『壹』 真核生物基因啟動子
啟動子
啟動子區域通常是指被轉錄的基因轉錄起始位點上游的序列，是特定調控元件結合的地方，能夠幫助RNA轉錄。真核生物至少需要七個轉錄因子才能使RNA聚合酶II（一種真核生物特異性RNA聚合酶）與啟動子結合。啟動子控制RNA聚合酶與DNA的結合，RNA聚合酶將DNA轉錄成mRNA，並最終翻譯成功能蛋白。
—addgene
「啟動子」實際上是一個模糊不精確的描述。啟動子區域內通常具有特定的序列，但有時也指延伸的啟動子區域，可能包括基因上游較遠的序列，這些序列可能有助於增強或抑制特定細胞中即將轉錄的特定基因。
—NHGRI
組成啟動子的主要部分有三個：核心啟動子，近端啟動子和遠端啟動子。
核心啟動子
核心啟動子區域位於最接近起始密碼子的位置，並包含RNA聚合酶結合位點，TATA框和轉錄起始位點（TSS）。RNA聚合酶將穩定地結合到該核心啟動子區域，並啟動模板鏈的轉錄。TATA盒是核心啟動子區域內的DNA序列（5'-TATAAA-3'），一般轉錄因子蛋白和組蛋白可以結合在該區域。組蛋白是在真核細胞中發現的將DNA包裝成核小體的蛋白質。組蛋白結合阻止轉錄的啟動，而轉錄因子促進轉錄的啟動。核心啟動子的3'端部分（最接近基因的起始密碼子）是TSS，它實際上是轉錄開始的地方。但是，只有真核生物和古細菌包含此TATA盒。大多數原核生物包含一個被認為功能上等效的序列，稱為Pribnow盒，通常由六個核苷酸TATAAT組成。
近端啟動子
在核心啟動子的更上游，近端啟動子包含許多主要調控元件。在TSS上游約250個鹼基對處發現了近端啟動子，它是一般轉錄因子結合的位點。
遠端啟動子
啟動子區域的最後部分稱為遠端啟動子，它位於近端啟動子的上游。遠端啟動子也含有轉錄因子結合位點，但主要是含有調控元件。
『貳』 關於pribnow box和TATA box
TATA box指的是古菌和真核生物啟動子區域裡面的叫法，細菌中tata box的同系物被叫做pribnow box。兩者功能類似但是pribnow box的序列相對較短，一般在-10 有6bp，在-35有8-12bp