導航:首頁 > 人文歷史 > ebi歷史數據怎麼刪除

ebi歷史數據怎麼刪除

發布時間:2022-08-05 05:35:53

⑴ DNA資料庫的EMBL

歐洲生物信息學研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)創建的一個核酸序列資料庫。EMBL的數據來源主要有兩部分,一部分由科研人員或某些基因組測序機構通過計算機網路直接提交,另一部分則來自科技文獻或專利(Stoesser等, 1998)。EMBL與DDBJ、GenBank建有合作關系,他們分別在全世界范圍內收集核酸序列信息,每天都將新發現或更新過的數據相互交換。
DNA資料庫的規模正在以指數方式增長,平均不到9個月就增加一倍。1998年1月,EMBL中收錄的序列數已超過一百萬,包括15,500個物種,其中模式生物的序列佔50%以上,它們包括人類(Homo sapiens), 線蟲(Caenorhabditis elegans),啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae),小鼠(Mus musculus)和擬南芥(Arabidopsis thalania)。
可以利用序列查詢系統 SRS(Sequence Retrieval System)從EMBL資料庫中提取有關信息(Etzold等,1996年)。SRS序列查詢系統通過超文本鏈接將DNA序列資料庫和蛋白質序列、功能位點、結構、基因圖譜以及文獻摘要MEDLINE等各種資料庫聯系在一起。利用EBI網站提供的BLAST或FastA程序,可以對EMBL資料庫進行未知序列同源性搜索。

⑵ 為什麼說swiss-prot是重要的蛋白質序列資料庫

SWISS-PROT是含有詳細注釋內容的蛋白質序列資料庫,由歐洲生物信息學中心(EBI)維護,目前已合並入 UniProt資料庫,旨在幫助基因組和蛋白質組以及相關的分子生物學研究人員提供有關蛋白質氨基酸序列的最新信息。
SWISS-PROT中盡可能減少了冗餘序列,並與其它30多個數據建立
了交叉引用,其中包括核酸序列庫、蛋白質序列庫和蛋白質結構庫等。SWISS-PROT資料庫包含了EMBL核酸序列資料庫中被經過仔細檢查和准確注釋了
的蛋白質序列,一般地,任何蛋白質序列數據的搜尋和比較都應從SWISS-PROT開始。

SWISS-PROT蛋白質序列數據由大量序列條目組成,每一個序列條目
有其自己的格式。為了標准化的目的,SWISS-PROT的格式與EMBL核酸序列資料庫的格式盡可能類似。SWISS-PROT涉及已知蛋白質的序列、
引用文獻信息、分類學信息、注釋等,注釋中包括蛋白質的功能、轉錄後修飾、特殊位點和區域、二級結構、四級結構、與其它序列的相似性、序列殘缺與疾病的關
系、序列變異體和沖突等信息。利用序列提取系統(SRS)可以方便地檢索SWISS-PROT和其它EBI的資料庫。SWISS-PROT只接受直接測序
獲得的蛋白質序列,序列提交可以在其Web頁面上完成。

⑶ 電子商務EBI是什麼意思

主要任務
⑴ 為科學界建立和維護生物學資料庫,提供免費的數據和生物信息服務,支持生物學數據的存儲和挖掘,促進科技進步;
⑵ 通過生物信息學的基礎研究繼續推動生物學發展;
⑶ 為各個層次的科學工作者提供生物信息學培訓;
⑷ 支持幫助邊緣尖端科技成果向工業界的轉化;
⑸ 協調歐洲生物數據的提供。


EBI系統特點
⑴友好圖形人機交互界面;
⑵支持本及遠程多個高性能工作站;
⑶對各類機電設備提供實時監控;
⑷功能完備報警管理;
⑸提供大量歷史數據及趨勢圖;
⑹內置多種標准格式報表,提供用戶自定義報表格式功能;
⑺強大應用開發工具;
⑻支持基於工業標准網路本及遠程多客戶機/伺服器體系;
⑼安保數據與人力資源軟體系統無縫集成;
⑽針對大型用戶多客戶機/伺服器DSA結構;
⑾針對關鍵任務熱冗餘功能;
⑿ActiveX技術。
EBI-----------External Bus Interface 外部匯流排介面
EBI-empty bottle inspector 空瓶檢測儀

⑷ 樓宇自控中EBI的全稱是什麼

EBI(歐洲生物信息學中心)全稱是European Bioinformatics Institute,是一個非盈利性的學術機構,是歐洲分子生物學實驗室(EMBL,全稱是European Molecular Biology Laboratory)的一部分。它的主要任務是建立、維護和提供生物學資料庫以及信息學服務,從而支持生物學數據的存放和進一步挖掘。EMBL全稱是歐洲分子生物學實驗室,位於德國海德爾堡,是世界上著名的生命科學研究機構。

⑸ ascp 如何刪除傳到ncbi上的數據

首先,到aspera網站下載你的操作系統對應的aspera connect。(如果選Linux,下載以後會是一個幾M大,內嵌二進制代碼的shell腳本。。) 。不需要root或者sudo許可權,直接安裝之:
$ sh aspera-connect-2.4.7.37118-linux-64.sh
安裝好以後,會在HOME目錄下新建一個叫.aspera的目錄,有兩個文件比較重要:
一個是ascp的可執行文件:
~/.aspera/connect/bin/ascp
另一個ascp的密鑰文件:
~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.putty
建議將密鑰備份到HOME目錄下方便使用:
$ cp ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.putty ~/
再把aspera-license復制到系統目錄
~/.aspera/connect/etc$ sudo cp aspera-license /usr/local/bin/
再把ascp可執行文件的路徑加入PATH變數中,或者將其拷貝到當前目錄。
使用
執行以下兩條命令(注意最後要加點號「.」,表示當前目錄)
從EBI下載:
$ ascp -i ~/asperaweb_id_dsa.putty era-fasp@f

⑹ ebi和ena一樣嗎

不一樣。
1、ebi是為科學界建立和維護生物學資料庫,提供免費的數據和生物信息服務。
2、ENA即抗可溶性抗原Extractablenuclerantigen(抗體)的簡寫

⑺ 高通量數據提交到ncbi的文件能不能撤回

我原來常用的:

NCBI:持有INSDC的節點。網站上有核酸、蛋白、基因名、基因組名等等的搜索工具,以及BLAST序列比對搜索工具,PUBMED文獻資料庫,Taxonomy數據,COG蛋白家族庫等等。FTP可以下到它全部的資料庫,BLAST的單機程序,以及各種工具程序。

EBI:和NCBI類似,歐洲搞的對等物。感覺EBI網站比NCBI要清楚簡潔。另外EBI網站整合了更多的工具,比如多序列比對。

Uniprot:全蛋白庫。NCBI和EBI的蛋白庫來源於此。目前包括兩部分:SwissProt是人工校對過的,TrEMBL是自動校對的。

Pfam:蛋白家族庫。可以使用配套的HMMER進行搜索。比BLAST能找到更遠緣的東西,而且找到的東西是結構域。
Rfam:RNA的,類似Pfam。

閱讀全文

與ebi歷史數據怎麼刪除相關的資料

熱點內容
word中化學式的數字怎麼打出來 瀏覽:745
乙酸乙酯化學式怎麼算 瀏覽:1410
沈陽初中的數學是什麼版本的 瀏覽:1361
華為手機家人共享如何查看地理位置 瀏覽:1052
一氧化碳還原氧化鋁化學方程式怎麼配平 瀏覽:892
數學c什麼意思是什麼意思是什麼 瀏覽:1419
中考初中地理如何補 瀏覽:1310
360瀏覽器歷史在哪裡下載迅雷下載 瀏覽:710
數學奧數卡怎麼辦 瀏覽:1399
如何回答地理是什麼 瀏覽:1033
win7如何刪除電腦文件瀏覽歷史 瀏覽:1062
大學物理實驗干什麼用的到 瀏覽:1492
二年級上冊數學框框怎麼填 瀏覽:1711
西安瑞禧生物科技有限公司怎麼樣 瀏覽:994
武大的分析化學怎麼樣 瀏覽:1254
ige電化學發光偏高怎麼辦 瀏覽:1343
學而思初中英語和語文怎麼樣 瀏覽:1663
下列哪個水飛薊素化學結構 瀏覽:1429
化學理學哪些專業好 瀏覽:1492
數學中的棱的意思是什麼 瀏覽:1069