怎麼使用ncbi查基因生物幫

⑴ 如何用NCBI查找某個菌屬下所有菌種的某個基因

1,sp.是圓廳species的縮寫,也就是物種,而spp.代表一個類群,比如一個屬的一群微生物 2,首先打開NCBI網站首橘蔽隱頁,然後在search一欄中選擇nucleotide,在框中輸入你要的並空基因序列名稱,點擊search就行.然後會出來很多結果,因為很多基因是同名的,或是一個基因在不同種屬中不一樣,尋找你要的基因序列就行了.注意的是,要確定你的基因名稱是否是統一的.

⑵ 如何使用 NCBI 查找基因序列，mRNA，Promoter

1、在NCBI上查找基因的mRNA序列。
2、Messenger RNA (mRNA）——信使核糖核酸信使核糖核酸
攜帶遺傳信息，在蛋白質合成時充當模板的RNA。悉基信使RNA
從脫氧型陸模核糖核酸（DNA）轉錄合成的帶有遺傳信息的一類單卜緩鏈核糖核酸（RNA）。它在核糖體上作為蛋白質合成的模板，決定肽鏈的氨基酸排列順序。mRNA存在於原核生物和真核生物的細胞質及真核細胞的某些細胞器（如線粒體和葉綠體）中。

⑶ 怎樣在NCBI上查找基因的cDNA序列

以上即是基本步驟。

⑷ 怎樣在NCBI中查找基因

在NCBI 上查找基因，挺多人都在問這個。當然，對於經常泡NCBI 的人來說，查找基因是
入門的、基礎的，對高手來講根本不是個問題。但新手就不同了。
當然了，直到現在，雖說已經會了一些，但在NCBI 查找基因，雖說是基礎但也是挺復雜的
今天要講的。
今天用「苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase，PAL)」來作為例子，物種是豆科的。
1，打開NCBI，選擇核苷酸（Nucleotide）資料庫，填上Phenylalanine ammonia-lyase，
點擊GO，搜索
2，我們來看結果，總共有1022 個，結果太多了，有時候剛好你要的結果在第一頁的話，
那就好辦。不是的話，你慢慢的找，實在不是辦法。特別是網路不好時，上NCBI 又很慢，
的確是一種折磨。
3，這個時候我們可以再想辦法縮少范圍，比方你要找的是豆科的，我們來大豆（soybean）
來作例子。在搜索時加上soybean，結果將會大大減少。
4，這時候結果已經一目瞭然此畝螞，這里需要再介紹另外一種搜索的方法。這種方法是比較精確
的。首先在taxonomy 資料庫查到soybean 的 taxonomy ID，再回到Nucleotide 資料庫，
搜索」 Phenylalanine ammonia-lyase txid3847 「，txid 是taxonomy ID 是縮寫，3847 是大豆
soybean 的taxonomy ID。這樣子，將搜索范圍鎖定在大豆。
5，看下圖，出來的結果都是大豆的，這時基本上就耐嘩大功告成了。找到了大豆苯丙氨酸解氨酶的序列
6，進入序列頁面，默認是GenBank 格式，你也可以選擇Fasta 格式，一般都是森埋保存為Fasta格式。

⑸ 怎樣使用NCBI搜索並下載基因序列

工具/材料

NCBI官網

首先，我們打開NCBI官網頁面，在頁面上方搜索框中，選擇要下載的基因序列類別，這里我們需要選擇「Nucleotide」選項。

接下來，我們就需要輸入具體的名稱了，這里我輸入的是Kinase，代表一種酶，然後點擊「search」按鈕，即可出現搜索結乎老叢歲櫻果。

點擊進入所需要的搜索結果，在頁面中左側，點擊「FASTA」按鈕。

在接下來打開的頁面右側，點擊「Send to」選項，然後選擇「File」，點擊「Creat File」按鈕。

最後，我們即可調用瀏覽器含梁下載該基因序列文件了，選擇好文件存儲位置之後，點擊「下載」按鈕。

⑹ 怎樣從NCBI上查載體基因序列，如果NCBI上沒有的話要到哪查例如：pROK II

首先打開NCBI網站首頁，然後在search一欄中選擇nucleotide，在框中輸入你要的基因序列名稱，點擊search就行。然後會出來很多結果，因為很多基因是同名的，或是一個基因在不同種屬中不一樣，尋找你要的基因序列就行了。注意的是禪灶，要確定你的基因名稱是否是統賀閉扮一的，我以前就是找一個基因費了很多事，之後發現是自己沒有用通用的。找到基因序列，蛋白序列就很容易了，因為結果中會顯示該基因的蛋白序列。你也可以在開始search的時候選protein，找到的就是蛋白序列了。多嘗試就好了，其實很簡單，英文不錯的話，更簡單。要有耐心。
只要已經測過序的基因上邊都態鎮有，而且這是最全的基因庫。其他的不用考慮，找不到就只能考慮上邊本人的經驗。

⑺ 在NCBI中如何查詢基因的功能

知道了名字，在搜索框里輸入後可以看到相應的搜索結果，然後點擊進去，有個「MIM」（在線孟德爾遺傳）就可以看到它的功能。
ORF是開放閱讀框，指的是mRNA上編碼氨基酸的那段序列，從AUG開始，直到終止子，但是不包括終止子。ORF的數據在進入NCBI主頁的右下側一個叫ORFfinder的超鏈接里，點擊進去後輸入相應序列的mRNA序列，然後再點擊ORF find就可以預測處它的ORF，但是往往會有很多結果，一般來說第一個結果是真實的，其餘的都是假陽性的。
fasta格式指配余的就是一個大於號開頭，後面跟上這段序列的描述，然後另起一行就是數列，給你個例子你就知道了，如下培納滾，這就是茄殲人類USF1 mRNA的fasta格式
>gi|46877100|ref|NM_007122.3| Homo sapiens upstream transcription factor 1 (USF1), transcript variant 1, mRNA


























AAAAAAAAAAA
這就是fasta格式，你可以以TXT的方式保存，也可以以後綴名為.fasta的方式保存，然後以文本文件打開就行了，說白了就是個文本文件呵呵。一般情況下這樣就可以了，但是如果用blast2go來做GO分類的話，就必須用.fasta來保存，否則該軟體不識別。詳細的在NCBI上都有的，自己可以去看。