㈠ 上海捷瑞生物工程有限公司 待遇怎麼樣
公司人事會修改你的學歷,少交金,女同事懷孕期間,想進各種辦法趕你走,你問問裡面員工就知道是不是真的了。
㈡ 如何設計sybrgreen法熒光定量pcr引物
引物 熒光定量PCR 是利用熒光定量PCR 儀(如ABI 7500、stepone、ROChe LightCycler、Bio-Rad CFX96 等)通過實時追蹤 PCR 每一步循環的熒光信號 值來達到對起始模板量的定量分析。一次成功的熒光定量 PCR 反應除了需要穩 定的儀器、優質的 Taq 酶、比較好的模板質量,更需要高質量的引物對。想要 得要高質量的引物對的前提是引物的設計必須要精益求精。下面我們以人IL6 因為例(以人IL6基因mRNA 序列作為模板設計引物),給大家講解如何進行高 質量的引物設計。 (1)利用 NCBI 資料庫,查詢基因的序列。登錄 NCBI 官方主頁: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/。在欄目項中選擇「Gene」,關鍵詞輸入「IL6 homo」,具體如下所示,點擊「Search」。(2)結果如下,一般第一條基因即為所要查詢的基因,這里需要注意「Aliases」 一欄,因為很多基因有很多別名,在查詢時需要注意。明確基因後,直接點擊 ,進入人IL6 基因的主頁。 上海捷瑞生物工程有限公司(3)進入人 IL6 基因的主頁後,往下拉動網頁,看到如下界面。由於我們設計 引物的模板是mRNA,所以我們要找到該基因的轉錄本信息。點擊「reference sequence details」。 (4)得到如下界面,我們看到,人IL6 基因在NCBI 里的記錄是2 個轉錄本, 我們在設計引物時,除非需要檢測某個特定的轉錄本,一般的做法是將該基因所 有的轉錄本序列進行比對分析,找到他們共有的序列區域,選擇該共有區域作為 模板設計引物,這樣設計的引物就能盡可能的擴增出該基因的所有mRNA 信息。 針對IL6 基因,我們分別點擊「NM_000600.4」和「NM_001318095.1」打 開這兩個轉錄本信息。 上海捷瑞生物工程有限公司(5)我們看到,人IL6 基因的兩個轉錄本序列大小不一樣,分別為1197bp 1006bp。我們將這兩條mRNA序列復制到比對軟體(如BIOEDIT 用軟體對這兩條序列進行比對分析。(6)比對結果如下,從比對結果看出,這兩條序列前後均一致,只有轉錄本2 在141-331bp 處發生了缺失,我們選擇共有區域331bp-1197bp 的序列作為 上海捷瑞生物工程有限公司模板設計引物。 (7)將這段共有序列復制到引物設計軟體中,引物設計的軟體很多,比如 Primer premier6.0、Oligo7.37、在線Primer3、Beacon Designer、在線NCBI Primer-BLAST 等。不同的引物設計軟體的工作原理大同小異,基本都具備引物 設計的基本原則(後面列出),但是對引物Tm值的計算結果不同的軟體可能有 差異,這主要跟計算方法有關。捷瑞生物提供免費的引物設計服務,所使用的設 計軟體是自主開發,並自主運行ePCR(電子PCR),具備引物BLAST 功能,盡 量選擇最優化的引物對。下面以在線NCBI Primer-BLAST 為例,說明引物的設 計過程。 (8)打開在線NCBI Primer-BLAST 。將序列復制到制定的位置,如下圖。在「PCR proct size」選擇 Min「80」;Max「250」(熒光定量PCR 產物的大小盡量不要很大,保證PCR 擴增的效率)。在「Database」一欄選擇mRNA 資料庫(一般默認為Refseq mRNA)。在「Organism」一欄選擇物種是人(一般默認為Homo sapiens)。 一切設置好後,點擊「Get Primers」即可。 上海捷瑞生物工程有限公司(9)打開後會出現以下選擇項,需要觀察這段序列是否屬於所要設計的基因序 列,這里直接點擊「Submit」即可。 (10)得到如下結果,圖中給出所設計的引物的上下游引物位置;具體的某一 對引物的參數;該對引物的ePCR 結果等。考察一對引物質量是否理論上優異, 需要看如下幾個方面:引物Tm值一致,盡量在60左右;引物盡量無發卡結 構二聚體等;ePCR 產物盡量單一,盡量無非特異性產物等。 上海捷瑞生物工程有限公司(11)至此,引物設計的工作就結束了,接下來就是將設計的引物序列發送到 引物合成公司合成,在拿到引物成品後,按照儀器和相關試劑盒說明書做預實驗, 調試引物的質量。理論上,選擇再優的引物對,只有且只能通過真實的實驗驗證, 才能100%確定該對引物是否能用。在做熒光定量P CR 實驗時,對引物擴增效 率的測試非常的重要,這塊後續我們再具體探討。 (12)熒光定量PCR 引物設計的一般原則: PCR產物的長度在70-300bp 之間,避免產物太長導致PCR 擴增效率降低, 影響定量結果; 引物設計的區域盡量選擇在mRNA的3』段,盡量保證擴增的產物為該基因 所表達的全部mRNA 信息; 如果一個基因有很多轉錄本,盡量選擇他們的共有序列為模板來設計引物,保證擴增產物的穩定性; 引物盡量避免發卡結構、二聚體結構、非特異性擴增產物、引物Tm值不一致、引物序列中有連續4 個鹼基以上的Poly 結構等等; 總之,理論上再好的引物對,只有通過真實的實驗驗證才能判斷其是否能用、好用。
㈢ 南京有沒有做的比較好的實驗外包的公司
南京英瀚斯生物不錯的,有實驗室,還能參與實驗,做的還比較全