如何對微生物分類鑒定

① 微生物如何界定物種

1。16S相似度。16S指的是核糖體小亞基的RNA組分，也就是16S rRNA。長度大約1500nt，不同物種略有差異。這里需要測全長的16S，一般用27F和1492R這對引物。擴出來之後送一代測序，然後去資料庫比對，也就是BLAST。一般認為相似度超過97%的話，就是同一個物種；低於97%的話就是不同物種。這只能用來做初步判斷，因為變形菌門可能相似度達到99%的仍然可能是不同的種（忘了是哪篇文獻了，似乎是討論97%閾值的）。但是這個指標可以簡單的幫我們確定這個菌是哪個屬，或者哪個科。定屬還是靠譜的。

2。形態學觀察。比如這個菌的形狀、大小、鞭毛情況等等。還包括最適生長條件的確定。

3。磷脂脂肪酸鑒定，這個具有屬特異性。

4。呼吸醌。看一下占優勢的呼吸醌是哪種。這個有種特異性。

5。分子雜交。測定基因組序列，草圖就行，然後跟近源物種去比較。相似度超過70%是一個種，低於70%是不同物種。閾值的數值記不清了，大概是65-70%吧。

6。碳源利用情況。看一下能利用哪些碳源。95種碳源的測試。

7。API試劑盒鑒定，生理生化鑒定的一方面。

8。GC含量。

9。革蘭氏染色。

確定了新種之後，需要命名。命名用的是現代拉丁文或者希臘文，因為拉丁文已經是死文字了，語義不會再變化。生物的拉丁名都是有意義的，比如Arthiobotrys oligospora，這是一種真菌，中文名寡孢節叢孢。是節叢孢屬的。種名oligo表示稀少的，spora表示孢子。屬名我不會拆詞，但是節肢動物的名字是Arthropoda，所以可以看出屬名是帶「節」的，表示分節。Pseudomonas aeruginosa，銅綠假單胞菌。pseudo是假的，偽的，monas表示單一的，單個的，aeruginosa表示銅綠，也就是銅銹。需要注意拉丁文和希臘文是分陰陽性的，這個在解釋命名的時候都會有。

② 如何對一株微生物進行分類鑒定和命名

如何對一株微生物進行分類鑒定和命名
（1）常規鑒定 常規鑒定內容有形態特徵和理化特性。形態特徵包括顯微形態和培養特徵；理化特性包括營養類型、碳氮源利用能力、各種代謝反應、酶反應和血清學反應等。（2）BIOLOG碳源自動分析鑒定 BIOLOG鑒定系統以微生物對不同碳源的利用情況為基礎，檢測微生物的特徵指紋圖譜，建立與微生物種類相對應的資料庫。通過軟體將待測微生物與資料庫參比，得出鑒定結果。（3）分子生物學鑒定 提取細菌基因組DNA，然後PCR擴增16srDNA片段並測序，將結果與GeneBank或者Eztaxon對比分析，一般序列相似度在97%以上就可以認為是同種細菌，該方法也是目前微生物分類學研究普遍採用的鑒定方法。——源自網路

③ 微生物檢測或鑒定技術或方法有哪些

微生物檢測或鑒定技術或方法有哪些
通過顯微鏡直接觀察。一般來說，在一定的培養條件下（相同的培養基、溫度以及培養時間），同種微生物表現出穩定的菌落特徵。這些特徵包括菌落的形狀、大小、隆起程度和顏色等方面。（見高中生物選系1《生物技術實踐》圖2-8）因此可以通過顯微鏡觀察菌落特徵對微生物種類進行判斷。
使用選擇培養基培養微生物或人為提供有利於目的菌株生長的條件。選擇培養基，顧名思義其作用是允許特定種類的微生物生長，同時抑制或阻止其他微生物生長。例如，使用以尿素作為唯一氮源的培養基能夠培養出可合成脲酶的微生物；在培養基中PH調至酸性有利於黴菌的生長繁殖（抑制細菌的生命活動）等。選擇培養一般是通過觀察微生物的同化作用類型或某一特徵進行間接判斷，得到的微生物往往並不只有一種，但是能夠大致確定這些微生物存在的共有特徵從而對其分類。
使用鑒別培養基。即根據微生物的代謝特點，在培養基中加入某種指示劑或化學葯品。例如，水質檢驗中大腸桿菌的檢驗（大腸桿菌的存在數量用以衡量水被糞便污染的程度）就用到了伊紅—美藍試劑，該試劑與水或乳製品中的大腸桿菌反應出現深紫色且帶有金屬光澤，屬於大腸桿菌的特徵反應。與選擇培養相比，鑒別培養基的鑒別所得結果的范圍比較小，一般可直接測定某微生物的種類。

④ 人們往往是根據什麼對微生物進行分類的

微生物的分類依據（可以參考沈萍 微生物學第二版 第十一章）
形態特徵
（1）個體形態 鏡檢細胞形狀、大小、排列，革蘭氏染色反應，運動性，鞭毛位置、數目，芽孢有無、形狀和部位，莢膜，細胞內含物；放線菌和真菌的菌絲結構，孢子絲、孢子囊或孢子穗的形狀和結構，孢子的形狀、大小、顏色及表面特徵等。 培養特徵 1）在固體培養基平板上的菌落（colony）和斜面上的菌苔（lawn）性狀（形狀、光澤、透明度、顏色、質地等）； 2）在半固體培養基中穿刺接種培養的生長情況； 3）在液體培養基中混濁程度，液面有無菌膜、菌環，管底有無絮狀沉澱，培養液顏色等。
生理生化特徵
（1）能量代謝 利用光能還是化學能； （2）對O2的要求 專性好氧、微需氧、兼性厭氧及專性厭氧等； （2）營養和代謝特性 所需碳源、氮源的種類，有無特殊營養需要，存在的酶的種類等。
生態習性
生長溫度，酸鹼度，嗜鹽性，致病性，寄生、共生關系等。
血清學反應
用已知菌種、型或菌株製成抗血清，然後根據它們與待鑒定微生物是否發生特異性的血清學反應，來確定未知菌種、型或菌株。
噬菌反應
菌體的寄生有專一性，在有敏感菌的平板上產生噬菌斑，斑的形狀和大小可作為鑒定的依據；在液體培養中，噬菌體的侵染液由混濁變為澄清。噬菌體寄生的專業性有差別，寄生范圍廣的謂多價噬菌體，能侵染同一屬的多種細菌；單價噬菌體只侵染同一種的細菌；極端專業化的噬菌體甚至只對同一種菌的某一菌株有侵染力，故可尋找適當專化的噬菌體作為鑒定各種細菌的生物試劑。
細胞壁成分
革蘭氏陽性細菌的細胞壁含肽聚糖多，脂類少。革蘭陰性細菌與之相反。鏈黴菌屬（Streptomyces）的細胞壁含丙氨酸、谷氨酸、甘氨酸和2，6-氨基庚二酸，而含有阿拉伯糖是諾卡氏菌屬（Nocardia）的特徵。黴菌細胞壁則主要含幾丁質。
紅外吸收光譜
利用紅外吸收譜技術測定微生物細胞的化學成分，了解微生物的化學性質，作為分類依據之一。
G+C含量
生物遺傳的物質基礎是核酸，核酸組成上的異同反映生物之間的親緣關系。就一種生物的DNA來說，它的鹼基排列順序是固定的。測定四種鹼基中鳥嘌呤（G）和胞密啶（C）所佔的摩爾百分比，就可了解各種微生物DNA分子不同源性程度。親緣關系接近的微生物，它們的G＋G含量相同或近似的兩種微生物，不一定緊密相關，因為它們的DNA的四個鹼基的排列順序不一定相同。
DNA雜合率
要判斷微生物之間的親緣關系，須比較它們的DNA的鹼基順序，最常用的方法是DNA雜合法。其基本原理是DNA解鏈的可逆性和鹼基配對的專一性。提取DNA並使之解鏈，再使互補的鹼基重新配對結合成雙鏈。根據能生成雙鏈的情況，可測知雜合率。雜合率越高，表示兩個DNA之間鹼基順序的相似越高，它們間的親緣關系也就越近。
核糖體核糖酸（rRNA ）相關度
在DNA相關度低的菌株之間，rRNA同源性能顯示它們的親緣關系。Rrna-DNA分子雜交試驗可沒定Rrna的相關度，揭示Rrna 的同源性。
rRNA的鹼基順序
RNA的鹼基順序由DNA轉錄來的，故完全具有相對應的關系。提取並分離細菌內標記的16SrRNA,以核糖核酸消化，可獲得各種寡核苷酸，測定這些寡核苷酸上的鹼基順序，可作為細菌分類學的一種標記。 核糖體蛋白的組成分析 分離被測細菌的30S和50S核糖體蛋白亞單位，比較其中所含核糖體蛋白的種類及其含量，可將被鑒定的菌株分為若干類群，並繪制系統發生圖。

⑤ 微生物群落中關鍵物種的區分和鑒定有哪些方法

微生物群落中關鍵物種的區分和鑒定有哪些方法
微生物群落的種群多樣性一直是微生物生態學和環境學科研究的重點。近幾年來，微生物群落結構成為研究的熱點。首先，群落結構決定了生態功能的特性和強弱。其次，群落結構的高穩定性是實現生態功能的重要因素。再次，群落結構變化是標記環境變化的重要方面。因此，通過對目標環境微生物群落的種群結構和多樣性進行解析並研究其動態變化，可以為優化群落結構、調節群落功能和發現新的重要微生物功能類群提供可靠的依據。
從年代上來看，微生物群落結構和多樣性解析技術的發展可以分為三個階段。20世紀70年代以前主要依賴傳統的培養分離方法，依靠形態學、培養特徵、生理生化特性的比較進行分類鑒定和計數，對環境微生物群落結構及多樣性的認識是不全面和有選擇性的，方法的分辨水平低。在70和80年代，研究人員通過對微生物化學成分的分析總結出了一些規律性的結論，從而建立了一些微生物分類和定量的方法即生物標記物方法，對環境微生物群落結構及多樣性的認識進入到較客觀的層次上。在80和90年代，現代分子生物學技術以DNA為目標物，通過rRNA基因測序技術和基因指紋圖譜等方法，比較精確地揭示了微生物種類和遺傳的多樣性，並給出了關於群落結構的直觀信息。

⑥ 微生物的哪些特徵可作為其分類鑒定

找了好久沒有 我就自己翻書了 給大家稍稍簡答一下 （1）形態學特徵 （2）生理生化特徵 （3）抗原特性 （4）對噬菌體的敏感性 這是傳統分類的方法（no details） 還有現代分類 如遺傳重組 核酸探針 看家基因等

⑦ 微生物是如何分類的有哪些特點

微生物的分類依據：形態特徵、生理生化特徵、生態習性、血清學反應、噬菌反應、細胞壁成分、紅外吸收光譜、GC含量、DNA雜合率、核糖體核糖酸（rRNA ）相關度、rRNA的鹼基順序。
形態特徵
（1）個體形態鏡檢細胞形狀、大小、排列，革蘭氏染色反應，運動性，鞭毛位置、數目，芽孢有無、形狀和部位，莢膜，細胞內含物；放線菌和真菌的菌絲結構，孢子絲、孢子囊或孢子穗的形狀和結構，孢子的形狀、大小、顏色及表面特徵等。
培養特徵
1）在固體培養基平板上的菌落（colony）和斜面上的菌苔（lawn）性狀（形狀、光澤、透明度、顏色、質地等）；
2）在半固體培養基中穿刺接種培養的生長情況；
3）在液體培養基中混濁程度，液面有無菌膜、菌環，管底有無絮狀沉澱，培養液顏色等。

生理生化特徵
（1）能量代謝利用光能還是化學能；
（2）對氧氣的要求專性好氧、微需氧、兼性厭氧及專性厭氧等；
（2）營養和代謝特性所需碳源、氮源的種類，有無特殊營養需要，存在的酶的種類等。

生態習性
生長溫度，酸鹼度，嗜鹽性，致病性，寄生、共生關系等。

血清學反應
用已知菌種、型或菌株製成抗血清，然後根據它們與待鑒定微生物是否發生特異性的血清學反應，來確定未知菌種、型或菌株。

噬菌反應
菌體的寄生有專一性，在有敏感菌的平板上產生噬菌斑，斑的形狀和大小可作為鑒定的依據；在液體培養中，噬菌體的侵染液由混濁變為澄清。噬菌體寄生的專業性有差別，寄生范圍廣的謂多價噬菌體，能侵染同一屬的多種細菌；單價噬菌體只侵染同一種的細菌；極端專業化的噬菌體甚至只對同一種菌的某一菌株有侵染力，故可尋找適當專化的噬菌體作為鑒定各種細菌的生物試劑。

細胞壁成分
革蘭氏陽性細菌的細胞壁含肽聚糖多，脂類少。革蘭陰性細菌與之相反。鏈黴菌屬（Streptomyces）的細胞壁含丙氨酸、谷氨酸、甘氨酸和2，6-氨基庚二酸，而含有阿拉伯糖是諾卡氏菌屬（Nocardia）的特徵。黴菌細胞壁則主要含幾丁質。

紅外吸收光譜
利用紅外吸收譜技術測定微生物細胞的化學成分，了解微生物的化學性質，作為分類依據之一。

GC含量
生物遺傳的物質基礎是核酸，核酸組成上的異同反映生物之間的親緣關系。就一種生物的DNA來說，它的鹼基排列順序是固定的。測定四種鹼基中鳥嘌呤（G）和胞密啶（C）所佔的摩爾百分比，就可了解各種微生物DNA分子不同源性程度。親緣關系接近的微生物，它們的G+G含量相同或近似的兩種微生物，不一定緊密相關，因為它們的DNA的四個鹼基的排列順序不一定相同。

DNA雜合率
要判斷微生物之間的親緣關系，須比較它們的DNA的鹼基順序，最常用的方法是DNA雜合法。其基本原理是DNA解鏈的可逆性和鹼基配對的專一性。提取DNA並使之解鏈，再使互補的鹼基重新配對結合成雙鏈。根據能生成雙鏈的情況，可測知雜合率。雜合率越高，表示兩個DNA之間鹼基順序的相似越高，它們間的親緣關系也就越近。

核糖體核糖酸（rRNA ）相關度
在DNA相關度低的菌株之間，rRNA同源性能顯示它們的親緣關系。Rrna-DNA分子雜交試驗可測定Rrna的相關度，揭示Rrna 的同源性。

rRNA的鹼基順序
RNA的鹼基順序由DNA轉錄來的，故完全具有相對應的關系。提取並分離細菌內標記的16SrRNA,以核糖核酸消化，可獲得各種寡核苷酸，測定這些寡核苷酸上的鹼基順序，可作為細菌分類學的一種標記。
核糖體蛋白的組成分析
分離被測細菌的30S和50S核糖體蛋白亞單位，比較其中所含核糖體蛋白的種類及其含量，可將被鑒定的菌株分為若干類群，並繪制系統發生圖。
望採納，謝謝。

⑧ 微生物的哪些形態特徵可作為其分類鑒定的依據

微生物的菌落已具有比較穩定的形態結構，所以可以根據微生物的大小菌落的形態結構以及隆起度，顏色等等，這些都是作為分類的重要依據。