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化學迴文結構怎麼判斷

發布時間:2022-07-18 04:12:37

㈠ 迴文結構和反向重復序列

六版生化講II類酶識別dna位點的核苷酸序列呈二元旋轉對稱,這種特殊的結構序列為回結構{lalindrome}如
5'-gaattc-3'
3'-cttaag-5'
下面一行反著讀和上面一行一樣
反向重復序列
{inverted
repeat
sequence}:
在同一多核苷酸鏈內的相反方向上存在的重復的核苷酸序列。在雙鏈DNA中反向重復可能引起十字形結構的形成。
tatagcGCTATA
ATTACGcgatat小寫部分就是反向重復
特別給你翻得書。給分吧
雜還不明白呢?只要雙鏈中的一條反方向讀和另一條一樣就是迴文結構啊!
5'-gaattc-3'
(1)
3'-cttaag-5'
(2)
第二行倒過來讀不就是5'-gaattc-3'么?是不是和第一行一樣?這種類似的就是迴文結構

㈡ 什麼是迴文結構

雙鏈DNA中含有的二個結構相同、方向相反的序列稱為反向重復序列,也稱為迴文結構,每條單鏈以任一方向閱讀時都與另一條鏈的序列是一致的。迴文結構序列是一種旋轉對稱結構,在軸的兩側序列相同而反向。

㈢ 迴文結構是什麼意思

迴文結構的意思是:雙鏈DNA中含有的兩個結構相同、方向相反的序列稱為迴文結構,每條單鏈以任一方向閱讀時都與另一條鏈以相同方向閱讀時的序列是一致的。迴文結構序列是一種旋轉對稱結構,在軸的兩側序列相同而反向。當然這兩個反向重復序列不一定是連續的。

迴文結構在某些因素作用下,可形成莖環式的十字形結構和上面提到的發夾結構,這些結構形式都可以互相轉變。迴文結構普遍存在於細胞的DNA分子中,與遺傳信息表達的調控和基因轉移有關。Y染色體的5000萬個鹼基對中,約有600萬個處於迴文結構中,使得Y染色體在一定程度上能夠自我修復有害的基因變異。



(3)化學迴文結構怎麼判斷擴展閱讀:

遺傳學上講的迴文序列是雙鏈DNA或RNA分子中的特定的核苷酸片段,該片段在其中一條鏈上按5'到3'讀取的序列與其互補鏈上按相同的5'到3'讀取的序列一致。迴文序列的單鏈DNA或RNA,存在對稱中心,對稱中心兩側鹼基關於該對稱中心對稱,可形成互補。

故迴文序列能夠形成發夾結構(莖環結構)。迴文序列廣泛存在於各種生物體基因組中,主要和轉錄終止有關,也是限制性內切酶酶切位點,還參與DNA復制等生命活動。

㈣ 名詞解釋:迴文結構

迴文,也寫作「回紋」、「回環」。它是漢語特有的一種使用詞序回環往復的修辭方法,文體上稱之為「迴文體」。

㈤ 如何進行dna迴文序列分析

分析:
迴文結構序列是一種旋轉對稱結構,在軸的兩側序列相同而反向。當然這兩個反向重復序列不一定是連續的。短的迴文結構可能是一種特別的信號,如限制性內切酶的識別序列。較長的迴文結構容易轉化成發夾結構,此種結構的形成可能有助於DNA與特異性DNA結合蛋白結合。

特徵與功能:
迴文序列的一般特徵: 有對稱軸 ; 是自我互補的序列 ; 兩條鏈從 5 『 到 3 『方向的序列一致 ; 是 II 類限制酶的識別序列 ;是某些蛋白的識別序列 ; 是基因的旁側序列。

結構:
其特點是在該段的鹼基序列的互補鏈之間正讀反讀都相同(並非在同一條鏈上正讀反讀)。
例如:
在雙鏈中,形成十字架結構
5' GGTACC 3'

㈥ 判斷是否是迴文的條件

buf[i] != buf[strlen(buf)-i-1]

㈦ 請問如何分析一個基因中的迴文結構

盼各位大牛提供點思路!謝謝了!迴文結構序列是指順讀和反讀都一樣的序列,廣泛存在於各種生物體基因組中。它可以在質粒、病毒和細菌基因組DNA以及真核染色體和細胞器中找到,並且廣泛分布於人類癌細胞中。很多蛋白質的結合位點是迴文結構:轉錄因子的結合位點,還有終止子也通常是迴文結構。編碼小RNA和其它非翻譯RNA的基因很多片段也是迴文結構。很多功能位點都是迴文結構。
有幾篇文獻供參考。
Computational Methods in Science and Technology 5, 21-24 (1999)SEARCHING FOR PALINDROMIC SEQUENCES IN PRIMARY STRUCTURE OF PROTEINS
Palindrome Patterns in Genomes Arthur Chun-Chieh Shih, D. T. Lee , Chi-Fang Chin, Hong-Yuan Mark Liao, and Wen-Hsiung Li
bioinformatics 2000 vol 16 no 11 page 968-977
BBRC 316 (2004) 755–762 The relationship between palindrome avoidance and intragenic codon usage variations: a Monte Carlo study Anders Fuglsang
BBRC 310 (2003) 280–285 Distribution of potential type II restriction sites
(palindromes) in prokaryotes Anders Fuglsang
Theoretical comupter science 292 (2003) 9-31
Pattern Recognition 35 (2002) 2581–2591 Finding approximate palindromes in strings
你講的是DNA或者RNA的。蛋白質的迴文序列有沒?謝了。
qigai wrote:迴文結構序列是指順讀和反讀都一樣的序列,廣泛存在於各種生物體基因組中。它可以在質粒、病毒和細菌基因組DNA以及真核染色體和細胞器中找到,並且廣泛分布於人類癌細胞中。很多蛋白質的結合位點是迴文結構:轉錄因子的結合位點,還有終止子也通常是迴文結構。編碼小RNA和其它非翻譯RNA的基因很多片段也是迴文結構。很多功能位點都是迴文結構。
有幾篇文獻供參考。

㈧ 生物化學中的迴文結構 為什麼GAGAGAGA不是 為什麼GCATATGC是

你沒發現後者是前後相互互補的嗎 g和c a和t 第一個不是迴文結構 老師是這么說的

㈨ 迴文結構

樓上錯了吧,只有第2個是迴文結構!
迴文就是雙螺旋DNA按確定的方向讀雙鏈中的每一條鏈的序列都一樣,就好像上面的第2個,
5『TCTCTCTCTCTCTCAGAGAGAGAGA』3
3『AGAGAGAGAGAGAGTCTCTCTCTCT』5
兩條鏈從5』到3』都TCTCTCTCTCTCTCAGAGAGAGAGA
反向重復與迴文結構不同,反向只是雙鏈DNA包含的一條鏈包含兩段互補序列,這兩段序列之間可以有其它任意脫氧核糖核苷酸,如:
NNNGAAGGTCCNNNGGACGTTCNNN
NNNCTTGCAGGNNNCCTGCAAGNNN(N代表任意脫氧核糖核苷酸)
每一條鏈都包含兩段互補序列!
希望我解釋清楚了!!

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