㈠ 靶向代謝組學和非靶向代謝組學的區別
靶向代謝組學新技術,區別於傳統的非定向代謝組學,具有如下優勢:
1.樣品種類多:生物流體(血液、尿、唾液、腸道微生物)、環境樣品、細胞、動植物組織、污水、葯品、食品。
2.化合物涵蓋廣:包括脂類、維生素、核苷酸、神經遞質等700種代謝產物,涵蓋所有主要代謝途徑。
3.分析時間短:我們的方法能在30min同時測定並准確鑒定出700種化合物。
4.復雜的數據處理:專業的數據處理方法和軟體,能對所得數據進行PLS-DA,PCA,ANOVA,VIP,Biomarker等分析。
㈡ 哪些單位能做微生物代謝組學的測定
靶向代謝組學新技術,區別於傳統的非定向代謝組學,具有如下優勢: 1.樣品種類多:生物流體(血液、尿、唾液、腸道微生物)、環境樣品、細胞、動植物組織、污水、葯品、食品。 2.化合物涵蓋廣:包括脂類、維生素、核苷酸、神經遞質等700種代謝產物,涵蓋所有主要代謝途徑。 3.分析時間短:我們的方法能在30min同時測定並准確鑒定出700種化合物。 4.復雜的數據處理:專業的數據處理方法和軟體,能對所得數據進行PLS-DA,PCA,ANOVA,VIP,Biomarker等分析。
㈢ 微生物代謝,微生物生長,微生物發酵有什麼不同
微生物代謝是指微生物吸收營養物質維持生命和增殖並降解基質的一系列化學反應過程。有機物的降解和微生物的增殖如圖所示,分解代謝中,有機物在微生物作用下,發生氧化、防熱和酶降解過程,使結構復雜的大分子降解;合成代謝中,微生物利用營養物及分解代謝中釋放的能量,發生還原吸熱及酶的合成過程,使微生物生長增殖。、內源呼吸,則是細胞質進行自身氧化並放出能量的過程。當有機物充足時,細胞質得到大量合成,而內源呼吸則並不顯著;當缺乏營養時,則只能通過內源呼吸吸收氧化自身的細胞物質而獲得微生物生命活動所需的能量。
微生物生長:微生物有機體的細胞組分與結構在量方面的增加。
微生物生理學嚴格定義的「發酵」:
有機物被生物體氧化降解成氧化產物並釋放能量的過程統稱為生物氧化。
微生物生理學把生物氧化區分為呼吸和發酵,呼吸又可進一步區分為有氧呼吸和無氧呼吸。因此,發酵是生物氧化的一種方式。
發酵是這樣一種生物氧化方式:在沒有外源最終電子受體的條件下,化能異養型微生物細胞對能源有機化合物的氧化與內源的(已經經過該細胞代謝的)有機化合物的還原相耦合,一般並不發生經包含細胞色素等的電子傳遞鏈上的電子傳遞和電子傳遞磷酸化,而是通過底物(激酶的底物)水平磷酸化來獲得代謝能ATP;能源有機化合物釋放的電子的一級電子載體NAD,以NADH的形式直接將電子交給內源的有機電子受體而再生成NAD,同時將後者還原成發酵產物(不完全氧化的產物)。
細胞中的NAD是有限的,如果作為一級電子載體的輔酶NAD不能得到再生,就不能被回用,有效的電子載體就會愈來愈少,脫氫反應就不能持續進行下去了。因此輔酶NAD的再生是生物氧化(包括發酵)繼續進行下去的必要條件。
㈣ 馬上就要研究生預報名了,關於華中農業大學微生物專業的導師選擇誰能給我點建議
我有同學在那裡,最好選你喜歡的方向,導師其次,找容易就業的(如果不想考博的話~~)現在只是報名,還沒選導師
㈤ 代謝組學樣本數目求助
代謝組學的代謝通路富集分析和MYROLE該怎麼用
代謝組學是對一系列相似的生物樣本中的代謝物進行比較分析的學科。代謝物在生物系統中起著至關重要的作用,因此代謝組學可用於發現和鑒定生物標志物,或更好地了解物或疾病對已知和未知生物通路的影響。成功的代謝物組學研究依賴於有效的代謝物提取。對於非靶向代謝組學研究,需要提取細胞和體液中的多種代謝物,並去除無需分析的蛋白質等成分。再加上代謝物的理化性質多樣,豐度動輒相差若干數量級,更進一步增加了提取的難度。液液萃取這種兩相分離方法常被用於代謝物的提取。液液萃取中有機溶劑和水溶液的性質、體積、溶劑比例、水溶液的pH 值都必須仔細考慮。這些因素會顯著影響提取的代謝物數量和實驗的重現性。本應用報告介紹了採用液液萃取提取紅細胞代謝物的方法。結果表明,調整水相/有機相的比例對於兩相分離非常重要。同時水相pH 值對提取的代謝物數量也有很大影響,為了提取盡可能多的代謝物,需要採用多個pH 值進行提取。
㈥ 土壤檢測一般檢測哪些項目
一般情況下,要測定土壤污染指標:銅、鋅、鉛、鎘、總汞、總砷、全硒、鎳、總鉻、氡濃度、氟化物、氯離子、硫酸根離子、有機磷農葯等。
㈦ 微生物群落結構分析的意義何在
微生物群落是廣泛存在於生態系統中的一種結構單位和功能單位,它們是生態系統內充滿生氣的一部分,群落中各種不同的種群能以有規律的方式共處,同時它們具有各自明顯的營養和代謝類型。從某種意義上說,群落的發展導致了生物的發展。在一定區域里,或一定生境里,各種微生物種群相互鬆散結合,或有組織緊湊結合的一種結構單位。在微生物群落中各種群之間相互作用。 微生物群落結構分析的意義能夠更好的把握個菌種之間的共,寄生等和諧的生活關系。比如通過對腸道菌群的分析。
㈧ 如何看待代謝組學的前景
代謝其實可以理解為生物反應的終端,內源或外源的一點擾動在代謝層面反映出來的影響都是非常大的,相比於蛋白質組學,他研究的對象更為復雜,傳統的代謝組研究一般都是通過NRM進行的,這個方法是比較准確的,尤其在定性方面,但是它的靈敏度有限,在定量方面基本是很難做到的,或者說是很不準確的。所以現在我們一般都採用質譜的方法,用GS-MS或LC-MS進行研究,GS-MS它是有公共資料庫的,可以做定性分析,但是對你樣本性質是有要求的,對於不能氣化的樣本就沒辦法適用了,所以其實還是用LC-MS多一些,不過就像上面那位同仁提到的,LC-MS現在是沒有公共資料庫的,因為代謝組研究你的儀器平台對實驗結果還是有影響的,所以一般需要根據你的儀器平台水平來自建標准品庫,所以用LC-MS很難做到定性,也可以說想做代謝定性代價很大,不過做定量的話還是很簡單的 代謝組最近幾年已經慢慢成為熱點了,發的文章的數量和水平都逐年遞增,他主要還是應用在醫學上比較多,尋找標志診斷物,尤其對於中醫,代謝組學可以說是非常非常重要的,通過代謝組學可以從數據上支持很多中醫診斷理論,當然,在其他領域也是可以應用的
㈨ 微生物做代謝組學分析的樣品怎麼處理
微生物代謝組學主要研究細胞生長或生長周期百某一時刻細胞內外所有低分子量代度謝物。分析技術的不斷發展促進了微生物代謝組學研究的進展。本文結合微生物樣品前處理方法,
綜述了目前研究中所採用內的各種分析技術的特點與應用,
並展望微生物代謝組學研究中容分析技術的發展趨勢。