊二烯烷烴組成上存在明顯的差異,如產自王場油田的那些重質富硫原油,其植烷優勢最強烈,Pr/Ph 值<0.1,而光明台構造的未成熟油和廣華構造潛一段未成熟油的Pr/Ph值相當,介於0.2~0.23 之間。不同原油中Pr/Ph、Pr/nC17和Ph/nC18相對組成的三角圖更直觀地反映出了不同原油中植烷、姥姣烷及其與相鄰正構烷烴相對組成特徵的異同(圖5-4)。在那些油質重、含硫量高,正構烷烴系列具有明顯偶碳優勢的原油中其植烷優勢最顯著,反之植烷優勢則越弱。

圖5-4 不同原油中Pr/Ph、Pr/nC17和Ph/nC18相對組成三角圖

另一個值得注意的現象是在所分析研究的原油樣品中,類異戊二烯烷烴基本均由植烷系列(iC13~iC20)組成,

以上的類異戊二烯烷烴僅檢測到iC21一個化合物,而沒有檢測到

類異戊二烯烷烴。但是在江漢鹽湖盆地潛江組烴源岩中,除了潛一段烴源岩外,其他層位大部分烴源岩中均檢測出iC13~iC25和iC30(角鯊烷)類異戊二烯烷烴系列(依據明鉀1井和王4-22井烴源岩的分析結果)。這一現象揭示出潛一段烴源岩可能是江漢鹽湖盆地大部分未—低熟油的主要油源層。

二、環狀生物標志物

江漢鹽湖盆地未—低熟油中的環狀生物標志物主要包括三環萜烷系列、藿烷和藿烯系列、伽馬蠟烷和甾烷系列和三芳甾烷系列,其分布與組成與原油的成因及相對演化程度的高低有關。

1.三環萜烷和四環萜烷

在所研究的江漢鹽湖盆地的未—低熟油中,檢測到13β(H),14α(H)和13α(H),14α(H)兩個系列的三環萜烷以及C24四環萜烷,但是在相對熱演化程度不同的原油中,這兩個系列三環萜烷相對豐度存在明顯的差異。如在相對演化程度很低的未成熟油中,兩個系列的三環萜烷均很發育,13α(H),14α(H)的豐度相當於13β(H),14α(H)豐度的一半,如光明台和廣華構造的潛一段原油。隨原油相對演化程度的升高,13α(H),14α(H)三環萜烷系列的豐度逐漸下降,直到完全消失,而13β(H),14α(H)三環萜烷系列則逐漸升高(圖5-5),值得注意的是同碳數兩種構型的三環萜烷同系物的比值與甾萜烷成熟度參數間存在良好的正相關關系(圖5-6)。其內在的原因是13α(H),14α(H)構型三環萜烷是一種熱穩定性很低的生物標志物,對成熟度的微小變化極為敏感,而13β(H),14α(H)構型的三環萜烷是一種熱穩定性很高的化合物,它對成熟度變化的敏感性則很低。結果隨原油成熟度的升高,兩種構型三環萜烷的比值也會隨之發生變化。由於13α(H),14α(H)構型的三環萜烷大多出現在鏡質體反射率Ro<0.6%的未成熟樣品中,因此,13α(H),14α(H)與13β(H),14α(H)兩種構型的比值是一個適用於反映低演化階段原油和烴源岩中有機質相對演化程度高低的成熟度參數。

圖5-5 江漢鹽湖盆地不同原油中兩種構型三環萜烷系列分布特徵

值得注意的現象是在江漢盆地的未—低熟原油中均富含C24四環萜烷,但沒有檢測到其他四環化合物,它與相鄰的C26三環萜烷的比值均大於1.0,這與文獻報道的蒸發岩盆地原油中C24四環萜烷組成特徵是一致的(Cannan等,1986;Hite 和Arders,1991)。而在一般的湖相成因的未熟油中,C24四環萜烷的相對豐度則是較低的。因此,富含C24四環萜烷可能是鹽湖盆地原油在生物標志物組成上的一個重要特徵。

圖5-6 不同原油中甾萜烷成熟度參數與兩種構型三環萜烷比值的關系圖

2.藿烷系列和伽馬蠟烷

藿烷和藿烯系列是一類代表細菌生源的生物標志物,它在江漢鹽湖盆地的未—低熟油中豐度較高,表徵細菌在鹽湖盆地烴源岩油氣生成過程中起了重要作用。鹽湖盆地未—低熟油中的藿烷系列及伽馬蠟烷的分布與組成特徵較為相似,均表現出C30藿烷和伽馬蠟烷是三萜烷中的優勢組分,C27和C29降藿烷的豐度相對較低(圖5-7)。

Ts和Tm相對組成受制於成熟度和沉積環境的性質,Ts相對豐度低是鹽湖盆地未—低熟油的共同特徵。實際上,高鹽度強還原的沉積環境是不利於Ts形成的。C31~C35升藿烷系列組成中,C35五升藿烷豐度的高低常與沉積環境還原的程度密切相關,在C31、C33和C35升藿烷碳數組成三角圖中(圖5-8),產自王場油田的重質富硫原油富含C35五升藿烷,它們分布在C35五升藿烷介於40%~50%的范圍內,而其他原油則分布在30%~40%的區間。這一現象揭示出富硫原油形成的環境其還原性強於其他含硫量相對較低的原油,而早期成岩階段硫與有機質結合(分子間或分子內)可能是細菌藿烷四醇骨架得以保存,然後經硫—硫和硫—碳鍵斷裂形成C35五升藿烷的內在原因。

伽馬蠟烷是江漢鹽湖盆地未—低熟油中十分豐富的一類生物標志物,它常是m/z191質量色譜圖上的最高峰。如在王場油田富硫重質原油中,其豐度是C30藿烷的三倍,在其他原油中伽馬蠟烷的豐度與C30藿烷豐度相當(圖5-7)。而我國東部其他非鹽湖相盆地所產的未—低熟油中,伽馬蠟烷的豐度不高,它與藿烷的比值通常小於0.3(王鐵冠等,1995)。這一現象揭示出鹽湖環境適宜於原生動物的生長發育,而且它在鹽湖盆地烴源岩有機質生烴過程中起了重要作用。伽馬蠟烷含量高是江漢鹽湖盆地未—低熟油在生物標志物分布與組成上的又一重要特徵。

圖5-7 江漢鹽湖盆地不同未—低熟油中三萜烷系列分布特徵

圖中G代表伽馬蠟烷(黑峰)

圖5-8 江漢鹽湖盆地不同原油中C31,C33和C35升藿烷相對組成三角圖

在不同生物標志物比值的關系圖中(圖5-9),姥植比(Pr/Ph)與伽馬蠟烷/C30藿烷和升藿烷指數間存在良好的相關性,表明低的姥植比與高的伽馬蠟烷和強的升藿烷指數的形成具有相似的地質-地球化學條件,而高的鹽度和強還原的沉積環境則是強植烷優勢,高含量伽馬蠟烷以及豐富的C31五升藿烷形成的重要原因。因此,低的Pr/Ph比,高的伽馬蠟烷/C30藿烷以及高的升藿烷指數是判別鹽湖沉積環境及由此環境的烴源岩生成的原油的重要的生物標志物組合。

圖5-9 江漢鹽湖盆地中Pr/Ph與伽馬蠟烷/C30藿烷和升藿烷指數間的關系圖

此外,在所研究的未—低熟油中,普遍檢測到了17(12)-藿烯系列標志物,但其含量相對較低,一般不足藿烷系列的1%,但17(21)藿烯系列在未—低熟油中的普遍存在,更進一步證實這些原油的低成熟性。

3.甾烷

甾烷是一類源於真核生物的生物標志物,C27甾烷和C29甾烷分別對應於低等生物藻類的生源輸入和高等植物生源輸入的貢獻。因此,強的C27甾烷優勢往往指示藻類的貢獻大,而C29甾烷的優勢往往與大量的陸源有機質的貢獻有關。

就江漢鹽湖盆地的未—低熟油而言,普遍都存在C27甾烷的優勢,其相對豐度介於40%~70%之間,而C29甾烷的含量相對較低,一般介於30%~40%之間(圖5-10),反映出在鹽湖盆地中藻類對生烴的貢獻占據主導地位。實際上,在某一地質時期鹽湖環境得以形成表明當時地表徑流帶來的淡水的影響較小,如果沒有地表徑流的注入或很少注入,盆地中陸源有機質供應就會變得相當饋乏。在這種情況下,鹽湖盆地烴源岩中生烴的主要原始母質就是那些適宜在這一特定沉積環境和生態條件下生存的低等生物如藍綠藻類、硅藻、綠藻、細菌和古細菌等一些耐鹽的生物。由此可見,江漢鹽湖盆地未—低熟油中富含C27甾烷也是由這一特定的沉積環境所決定的。

圖5-10 江漢鹽湖盆地未低熟油甾烷碳數組成三角圖

仔細對比發現,在不同原油中甾烷碳數組成仍存在一定差異。主要表現為富硫的重質原油中特別富含C27甾烷,如王場油田的高硫原油,而且不同原油中C27甾烷相對豐度的變化與正構烷烴的CPI、伽馬蠟烷/C30藿烷和升藿烷指數〔C35/(C31~C35)〕之間存在良好的正相關性,而與Pr/Ph值之間則呈現出負相關性,且相關性均很高(圖5-11)。這一現象更進一步佐證了鹽湖盆地原油中甾烷碳數組成特徵不是一個孤立的現象,烴源岩形成的環境的性質及由此環境決定的古生態條件是控制原油甾烷碳數組成的內在原因。

圖5-11 江漢鹽湖盆地未—低熟油中C27/C29甾烷比值與其他生物標志物參數間的關系圖

三、生物標志物絕對濃度

為了比較不同原油中各類生物標志物濃度的差異,藉助於內標化合物,分別計算了所研究的幾個原油中藿烷、伽馬蠟烷、三環萜烷和甾烷以及單芳甾烷絕對濃度,圖5-12則是不同原油中各類生物標志物絕對濃度變化特徵。由此可以看出,產自光明台和廣華油田潛一段的典型未成熟油中,各類生物標志物的濃度均較高,而在成熟度相對較高的原油中(仍屬低成熟油)各類物標志物的濃度則明顯下降,尤其是藿烷和單芳甾烷系列,這一現象反映出未成熟原油是一種特殊成因的原油,由於它是有機質在熱演化早期階段由生物類脂物直接生成的,沒有受到後期由乾酪根熱降解的生烴稀釋的影響,因而其中所包含的具有成因意義的各類生物標志物的濃度就高;而對於成熟度較高的原油而言,其中不但含有由生物類脂物直接生成的各類生物標志物,同時也包含一部分乾酪根中由低活化能基團轉變來的烴類物質,因而其濃度相對較低。因此,未成熟油中各類生物標志物濃度高,也是由其成熟度決定的。

值得注意的是取自王場油田的兩個特別富含硫的重質原油中,除伽馬蠟烷外的各類生物標志物的濃度異常的低,與具有相當演化程度的原油相比,其各生物標志物濃度只有1/4~1/20,取而代之的是這類原油的芳烴餾分中存在豐富的各類有機硫化物,其中包括一些含硫的藿烷和甾烷(見第三節)。由此可以推測,這些富硫原油各類生物標志物的濃度異常低不是一個偶然現象,而可能暗示了硫在早期成岩階段與有機質結合形成了大量的含硫大分子。含硫大分子的形成降低了那些含氧基因的生物前身物直接經脫官能團形成相應生物標志物的概率,結果導致生物標志物的濃度下降。同時它給我們提供的另一重要信息是硫與有機質發生鍵合的時間可能早於生物類脂物的脫官能團作用,或者是在這一階段硫與有機質發生鍵合較生物類脂物的脫官能團作用更容易進行。

圖5-12 江漢鹽湖盆地不同未—低熟油中各類生物標志物濃度的變化特徵

1—潛深10井;2—明斜4-2井;3—廣27井;4—王14井;5—王31-12井;6—王31-6井;7—王8-1井;8—潭34井;9—王4-5-1井;10—潛深5井;11—王3井

如上所述,不同原油中各類生物標志物的濃度存在明顯差異,那麼究竟是什麼因素控制了不同原油中各類生物標志物的濃度變化呢?圖5-13是所研究的原油中C2920S/(20S+20R)成熟度參數與各類生物標志物濃度間的關系圖。除了上述王場油田兩個原油外,它們之間存在良好的負相關性,突出表現為未成熟原油中各類生物標志物的濃度明顯較其他原油中高,反映出它是一個特殊成因類型的原油。因此,完全有可能依據原油中各類標志物的絕對濃度來判斷原油的成熟度,而且結論可能更加可靠。有研究表明,當成熟原油受到微量未熟瀝青的浸染時,其生物標志物成熟度參數就會顯示出低成熟性,但此時如果有該原油中各類生物標志物絕對濃度的信息就不難澄清浸染這一問題,因為微量的浸染不會掩蓋成熟原油中各類生物標志物絕對濃度低這一基本事實。

圖5-13 江漢鹽湖盆地原油中C2920S/(20S+20R)

與各類生物標志物絕對濃度間的關系

Ⅶ 阿爾茨海默病的生物標志物包括哪些

生物標志物(Biomarker)是指可以標記系統、器官、組織、細胞及亞細胞結構或功能的改變或可能發生的改變的生化指標,具有非常廣泛的用途。生物標志物可用於疾病診斷、判斷疾病分期或者用來評價新葯或新療法在目標人群中的安全性及有效性。具有一定的敏感性,敏感性應高於一般生物檢測指標,低劑量下就可測出,可微量操作;2.具有反應的時間效應。反應要有一定的穩定時間,同時要快速; 3.效應標志物在分子和生化水平上的效應要與高級生物學水平上的效應(如生長、繁殖)緊密相聯

Ⅷ 什麼是生物標志物

生物標志物(Biomarker)是指可以標記系統、器官、組織、細胞及亞細胞結構或功能的改變或可能發生的改變的生化指標,具有非常廣泛的用途。

Ⅸ 生物標志物的分類

從功能上一般分為:
接觸(暴露)生物標志物
(biomarker of exposure);
效應生物標志物
(biomarker of effect);
敏感性生物標志物
(biomarker of susceptibility)

Ⅹ 環境污染作用人體後產生的生物標志物包括哪些

生物學標志又稱生物標志物或生物學標記。 生物學標志是指外源化學物通過生物學屏障並進入組織或體液後,對該外源化學物或其

所致生物學後果的測定指標,可分為接觸標志、效應標志和易感性標志。

接觸生物學標志是測定組織、體液或排泄物中吸收的外源化學物、其代謝物或與內源性物質的反應產物,作為吸收劑量或靶劑量的指標,提供關於暴露於外源化學物的信息。接觸生物學標志包括內劑量(如化學物原型或其代謝物)和生物效應劑量(如蛋白質加合物、DNA加合物等)兩類標志物。接觸生物學標志如與外劑量相關或與毒效應強度相關,可用於評價接觸水平或建立生物閾限值。

效應生物學標志指機體中可檢測的生化、生理、行為或其他改變的指標,包括早期生物效應標志、結構和(或)功能改變標志、疾病標志3類,反映與不同靶劑量的外源化學物或其代謝物有關聯的健康有害效應的信息。

易感性生物學標志是關於個體對外源化學物的生物敏感性的指標,即反映機體先天具有或後天獲得的對接觸外源性物質產生反應能力的指標。如化學物接觸者體內代謝酶、修復酶及靶分子相關的基因多態性,屬遺傳易感性標志物。環境因素作為應激原時,機體的神經、內分泌和免疫系統的反應及適應能力,亦可影響機體的易感性。易感性生物學標志可用以篩檢易感人群,保護高危人群。

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