1. 什麼是WGS測序
WGS全稱為whole-genome shotgun就是全基因組鳥槍法
它的作法是把基因組直接打碎成3kb(也有地方寫的是2Kb……)左右的小片段,測序並拼接。並且,WGS在現在的測序項目中使用得越來越廣泛。例如水稻基因的測序,就是使用的WGS策略。
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基因測序的方法 是在獲得一定的遺傳及物理圖譜信息的基礎上,繞過bac克隆逐個排序的過程,將基因組dna分解成2kb左右的小片段進行隨機測序,輔以一定數量的10kb的克隆和bac克隆的末端測序,利用超級計算機進行整合進行序列組裝
2. 生物信息學計算機知識和CS專業計算機知識有多大不同
計算生物學(通常翻譯為Computational Biology)和生物信息學(通常翻譯為Bioinformatics)暫時還沒有統一的定義。但是從對計算機,生物和醫學知識的要求方面,可以簡約分成兩類。
第一類對計算機方面要求更高,更多專注於演算法,數據結構。強調工具的效率和通用性。比方說通常提到的比對(Alignment)和組裝(Assembly)問題。一個高效通用的比對演算法可以用在DNA,RNA,Epi等不同方面的分析當中,比方說當前被大量使用的BWT轉換(Burrows-Wheeler Transformation,生物信息常用變體包括雙向BWT轉換,FM-index,分區FM-index),動態規劃(Dynamic Programming,生物信息里常用變體包括Banded DP, Myers' bit-vector)。為了提高效率,在硬體允許的情況下還會用到SIMD,GPU,MIC和FPGA等專用加速設備。這部分的專家還會參與到文件格式和API標準的制定,比方說BAM和VCF文件格式和GA4GH API標準的制定。對於推進工業化的進程,這方面的專家會因應需求,製作在線或者本地部署的平台以應付日益增長的對項目、數據和知識的分析、總結和共享的需求。相比較項目分析(第二類)而言,從事了這方面的研究,時間投入較大,較難出成果,更難銷亂絕對生物信息分析中的多個分支有全面的了解。但是這部分專家的技能較難替代,回報也相對較大。一個優秀的工具可能被引用上百次甚至上千次。這部分專家從就業的角度並不局限於生物信息,積累下來的演算法,數據結構,計算機,數據挖掘,機器學習方面的技能能平行運用到金融等其他領域,一個例子是Morgan Stanley總部去年招Engineers和Quants特別青睞生物信息方面畢業的博士。
第二類對生物和醫學方面要求更高,更多專注於對研究對象和數據的理解。比方說通常人方面提到的全基因組(WGS),全外顯子組(WES),癌症基因組,輔助制葯,表觀分析(WGBS,RRBS,Chip-SEQ,Hi-C),單細胞等,非人方面的包括育種,宏基因組,虧姿基因組組裝等。不同方向之間共享一部分的基礎知識,比方說質控。不同方向對知識儲備和經驗有不同的要求,比方說癌症基因組對醫學和臨床的要求較高,基因組組裝對計算機方面的要求較高。一個人可以是一個方向,也可以是多個方向的專家。這些人能把多個基礎工具結合在一起產生1+1>2的效果(有時候連第一類寫工具的人都想不到自己的工具可以被這么使用)。這些專家的經驗比較難通過項目之外的其他途徑獲得(不是說書本無用,但肯定不夠用)。這方面的研究對出成果有更好的保證(無論大小,一個項目一個成果)。這方面的人才在這個時間點上比較容易獲得海外博士以及博士後的機會。但是畢業後轉換工作機會成本較大,工作的選擇也較為局限。需要盡早對職業進行規劃,找到機會逃出自己的舒適區,擴展知識面,或者根據自己的能力,做好進入管理崗等其他通道的准備。
隨著生物信息的發展,在陪模下一個Solexa技術出來之前,市場對這兩類人的要求必然更加精細化,第一類人提供更好的平台和工具,第二類人更高效和全面地發現問題和解決問題。
3. 高中生物植物激素的字母簡稱都是什麼 生長素,赤黴素,乙烯,細胞分裂素,脫落酸
脫落酸(abscisic acid,ABA) 赤黴素(英語:Gibberellin,簡稱為GA)
生長素(auxin英文簡稱IAA) 乙烯(ethylene)
細胞分裂素 (cytokinin, CTK)
4. WGS測序的優缺點及如何在醫學研究中的應用
wgs即「鳥槍法」優點是速度快,簡單易行,成本較低。缺點是真核生物因含有內含子,所以 不宜使用 。
醫學研究中可以用來測某一個基因的全長
5. G1 G2,S,M在生物學中分別代表什麼期
G1,G2,S都屬於分裂間期,M屬於分裂期,G1期是合成與DNA合成有關的蛋白質,S是DNA合成,G2是合成另一些蛋白質,為M期准備。
6. 生物 大腦皮層語言區怎麼記。什麼S W H V區。求竅門
樓主你好,可以採用單詞記憶法,w可以理解為write,s為speak,v為vision(此詞為視覺的名詞),h為hear。這樣可以形象一點,還有,必修三這個圖的出題性不是很大,樓主須記住"運動性失語症"便可。望採納
7. 國自然標書里測序分析怎麼寫
標書寫作技巧
一、概述
1.概述:簡要描述測序分析的基本原理,以及作為生物科學研究的重要性。
2.技術:介紹常用的測序分析方法,如Sanger測序,高通量測序,質譜分析等。
3.優勢:介紹測序分析技術的優勢,如可提供准確、快速和可重復性的結果,可提供全面的基因組結構信息等。
4.應用:簡要介紹測序分析在生物學研究中的應用,如研究基因組結構、進化關系、物種分類等。
二、正文
測序分析是指利用一定的技術方法,對樣品中的DNA、RNA或蛋白質的結構進行測定,獲取其序列的過程。這種技術可以為生物科學研究提供重要的信息,對於我們對生輪手物基因的進一步解析具有重要意義。
常用的測序分析方法主要有Sanger測序、高枝帆通量測序和質譜分析等。Sanger測序是一種改良的DNA測序方法,它可以獲得准確、快速和可重復性的結果,是在發展測序技術的過程中的重要進步。高通量測序是一種新型的基因測序技術,它可以在短時間內對大量樣品進行測序,可以提供全面的基因組結構信息,是研究生物基因組結構和進化關系的重要臘搭嫌手段。質譜分析也是一種比較常用的測序分析方法,它可以准確地測定DNA序列,並可以檢測和鑒定DNA片段中的異常鹼基對。
測序分析技術在生物學研究中有廣泛的應用,包括研究基因組結構、進化關系、物種分類、微生物多樣性、基因定位、基因表達調控等。它可以提供准確、快速和可重復性的結果,為生物學研究奠定了基礎。
三、結論
綜上所述,測序分析技術是一種重要的生物學研究工具,其准確、快速和可重復性的結果為生物學研究奠定了基礎,可以提供全面的基因組結構信息,在生物學研究中有廣泛的應用。
8. G1 G2,S,M在生物學中分別代表什麼期
G1,G2,S都屬於分裂間扮猛期,M屬於分裂期,G1期罩缺則是合成與DNA合成有關的蛋物棚白質,S是DNA合成,G2是合成另一些蛋白質,為M期准備。
9. 高中生物植物激素的字母簡稱都是什麼生長
1、脫落酸(abscisic acid,簡稱ABA):強烈地抑制生長,並使衰老的過程加速。
2、赤黴素(Gibberellin,簡稱GA):夏季使植物繼續生長,冬季使芽進入休眠狀態。
3、生長素(auxin,簡稱IAA):能促進細胞伸長,體積增大,使植株生長。
4、乙烯(ethylene):對細胞生長的抑製作用。
5、細胞分裂素(cytokinin,簡稱CTK):促進細胞分裂,使植株的細胞數目增多,從而促進植物生長。
(9)wgs在生物是什麼擴展閱讀
植物生長調節劑的應用
1、剩用乙烯利催熟,如鳳梨的有計劃上市,香蕉、柿子、番茄等上市前的催熟。
2、利用赤黴素溶液處理蘆葦,增加纖維長度,如在蘆葦生長期用一定濃度的赤黴素溶液處理,就可以使蘆葦的纖維長度增加50%左右。
3、用赤黴素處理大麥,可使大麥種子無須發芽就可產生α一澱粉酶。
4、青鮮素可以抑制發芽,延長馬鈴薯、大蒜、洋蔥的貯藏期。
10. 什麼是WGS測序
Whole genome sequencing的縮寫,全基因組測序的意思。