㈠ ssp intein是什麼
ssp ： 生物學 亞種 ；intein：指蛋白質的內含子。同mRNA一樣，一些前體蛋白質具有內含子(intein)序列，位於多肽序列的中間，經加工切除後，兩端的蛋白質外顯子 (extein)連接為成熟蛋白質分子，典型的intein在N-末端通常有150個氨基酸序列在C-末端有約50個氨基酸序列。
㈡ SSP菌肥有什麼特點嗎
1、我知道的最大的特點就是它經過發酵後的菌群數可以達到10的11次方,這個是比較強悍的.畢竟菌肥看的就是菌群數.
2、降低成本,SSP微生物菌肥其特有的微生物原理能很簡單的改良土壤,被改良過的土壤2-3年內,幾乎不需要施用化肥就能讓作物高產,最保守估計能增產40%.
3、用SSP制備有機肥的同時,其特有的除臭菌和強大的分解轉化能力,解決了豬糞、牛糞等環境污染問題.
㈢ 微生物（Microbe）名稱---A
Abiotrophia defectiva 缺陷乏養菌
Acetobacter aceti醋酸桿菌
Acetobacter pasteurianus巴氏醋桿菌
Acetobacter pasteurianus ssp pasteurianus 巴氏醋桿菌巴氏亞種
Acholeplasma laidlawii 萊氏無膽甾原體
Achromobacter denitrificans反硝化無色桿菌
Achromobacter insolitus insolitus無色桿菌屬
Achromobacter piechaudii皮氏無色桿菌
Achromobacter ruhlandii ruhlandii 無色桿菌屬
Achromobacter sp 無色桿菌屬某些種
Achromobacter spanius spanius無色桿菌屬
Achromobacter xylosoxidans木糖氧化無色桿菌
Achromobacter xylosoxidans ssp xylosoxidans木糖氧化無色桿菌木糖氧化亞種
Acidaminococcus fermentans 發酵氨基酸球菌
Acidaminococcus intestini 氨基酸球菌屬
Acidiphilium acidophilum acidophilum 嗜酸菌屬
Acidovorax avenae ssp avenae 燕麥噬酸菌燕麥亞種
Acidovorax avenae ssp citrulli燕麥噬酸菌西瓜亞種
Acidovorax defluvii DSM defluvii 嗜酸菌屬
Acidovorax delafieldii 德氏噬酸菌
Acidovorax facilis敏捷食酸菌
Acidovorax konjaci konjaci 嗜酸菌屬
Acidovorax temperans 中等食酸菌
Acinetobacter baumannii鮑氏不動桿菌
Acinetobacter baylyi baylyi不動桿菌屬
Acinetobacter bouvetii bouvetii不動桿菌屬
Acinetobacter calcoaceticus 醋酸鈣不動桿菌
Acinetobacter gerneri gerneri不動桿菌屬
Acinetobacter guillouiae guillouiae 不動桿菌屬
Acinetobacter haemolyticus 溶血不動桿菌
Acinetobacter johnsonii 約氏不動桿菌
Acinetobacter junii 瓊氏不動桿菌
Acinetobacter lwoffii 魯氏不動桿菌
Acinetobacter nosocomialis醫院不動桿菌
Acinetobacter parvus parvus不動桿菌屬
Acinetobacter pittii皮特不動桿菌
Acinetobacter pittii Serovar pittii Serovar不動桿菌屬
Acinetobacter radioresistens 抗輻射不動桿菌
Acinetobacter schindleri schindleri 不動桿菌屬
Acinetobacter sp 不動桿菌某些種
Acinetobacter tandoii tandoii不動桿菌屬
Acinetobacter tjernbergiae tjernbergiae不動桿菌屬
Acinetobacter towneri towneri 不動桿菌屬
Acinetobacter ursingii烏爾辛不動桿菌
Actinobacillus delphinicola delphinicola不動桿菌屬
Actinobacillus equuli ssp equuli equuli ssp equuli不動桿菌屬
Actinobacillus lignieresii lignieresii不動桿菌屬
Actinobacillus pleuropneumoniae胸膜肺炎放線桿菌
Actinobacillus rossii羅斯放線桿菌
Actinobacillus suis 豬放線桿菌
Actinobacillus ureae尿放線桿菌
Actinobaculum schaalii schaalii 放線菌屬
Actinobaculum suis suis放線菌屬
Actinobaculum urinale urinale放線菌屬
Actinocorallia libanotica libanotica放線菌屬
Actinomyces bovis牛型放線菌
Actinomyces bowdenii bowdenii放線菌屬
Actinomyces canis canis放線菌屬
Actinomyces cardiffensis cardiffensis放線菌屬
Actinomyces catuli catuli放線菌屬
Actinomyces coleocanis coleocanis放線菌屬
Actinomyces dentalis dentalis放線菌屬
Actinomyces denticolens齒垢放線菌
Actinomyces europaeus歐洲放線菌
Actinomyces funkei funkei放線菌屬
Actinomyces gerencseriae戈氏放線菌
Actinomyces graevenitzii graevenitzii 放線菌屬
Actinomyces hordeovulneris hordeovulneris 放線菌屬
Actinomyces hyovaginalis hyovaginalis 放線菌屬
Actinomyces israelii 衣氏放線菌
Actinomyces marimammalium marimammalium 放線菌屬
Actinomyces meyeri 邁爾放線菌
Actinomyces naeslundii 內氏放線菌
Actinomyces nasicola 紐氏放線菌
Actinomyces neuii諾伊放線菌
Actinomyces neuii ssp anitratus諾伊放線菌無硝亞種
Actinomyces neuii ssp neuii諾伊放線菌諾伊亞種
Actinomyces odontolyticus 齲齒放線菌
Actinomyces oris口腔放線菌
Actinomyces radicidentis口腔放線菌
Actinomyces radingae 瑞丁放線菌
Actinomyces ruminicola ruminicola 放線菌屬
Actinomyces sp放線菌屬某些種
Actinomyces suimastitidis suimastitidis放線菌屬
Actinomyces turicensis 蘇黎世放線菌
Actinomyces urogenitalis urogenitalis 放線菌屬
Actinomyces vaccimaxillae vaccimaxillae 放線菌屬
Actinomyces viscosus 粘放線菌
Adlercreutzia equolifaciens Adlercreutzia
equolifaciens Aerococcus christensenii氣球菌屬
Aerococcus sanguinicola 氣球菌屬
Aerococcus urinae脲氣球菌
Aerococcus urinaehominis 氣球菌屬
Aerococcus viridans綠色氣球菌
Aeromicrobium flavum flavum氣微菌屬
Aeromonas bestiarum bestiarum 氣單胞菌屬
Aeromonas caviae豚鼠氣單胞菌
Aeromonas encheleia encheleia氣單胞菌屬
Aeromonas enteropelogenes enteropelogenes氣單胞菌屬
Aeromonas eucrenophila腸棕氣單胞菌
Aeromonas hydrophila嗜水氣單胞菌
Aeromonas hydrophila ssp anaerogenes 嗜水氣單胞菌
Aeromonas hydrophila ssp hydrophila嗜水氣單胞菌嗜水氣亞種
Aeromonas hydrophila ssp ranae 嗜水氣單胞菌
Aeromonas ichthiosmia嗜水氣單胞菌
Aeromonas jandaei簡氏氣單胞菌
Aeromonas media 中間氣單胞菌
Aeromonas molluscorum molluscorum氣單胞菌屬
Aeromonas popoffii popoffii氣單胞菌屬
Aeromonas punctata ssp caviae punctata ssp caviae氣單胞菌屬
Aeromonas salmonicida ssp masoucida 殺鮭氣單胞菌殺日本鮭亞種
Aeromonas salmonicida ssp pectinolytica pectinolytica 殺鮭氣單胞菌屬
Aeromonas salmonicida ssp salmonicida 殺鮭氣單胞菌殺鮭亞種
Aeromonas schubertii 舒氏氣單胞菌
Aeromonas simiae simiae 氣單胞菌屬
Aeromonas sobria 溫和氣單胞菌
Aeromonas sp 氣單胞菌屬某些種
Aeromonas veronii維羅納氣單胞菌
Afipia broomeae布氏阿菲波菌
Afipia felis貓阿菲波菌
Afipia massiliensis 阿菲彼亞桿菌屬
Aggregatibacter actinomycetemcomitans 伴放線凝聚桿菌
Aggregatibacter segnis惰性凝聚桿菌
Agrococcus jenensis jenensis壤黴菌屬
Agromyces bracchium bracchium壤黴菌屬
Agromyces cerinus ssp cerinus蠟黃色壤黴菌蜜黃色亞種
Agromyces cerinus ssp nitratus 蠟黃色壤黴菌解亞硝鹽亞種
Agromyces fucosus 岩藻糖壤黴菌
Agromyces hippuratus 馬尿酸壤黴菌屬
Agromyces humatus humatus壤黴菌屬
Agromyces italicus italicus壤黴菌屬
Agromyces lapidis lapidis壤黴菌屬
Agromyces mediolanus mediolanus壤黴菌屬
Agromyces neolithicus neolithicus壤黴菌屬
Agromyces rhizospherae rhizospherae 壤黴菌屬
Agromyces salentinus salentinus壤黴菌屬
Agromyces subbeticus subbeticus 壤黴菌屬
Alcaligenes faecalis 糞產鹼桿菌
Alcaligenes faecalis ssp faecalis 糞產鹼桿菌糞亞種
Alcaligenes faecalis ssp parafaecalis parafaecalis糞產鹼桿菌屬
Alcaligenes faecalis ssp phenolicus phenolicus糞產鹼桿菌屬
Alcaligenes sp 產鹼桿菌某些種
Alicyclobacillus acidocaldarius ssp acidocaldar酸熱脂環酸芽孢桿菌酸熱亞種
Alicyclobacillus acidocaldarius ssp rittmannii 酸熱脂環酸芽孢桿菌
rittmannii亞種
Alicyclobacillus acidoterrestris 酸土脂環酸芽孢桿菌
Alicyclobacillus cycloheptanicus 環庚基脂環酸桿菌
Aliivibrio fischeri 別弧菌屬
Alishewanella fetalis別許旺氏菌屬
Alistipes finegoldii finegoldii另枝菌屬
Alistipes onderdonkii onderdonkii另枝菌屬
Alistipes shahii shahii另枝菌屬
Alkalibacillus haloalkaliphilus haloalkaliphilus鹼桿菌屬
Alloiococcus otitis 耳炎差異球菌
Alloscardovia omnicolens omnicolens另類斯卡多維亞氏菌屬
Alternaria alternata alternata交鏈孢霉
Amycolatopsis alba 白擬無枝酸菌
Amycolatopsis azurea 天藍色擬無枝酸菌
Amycolatopsis balhimycina balhimycina擬無枝酸菌
Amycolatopsis coloradensis 科羅拉多擬無枝酸菌
Amycolatopsis fastidiosa 苛求擬無枝酸菌
Amycolatopsis japonica japonica擬無枝酸菌屬
Amycolatopsis kentuckyensis kentuckyensis 擬無枝酸菌屬
Amycolatopsis keratiniphila ssp
keratiniphila keratiniphila ssp keratiniphila擬無枝酸菌屬
Amycolatopsislexingtonensis lexingtonensis擬無枝酸菌屬
Amycolatopsis lurida lurida擬無枝酸菌屬
Amycolatopsis mediterranei 地中海擬無枝酸菌
Amycolatopsis minnesotensis minnesotensis擬無枝酸菌屬
Amycolatopsis pretoriensis pretoriensis 擬無枝酸菌屬
Amycolatopsis sulphurea sulphurea 擬無枝酸菌屬
Amycolatopsis tolypomycina 帶顆粒擬無枝酸菌
Anaerococcus hydrogenalis hydrogenalis
Anaerococcus lactolyticus解乳厭氧球菌
Anaerococcus murdochii murdochii 厭氧球菌屬
Anaerococcus octavius octavius厭氧球菌屬
Anaerococcus prevotii prevotii厭氧球菌屬
Anaerococcus sp 厭氧球菌屬某些種
Anaerococcus tetradius四聯消化厭氧球菌
Anaerococcus vaginalis vaginalis厭氧球菌屬
Anaerotruncus colihominis colihominis 厭氧球菌屬
Aneurinibacillus aneurinilyticus 解硫胺素解硫胺素芽孢桿菌
Aneurinibacillus migulanus migulanus芽孢桿菌屬
Aquincola tertiaricarbonis tertiaricarbonis水居菌屬
Arcanobacterium haemolyticum 溶血隱秘桿菌
Arcanobacterium hippocoleae hippocoleae隱秘桿菌屬
Arcanobacterium phocae phocae隱秘桿菌屬
Arcanobacterium pluranimalium pluranimalium隱秘桿菌屬
Arcobacter butzleri 布氏弓形菌
Arcobacter cibarius cibarius 弓形菌
Arcobacter cryaerophilus 嗜冷氣弓形菌
Arcobacter halophilus halophilus弓形菌
Arcobacter nitrofigilis 硝化弓形菌
Arcobacter skirrowii斯氏弓形菌
Aromatoleum alkani Aromatoleum alkani
Aromatoleum tolulyticus Aromatoleum tolulyticus
Aromatoleum aromaticum Aromatoleum aromaticum
Aromatoleum bremensis Aromatoleum bremensis
Aromatoleum buckelii Aromatoleum buckelii
Aromatoleum diolicum Aromatoleum diolicum
Aromatoleum evansii Aromatoleum evansii
Aromatoleum pretroleum Aromatoleum pretroleum
Aromatoleum terpenicum Aromatoleum terpenicum
Aromatoleum tolulyticus Aromatoleum tolulyticus
Aromatoleum toluolicum Aromatoleum toluolicum
Aromatoleum toluvorans Aromatoleumtoluvorans
Arsenophonus nasoniae飛蟲殺雄菌
Arthroascus schoenii schoenii節囊酵母屬
Arthrobacter ardleyensis ardleyensis節桿菌屬
Arthrobacter arilaitensis arilaitensis 節桿菌屬
Arthrobacter aurescens金黃節桿菌
Arthrobacter bergerei bergerei節桿菌屬
Arthrobacter castelli castelli 節桿菌屬
Arthrobacter chlorophenolicus
chlorophenolicus節桿菌屬
Arthrobacter citreus 檸檬節桿菌
Arthrobacter creatinolyticus
creatinolyticus 節桿菌屬
Arthrobacter crystallopoietes CIP 102717成晶節桿菌
Arthrobacter cumminsii 卡明斯節桿菌
Arthrobacter flavus flavus節桿菌
Arthrobacter gandavensis gandavensis節桿菌
Arthrobacter globiformis球形節桿菌
Arthrobacter histidinolovorans 噬組氨醇節桿菌
Arthrobacter ilicis 冬青節桿菌
Arthrobacter kerguelensis kerguelensis節桿菌
Arthrobacter koreensis 韓國節桿菌
Arthrobacter luteolus luteolus節桿菌
Arthrobacter monumenti monumenti節桿菌
Arthrobacter mysorens 邁索爾節桿菌
Arthrobacter nasiphocae nasiphocae節桿菌
Arthrobacter nicotianae煙草節桿菌
Arthrobacter nicotinovorans噬尼古丁節桿菌
Arthrobacter nitroguajacolicus
nitroguajacolicus節桿菌
Arthrobacter oxydans 氧化節桿菌
Arthrobacter parietis parietis節桿菌
Arthrobacter pigmenti pigmenti節桿菌
Arthrobacter polychromogenes 多色節桿菌
Arthrobacter protophormiae 原玻璃蠅短桿菌
Arthrobacter psychrolactophilus
psychrolactophilus節桿菌
Arthrobacter psychrophenolicus
psychrophenolicus節桿菌
Arthrobacter pyridinolis吡啶酚節桿菌
Arthrobacter ramosus 分枝節桿菌
Arthrobacter roseus玫瑰色節桿菌
Arthrobacter russicus russicus節桿菌
Arthrobacter scleromae硬節節桿菌
Arthrobacter sp 節桿菌屬
Arthrobacter stackebrandtii stackebrandtii節桿菌
Arthrobacter sulfonivorans sulfonivorans節桿菌
Arthrobacter sulfureus 硫磺節桿菌
Arthrobacter tecti tecti節桿菌
Arthrobacter tumbae tumbae節桿菌
Arthrobacter uratoxydans 尿酸氧化節桿菌
Arthrobacter woluwensis woluwensis節桿菌
Arthroderma benhamiae 皮膚癬黴菌
Arthrographis_kalrae[ana] (Eremomyces_lang
kalrae爪甲白癬菌Aspergillus brasiliensis巴西麴黴
Aspergillus flavus 黃麴黴
Aspergillus fumigatus煙麴黴
Aspergillus niger 黑麴黴
Aspergillus terreus土麴黴
Aspergillus versicolor 雜色麴黴
Aspergillus_thermomutatus thermomutatus麴黴
Atopobium minutum小阿托波氏菌
Atopobium parvulum極小阿托波氏菌
Atopobium rimae 裂阿托波氏菌
Atopobium sp阿托波氏菌屬
Atopobium vaginae vaginae阿托波氏菌
Aureimonas altamirensis Aureimonasaltamirensis
Aureobasidium pullulans 出芽短梗黴菌
Austwickia chelonae chelonae放線菌
Avibacterium avium avium桿菌
Avibacterium endocarditidis 禽心內膜炎桿菌
Avibacterium gallinarum副雞禽桿菌
Avibacterium volantium volantium桿菌
Azoarcus communis 普通固氮弧菌
Azoarcus indigens需求固氮弧菌
Azoarcus sp 固氮弧菌屬
Azohydromonas lata 阿特拉津降解菌
（出處:http://www.doczj.com/doc/3f93df64c77da26924c5b035.html）
㈣ 微生物可以分成哪「三行八大類」啊詳細點！謝謝啊!
微生物的分類,鑒定及命名
1,生物界的分類
地球上的物種估計大約有150萬,其中微生物超過10萬種,而且其數目還在不斷增加.
在生物進化歷史過程中演化形成生物種類和種群的多樣性.
生物分類就是通過研究生物的系統發育及其進化歷史,揭示各類生物的多樣性及其系統關系,編制分類系統,還原生物的自然歷史位置.
高等動植分類
化石資料,形態學,比較胚胎學
較正確反映其系統發育
微生物分類的難題:
絕大部分微生物個體小,形態簡單,易受環境影響而變異,缺少有性繁殖,缺乏化石資料.
生物分類的二種基本原則:
a)根據表型(phenetic)特徵的相似程度分群歸類,這種
表型分類重在應用,不涉及生物進化或不以反映生
物親緣關系為目標;
b)按照生物系統發育相關性水平來分群歸類,其目標
是探尋各種生物之間的進化關系,建立反映生物系
統發育的分類系統.
★從兩界系統經歷過三界系統,四界系統,五界系統甚至六界系統,最後又有了三原界(或三總界)系統.
★傳統的,為多數學者所接受的是1969年魏塔克(R.H.Whittaker)在《Science》上提出的五界學說,它以縱向顯示從原核生物到真核單細胞生物再到真核多細胞生物的三大進化過程.
生物的界級分類學說
利用16SrRNA建立分子進化樹的美國科學家
Carl Woese
三域學說的建立
(1)古細菌原界(Archaebacteria) ,包括產甲烷細菌,極端嗜鹽菌和嗜熱嗜酸菌;
(2)真細菌原界(Eubacteria) ,包括藍細菌和各種除古細菌以外的其它原核生物;
(3)真核生物原界(Eucaryotes),包括原生生物,真菌,動物和植物.
2,微生物分類學
經典分類學:按微生物表型分類
微生物系統學:按親緣關系和進化規律分類
發展
表型特徵:形態學,生理生化學,生態學等,推斷微生物的系統發育.
表型特徵結合分子水平上比較微生物的基因型特徵(如16S rRNA)探討微生物進化,系統發育和分類鑒定.
★微生物分類學的三個任務:分類,鑒定及命名
☆分類是根據微生物的相似性和親緣關系,將微生物歸入不同的分類類群.
☆鑒定是確定一個新的分離物屬於已經確認的分類單元的過程.
☆命名是根據國際命名法規給微生物分類單元以科學的名稱.
以啤酒酵母為例,它在分類學上的地位是:
界(Kindom):真菌界
門(Phyllum):真菌門
綱(Class):子囊菌綱
目(Order):內孢霉目
科(Family):內孢霉科
屬(Genus):酵母屬
種(Species):啤酒酵母
3,微生物的分類單位
界,門,綱,目,科,屬,種
種是最基本的分類單位
每一分類單位之後可有亞門,亞綱,亞目,亞科...
種(species):是一個基本分類單位;是一大群表型特徵高度相似,親緣關系極其接近,與同屬內其他種有明顯差別的菌株的總稱.
菌株(strain): 表示任何由一個獨立分離的單細胞繁殖而成的純種群體及其一切後代(起源於共同祖先並保持祖先特性的一組純種後代菌群).因此,一種微生物的不同來源的純培養物均可稱為該菌種的一個菌株.菌株強調的是遺傳型純的譜系.
例如:大腸埃希氏桿菌的兩個菌株:
Escherichia coli B 和Escherichia coli K12
★菌株的表示法:
★種是分類學上的基本單位,菌株是實際上應用的基本單位,因為同一菌種的不同菌株在產酶上種類或代謝物產量上會有很大的不同和差別!
亞種(subspecies)或變種(variety):
為種內的再分類.
當某一個種內的不同菌株存在少數明顯而穩定的變異特徵或遺傳形狀,而又不足以區分成新種時,可以將這些菌株細分成兩個或更多的小的分類單元——亞種.
變種是亞種的同義詞,因"變種"一詞易引起詞義上的混淆,從1976年後,不在使用變種一詞.通常把實驗室中所獲得的變異型菌株,稱之為亞種.
如:E.coli k12(野生型)是不需要特殊aa的,而實驗室變異後,可從k12獲得某aa的缺陷型,此即稱為E.coli k12的亞種.
型(form):
常指亞種以下的細分.當同種或同亞種內不同菌株之間的性狀差異不足以分為新的亞種時,可以細分為不同的型.
例如:按抗原特徵的差異分為不同的血清型;
學名—是微生物的科學名稱,它是按照有關微生物分類國際委員會擬定的法則命名的.學名由拉丁詞,或拉丁化的外來片語成.學名的命名有雙名法和三名法兩種.
①雙名法:
學名=屬名+種名+(首次定名人)+現定名人+定名年份
屬名:拉丁文的名詞或用作名詞的形容詞,單數,首字母大寫,表示微生物的主要特徵,由微生物構造,形狀或由科學家命名.
種名:拉丁文形容詞,字首小寫,為微生物次要特徵,
如微生物色素,形狀,來源或科學家姓名等.
4,微生物的命名
必要,用斜體表示
可省略,用正體字
微生物的名字有俗名和學名兩種.如: 紅色麵包霉———粗糙脈孢霉
綠膿桿菌———銅綠假單胞菌
例:大腸埃希氏桿菌
Escherichia coli (Migula)Castellani et Chalmers 1919
金黃色葡萄球菌
Staphylococcus aureus Rosenbach 1884
◆當泛指某一屬微生物,而不特指該屬中某一種(或未定種名)時,可在屬名後加sp.或ssp.(分別代表species 縮寫的單數和復數形式)
例如:Saccharomyces sp.
表示酵母菌屬中的一個種.
◆菌株名稱——在種名後面自行加上數字,地名或符號等,如: Bacillus subtilis AS1.389 AS=Academia Sinica
Bacillus subtilis BF7658 BF=北紡
Clostridium acetobutylicum ATCC824 丙酮丁醇梭菌
ATCC=American Type Culture Collection美國模式菌種保藏中心
◆當文章中前面已出現過某學名時,後面的可將其屬名縮寫成1~3個字母.
如:Escherichia coli 可縮寫成 E.coli
Staphylococcus aureus可縮寫成 S. aureus
②三名法:用於對亞種的命名,這時在屬和種名後加寫一個subsp.,然後再附上亞種名稱(斜排體). 如:
Bacillus thuringiensis subsp. galleria
蘇雲金芽孢桿菌臘螟亞種
形態結構,生理生化,少量的化石資料,行為習性,等等
表型特徵:
5, 進化指征的選擇:
b)形態特徵在不同類群中進化速度差異很大,僅根據形態推斷進化關系往往不準確;
缺點:
a)由於微生物可利用的形態特徵少,很難把所有生物放在同一水平上進行比較;
蛋白質,RNA和DNA序列進化變化的顯著特點是進化速率相對恆定,也就是說,分子序列進化的改變數(氨基酸或核苷酸替換數或替換百分率)與分子進化的時間成正比.
生物大分子作為進化標尺依據
a)在兩群生物中,如果同一種分子的序列差異很大時,
------------進化距離遠,進化過程中很早就分支了.
b)如果兩群生物同一來源的大分子的序列基本相同,
------------處在同一進化水平上.
大量的資料表明:功能重要的大分子,或者大分子中功能重要
的區域,比功能不重要的分子或分子區域進化變化速度低.
RNA作為進化的指征
16S rRNA被普遍公認為是一把好的譜系分析的"分子尺":
1)rRNA具有重要且恆定的生理功能;
2)在16SrRNA分子中,既含有高度保守的序列區域,又有中度保守和高度變化的序列區域,因而它適用於進化距離不同的各類生物親緣關系的研究;
3)16SrRNA分子量大小適中,便於序列分析;
4)rRNA在細胞中含量大(約占細胞中RNA的90%),也易於提取;
5)16SrRNA普遍存在於真核生物和原核生物中(真核生物中其同
源分子是18SrRNA).因此它可以作為測量各類生物進化的工具.
Eubacteria
(真細菌界)
Archaebacteria
(古細菌界)
Eukarya
(真核生物界)
Carl Woese利用16SrRNA建立分子進化樹
微生物
(病毒)
古生菌(Archaea)
細菌(Bacteria)
真菌(酵母,黴菌,蕈菌等),
單細胞藻類,原生動物等
非細胞型
細胞型
原核微生物
真核微生物(Eukarya)
古生菌在進化譜繫上與真細菌及真核生物相互並列,且與後者關系
更近,而其細胞構造卻與真細菌較為接近,同屬於原核生物.
6,微生物分類鑒定的特徵和技術
形態學特徵,
生理學特徵,
生態學特徵
6.1 生物分類的傳統指標:
☆形態學特徵
培養特徵,
運動性,
特殊的細胞結構,
細胞形態及其染色特性,
等等
微生物分類和鑒定的重要依據之一:
a)易於觀察和比較,尤其是真核微生物和具有特殊
形態結構的細菌;
b)許多形態學特徵依賴於多基因的表達,具有相對
的穩定性;
☆生理生化特徵�
與微生物的酶和調節蛋白質的本質和活性直接相關;
代謝產物等
營養類型;
與氧的關系;
對溫度的適應性;
對pH的適應性;
對滲透壓的適應性;
酶及蛋白質都是基因產物;
對微生物生理生化特徵的比較也是對微生物基因組的間接比較;
測定生理生化特徵比直接分析基因組要容易得多;
常藉助特異性的血清學反應來確定未知菌種,亞種或菌株.
★生態特性
包括在自然界的分布情況,與其他生物有否寄生或共生關系, 宿主種類及與宿主關系, 有性生殖情況, 生活史等.
★血清學反應
6.2 核酸的鹼基組成和分子雜交
特點:
與形態及生理生化特性的比較不同,對DNA的鹼基
組成的比較和進行核酸分子雜交是直接比較不同微
生物之間基因組的差異,因此結果更加可信.
(1) DNA的鹼基組成(G+Cmol%)
DNA鹼基因組成是各種生物一個穩定的特徵,即使個別基因突變,鹼基組成也不會發生明顯變化.
分類學上,用G+C佔全部鹼基的克分子百分數(G+Cmol%)來表示各類生物的DNA鹼基因組成特徵.
◆每個生物種都有特定的GC%范圍,因此後者可以作為分類鑒定的指標.細菌的GC%范圍為25--75%,變化范圍最大,因此更適合於細菌的分類鑒定.
◆GC%測定主要用於對表型特徵難區分的細菌作出鑒定,並可檢驗表型特徵分類的合理性,從分子水平上判斷物種的親緣關系.
使用原則:
G+C含量的比較主要用於分類鑒定中的否定
每一種生物都有一定的鹼基組成,親緣關系近的生物,
它們應該具有相似的G+C含量,若不同生物之間G+C含
量差別大表明它們關系遠.
但具有相似G+C含量的生物並不一定表明它們之間具有近的親緣關系.
同一個種內的不同菌株G+C含量差別應在4～5%以下;同屬不同種的差別應低於10～15%;G+C含量已經作為建立新的微生物分類單元的一項基本特徵,它對於種,屬甚至科的分類鑒定有重要意義.
若二個在形態及生理生化特性方面及其相似的菌株,如果其G+C含量的差別大於5%,則肯定不是同一個種,大於15%則肯定不是同一個屬.
在疑難菌株鑒定,新種命名,建立一個新的分類單位時,G+C含量是一項重要的,必不可少的鑒定指標.
其分類學意義主要是作為建立新分類單元的一項基本特徵和把那些G+C含量差別大的種類排除出某一分類單元.
G+C含量的比較主要用於分類鑒定中的否定
(2) 核酸的分子雜交
不同生物DNA鹼基排列順序的異同直接反映生物之間親緣關系的遠近,鹼基排列順序差異越小,它們之間的親緣關系就越近,反之亦然.
核酸分子雜交(hybridization)間接比較不同微生物DNA鹼基排列順序的相似性
a)DNA-DNA雜交;
(親緣關系相對近的微生物之間的親緣關系比較)
b)DNA-rRNA雜交;
(親緣關系相對遠的微生物之間的親緣關系比較)
c)核酸探針;
(利用特異性的探針,用於細菌等的快速鑒定)
(3) 16SrRNA或18SrRNA的核酸序列分析
16SrRNA被普遍公認為是一把好的譜系分析的"分子尺":
16SrRNA的序列高度保守,可精確指示細菌之間的親緣關系
16SrRNA的大小為1500bp左右,所含信息能反映生物界進化關系,易操作,適用於各級分類單元
目前常用的是建立在PCR技術基礎上的16SrRNA基因的直接測序法,方便快捷.
《伯傑氏鑒定細菌學手冊》
(Bergey's Manual of Determinative Bacteriology)
美國賓夕法尼亞大學的細菌學教授伯傑(D.Bergey)(1860-1937)
1957年第七版後,由於越來越廣泛地吸收了國際上細菌分類學家參加編寫(如1974年第八版,撰稿人多達130多位,涉及15個國家;現行版本撰稿人多達300多人,涉及近20個國家),所以它的近代版本反映了出版年代細菌分類學的最新成果,因而逐漸確立了在國際上對細菌進行全面分類的權威地位.
7.1 細菌分類系統
7,微生物分類系統
《伯傑氏系統細菌學手冊》
(Bergey's Manual of Systematic Bacteriology)
伯傑氏手冊是目前進行細菌分類,鑒定的最重要依據,其特點是描述非常詳細,包括對細菌各個屬種的特徵及進行鑒定所需做的實驗的具體方法.
(20世紀80年代末期)
7.2 真菌分類系統
真菌界分類系統很多,各國採用不同的系統,比較混亂.近年來為較多人接受的是Ainsworth的綱要.
俗名—common name簡潔易懂,方便記憶,但涵義往往不夠准確,還有適用范圍和地區性的限制.
命名—scientific name菌種的科學名稱.菌種的學名是按照《國際細菌命名法規》命名的國際學術界公認,並通用的名稱.
命名原則:
學名=屬名+種的加詞+(首次定名人)+現名定名人和鮮明定名年份
規定與常識:屬名應大寫首字母,單數,可以組合外而成.種的加詞代表一個種的次要特徵,首字小寫
㈤ SSP是什麼
SSP是一組超強有益菌群的名稱，其最大的優點是能隨時喚醒休眠態的微生物菌群，這是世界難題，國內幾乎占絕大多數的菌肥產品在生產過程中成活菌群數達到10的7次方8次方，但經過商品流通環節後，到客戶手裡成活菌群數已只剩下10的3次方，甚至全軍覆滅，造成無效或效果不明顯，給菌肥的推廣帶來了無法解決的瓶頸，而ssp技術，經過喚醒後能達到10的12次方。該細菌不僅能給植物帶來快速生長植物根系的作用，並具有提高土壤肥力，改良土壤，增強作物抗病能力，促進生長提早成熟，提高產量，改善品質等功能。更主要的是能防治非寄生性植物病原體（有害根際細菌和有害根際真菌），以及對寄生植物病原體的作用。原因是因為ssp能產生鐵載體（含鐵低分子絡合物），能提高鐵的可絡性，ssp生產鐵載體將鐵絡合起來限制了有害微生物的生長。所以能抵制根瘤病、寄生蟲、土壤線蟲等植物根部的病害和菌害
㈥ 誰能介紹一個「生物分類索引」給我
這個工程太龐大了
你還是看看那麼一大摞中國動物志，中國植物志，蘚類植物分類索引等等
可知分類學是多麼龐雜
另外，你所列舉的都是中文名，是不科學的
分類學上稱之為俗名
真正的學名是拉丁文
也就是常說的雙名法來表示
前面是屬名，後面是種加詞，通常還要加上命名者的姓名
如白菜：Brassica campestris L. ssp．Chinensis (L.) Makino. Var. cammunis Tsen et Lee
var表示變種
現在你知道有多復雜了吧
另外
現在分類學界對分類學的單位也有爭論
三界學說
五界學說
都有道理