A. 簡述生物進化的主要證據有哪些
古生物學上的證據：各類生物的化石在地層里的出現是有一定順序的，也就是越早形成的地層里成為化石的生物越簡單、越低等；越晚形成的地層里成為化石的生物越復雜越高等。還有胚胎學上的證據，比較解刨學上的證據。
B. 生物進化論是真實的嗎有什麼證據可以證明呢
生物進化論（達爾文）是一種科學理論。就目前的實驗及研究看來，這個理論還是很正確的。
證據：由於進化論核心觀點是適者生存，物競天擇。目前比較好的例子就是非洲草原上的犀牛——犀牛一直都長著角。但由於大量偷獵行為，有角的犀牛經常受到捕殺。結果近幾年人們發現，犀牛族群中出現了沒有角的犀牛（後來人們發現這種犀牛原本就有，只不過數量稀少），並且這種犀牛的數量還在不斷擴大。
另一個比較好的例子就是課本上的曼徹斯特實驗。
其實你在生活中多觀察，也一定能找到這種理論的證據。
C. 進化有哪些證據
生物進化論的證據首先是化石。科學家通過對化石生物與後來的生物進行對比，找出其進化的證據。另一個證據是通過對不同動物相應器官的對比，如人的手和鳥類的翅膀，雖然表面不一樣，但結構和起源卻相同，來說明人和鳥類在遠古時代有共同的祖先。此外，還可以通過對不同生物的胚胎進行研究，找出它們在發育學上的共同祖先和依據。
化石
化石是動物或植物死亡後的殘體經過長時間而沒有腐爛，數年後成為地殼的一部分。有的化石是機體自身完好的保存，有的是在沉積岩中的印模，有的是生存時留下的痕跡。到目前為止，已發現的化石有幾百萬種，大部分是海中生物的化石。通過研究這些化石，科學家可以逐漸認識遙遠的歷史時期生物的形態、結構、類別，可以推測出億萬年來生物起源、進化、發展的過程，還可以恢復漫長的地質歷史時期各個階段地球的生態環境。
D. 生物進化論都有那些證據
生物進化論,簡稱進化論[1],是生物學最基本的理論之一。進化(evolution),是指生物在變異、遺傳與自然選擇作用下的演變發展,物種淘汰和物種產生過程。地球上原來無生命,大約在30多億年前,在一定的條件下,形成了原始生命,其後,生物不斷的進化,直至今天世界上存在著170多萬個物種。生物進化論最早是由查爾斯·羅伯特·達爾文提出的,在其名著《物種起源》有詳細的論述。進化論有三大經典證據:比較解剖學、古生物學和胚胎發育重演律。
E. 生物進化論的證據是什麼
進化論的破滅
導 言
進化論，一個錯誤的信仰！進化論，一個無知的信仰！進化論，一個誤入歧途的信仰！
1859年，達爾文提出了進化論學說，他認為生物不是神創造的， 而是經過漫長的歲月從簡單到復雜進化來的。嚴格地說，進化論至今都只是一種假說，當年達爾文希望將來能發現確鑿的證據，可是禁得起檢驗的證據至今也沒有找到，而且進化論的理論與事實也出入太大，論證模稜兩可，結論也無法重復。後來的學者是把進化論當作一種科學的信仰繼承下來的。也正是因為信仰，才把它當成真理介紹給學術界和公眾，這種新奇的假說很快形成了一個流行的信仰，人雲亦雲，被人們當成了真理。 然而，嚴謹的學者清楚：接受的人多並不能把一個假說上升為真理，真理需要嚴密的推理和無可辯駁的證據，這正是進化論所缺乏的。
筆者多年來熱衷於進化論的研究，也一度在感情上強烈地維護著它的尊嚴。但是面對越來越多的事實，嚴謹的思考使我看到了進化論的錯誤所在。在此，筆者希望用通俗的語言，把進化論的問題和一些鮮為人知的事實公諸於世。 希望改變這一百多年來，進化論者代替公眾在思考，甚至代替其它領域的科學家在認識真理的局面－－在事實面前，在嚴謹的推理面前，把理智思考的機會留給每一個人。
一、暴露的問題被掩蓋了
1880年，美國加利福尼亞的太波山下出土了許多精巧的石器工具，鑒定後確認這是5500萬年前的遺跡，完全打破了進化論里人類進化的體系。然而， 這個驚人的發現很快被莫名其妙地「淡忘」了。當盛行的理論受到沖擊時，人們總是不願意懷疑自己的信仰，即便面對事實也要懷疑或者不願理睬。
1966年，墨西哥的霍亞勒克出土了一批鐵矛，美國地質學家麥金泰爾博士奉命去鑒定。她用了兩種方法測定了鐵矛的年代，得到了同樣的結果：距今25萬年。這個違背進化論的結果實在讓科學界無法接受。一個歐洲學者迫於各方面的壓力， 改成了人們願意接受的年代。而麥金泰爾，這位在國際上有一定聲望的教授，卻從此失去了在相關領域里工作的一切機會。
已故的考古學家阿曼塔也遭遇了類似的命運。他在墨西哥的普瑞拉瓦城發現了一個史前動物的頜骨，裡面有一塊殘破的鐵矛的矛頭，鑒定發現是26萬年前的武器，一些刊物公布了這個不尋常的發現，但很快招來了權威們不做任何調查的批判，阿曼塔的事業也從此被扼殺了。
這類故事還有不少。好象一些人總在維護著過去的東西，他們可以憑經驗否定事實。少數人的權威言論，代替了公眾的思考。權威們造成的科學輿論，成了先入為主的思維框框，公眾很難了解實際情況，只有無條件接受權威的觀點－－科學在這里成了一種信仰。
隨著時間的推移，進化論暴露的問題越來越多。一些進化論學者開始反戈一擊， 他們根據事實對進化論謹慎地提出了疑問，自然毫無例外地招來了經驗性的批判。但是，事實畢竟是事實，理論的困惑，永遠吸引著每一個探求真理的人。
二、進化論的三大證據相繼破滅
進化論有三大經典證據：比較解剖學、古生物學和胚胎發育的重演律，可是近年來的研究使得它們相繼瓦解了。
比較解剖學，暴露了進化論的邏輯錯誤－－循環論證。
科學上，如果一個理論的證明違背邏輯，這個理論就不能成立，但是人們對進化論的邏輯錯誤卻沒有深糾，也是因為深糾起來，就沒有證據可言了。例如用比較解剖學來論證進化，形象地說就是：「如果人是猿進化來的，人和猿就會有許多相近的特徵；因為人和猿有許多近似之處，所以人就是猿進化來的。」懂邏輯的人都知道這種循環論證毫無意義。這種似是而非的「證明」貫穿於進化論所有的證據之中。人雲亦雲，人們盲從地接受了它。
胚胎發育重演律，邏輯上不能立足，理論上禁不起推敲，事實上是一個觀察錯誤。
19世紀，德國的海克爾提出了重演律學說，認為高等生物胚胎發育會重現該物種進化的過程。其實重演律本身就是假說，這個假設就成了進化論的重要證據：如果進化存在，胚胎發育的「重演現象」很象在反映進化的過程；因為有重演現象，進化就是存在的。這不但運用無意義的循環論證，而且掩蓋了最關鍵的一點：誰也不明白「重演現象」和進化有什麼關系，硬說成是因果關系。
其實，重演律是在生物學還很不發達的時候提出的假說，隨著遺傳學的出現和分子生物學的發展，特別是對基因的深入研究，重演論失去了理論依據。既然過去的基因已經突變成新基因了，怎麼還重現過去的特徵呢？就重演律本身，古生物學家古爾德也指出了該理論的致命缺陷，這些已是共識了。
現在，很多學者證明了重演律是一個觀察錯誤。 德國人類胚胎學家布萊赫施密特（Erich Blechschmidt）所著的《人的生命之始》（ The Beginnings of Human Life）一書中，以詳盡的資料證明人的胎兒開始就都是人的結構，例如以前認為胎兒早期出現的象魚一樣的「鰓裂」，實際是胎兒臉上的皺褶，完全是人臉的結構，被硬說成「鰓裂」。胎兒在9毫米左右，身體下端的突起好象是尾巴，其實沒有任何尾巴的結構特徵，那是一條中空的神經管，它發育較快，向阻力小的方向生長，暫時向末端突出，很快就平復了。而且它是有重要作用的，根本就不是殘跡器官。
對罕見的畸形病：毛孩和長尾巴的小孩，進化論認為那是人祖先的特徵；要按這么推理，沒有大腦的畸形更多，那人的祖先就沒有大腦了？先天肢體殘缺的、多長手指、腳趾的也常見，那麼人的肢體就是從各種畸形進化來的？ 跳出進化論的思想框框一想，就會發現所謂的「返祖現象」只是畸形或缺陷而已，是基因畸變的反映，和人類祖先聯系在一起毫無道理。
古生物學上，至今沒有找到確鑿的證據－－進化中的過渡類型。如果進化存在，必然存在進化過程中物種之間的過渡類型， 否則就進化就是謬論。
在邏輯上，過渡類型的化石也就成了進化論的三大證據之一。而事實上，這方面並沒有確鑿的證據可用，達爾文等人猜想20世紀會找到明確的證據，也就是當時用「猜想」作了證據－－這又是極不嚴肅的。事實又是怎樣呢？直到現在， 發掘出的化石不計其數，禁得起推敲和鑒定的證據還沒有一例。
在從猿到人的問題上，尋找過渡物種「類猿人」，早就列入了科學的「十大懸案」。數次宣布的人類始祖，很快就被否定了。例如1892 年發現的人和猿之間的過渡化石「嘉伯人」，是一塊猿的頭骨和相距40英尺的一根人的腿骨拼湊出來的，學術界否定了「嘉伯人」，科教方面卻還在宣傳。直到1984 年「嘉伯人」才被新發現的猿人化石「露茜」代替。但後來的鑒定中，露茜也被大部分學者否定了，科學家已經確定了露茜是一種絕種的猿，和人無關。6具「始祖鳥化石」的相繼問世，轟動了世界，成為鳥類和爬行動物之間過渡物種的典範。後來鑒定出5具是人造的，剩下的1具堅決拒絕任何鑒定。 最初的「發現者」坦白了造假的原因之一：太信仰進化論了，就造出了最有力的證據。 而教科書中，對始祖鳥和露茜還是不予更正，公眾也就不知真相了。
假如進化存在，過渡類型化石就應該很容易找到，為什麼沒有呢？大家沿用達爾文的解釋：化石記錄不完全。深入一想：化石的形成是普遍和隨機的，為什麼單單漏掉了過渡類型呢？《審判達爾文》一書的作者約翰遜(Philip Johnson）做了這樣的總結：「化石向我們展示的都是突然出現的某種有機體，沒有逐步進化的任何痕跡……這些有機體一旦出現，基本上就不再變了，哪怕過了幾百萬年， 不管氣候和環境如何變化。如果達爾文的理論成立，這些條件本應該引起物種的巨大變化。」
古生物學家古爾德（Stephen Jay Gould）和埃爾德里奇曾根據地質歷史的事實，提出了一個「間斷平衡」假說，來說明過渡類型形成化石機率較小， 並但不能解釋為什麼過渡類型根本不存在，而且該假說的進化機制在基因水平上看， 是絕對不可能的。
三、 現代進化論在理論上的致命錯誤
如果一個理論是正確的，從不同的角度出發，都能證實其真理性，而且不同方面的證明互為補充。相對論的證明和證明基因是DNA分子正是這樣。而進化論卻相反：各個學說之間有著根本的對立，分歧之大是絕無僅有的。
可能古爾德舉的這個例子能很形象地揭示原因：「布林頓（D.G.Brinton）1890年的研究指出：黑人是低等的，因為他們保留著幼年的特徵；博克（L. Bolk）1926年的研究宣稱：黑人是低等的，因為他們的發育超越了白種人保留的幼年的特徵。」為什麼矛盾的論據會支持同樣的觀點呢？因為他們在為一種錯誤的信仰找根據，而不是根據事實得出科學的結論。這里暴露的也正是進化論的問題。
再從一般的角度講，如果一個理論在根本上有自相矛盾的地方，而且與某些已被驗證的定理矛盾，科學的嚴謹性是不能容忍它立足的。下面的幾點致命問題，足以否定進化論了：
概率計算表明，生物進化的可能性小到了絕對不可能的程度。現代進化論從基因水平解釋進化，這是達爾文時代無法想像的。基因不發生根本的改變，一切表面的變化對進化都沒有意義。也就是說，進化必須以基因進化為基礎。現代進化論用基因隨機突變假說解釋進化的根本原因。值得注意的是，在數學公式和模型普遍應用與生物學領域的今天，進化論者從來沒有提出公式，計算基因突變機制實現進化的機率，因為任何一個合理的公式都會否定進化。
許多學者從概率上證明了現代進化論的錯誤，貝希（Behe, M.J. ）的《達爾文的黑匣子》(Darwin`s Black Box )一書，多處從生命結構的復雜精密性否定了進化的可能。
這里提出一個寬松的公式，根據突變機率計算進化產生新物種的概率：P＝（M• C•L•B•S)&&N
通俗地說，就是一個物種的某個體發生了突變（機率只有10&&-3），並且突變後的基因與自身其它基因在不同層次的產物上可以相容（寬松估計10&&-2），而且在生存競爭中該個體能夠存活，有繁殖的機會（10&&-1），而且突變恰好好有縱向進化的意義（這種情況至今沒有發現，權且估計為10&&-3），而且突變基因在種群中不被丟失、穩定、擴大，一旦丟失就又得重來（寬松的估計為10&&-2）；因為新物種的形成需要一系列新基因的出現，假設要10個（冪指數N＝10，實際物種間絕對沒有這么小的基因差異）那麼進化出一個新物種的概率為：P＝（10&&-3 × 10&&-2 × 10&&-1 × 10&&-3× 10&&-2 ）&&10 = 10&&-110。
按照一年繁殖10代，種群個體數為1000，相應的進化所需要的時間極為寬松的計算也需要10&&106年。目前科學認為宇宙中所有基本粒子總數只有10&&70個，宇宙年齡只有200億（2×10&&10年），進化一個新物種的時間，是宇宙的年齡的自乘10億次，足見進化是絕不可能的。
無數實踐證明：品種的變化和新物種的產生是兩回事。達爾文把一個物種內部的變化推廣到所有生物物種的進化， 比如狗可以培養出許多品種，那麼猴子也能這樣進化成人。這種推測本身就大有問題。實踐的結果都在否定達爾文的這個猜想。育種專家都知道，一個物種的變化范圍是有限的。最終，培育出的品種不是不育，就是又變成原來的親本。
現代進化論對於進化的速度問題，理論和事實自相矛盾生物從低等到高等，在縱向上、整體上看，基因突變發生的速度越來越慢，突變個體的自然存活能力越來越低，那麼進化速度就應該越來越慢； 而進化論領域公認：在地質歷史上，縱向上看，新生物出現的速度越來越快，呈現明顯的加速進化趨勢。
「進化時間表」掩蓋了大量反面事例，化石展示了周期性災變的歷史。生物進化時間表是在化石資料很有限的情況下，為證明進化論而編成的，本身錯誤很多，如鳥類出現的時間是根據造假的始祖鳥來的。隨著後來化石出土得越來越多，大量與進化論相背的事例不斷出現，但是因為這些發現不可理解就給壓制住了。如果按時間順序排列古生物學的全部發現，得到的結果足以否定進化論了。考古學家克萊默和湯姆森（Michael A. Cremo & RichardThompson）的《考古學禁區》(Forbidden Archeolgy) 一書，列舉了500個確鑿的與進化論相背的事例，那是幾萬、幾十萬、百萬、幾萬甚至幾億年前的人類文明遺跡。
考古學家朱伊特（Y. Druet ）在法國的一塊石灰岩層中發現了一些不同型號的金屬管，岩層的年齡是6500萬年。在美國德克薩斯州拉克西河岸的岩層中，在恐龍腳印化石旁邊發現了12 具人的腳印化石。同一地層中又發現了人的手指化石和一把鐵錘，錘柄已經變成了煤，足見其年代的古老。錘頭含有96.6%的鐵，0.74%的硫，2.6%的氯，這是一種現在都不可能造出來的合金。最遠可追溯到的28億年前的幾百個精巧的金屬球，20億年前的大型核反應堆，其結構也比今天還先進。許多學者猜測那個反應堆是外星人的遺跡，那麼2萬年前的古代神廟顯然是地球人的建築，它體現的天文學知識和冶金技術也超出了現代人；而發現的25萬年前的鐵制武器又展示出一個不太發達的人類文明，著名的美國Science雜志98年（282卷1453～1459）刊登了一系列考古發現：1.5萬年前的人像，2.3萬年前的人像、3萬年前用猛獁象牙雕刻的馬，9萬年前帶倒鉤的矛。我們知道，我們人類的文明從蒙昧時期發展到今天的輝煌，只用了5千年左右，這些間隔久遠古跡的，不正代表了不同時期的文明嗎？這樣的例子數不勝數。
事實告訴人們：人類的文明也遵循著這樣一條規律：「出生－－發展－－滅亡」。 跳出進化論的框框，就會發現化石實際對進化論反戈一擊。 化石不是一般條件下能形成的，生物在腐爛風化前必須埋在地下很深，在強大的壓力下才能漸漸變成化石。只有大災變才能提供這樣的條件，化石也就成了災難的見證。地層中化石的研究恰恰告訴人們：物種的發展是很短時間內大面積突然出現的，發展繁榮，再到大毀滅，殘留的和新出現的物種再這樣發展，周而復始。
地球周期性災變的直接證明非常多。在西伯利壓的凍土中，發現了冰凍的成千上萬的哺乳動物的遺骸。有的很完整，有的被扯碎和樹干絞在一起。檢測它們胃裡的食物，發現了還沒來得及消化的毛茛草。活生生的事實告訴人們，那裡曾是溫和地帶的草原，極短時間內，發生這場毀滅性的災難。哈普古德（Charles H. Hapgood ）認為：極短的時間內，板塊發生了幾千英里的移動，把西伯利壓帶到了今天的位置。當然，還可能是其它大災變的原因。哈普古德教授發現了費納烏斯（Oronteus Finaeus）在1532 年根據史料繪制的世界地圖，它顯示了冰層以下的南極洲，當把它與現代測到的南極洲冰層以下的面貌疊在一起的時候，驚人地相似。在君士坦丁堡（Constantinople）還發現了1513 年皮瑞• 雷斯（A. PiriReis）綜合史料繪制的非洲和南美洲的海岸地圖及南極洲地圖，精確到半個經度，這比在人類能夠在海上確定位置早250年。顯然，這是上一期人類文明的遺跡。而且，那個文明時期，南極洲沒有冰雪覆蓋。
四、人類忘記了過去
至此，誰還要維護進化論的信仰呢？其實現在，很多理智的科學家也承認進化論是一個不能證明的信仰，沒有新理論，只能用它，而反對它就會弄得身敗名裂，這樣引火燒身的例子也不少。許多科學家為進化論奮斗幾十年，越研究越發現進化的飄渺，有人象牛頓、愛因斯坦一樣，最終醒悟，去宗教中尋找答案。紐西蘭遺傳學家但頓（Michael Denton ）在《出現危機的理論：進化論》一書中坦白地說：「達爾文的進化論是二十世紀最大的謊言。」
印度已故一代偉大靈性宗師聖帕布帕德在《博伽梵歌原義》的導言中寫道：「凡人有著四種缺陷：（1）肯定會犯錯；（2）常為假象迷惑；（3）有欺騙的傾向；（4）受不完整的感官限制。有這四種缺陷的人，便不能夠完整地傳達遍存萬有的知識。」進化論的始作俑者及其追隨者們便是這四項缺陷的最好的寫照。
進化論不僅誤導了整個生物學，而且誤導了心理學、倫理學和哲學等許多領域，誤導了人類文明的發展。它給人類文明造成的潛在的禍害，是觸目驚心的：它讓人把宗教和道德善惡視為欺騙，敗壞精神寄託和道德制約；它告訴人們弱肉強食，適者生存，在競爭中採取各種手段發展自己；讓人們相信反傳統、反潮流的畸變可能出現更進化的、更好的結果；它讓人相信人是動物的後裔，讓人相信人的本性來源於動物；西方心理學進一步發展認為：人的慾望是人最本質的本性，甚至是進化出來的最好的本性，為物慾橫流和倫理的敗壞從科學上解除了約束，這種宣傳已經充斥了社會的方方面面。種種這類敗壞的因素滲透進現代常人社會的一切，潛在地推動了人類道德的滑坡。人們一心進化自己，一面放縱地發展著自己，一面在緊張的競爭和顧慮中生存，越來越自私，當自私慾望得不到滿足時，各種不道德的行為和犯罪愈演愈烈了。人們失去了理解和信任，在社會上失去了安全感。短暫的享受和榮耀，換取著無可挽回的一切：道德滑坡、心理畸變、利慾膨脹、兩極分化、怪病叢生、無休止的競爭、社會的畸形發展、資源的耗竭、環境的污染、慘列的戰爭等等。失去了道德的約束，人們失控發展私慾，造成了無可挽回的一切。如今恐怕到了必須破除進化論的迷信的時候了。
我們應該正視那些被進化論掩蓋了的真實的歷史。無數輝煌的文明消失了，能看到的只是零星的殘跡，在我們的記憶中，只記得柏拉圖時代留下的傳說：發達的亞特蘭帝斯文明葬身海底。迄今可見的史前人類文明，埃及的金字塔、玻利維亞的古城帝華納科（Tiahuaracu）、秘魯薩克塞華曼（Sacsayhuaman）城堡也許是傑出的代表了。這些巨石建築體現了一個天文、建築、冶金等技術超過現代人的文明。他們留下的遙遠的傳說，以及世界各地的傳說，為什麼在文明毀滅的原因上驚人的一致？ 今天的人們卻忘記了古人的啟示，甚至憑借進化論自居，認為古人愚昧。
復活節島的巨石人像，默默凝望著東方，那時的人，沒有忘記給雕像刻上眼淚。
F. 生物進化的證據在哪
現在的科學家們不僅接受了生物進化的理論，而且找到了大量的證據來證實它。
最直接和最可靠的證據是古生物學研究中挖掘出來的大量化石。化石是保存在地層中古代生物的遺體、遺骸和生物活動的遺跡、遺物的總稱。在不同的地質年代所發現的不同化石，就是在地球演變的不同時期各類生物發生和發展的真實記錄。因此化石是能夠證明生物進化的最有說服力的歷史證據之一
通過化石人們了解到，在地球形成的初期太古代，地球上沒有生命存在。目前已知最早的生命痕跡，出現在34億年前。元古代開始出現一些原始動植物，主要是單細胞綠藻、原生動物和腔腸動物。古生代的化石非常豐富，幾乎所有無脊椎動物門類都能找到其化石的代表。有一種屬於節肢動物門的古生物叫三葉蟲。它的甲殼容易存留成為化石。從化石中可以清楚地看到，這種小動物在寒武紀初期即已出現，寒武紀晚期發展到高峰，志留紀以後逐漸衰亡，二迭紀未完全絕滅。前後長達幾億年，品種多達一萬種，所以有人稱那個時代為「三葉蟲時代」。
古生代中期是魚類的極盛時期。古生代末期兩棲類高度發展，同時出現了原始的爬行類和原始的裸子植物。中生代是爬行類和裸子植物的時代，這一代的中期，恐龍稱霸於世，廣布於水陸空各個領域。新生代出現了現代類型的生物，恐龍等大型爬行類和裸子植物基本滅絕，代之而起的是鳥類、哺乳類和被子植物。在新生代後期距今200～300萬年前，生物進化達到高峰，完成了從猿到人的轉變。
化石的發現和研究，使人們清楚地看到，地球上各類生物並非在同一時期出現，而是有早有晚。越是早期地層發掘的化石構造越簡單；越是晚期地層發掘的生物化石構造越復雜，和現在的生物類型越相似。演變的總趨勢是從簡單到復雜，從低等到高等，種類也由少到多。這清楚地說明，生命在悠久的歷史發展中是不斷前進的，各類生物都是通過億萬年的逐漸進化發展才形成的。
一些過渡類型的生物化石更能說明問題，比如始祖鳥化石，兼有鳥類和爬行類兩類動物的特徵，表明鳥類是從古代爬行類動物演化來的。各種各樣馬的化石多達數百種，按地質年代順序排起來，就可以清楚地看到從始祖馬、漸新馬、中新馬、上新馬直到現代馬的整個變化過程。
此外還有一些器官，在某些生物體內十分發達有用，而在另一些生物體內卻顯著退化，變得無用，這叫做「痕跡器官」，像人的闌尾。從痕跡器官的存在可以追溯物種進化的歷史。鯨的體內留有後肢骨的痕跡，說明鯨起源於陸生脊椎動物。蟒蛇光溜溜的，一條腿也沒有，但體內卻有四肢的痕跡，說明它起源於四足動物。
通過發掘化石研究生物進化的過程是很有說服力的，但這並非是一件容易的事情。對任何一個結論的作出，都要經過艱苦的發掘和認真的考證。自從近幾年我國科學家發現了「中華龍鳥」和「孔子鳥」的化石後，一場關於「究竟誰是鳥類真正始祖」的爭論就開始了。但不少中外科學家在看了中華龍鳥的化石後，認為這是一種恐龍的化石而不是鳥類的化石。而孔子鳥與始祖鳥雖然都生活在中生代晚侏羅紀，但孔子鳥化石所在地層的地質年代稍晚於始祖鳥。因此目前世界上已發現的最早的過渡類型的鳥類化石還是德國的始祖鳥。不過這場爭論還在繼續中。
比較解剖學也為生物進化提供了有力的證據。在許多不同種類的生物體上，有些位置相當的器官，外形和功能上很不相同，但內部結構卻基本一致，而且在胚胎發育過程中有相似的起源，這樣的器官叫「同源器官」。例如鳥類的翅膀和哺乳類的兩個前肢。這說明，它們都起源於原始的爬行類。與此相反，有些器官外形相似，功能也相同，但內部構造和胚胎發育中的起源都不同，這叫做「同功器官」。例如鳥類的翅膀和蒼蠅的翅膀。這說明這些生物並非從同一祖先發展而來，它們的器官是在適應外界環境的發展變化過程中趨向於一致，形成了相似的形態。
胚胎學的證據更加有趣。一切高等動物、植物的胚胎發育都是從一個受精卵開始的，這似乎可以說明高等生物起源於低等的單細胞生物。魚類、兩棲類、爬行類、鳥類、哺乳類和人，在成熟的生物個體形態上，差別非常大。但是觀察它們的早期胚胎，卻相似到難以辨認的程度。胚胎早期，各種高等生物都有鰓裂和尾巴，頭大，身體彎曲，發育到一定程度後才顯現出不同的形態。這說明脊椎動物都有共同的祖先，人類是從有尾巴的動物進化來的。這個現象正是德國的赫胥黎、海克爾在1866年提出的「生物發生律」，也叫「重演律」的佐證。這是由於生物在個體發育中迅速地重現了祖先的主要演化階段，這種重演現象在生物界普遍存在，是生物進化有力而又有趣的證據。
此外細胞學、生物化學和分子生物學也都能為進化論提供證據。例如可以從生物染色體的數目和形態上研究物種間的親緣關系。染色體數目相同，形態相近，說明它們在物種上有非常近的親緣關系。如果用血清比較法進行鑒別，會發現狗和狼的親緣關系比較近，而與狐狸和牛的親緣關系就比較遠。先進的科學技術所提供的各種精細的測試手段為研究物種關系和生物進化打開了方便之門。
物種在地理分布上的特點也從某個側面證實了進化的過程。比如澳大利亞和紐西蘭有很多袋鼠、袋狼等有袋類動物和鴨嘴獸、針鼴等單孔類動物，但很難見到胎盤類動物。這說明胎盤類的哺乳動物最初出現在北方大陸上，後來逐漸向南方推移。但紐西蘭陸地在中生代的侏羅紀就脫離大陸而去，澳大利亞陸地在中生代白堊紀前也與北方大陸分離，所以北方大陸上的新物種無法進入遠隔重洋的地區，這才使隔離出去的陸地上仍然保持著原始哺乳動物物種的水平。
總之，各種各樣無以數計的證據都為生物進化這一科學理論作了很好的說明。在令人信服的科學理論和有力證據的支持下，生物進化論和細胞學說一起成為近代生物科學的基礎理論並帶動和引導生物學的各個分支學科蓬蓬勃勃地發展起來。