㈠ 測序出來的序列,在NCBI網站上比對相似度,尋找相似度100%或99%的是為了分析什麼
找到你測的序列是什麼物種，如果是100%，說明你測的這個物種就是你在NCBI上找到的這個。
㈡ 測序得到基因序列後如何分析呢 都需要用什麼軟體啊 新手 拜託高人指點下 什麼都不會 求死啊！！
測序得到基因序列後一般都需要進行序列比對，看和目的序列的差異情況，常用的軟體有DNAman,還有invitrogen的vectorVI也不錯。此外還可以直接在網上進行比對，推薦NCBI網站的BLAST可以直接網上進行。
不用擔心，多熟悉幾遍就可以操作了，很簡單的，要對自己有信心，加油！
可以用16s rDNA的通用引物，對細菌的16s rDNA進行PCR， 然後測序，得到序列片段之後，在GenBank或者其他的數據網站進行比對，就可以得出微生物的種屬。
㈣ 16srRNA的測序結果怎麼分析啊謝謝！！！！！
原核生物的30S核糖體亞基中含有16S rRNA.16S rRNA的相對分子質量約為0.6 MDa,長度約為1540 nt.在30S核糖體亞基組裝過程中,16S rRNA與其核糖體蛋白質S4、S7、S8、S15、S17和S20結合先行成初級復合物.
16S rRNA約有一半的核苷酸形成鏈內鹼基對,使其具有約60個螺旋；分子中未配對部分則形成突環.在濃度足夠的Mg2+存在下分離得到的16S rRNA處於緊密狀態,與30S核糖體亞基的結構相似.已發現16S rRNA中的一些序列與蛋白質合成時30S核糖體亞基、mRNA及一些翻譯因子的結合有關.核糖體16S rRNA的3'端能識別待翻譯mRNA的5'端的夏因-達爾加諾序列,起始翻譯.另有研究表明,16S rRNA也能與進入核糖體P位點的tRNA相互作用.
16S rRNA作為研究分類學和系統進化的分子受到很大重視,16S rRNA序列分析是當前對細菌進行分類學研究中較精確的一種技術.隨著分子生物學的快速發展以及該技術在醫學微生物研究中的應用,對16S rRNA作為微生物分類依據的研究也逐漸發展起來並已得到廣泛認同.
位於原核生物70S核糖體A位點的16S rRNA部分的是氨基糖苷類抗生素的作用靶位,該類抗生素通過與16S rRNA的A位點結合而阻礙原核翻譯.但由質粒介導的16S rRNA甲基化酶能將16S rRNA甲基化,從而導致細菌產生對該類抗生素較高的抗葯性.
㈤ 我有一個細菌測序結果可是不會比對,有哪位前輩可以指教一下
網頁上輸入NCBI BLAST進入主頁後黏貼你的序列，選擇blastn表示核酸比對，blastx表示氨基酸比對，確定就有比對結果了
㈥ 基因測序結果怎麼看
問題一：測序結果怎麼分析 測序結果的分析
測序都是從5端進行的，正向和反向測序是指對DNA的兩條互補鏈分別測序，通常兩個方向測序結果經校讀後完全一致才能認為得到可靠結果。生工測序結果一般都提供兩個文檔，一個是TEXT的序列文檔，一個是用Chromas軟體打開的ABI文檔。
1.尋找引物
blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 比對，去除引物序列，找到目的片段。
在DNAMan上進行比對，看引物能不能比對上（一個不變，一個反向互補），如果比不上，那可能就不是你要的序列，如果能比上，上游以引物第一個為分界線，去除前面的；下有一最後一個為分界線，去除後面的，剩下的就是目的序列。然後在NCBI上Blast.就OK了。
批註：PCR產物進行測序的結果可能不包含引物序列
2.將找到的對應目的片段轉成*.txt格式
3.下載BioEdit軟體
第一：打開Bioedit軟體，導入拼接好的樣品序列與標准亞型參考序列
File New Alignment Sequence New Sequence 導入拼接好的樣品序列和標准參考序列（從TEXT文檔利用復制粘貼工具） Apply and close 保存結果 關閉窗口
第二：點擊菜單欄上按鈕 Accessory Application ，選擇 Clustalw Multiple Alignment
File Open Accessory Application Clustalw Multiple Alignment
第三：比對結束後，刪除比對序列兩端的多餘序列，使所有序列等長
選擇需要編輯的序列 Sequence Edit Sequence 進行序列的編輯 保存修改後結果
第四：選擇 Sequence 菜單下的 Gaps ，點擊 Lock Gaps
第五：將比對後的序列保存為Fasta 格式文檔
4.下載MAGE4.0軟體
1) 打開MEGA軟體，選擇 File 菜單欄中的 Convert To MEGA Format ，把序列文件的格式轉換為meg文檔保存；
2) 雙擊序列的meg文檔，選擇 Nucleotide Sequences ，點擊 OK ；
3) 程序運行中詢問是否為蛋白編碼序列，選擇 NO ；
4) 在MEGA操作界面選擇 Phylogeny 菜單欄下 Bootstrap Test of Phylogeny 中的 Neibour-Joining ；
5) 選擇 Test of Phylogeny 欄中的 Bootsrap ， Replications 設定為1 000；在 Options Summary 欄中的 Model 項中，設定參數為 Kimura 2-Paramete r，最後選擇 pute ；
6) 將分析結果採用Los Alamos HIV序列庫提供的HIV-BLAST和Subtyping工具進行驗證。...>>
問題二：dna測序結果分析怎麼看進化圖 如果是用Sanger測序的話，電泳得到的條帶是模板連的互補鏈，電泳的方向是有3『段到5』段的，那麼從下往上讀，就可以的出互補鏈，根據反向平行，就可以推倒出模板連的鹼基序列。
問題三：怎樣分析基因測序結果 1.假設你測的是一個基因的序列,如果已知這個基因的序列,則將你測序得到的基因序列與已知的序列相比對,分析看兩者在哪個地方不對應,不對應的地方即為突變的地方.比對的軟體有sequencher,或者去NCBI網站點擊BLAST進行.
2.如果你測的是一個以前未知的序列,那麼要測幾個不同的單克隆,將測得的結果進行比對,分析一致的地方以及不一致的地方.
問題四：細菌基因組重測序結果分析報告怎麼看 測序只是最基礎的，接下來你要做功能基因分析，查找確定哪一些是編碼基因的序列，然後做表達檢測。。 如果你事先知道自己的目的基因序列，測序結束後，應該可以直接找到。
問題五：高通量基因測序檢驗報告單怎麼看 哪個公司出的，可撥打他們的客服電話。從業人員素質普遍較高，可以很詳細解答您的疑問。
問題六：如何看測序的結果與預期相差很大 先注意染色體與基因的關系，一條染色體有多個基因。
所以基因結構變異（鹼基對增、減、變）導致一個基因變。染色體結構變異，導致多個基因的重復，缺失，排列順序的改變等。所以基因突變是某一性狀改變，而染色體變異是某一系列性狀的改變。
㈦ 第二代高通量測序都有哪些平台
Illumina公司的Solexa測序平台，目前主流的型號的HiSeq-2500，以及Hiseq-2000，數據通量在每張Flow cell 300G數據，每次最多可以上2張Flow cell，單張Flow cell運行時間大約在11天左右。讀長通常是100BP，據說近期有了長度上的突破。還有一個型號是MiSeq，該機器運行通量較小，但是讀長大約在150BP以上，常用於微生物檢測，而且該型號獲得FDA認證，可以進行臨床樣本的檢測。Solexa的錯誤類型主要是顛換。
羅氏454平台，主要特點是測序長度很長，目前大於1K的測序沒有什麼難度了，比較適合基因組測序，用於搭建基因組框架，也常用於微生物基因組測序。該平台主要的錯誤類型是插入缺失。
ABI的SoLID平台，聽說該平台不在維護了，故而不再描述。
Life的Ion torrent平台，目前主要有2種型號，較早的一個型號是PGM，該測序儀原理類似於454測序，與454不同的是，454是化學反應發光進行檢測，而PGM是半導體測序，檢測H離子，如果發生了鹼基互補配對，那麼高能磷酸鍵就會釋放H離子，導致電位變化，從而根據已知加入的鹼基，就可以判斷待測序列是否與已知加入的鹼基發生互補，從而達到測序目的，測序長度可以達到400BP，主要用於微生物的檢測，錯誤類型也是插入缺失錯誤。最新的型號是IonProton，該機器與PGM測序原理一致，但是測序通量由PGM的1G數據上升至10G數據，測序精度也較PGM有大幅度提升，測序時間大約是1天。
PacBio的單分子三代測序，該測序儀最大的特點就是測序長度比454更長，更加有利於基因組的拼接工作，有些較小的微生物可以直接將基因組測通成環狀。
㈧ 基因測序結果的圖怎麼看
你是Sanger測序還是二代測序？Sanger測序的話一般公司都會給你兩個文件，一個是峰圖的文件，還有個能用文本文檔打開的文件，里邊是測序得到的序列，峰圖可以用軟體打開，比如Chromas Lite是一個免費軟體，網上就能下到。若是二代測序的話就需要生物信息學的人給處理下才能看了
1. 假設你測的是一個基因的序列，如果已知這個基因的序列，則將你測序得到的基因序列與已知的序列相比對，分析看兩者在哪個地方不對應，不對應的地方即為突變的地方。比對的軟體有sequencher，或者去NCBI網站點擊BLAST進行。
2. 如果你測的是一個以前未知的序列，那麼要測幾個不同的單克隆，將測得的結果進行比對，分析一致的地方以及不一致的地方。