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怎麼構建物理圖譜

發布時間:2023-07-18 05:53:46

Ⅰ 物理圖譜的構建方法主要有哪幾種

物理圖譜的構建方法主要有哪幾種
研究物理的科學方法有許多,經常用到的有觀察法、實驗法、比較法、類比法、等效法、轉換法、控制變數法、模型法、科學推理法等.研究某些物理知識或物理規律,往往要同時用到幾種研究方法.如在研究電阻的大小與哪些因素有關時,

Ⅱ 為什麼要構建遺傳圖和物理圖

1.基因組存在大量重復序列,會干擾排序,因此需要高密度基因組圖譜
2.基因組太大,必需打斷之後分散測序,然後將分散的順序按原來位置組裝,需要圖譜進行指導
3.遺傳圖譜和物理圖譜各有優缺點,必須相互整合校正

生物學 EST是什麼啊 詳細的介紹一下

EST是Expressed Sequence Tag的縮寫,意思是表達序列標簽,指從一個隨機選擇的cDNA克隆,進行5』端和3』端單一次測序挑選出來獲得的短的cDNA 部分序列。

EST是從一個隨機選擇的cDNA 克隆進行5』端和3』端單一次測序獲得的短的cDNA 部分序列,代表一個完整基因的一小部分,在資料庫中其長度一般從20 到7000bp 不等,平均長度為360 ±120bp。

EST 來源於一定環境下一個組織總mRNA 所構建的cDNA 文庫,因此EST也能說明該組織中各基因的表達水平。

(3)怎麼構建物理圖譜擴展閱讀

EST的作用表現在:

1、 用於構建基因組的遺傳圖譜與物理圖譜;

2、作為探針用於放射性雜交;

3、 用於定位克隆;

4、藉以尋找新的基因;

5、作為分子標記;

6、 用於研究生物群體多態性。

Ⅳ 什麼是物理圖譜如何用序列標簽位點繪制物理圖譜

通過遺傳重組所得到的基因在具體染色體上線性排列圖稱為遺傳連鎖圖.它是通過計算連鎖的遺傳標志之間的重組頻率,確定他們的相對距離,一般用厘摩(cM,即每次減數分裂的重組頻率為1%)來表示.繪制遺傳連鎖圖的方法有很多,但是在DNA多態性技術未開發時,鑒定的連鎖圖很少,隨著DNA多態性的開發,使得可利用的遺傳標志數目迅速擴增.早期使用的多態性標志有RFLP(限制性酶切片段長度多態性)、RAPD(隨機引物擴增多態性DNA)、AFLP(擴增片段長度多態性);80年代後出現的有STR(短串聯重復序列,又稱微衛星)DNA遺傳多態性分析和90年代發展的SNP(單個核苷酸的多態性)分析.
 物理圖譜是利用限制性內切酶將染色體切成片段,再根據重疊序列確定片段間連接順序,以及遺傳標志之間物理距離〔鹼基對(bp) 或千鹼基(kb)或兆鹼基(Mb)〕的圖譜.以人類基因組物理圖譜為例,它包括兩層含義,一是獲得分布於整個基因組30 000個序列標志位點(STS,其定義是染色體定位明確且可用PCR擴增的單拷貝序列).將獲得的目的基因的cDNA克隆,進行測序,確定兩端的cDNA序列,約200bp,設計合成引物,並分別利用cDNA和基因組DNA作模板擴增;比較並純化特異帶;利用STS制備放射性探針與基因組進行原位雜交,使每隔100kb就有一個標志;二是在此基礎上構建覆蓋每條染色體的大片段:首先是構建數百kb的YAC(酵母人工染色體),對YAC進行作圖,得到重疊的YAC連續克隆系,被稱為低精度物理作圖,然後在幾十個kb的DNA片段水平上進行,將YAC隨機切割後裝入粘粒的作圖稱為高精度物理作圖.

Ⅳ 如何將10bp的DNA序列在人染色體上定位並圖形化顯示

構建遺傳連鎖圖譜的軟體好多
不同的軟體作出的圖大差不差
一般常用的有linkagemap1.0或者mapmaker 3.0
南京的去南林大找吧
去林木遺傳育種實驗室
生物技術大樓5樓
他們作圖做的很多
這些軟體都很齊全
網上也有免費的軟體下載

照你的意思的話你是要作物理圖譜
物理圖譜的目的就是用分子生物學技術直接將DNA分子標記或基因定位在基因組的實際位置
你那些10bp的DNA序列也就是相當於分子標記
但是物理圖的構建比遺傳圖譜復雜多了
你這個可以採用熒光原位雜交FISH來作圖
將10bp的DNA互補序列做成探針直接與染色體進行雜交
通過熒游標記將序列直接顯示出位置
STS作圖是目前最有效的物理作圖方法
通常使用的軟體是由Phil Green小組的C. L. Magness等人編寫的SEGMAP
物理圖譜我沒做過不是很清楚
我只能幫你這么多了

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