① 如何查詢化學結構信息
首先,網路HMDB,找到並打開HMDB資料庫。
打開HMDB資料庫後,點擊「Search」下的第一個子選項。
彈出頁面中,在繪制結構式的區域繪制所要查詢的結構式,本例以繪制化合物「瓜氨酸「為例。
用周圍的工具正確繪制瓜氨酸的結構式,之後點擊」Search「。
根據化合物英文名以及Score值來選擇正確的化合物,一般來說就是第一個。
6
點擊」HMDB「開頭的那個按鈕,就彈出了這個化合物的詳細的信息,包括描述以及相關蛋白、基因和通路等等。
② 根據有機化學的結構式,如何查尋該物質名稱
1)下載軟體「ChemDraw」。
2)畫有機分子結構。
3)在結構欄內點擊:結構—〉名稱,
就會給你IUPAC的系統命名。
③ 分子結構是通過什麼方式來知道的呢
原先是根據規律和組分猜測,到了20世紀多用譜的方法。
質譜:確定分子量,局部分子結構的質量
紅外光譜:確定化學鍵的類型,識別特定基團
紫外光譜:確定特定的結構
核磁共振氫譜:識別該分子中氫原子(氕)的位置(非常重要),類似的技術也可以檢測其它原子,如C-13,的位置
X射線衍射:測定晶體的結構
在這幾種手段的幫助下,結合量子化學理論,和若干年來積累的一系列理論和經驗,科學家們像偵探一樣猜測,排除別的可能,最終搞定一種結構。
此外,特定的局部結構有特定的性質,在知道分子組分的情況下可以通過反應來猜測。對於大分子,可以通過化學反應拆成小分子再各個擊破。此外,在自然界發現的復雜分子,往往人們會在實驗室里合成出可能的結構,再檢測哪種結構的特性和原分子一樣,就是這種結構。
最毒的方法是放隧道掃描鏡底下直接看,不過沒聽說有人這么干過。
④ 對有機化合物的結構鑒定,除了紅外光譜外,常用的還有哪些方法
核磁共振
確定分子結構有化學方法與物理方法,
化學方法是利用有機物官能團的特徵反應,以確定該化合物所含官能團,還可以利用化學反應進行衍生化,通過確定衍生物的結構進一步推斷原分子的結構。化學方法比較麻煩、耗時、消耗樣品較多。
物理方法因所需樣品量少、速度快、准確,甚至可以確定分子的三維空間結構,而顯出較大的優越性,是化學方法所不能比擬的。
質譜分析:
質譜分析法是一種通過測量化學物質分子或分子碎片的質量進行分析的方法,所用的儀器稱為質譜儀,所得的譜圖稱為質譜圖。
紅外光譜:
在鑒定有機化合物結構的工作中,紅外光譜是一種重要的手段,它可以確定有機化合物中存在何種官能團,也可以用來推測物質的純度。分子中的原子總是處在不斷地振動中,包括伸縮振動與彎曲振動,這兩種振動的頻率正好位於紅外區。
核磁共振氫譜:
核磁共振譜學是一門發展極為迅速的科學。因為質量數為奇數的原子核,如1H、13C、15N、19F和31P的核自旋所產生的弱磁場,在強外磁場中可以對某個特定頻率的電磁波發生共振吸收,吸收頻率和吸收強度可以提供分子結構的重要信息,從而發展成為核磁共振譜學。
⑤ web of science哪個字型檔提供化學結構檢索
Web of Science分一般檢索(Search)、被引參考文獻檢索(CITED REFERENCE SEARCH)、高級檢索(Advanced Search)、化學結構檢索(structure search)四種檢索方式。
⑥ 怎麼查找物質的化學結構式
知道化學物質的英文名稱和結構式,可以知道這種化學物質的中文名稱。
物質是組成物體的材料。
物質首先根據組成物質的不同,分為混合物和純凈物,混合物是由多種物質組成的物質,常見的混合物包括空氣、溶液、懸濁液、乳濁液、礦石和合金等。純凈物是由一種物質組成的物質,包括單質和化合物,其中單質是由一種元素組成的,分為金屬、非金屬、稀有氣體;化合物由幾種元素組成,分為無機化合物和有機化合物,無機化合物是不含碳的化合物,又分為氧化物、無機酸、鹼、無機鹽等,有機化合物是含碳元素的化合物,分為烴、烴的衍生物、碳水化合物、含氮有機化合物、高分子有機化合物等。這些物質在英文里怎麼命名呢?
一、單質。
單質在英文里,直接用組成它的元素命名即可, 如:
金屬單質:
silver 銀
aluminum 鋁
gold 金
barium 鋇
bismuth 鉍
calcium 鈣
cadmium 鎘
cerium 銫
cobalt 鈷
chromium 鉻
copper 銅
iron 鐵
mercury 汞
potassium 鉀
magnesium 鎂
manganese 錳
sodium 鈉
nickle 鎳
lead 鉛
palladium 鈀
platinum 鉑
selenium 鍶
tin 錫
titanium 鈦
uranium 鈾
zinc 鋅
非金屬單質:
arsenic 砷
boron 硼
bromine 溴
diamond 金剛石
graphite 石墨
chlorine 氯氣
fluorine 氟氣
hydrogen 氫氣
iodine 碘
nitrogen 氮氣
oxygen 氧氣
ozone 臭氧
white phosphorous 白磷
red phosphorous 紅磷
silicon 硅
稀有氣體單質:
helium 氦氣
neon 氖氣
argon 氬氣
krypton 氪氣
xenon 氙氣
radon 氡氣
二、氧化物。
氧化物是由兩種元素組成的,其中一種為氧元素,包括酸性氧化物、鹼性氧化物、兩性氧化物和不成鹽氧化物。命名金屬氧化物的時候,按照化學式的順序從左往右念即可,而命名非金屬氧化物時,要用字首表示分子里原子的個數,如:
金屬氧化物。
ferrous oxide 氧化亞鐵
ferric oxide 氧化鐵
ferroferric oxide 四氧化三鐵
trilead tetroxide 四氧化三鉛
sodium peroxide 過氧化鈉
非金屬氧化物。
carbon monoxide 一氧化碳
carbon dioxide 二氧化碳
sulfur trioxide 三氧化硫
nitrous oxide 一氧化二氮
nitric oxide 一氧化氮
dinitrogen trioxide 三氧化二氮
dinitrogen tetroxide 四氧化二氮
diphosphorous pentoxide 五氧化二磷
dichlorine heptoxide 七氧化二氯
water 水
三、酸。
酸是電離時生成的陽離子全部是氫離子的化合物。酸根據組成元素是否含有氧元素,可以分為含氧酸和無氧酸;根據酸中可被電離的氫原子個數,可以分為一元酸、二元酸和三元酸。
含氧酸的命名,是在除氫、氧元素之外的另一種元素的名稱之後加上一個「酸」字,如:
carbonic acid 碳酸
sulfuric acid 硫酸
sulfurous acid 亞硫酸
phosphoric acid 磷酸
metaphosphoric acid 偏磷酸
phosphorous acid 亞磷酸
nitric acid 硝酸
nitrous acid 亞硝酸
perchloric acid 高氯酸
chloric acid 氯酸
chlorous acid 亞氯酸
hypochlorous acid 次氯酸
acetic acid 乙酸
thiosulfuric acid 硫代硫酸
無氧酸的命名,是在「氫」字之後加上另一種元素的名稱,命名為「氫某酸」,如:
hydrochloric acid 鹽酸,氫氯酸
hydrosulfuric acid 氫硫酸
hydrocyanic acid 氫氰酸
四、鹼。
鹼是電離時生成的陰離子全是氫氧根離子的化合物,根據溶解性,可以分為可溶性鹼、微溶性鹼和難溶性鹼,根據可電離出的氫氧根離子的個數,分為一元鹼、二元鹼和三元鹼。氫氧根離子叫做hydroxygen,所以鹼的命名是在金屬元素或銨根離子的後面加上氫氧根離子。如:
aluminum hydroxide 氫氧化鋁
sodium hydroxide 氫氧化鈉
calcium hydroxide 氫氧化鈣
barium hydroxide 氫氧化鋇
cobaltous hydroxide 氫氧化亞鈷
五、鹽。
鹽是酸和鹼中和的生成物,由金屬元素(或銨根)和酸根組成,可以分為正鹽、酸式鹽和鹼式鹽。
正鹽:由金屬元素和酸根構成,其命名是在金屬元素名稱後面加上酸根的名稱,如:
mercury sulfate 硫酸汞
mercurous sulfate 硫酸亞汞
potassium nitrate 硝酸鉀
sodium carbonate 碳酸鈉
sodium hypochlorite 次氯酸鈉
ferrous sulfate 硫酸亞鐵
potassium permanganate 高錳酸鉀
lithium propanoate 丙酸鋰
sodium chloride 氯化鈉
aluminum chloride 氯化鋁
酸式鹽:由金屬元素和含氫元素的酸根組成,其命名是在酸根的前面加一個氫字,如:
sodium hydrogen sulfate 硫酸氫鈉
disodium hydrogen phosphate 磷酸氫二鈉
sodium dihydrogen phosphate 磷酸二氫鈉
calcium bisulfate 硫酸氫鈣
sodium hydrogen carbonate 碳酸氫鈉
calcium bisulfite 亞硫酸氫鈣
鹼式鹽:由金屬元素、氫氧根和酸根組成,這里的金屬元素的化合價一定是正一價以上,其命名是在酸根的前面加上「氫氧根」這個字,如:
dicopper dihydroxycarbonate 鹼式碳酸銅
calcium hydroxychloride 鹼式氯化鎂
magnesium hydroxyphosphate 鹼式磷酸鎂
復鹽:由兩種金屬元素和酸根組成,或者由一種金屬元素和兩種酸根組成,如:
sodium potassium sulfite 亞硫酸鉀鎂
calcium ammonium phosphate 磷酸銨鈣
silver lithium carbonate 碳酸鋰銀
sodium ammonium sulfate 硫酸銨鈉
potassium soldium carbonate 碳酸鈉鉀
potassium aluminum sulfate 硫酸鋁鉀
sodium ammonium hydrogen phosphate 磷酸氫銨鈉
六、有機化合物。
烴:也稱為碳氫化合物,分為烷烴、烯烴、炔烴、脂環烴和芳香烴。烷烴的命名是在表示碳原子個數的數字後面加上字尾-ane,如:
methane 甲烷
ethane 乙烷
propane 丙烷
butane 丁烷
pentane 戊烷
hexane 己烷
heptane 庚烷
octane 辛烷
nonane 壬烷
decane 癸烷
undecane 十一烷
dodecane 十二烷
heptacontane 七十烷
烯烴的命名是在數字後面加上-ene的字尾,二烯烴、三烯烴的字尾為-adiene和-atriene。如:
ethylene 乙烯
propylene 丙烯
butylene 丁烯
pentylene 戊烯
propadiene 丙二烯
炔烴的命名是在數字後面加上-yne的字尾,二炔烴、三炔烴的字尾為-adiyne和-atriyne。如:
acetelyne 乙炔
propyne 丙炔
butyne 丁炔
pentyne 戊炔
butadiyne 丁二炔
有些烴中同時含雙鍵和三鍵,稱為烯炔。如:
hexadienyne 己烯炔
pentenyne 戊烯炔
脂環烴的命名是在烴的名稱前加一個環字。如:
cyclopropane 環丙烷
cyclobutane 環丁烷
cyclohexane 環己烷
cyclopentane 環戊烷
cyclopropene 環丙烯
cyclohexenyne 環己烯炔
cyclooctadienyne 環辛二烯炔
cyclopentadiene 環戊二烯
芳香烴的命名,苯環稱為benzene,前面加上側鏈的烴基名稱即可:
benzene 苯
pentylbenzene 戊苯
heptylbenzene 己苯
二、烴的衍生物:
烴的衍生物是由烴演變而來的,由烴中的幾個氫原子被各種原子或原子團取代而成,這些原子團稱為官能團。
官能團,是決定有機化合物的化學性質的原子或原子團。常見官能團碳碳雙鍵、碳碳三鍵、羥基、羧基、醚鍵、醛基、羰基等。有機化學反應主要發生在官能團上,官能團對有機物的性質起決定作用,-X、-OH、-CHO、-COOH、-NO2、-SO3H、-NH2、RCO-,這些官能團就決定了有機物中的鹵代烴、醇或酚、醛、羧酸、硝基化合物或亞硝酸酯、磺酸類有機物、胺類、醯胺類的化學性質。
一、醇類——分子中含有跟烴基或苯環側鏈上的碳結合的羥基的化合物叫做醇,在烴基的後面加上字尾-ol。如:
methanol 甲醇
ethanol 乙醇
propanol 丙醇
butanediol 丁二醇
pentanetriol 戊三醇
cyclohexanetriol 環己三醇
benzenediol 苯二醇
propanetriol 丙三醇
二、酚類——芳香烴環上的氫被羥基(—OH)取代的一類芳香族化合物,在苯環的後面加上字尾-ol即可,最簡單的酚叫做苯酚,如:
phenol 苯酚
如果分子中含有跟烴基或苯環側鏈上的碳結合的巰基,或者芳香烴環上的氫被巰基(—SH)取代的一類芳香族化合物,則叫做硫醇和硫酚,如:
ethanethiol 乙硫醇
benzenethiol 苯硫酚
mercaptoethanol 巰基乙醇
用濃硫酸可以使醇分子間發生脫水反應,形成醚,命名時只需把發生脫水的兩個醇分子的烴基後面加上醚即可,如:
diethyl ether 二乙醚
dipropyl ether 二丙醚
dinaphthyl ether 二萘醚
三、醛類——醛是由烴基與醛基相連而構成的化合物,命名時在烴基後面加上-al構成。如:
formaldehyde 甲醛
pentanal 戊醛
hexanedial 己二醛
acryaldehyde 丙烯醛
crotonaldehyde 丁烯醛
anasildehyde 對甲氧基苯甲醛
furfuraldehyde 呋喃甲醛
四、酮類——酮是羰基與兩個烴基相連的化合物,命名時,在這兩個烴基的後面加上酮字即可,根據羰基的個數,可以分為一元酮、二元酮和三元酮等:
propone 丙酮
butanone 丁酮
pentenone 戊烯酮
hexanedione 戊二酮
diethylketone 二乙酮,戊酮
ethylmethylketone 甲乙酮
phenylethylketone 苯乙酮
五、醌類——醌是含有共軛環己二烯二酮或環己二烯二亞甲基結構的一類有機化合物的總稱。命名時,把醌字放在烴基名前面即可:
benzoquinone 苯醌
napthoquinone 萘醌
六、羧酸——羧酸的命名,是在烴基名稱後面加一個「酸」字,也叫做有機酸。羧酸都是含氧酸,如:
formic acid 甲酸
acetic acid 乙酸
oxalic acid 乙二酸
malonic acid 戊二酸
adipic acid 己二酸
succinic acid 丁二酸
benzoic acid 苯酸
phthalic acid 鄰苯二甲酸
maleic acid 順丁烯二酸
fumaric acid 反丁烯二酸
七、酯類——酸(羧酸或無機含氧酸)與醇起反應生成的一類有機化合物叫做酯,命名時在烴基的後面加上酸根的名稱即可,如:
methyl butarate 丁酸甲酯
三、含氮有機化合物。
一、硝基化合物——硝基化合物可看作是烴分子中的一個或多個氫原子被硝基(—NO2)取代後生成的衍生物,命名時,硝基要放在烴名稱前,如:
nitrobenzene 硝基苯
nitromethane 硝基甲烷
二、胺類——氨分子中的一個或多個氫原子被烴基取代後的產物,稱為胺。氨基是胺類的官能團。命名時,在烴基名稱後加-amine構成,如:
methanamine 甲胺
ethanamine 乙胺
benzenamine 苯胺
三、醯胺——羧酸中的羥基被氨基(或胺基)取代而生成的化合物,最簡單的醯胺是尿素,它是碳酸的二醯胺,命名時,在烴基後面加上-amide構成,如:
urea 尿素
butenamide 丁醯胺
四、腈類——腈可以看作氫氰酸的氫原子被烴基取代而生成的化合物,腈的官能團是氰基,最簡單的腈是乙腈。腈和氰化物不同,不是劇毒物質。命名是在烴基後面加上-onitrile構成,如:
ethanonitrile 乙腈
benzonitrile 苯腈
⑦ 如何通過結構式查詢該化合物信息
通常學化學的朋友,需要畫些簡單的分子結構圖或者反應式,用chemical draw,比較的麻煩,而在常用的word、wps中來畫則比較方便。首先,我們想好結構布局圖,然後先編輯好需要的分子結構的字母以及分布然後選擇工具欄上的"插入"選擇"形狀",選擇需要的圖形,如直線,然後在鏈端中間將直線放進去調整好間距即可。
一、原始文獻追溯法
從化合物相關的化學文獻中去尋找,最初發表這個化合物的那篇化學論文,肯定有結構式,文獻查找方法主要依賴於SCIfinder。文獻包括中文文獻、英文和其他語言種類的文獻。最直接最管用的方法。
二、軟體查詢法
例如chemdraw,名稱轉化為結構。chemdraw 裡面有名稱和結構的轉換在structure 的選項里,這個主要是針對一些常見的化合物。
其他轉件待補充。
三、CAS號搜索法
直接搜索,找到CAS號,然後去搜索結構,或者用個化學軟體,把名稱打進去