⑴ 目前常用生物信息學分析方法有哪些
現在比較熱門的資料庫包括GEO、TCGA
GEO分析主要是晶元做差異分析,得到差異基因,差異基因可以做GO、KEGG功能富集分析
TCGA資料庫是癌症分析的利器,可以做差異基因,差異miRNA,差異lncRNA,下載和整理臨床數據,做生存分析,高難度的COX分析
這兩個資料庫可以發到不錯的文章
⑵ 生物檢測新方法
生物檢測法包括:(1)生物毒性試驗法。小鼠生物法是AOAC推廣的檢測麻痹性貝類毒素的標准方法,是國際上都能接受的唯一的方法。該方法在檢測樣本總毒性方面相當成功,但是無法准確定性樣本中單個毒素。
此外,還有家蠅生物分析法、蝗蟲生物分析法。上述3種生物分析技術原理相似。 (2)細胞毒性試驗法。石房蛤毒素具有Na+通道阻滯劑的特性,可拮抗箭毒、藜蘆鹼的作用,以減少或「解救」細胞形態的改變及細胞裂解死亡,且該拮抗或「解救」作用與毒素的量呈對應關系。
根據該對應關系可以計算出毒素的含量。早期建立的方法是用顯微鏡計數活細胞數以檢測PSP毒素的量,但試驗時間長,操作繁瑣,所需細胞量大。 在該原理之上發展起來一種STX的快速診斷裝置MIST,已成功用於酸性粗毒中PSP總毒性的測定及STX、neoSTX、GTX和dcSTX相關毒性的測定,該裝置的靈敏度高,檢測迅速且無需組織培養的設備及專業知識。
(3)免疫分析技術。隨著抗STX抗體的獲得,免疫分析技術如血球凝聚反應、放射免疫分析(RIA)和酶聯免疫分析(ELISA)等逐漸發展起來,其中直接競爭ELISA法是最常用的一種方法,檢測限可達3pg/ml,間接ELISA的檢測限也可達到10pg/ml。
免疫方法靈敏度高,方便迅速,但抗體的獲得是其關鍵,各毒素的交叉反應低,不能完全體現樣品的毒性來源。(4)受體分析法。即固相受體結合法(solid-phase receptor binding assay),主要是根據PSP毒素能與Na+通道蛋白質結合的特點,應用同位素標記以檢測PSP類毒素的量,具有快速、可靠、准確的特點。
Llewellyn等以一種特異結合STX的類似轉鐵蛋白Saxiphilin代替Na+通道蛋白質,其對STX的鑒定具有專一性,從而與TTX的鑒定相區別。
⑶ 建立生物樣品分析方法,對定量分析方法進行驗證包括哪些內容
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生物樣品定量分析方法驗證指導原則
1.
范圍
准確測定生物基質(如全血、血清、血漿、尿)中的葯物濃度,對於葯物和制劑研發非常重要。這些數據可被用於支持葯品的安全性和有效性,或根據毒動學、葯動學和生物等效性試驗的結果做出關鍵性決定。因此,必須完整地驗證和記錄應用的生物分析方法,以獲得可靠的結果。
本指導原則提供生物分析方法驗證的要求,也涉及非臨床或臨床試驗樣品實際分析的基本要求,以及何時可以使用部分驗證或交叉驗證,來替代完整驗證。
生物樣品定量分析方法驗證和試驗樣品分析應符合本指導原則的技術要求。應該在相應的生物樣品分析中遵守GLP原則或GCP原則。
2.
生物分析方法驗證
2.1
分析方法的完整驗證
分析方法驗證的主要目的是,證明特定方法對於測定在某種生物基質中分析物濃度的可靠性。此外,方法驗證應採用與試驗樣品相同的抗凝劑。一般應對每個物種和每種基質進行完整驗證。當難於獲得相同的基質時,可以採用適當基質替代,但要說明理由。
一個生物分析方法的主要特徵包括:選擇性、定量下限、響應函數和校正范圍(標准曲線性能)、准確度、精密度、基質效應、分析物在生物基質以及溶液中儲存和處理全過程中的穩定性。
有時可能需要測定多個分析物。這可能涉及兩種不同的葯物,也可能涉及一個母體葯物及其代謝物,或一個葯物的對映體或異構體。在這些情況下,驗證和分析的原則適用於所有涉及的分析物。
⑷ 生物樣品分析方法驗證應包含哪些內容,如何驗證及評價
那要看是哪一類的生物樣品,主要風險控制在於哪個方向。 一般要根據樣品的種類,所要測定的成份,來確定使用什麼葯品什麼測定方法。 對於植物主要是重金屬和農殘,鉛砷鉻鎘銅和DDt,666等 對於動物主要是抗生素、寄生蟲葯等獸葯殘留和激素等
⑸ 簡述酶法分析生物葯物和基因工程葯物的原理,主要有哪些方法
酶分析法在生物葯物分析中的應用主要有兩個方面:第一,以酶為分析對象,根據需要對生物葯物生產過程中所使用的酶和生物葯物樣品所含的酶進行酶的含量或酶活力的測定,稱為酶分析法;第二,利用酶的特點,以酶作為分析工具或分析試劑,用於測定生物葯物樣品中用一般化學方法難於儉測的物質,如底物、輔酶、抑制劑和激動劑(活化劑)或輔助因子含量的方法稱為酶法分析。
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特定及優勢
而如果有僅作用於被測物質的酶,利用酶的特異性,不需要分離就能辨別試樣中的被測組分,從而對被測物質進行定性和定量分析。所以,酶法分析常用於復雜組分中結構和物理化學性質比較相近的同類物質的分離簽定和分析,而且樣品一般不需要進行很復雜的預處理。酶法分析具有特異性強,干擾少,操作簡便,樣品和試劑用量少,測定快速精確,靈敏度高等特點。通過了解酶對底物的特異性。可以預料可能發生的干擾反應並設法糾正。在以酶作分析試劑測定非酶物質時,也可用偶聯反應;而且偶聯反應的特異性,可以增加反應全過程的持異性。此外,由於酶反應一般在溫和的條件下進行,不需使用強酸強鹼,它還是一種無污染或污染很少的分析方法。很多需紅使用氣相色譜儀、高壓液相色譜儀等貴重的大型精密分析儀器才能完成的分析檢驗工作,應用酶法分析方法即可簡便快速地進行。酶法分析目前主要廣泛應用於醫葯、臨床、食品和生化分析檢測中,如尿素、各種糖類、氨基酸類、有機酸類、維生素類、毒素等物質的定性和定量分析。