怎麼查找基因的物理位置

『壹』 如何查找正常人某個基因位點是G還是C

如果你知道這個位點的RS號，可以直接在ncbi的dbSNP資料庫網站查詢，輸入rs號後的搜索結果里會顯示這個位點的信息，如下：該位點野生型是G，突變型是A。

如果不知道rs號，其他的如該位點在染色體上的絕對位置，也就是上圖的「position」也可以在ncbi等多個資料庫網站查詢。如果一概不知，只知道基因名稱，也可以去ncbi查找該基因的全序列，去看這個位置是G還是C。

總之，ncbi上就可以查到。

『貳』 如何查找基因的基本信息

NC表示人類基因組DNA的RefSeq。（鏈接序列）

NM表示mRNA的RefSeq。

NP表示蛋白質的RefSeq

查找基因的基本信息的方法如下:

1. 根據文獻中已知的基因ID如果你在文獻中看到你感興趣的基因，而且文中還提到了

基因在Genbank中的ID號，那就好辦了，直接打開http://www.ncbi.nlm.nih.gov ，在Search後的下拉框中選擇Nucleotide，把Genbank ID號輸入GO前面的文本框中，點「GO」，就可以找到了。(如GenBank accession number gi 16151096)」。

2. 根據已經獲得的基因的相關信息進行查找，打開http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在search後面的下拉框中選擇Gene，然後在中間的文本框中輸入基因名稱「VEGF」，點擊GO。搜索結果出來了，點擊箭頭所指的Limits, Limits的意思其實就是高級檢索，你可以在這里對檢索詞進行很多限制，這樣能大大精簡查詢結果。我們接著來，在Limits這個界面，先選擇查詢的限定范圍：先選Gene name(基因名稱)；然後再選擇Limit by Taxonomy（生物分類限定）中的Homo sapiens（人類），然後再點擊「GO」。直接點擊基因名稱「VEGFA」就可以看到有關基因的信息了。需要指出的是，在Genbank中，基因有很多別名（Aliases），和Genbank中記錄的名稱有可能不一致。比如在這里，VEGFA是Genbank中記錄的基因名稱，而它還有很多別名，比如MGC70609, VEGF（這就是我們要找的基因名稱 ）, VEGF-A, VPF；還有，在這里可以看到該基因在染色體上的位置... 再往下看，可以看到Genomic regions, transcripts, and procts，這里顯示了該基因在基因組中的位置，以及轉錄本的生成情況：就看見了目的基因的mRNA的鏈接（如NM_001025366.1）和蛋白質的鏈接（如NP_001020537.2 ） 這里得說兩句，有的基因也許只有一個編碼序列，但有的基因有很多的mRNA剪接體，但都是歸在一個基因名稱下面。比如，在VEGF基因下面有7個序列，分別是vascular endothelial growth factor A isoform a, isoform c, isoform d, isoform e, isoform f , isoform g, isoform b precursor ，就需要根據查閱的文獻以及在這些基因序列後面的解釋來確定了。如果我想找的基因是第一個序列即isoform a, 就可以點擊NM_001025366.1，