❶ 如何根據遺傳距離判斷是否能夠鑒別兩個種
大於50個遺傳單位的遺傳距離說明這兩個基因可以看做是自由組合而不連鎖.在物理圖譜上則說明這兩個基因在染色體上相距離很長,是必定會發生交換,甚至二次交換的. ————————————————————————————————— （我是一樓）首先你要知道,最開始還沒有染色體測序的時候,是靠交換率來確定兩個基因的距離的,因此規定了1%的交換率表示兩個基因相隔1cM.由於由配子數計算來的交換率一定是小於50%的,因此早期認為50%就是自由組合了. 但是,隨著研究的深入,人們發現了基因距離和鹼基數的關系.也就是說1cM的基因距離,一般相當於50萬~100萬個鹼基對（對於人類染色體來說）.後來,人們不用交換率來測量基因距離了,而是靠基因間的鹼基數衡量基因距離,而厘摩這個單位因為使用廣泛,並且在衡量配子交換率時也有用處,因此就流傳了下來.但是,有些染色體是長於5000萬鹼基對的,因此換算的話就成了100多厘摩的距離.明白了吧? 其實,長於50厘摩,相當於兩個基因間距離很長,總能夠發生交換,但是,不能理解為長於50厘摩就是交換率大於50%,這點是不合適的.
❷ 地理圖怎麼看經緯度
1、上北下南，左西右東。
2、東西方向延伸的是經線，南北方向延伸的是緯線。
3、緯度中，越向北越大，表示北緯，越向南越大，表示南緯。
4、經度中，越向東越大，表示東經，越向西越大，表示西經。
5、結論：A為南緯40度，西經40度 ；B為北緯40度，東經40度；C為北緯10度，西經170度；D為南緯10度，東經170度。
❸ mantel檢驗如何操作 補充說明下：我想做地理距離和遺傳距離這兩個矩陣之間的相關分析，即mantel檢驗。
用TFPGA軟體 就可以做出來
❹ 什麼是遺傳距離
遺傳距離(genetic distance) 衡量品種間若乾性狀綜合遺傳差異大小的指標。育種目標所要求的性狀不止一個,為了能夠更全面地反映親本品種間的遺傳差異,需要對多個性狀綜合考慮,從而引伸出遺傳距離的概念。
❺ 遺傳距離和物理距離的異同點
異在於表示的單位不一樣，一個是厘摩，一個是核苷酸；前者是相對距離，後者是實際距離。
同在於兩者都是線性排布，都可反應基因或者標記的先後順序，都是將一些相關的基因或者標記定位在某一染色體上（遺傳圖譜的連鎖群，物理圖譜的疊連群）。
❻ 怎樣估算遺傳距離
遺傳距離指個體、群體或種之間用DNA序列或等位基因頻率來估計的遺傳差異大小。衡量遺傳距離的指標包括用於數量性狀分析的歐式距離（D），可用於質量性狀和數量性狀的Gower距離（DG）和Roger距離（RD），用於二元數據的改良Roger距離（GDMR）、Nei&Li距離（GDNL）、Jaccard距離（GDJ）和簡單匹配距離（GDSM）等：
D=[（x1-y1）2+（x2-y2）2+…（xp-yp）2]1/2，這里x1，x2，…，xp和y1，y2，…，yp分別為兩個個體（或基因型、群體）i和j形態學性狀p的值。
兩個自交系之間的遺傳距離Dsmith=∑[（xi（p）-yj（p））2/varx（p）]1/2，這里xi（p）和yj（p）分別為自交系i和j第p個性狀的值，varx（p）為第p個數量性狀在所有自交系中的方差。
DG=1/p∑wkdijk，這里p為性狀數目，dijk為第k個性狀對兩個個體i和j間總距離的貢獻，dijk=｜dik-xjk｜，dik和djk分別為i和j的第k個性狀的值，wk=1/Rk，Rk為第k個性狀的范圍（range）。
當用分子標記作遺傳多樣性分析時，可用下式：d（i，j）=constant（∑｜Xai-Xaj｜r）1/r，這里Xai為等位基因a在個體i中的頻率，n為每個位點等位基因數目，r為常數。當r=2時，則該公式變為Roger距離，即RD=1/2[∑（Xai-Xaj）2]1/2。
當分子標記數據用二元數據表示時，可用下列距離來表示：
GDNL=1-[2N11/(2N11+N10+N01)]
GDJ=1-[N11/(N11+N10+N01)]
GDSM=1-[(N11+N00)/(N11+N10+N01+N00)]
GDMR=[(N10+N01)/2N]0.5
這里N11為兩個個體均出現的等位基因的數目，N00為兩個個體均未出現的等位基因數目，N10為只在個體i中出現的等位基因數目，N01為只在個體j中出現的等位基因數目，N為總的等位基因數目。譜帶在分析時可看成等位基因。
在實際操作過程中，選擇合適的遺傳距離指標相當重要。一般來說，GDNL和GDJ在處理顯性標記和共顯性標記時是不同的，用這兩個指標分析自交系時排序結果相同，但分析雜交種中的雜合位點和分析雜合基因型出現頻率很高的群體時其遺傳距離就會產生差異。根據以前的研究結果，建議在分析共顯性標記（如RFLP和SSR）時用GDNL，而在分析顯性標記（如AFLP和RAPD）時用GDSM或GDJ。GDSM和GDMR，前者可用於巢式聚類分析和分子方差分析（AMOVA），但後者由於有其重要的遺傳學和統計學意義而更受青睞。
在衡量群體（居群）的遺傳分化時，主要有三種統計學方法：一是χ2測驗，適用於等位基因多樣性較低時的情形，二是F統計（Wright，1951），三是GST統計（Nei，1973）。在研究中涉及到的材料很多時，還可以用到一些多變數分析技術，如聚類分析和主成分分析等等。
❼ 遺傳距離與物理距離之間有什麼聯系嗎或者說物理距離會對遺傳距離有什麼影響嗎
遺傳距離與物理距離成正比。這是因為人的長相與骨骼的結構形狀與食物有密切關系。比如某民族的特徵是蒜頭鼻子，夫妻二人如果在漢地生活的話，他們的兒女雖然仍然有本民族的特徵，但是在其民族看來已經有所區別。也就是水土決定的。
❽ 根據遺傳距離怎麼做聚類圖，求指點
你先不用著急，好好看看相關文獻！
這好這幾天我也在做聚類分析，所謂聚類分析就是根據遺傳距離或相似系數把遺
傳距離小的或相似系數大的樣品聚為一類，然後應用可生成樹狀圖以便觀
察。
如還不明白可繼續提問。
❾ 遺傳學中遺傳距離cM與鹼基kb 之間如何換算
你好！
舉個例子你就懂了。人類基因組遺傳距離3300cM，基因組測序3000MB，接下來怎麼算應該不用我說。一般而言，水稻的1cM大概750bp左右，大豆棉花也在1000左右。當然隨著遺傳圖譜的不斷加密，1cM的物理距離會漸短的。
如果對你有幫助，望採納。
❿ 能用ntsys軟體計算遺傳距離和地理距離的mantel檢驗嗎
利用NTSYS軟體計算品種間遺傳距離：
1．將已賦值好的Excel文件放於桌面，假設命名為A.xls，保存為Microsoft office 5.0/95工作薄形式。Excel文件格式設成軟體識別的模式，即A1=1，表示出現等位基因；B1=132，表示等位基因數，C1=189表示品種數；D1=0表示不出現等位基因。從A3開始，在第一列標上所有的SSR引物，從B2開始，第二行標上所有的品種名，由此得到一個數據矩陣。
2．雙擊NTSYS軟體，選擇file→edit file，選擇A.xls文件，將出現NTedit1.2編輯器，點擊file→sale file as選項，將導入的Excel文件轉換為軟體識別的格式，命名為A-1.NTS文件。
3．點擊Ntsyspc2.1界面的「Similarity」，點擊「Genetic distance」；在Input data file中輸入A-1.NTS；在Output file中輸入A-2.NTS，點擊Compute；則計算好的遺傳距離放在A-2.NTS文件中。
4．點擊Ntsyspc2.1界面的output&transf→output→Input file，選擇A-2.NTS，即可查看到品種間的遺傳距離。
地理距離矩陣 ：
A B C D
==================================================
A 0
B 1061.38 0
C 1502.5 770.26 0
D 1130.1 788.052 474.616 0
==================================================
遺傳距離矩陣 ：
pop ID a b c d
==================================================
a 0
b 0.1282 0
c 0.2010 0.0985 0
d 0.1604 0.1058 0.1388 0
==================================================
TFPGA做Mantel檢驗輸入格式 ：
1，2， 0.1282，1061.38
1，3， 0.2010，1502.50
1，4， 0.1604，1130.10
2，3， 0.0985，770.26
2，4， 0.1058，788.052
3，4， 0.1388，474.616
0，0， 0，0
前兩列數字為第i列第j列label；
注意j一定小於i ；
後兩列為需要比較的兩個矩陣的對應元素 ；
Matrix Size就是矩陣的大小 ；
兩個矩陣必須大小相同。