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生物拓扑图怎么看懂

发布时间:2022-07-22 12:14:58

❶ 如何看网络拓扑结构图

路由器可以充当服务器,可以管理网络数据,一般局域网内只需要一个路由,而交换机根据机器的数量有多个。

❷ 请问宇观,拓扑学是怎样的概念

宇观 通常把质量范围在10-15克,尺度范围在
10-5厘米以上的物质客体及其现象的总和称为宏观
世界,一般容易观察的物质层次.无机界包括地球上所有
的物体、包围在地球表面的空气层,有对流层、平流层、电
离层和扩散层,还有太阳系内的恒星、行星、卫星、彗星
等.有机界包括人在内的动物、植物种群、生物群落、生态
系统、生物圈,还有人类社会等.宏观世界一般服从经典
力学规律,但是不同质的宏观世界具有不同的运行规律.
如生物界还具有生命运动的规律;天体现象服从天体运
行规律,社会运动服从社会规律等等.学术界有一种意见
认为,应该抛开物质客体自身的属性,从认识论的观点,
根据主体对客体的变革特征和观测特征来定义宏观世
界,那么就是指人们可以直接观测,且能以物质手段加以
变革的时空区域.而可以观测到,但还不能以物质手段加
以影响和变革的时空区域则为宇观世界.它们不同于宏
观规模的物质过程,具有高密度、高温度、高压、大质量、
大尺度、大时标等特征,运动速度大到接近光速,万有引
力起主要作用并服从相对论力学规律,包括星系、星系
团、总星系,距地球100亿光年的宇宙太空.60年代以来,
人类对宇宙观测研究获得的一系列重要发现,如脉冲星、
类星体、微波背景辐射、星际分子等都属宇观世界.宇观
概念就是在总结现代天文学发展基础上提出的新概念,
由我国着名天文学家戴文赛于1962年首次提出,他在《宇
观的物质过程》一书中指出:“大质量加大尺度,既是宇观
过程的特征,又是它的条件.”
拓扑学的英文名是Topology,直译是地志学,也就是和研究地形、地貌相类似的有关学科.我国早期曾经翻译成“形势几何学”、“连续几何学”、“一对一的连续变换群下的几何学”,但是,这几种译名都不大好理解,1956年统一的《数学名词》把它确定为拓扑学,这是按音译过来的.
拓扑性拓扑学是几何学的一个分支,但是这种几何学又和通常的平面几何、立体几何不同.通常的平面几何或立体几何研究的对象是点、线、面之间的位置关系以及它们的度量性质.拓扑学对于研究对象的长短、大小、面积、体积等度量性质和数量关系都无关.
在拓扑学里不讨论两个图形全等的概念,但是讨论拓扑等价的概念.比如,尽管圆和方形、三角形的形状、大小不同,在拓扑变换下,它们都是等价图形.左图的三样东西就是拓扑等价的,换句话讲,就是从拓扑学的角度看,它们是完全一样的.
在一个球面上任选一些点用不相交的线把它们连接起来,这样球面就被这些线分成许多块.在拓扑变换下,点、线、块的数目仍和原来的数目一样,这就是拓扑等价.一般地说,对于任意形状的闭曲面,只要不把曲面撕裂或割破,他的变换就是拓扑变幻,就存在拓扑等价.
应该指出,环面不具有这个性质.比如像左图那样,把环面切开,它不至于分成许多块,只是变成一个弯曲的圆桶形,对于这种情况,我们就说球面不能拓扑的变成环面.所以球面和环面在拓扑学中是不同的曲面.
直线上的点和线的结合关系、顺序关系,在拓扑变换下不变,这是拓扑性质.在拓扑学中曲线和曲面的闭合性质也是拓扑性质.
在宇宙学中, 暗物质(Dark Matter)是指那些不发射任何光及电磁辐射的物质.人们目前只能通过引力产生的效应得知宇宙中有大量暗物质的存在.暗物质存在的最早证据来源于对球状星系旋转速度的观测.现代天文学通过引力透镜、宇宙中大尺度结构形成、微波背景辐射等研究表明:我们目前所认知的部分大概只占宇宙的4%,暗物质占了宇宙的23%,还有73%是一种导致宇宙加速膨胀的暗能量.暗物质的存在可以解决大爆炸理论中的不自洽性,对结构形成也非常关键.暗物质很有可能是一种(或几种)粒子物理标准模型以外的新粒子.对暗物质和暗能量的研究是现代宇宙学和粒子物理的重要课题.
重子(baryon)是由三个夸克(或者三个反夸克组成反重子)组成的基本粒子.最常见的重子有质子和中子(合称为核子),其它重子有比这两个粒子重的粒子(所谓的超子).重子这个称呼是指其质量相对重于轻子和介于两者之间的介子起的.
重子是强相互作用的费米子,也就是说它们遵守费米-狄拉克统计和泡利不兼容原理,通过组成它们的夸克它们参加强相互作用.同时它们也参加弱相互作用和引力.带电荷的重子也参加电磁力作用.
重子与由一个夸克和一个反夸克组成的介子一起被合称为强子.强子是所有强相互作用的粒子的总称.
质子是唯一独立稳定的重子.中子假如不与其它中子或者质子一起组成原子核的话不稳定,会衰变.

❸ DNA的结构与功能的关系,详细一些

沃森和克里克发现,DNA是双螺旋结构。DNA蕴藏了大量的遗传信息。有A、T、C、G四种碱基,双链互补,双链DNA可以进行自我的复制,也可以指导RNA(单链)的合成。而mRNA、tRNA、rRNA又参与了蛋白质的合成,蛋白质是生命活动的物质承担者,在生物体中发挥着重要的作用。

❹ 生物拓扑学研究内容是什么

生物拓扑学应该是主要研究生物大分子(特别是DNA,RNA 和 蛋白质)在空间结构上缠绕的问题。目前,研究得最清楚的,也是最多的,应该是DNA的拓扑结构问题。因为DNA是双螺旋,所以当DNA复制、转录和折叠的时候都会涉及到拓扑结构发生变化的问题,例如形成超螺旋。这些超螺旋的形成,往往对DNA的复制和转录是不利的,要解开才能进一步的复制和转录。生物体中有专门的拓扑异构酶来解决这类拓扑结构问题。DNA拓扑异构酶有两类,I型和II型。具体的有什么区别,你可以网络的。要是想了解的更深,你可以上pubmed数据库搜索相关的review。其实除了DNA,近年来,也有报道发现RNA拓扑异构酶。因为RNA是单链的,所以,一直以来人们认为它们不存在拓扑问题。但是,生物体是复杂的。RNA也存在很多拓扑问题,例如在mRNA翻译的时候,两端往往是有核糖体结合的,这样就成了一个环,也会存在拓扑结构的问题。还有rRNA中也存在拓扑结构的问题。环状RNA也会存在拓扑结构的问题。

❺ 拓扑是什么意思

拓扑学是数学中一个重要的、基础性的分支。它最初是几何学的一个分支,主要研究几何图形在连续变形下保持不变的性质,现在已成为研究连续性现象的重要的数学分支。

拓扑学起初叫形势分析学,是莱布尼茨1679年提出的名词。十九世纪中期,黎曼在复函数的研究中强调研究函数和积分就必须研究形势分析学。从此开始了现代拓扑学的系统研究。

连续性和离散性是自然界与社会现象中普遍存在的。拓扑学对连续性数学是带有根本意义的,对于离散性数学也起着巨大的推动作用。拓扑学的基本内容已经成为现代数学的常识。拓扑学的概念和方法在物理学、生物学、化学等学科中都有直接、广泛的应用。
拓扑学的由来

几何拓扑学是十九世纪形成的一门数学分支,它属于几何学的范畴。有关拓扑学的一些内容早在十八世纪就出现了。那时候发现一些孤立的问题,后来在拓扑学的形成中占着重要的地位。
在数学上,关于哥尼斯堡七桥问题、多面体的欧拉定理、四色问题等都是拓扑学发展史的重要问题。
哥尼斯堡(今俄罗斯加里宁格勒)是东普鲁士的首都,普莱格尔河横贯其中。十八世纪在这条河上建有七座桥,将河中间的两个岛和河岸联结起来。人们闲暇时经常在这上边散步,一天有人提出:能不能每座桥都只走一遍,最后又回到原来的位置。这个问题看起来很简单有很有趣的问题吸引了大家,很多人在尝试各种各样的走法,但谁也没有做到。看来要得到一个明确、理想的答案还不那么容易。
1736年,有人带着这个问题找到了当时的大数学家欧拉,欧拉经过一番思考,很快就用一种独特的方法给出了解答。欧拉把这个问题首先简化,他把两座小岛和河的两岸分别看作四个点,而把七座桥看作这四个点之间的连线。那么这个问题就简化成,能不能用一笔就把这个图形画出来。经过进一步的分析,欧拉得出结论——不可能每座桥都走一遍,最后回到原来的位置。并且给出了所有能够一笔画出来的图形所应具有的条件。这是拓扑学的“先声”。
在拓扑学的发展历史中,还有一个着名而且重要的关于多面体的定理也和欧拉有关。这个定理内容是:如果一个凸多面体的顶点数是v、棱数是e、面数是f,那么它们总有这样的关系:f+v-e=2。
根据多面体的欧拉定理,可以得出这样一个有趣的事实:只存在五种正多面体。它们是正四面体、正六面体、正八面体、正十二面体、正二十面体。
着名的“四色问题”也是与拓扑学发展有关的问题。四色问题又称四色猜想,是世界近代三大数学难题之一。
四色猜想的提出来自英国。1852年,毕业于伦敦大学的弗南西斯.格思里来到一家科研单位搞地图着色工作时,发现了一种有趣的现象:“看来,每幅地图都可以用四种颜色着色,使得有共同边界的国家都被着上不同的颜色。”
1872年,英国当时最着名的数学家凯利正式向伦敦数学学会提出了这个问题,于是四色猜想成了世界数学界关注的问题。世界上许多一流的数学家都纷纷参加了四色猜想的大会战。1878~1880年两年间,着名律师兼数学家肯普和泰勒两人分别提交了证明四色猜想的论文,宣布证明了四色定理。但后来数学家赫伍德以自己的精确计算指出肯普的证明是错误的。不久,泰勒的证明也被人们否定了。于是,人们开始认识到,这个貌似容易的题目,其实是一个可与费马猜想相媲美的难题。
进入20世纪以来,科学家们对四色猜想的证明基本上是按照肯普的想法在进行。电子计算机问世以后,由于演算速度迅速提高,加之人机对话的出现,大大加快了对四色猜想证明的进程。1976年,美国数学家阿佩尔与哈肯在美国伊利诺斯大学的两台不同的电子计算机上,用了1200个小时,作了100亿判断,终于完成了四色定理的证明。不过不少数学家并不满足于计算机取得的成就,他们认为应该有一种简捷明快的书面证明方法。
上面的几个例子所讲的都是一些和几何图形有关的问题,但这些问题又与传统的几何学不同,而是一些新的几何概念。这些就是“拓扑学”的先声。
什么是拓扑学?
拓扑学的英文名是Topology,直译是地志学,也就是和研究地形、地貌相类似的有关学科。我国早期曾经翻译成“形势几何学”、“连续几何学”、“一对一的连续变换群下的几何学”,但是,这几种译名都不大好理解,1956年统一的《数学名词》把它确定为拓扑学,这是按音译过来的。
拓扑学是几何学的一个分支,但是这种几何学又和通常的平面几何、立体几何不同。通常的平面几何或立体几何研究的对象是点、线、面之间的位置关系以及它们的度量性质。拓扑学对于研究对象的长短、大小、面积、体积等度量性质和数量关系都无关。
举例来说,在通常的平面几何里,把平面上的一个图形搬到另一个图形上,如果完全重合,那么这两个图形叫做全等形。但是,在拓扑学里所研究的图形,在运动中无论它的大小或者形状都发生变化。在拓扑学里没有不能弯曲的元素,每一个图形的大小、形状都可以改变。例如,前面讲的欧拉在解决哥尼斯堡七桥问题的时候,他画的图形就不考虑它的大小、形状,仅考虑点和线的个数。这些就是拓扑学思考问题的出发点。
拓扑性质有那些呢?首先我们介绍拓扑等价,这是比较容易理解的一个拓扑性质。
在拓扑学里不讨论两个图形全等的概念,但是讨论拓扑等价的概念。比如,尽管圆和方形、三角形的形状、大小不同,在拓扑变换下,它们都是等价图形。左图的三样东西就是拓扑等价的,换句话讲,就是从拓扑学的角度看,它们是完全一样的。
在一个球面上任选一些点用不相交的线把它们连接起来,这样球面就被这些线分成许多块。在拓扑变换下,点、线、块的数目仍和原来的数目一样,这就是拓扑等价。一般地说,对于任意形状的闭曲面,只要不把曲面撕裂或割破,他的变换就是拓扑变幻,就存在拓扑等价。
应该指出,环面不具有这个性质。比如像左图那样,把环面切开,它不至于分成许多块,只是变成一个弯曲的圆桶形,对于这种情况,我们就说球面不能拓扑的变成环面。所以球面和环面在拓扑学中是不同的曲面。
直线上的点和线的结合关系、顺序关系,在拓扑变换下不变,这是拓扑性质。在拓扑学中曲线和曲面的闭合性质也是拓扑性质。
我们通常讲的平面、曲面通常有两个面,就像一张纸有两个面一样。但德国数学家莫比乌斯(1790~1868)在1858年发现了莫比乌斯曲面。这种曲面就不能用不同的颜色来涂满两个侧面。
拓扑变换的不变性、不变量还有很多,这里不在介绍。
拓扑学建立后,由于其它数学学科的发展需要,它也得到了迅速的发展。特别是黎曼创立黎曼几何以后,他把拓扑学概念作为分析函数论的基础,更加促进了拓扑学的进展。
二十世纪以来,集合论被引进了拓扑学,为拓扑学开拓了新的面貌。拓扑学的研究就变成了关于任意点集的对应的概念。拓扑学中一些需要精确化描述的问题都可以应用集合来论述。
因为大量自然现象具有连续性,所以拓扑学具有广泛联系各种实际事物的可能性。通过拓扑学的研究,可以阐明空间的集合结构,从而掌握空间之间的函数关系。本世纪三十年代以后,数学家对拓扑学的研究更加深入,提出了许多全新的概念。比如,一致性结构概念、抽象距概念和近似空间概念等等。有一门数学分支叫做微分几何,是用微分工具来研究取线、曲面等在一点附近的弯曲情况,而拓扑学是研究曲面的全局联系的情况,因此,这两门学科应该存在某种本质的联系。1945年,美籍中国数学家陈省身建立了代数拓扑和微分几何的联系,并推进了整体几何学的发展。
拓扑学发展到今天,在理论上已经十分明显分成了两个分支。一个分支是偏重于用分析的方法来研究的,叫做点集拓扑学,或者叫做分析拓扑学。另一个分支是偏重于用代数方法来研究的,叫做代数拓扑。现在,这两个分支又有统一的趋势。
拓扑学在泛函分析、李群论、微分几何、微分方程额其他许多数学分支中都有广泛的应用。
参考资料:
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❻ 怎么用gephi输入一个邻接矩阵画出拓扑图

用gephi输入一个邻接矩阵画出拓扑图方法如下:

  1. //Ford-Fulkerson
  2. //邻接矩阵BFS
  3. #include<stdio.h>
  4. #include<string.h>
  5. #include<algorithm>
  6. usingnamespacestd;
  7. #defineMAXN205
  8. #defineinf2100000000
  9. intc[MAXN][MAXN];
  10. intpass[MAXN];
  11. intbfs_max_flow(intn,ints,intt)
  12. {
  13. intpre[MAXN],low[MAXN],head,tail,que[1000],i,maxflow=0;
  14. while(1)
  15. {
  16. memset(pre,-1,sizeof(pre));
  17. head=tail=0;
  18. low[s]=inf;que[tail++]=s;
  19. pre[s]=0;
  20. while(head<tail)
  21. {
  22. intx=que[head++];
  23. for(i=1;i<=n;++i)
  24. if((c[x][i])&&(pre[i]==-1))
  25. {
  26. que[tail++]=i;
  27. low[i]=low[x]<c[x][i]?low[x]:c[x][i];
  28. pre[i]=x;
  29. }
  30. if(pre[t]!=-1)
  31. {
  32. x=t;
  33. while(x!=s)
  34. {
  35. c[x][pre[x]]+=low[t];
  36. c[pre[x]][x]-=low[t];
  37. x=pre[x];
  38. }
  39. break;
  40. }
  41. }
  42. if(pre[t]!=-1)maxflow+=low[t];
  43. elsereturnmaxflow;
  44. }
  45. }
  46. intmain()
  47. {
  48. intn,m,i,a,b,d;
  49. while(scanf("%d%d",&n,&m)!=EOF)
  50. {
  51. memset(c,0,sizeof(c));
  52. for(i=1;i<=n;++i)
  53. {
  54. scanf("%d%d%d",&a,&b,&d);
  55. c[a][b]+=d;
  56. }
  57. printf("%d/n",bfs_max_flow(m,1,m));
  58. }
  59. }
  60. //Ford-Fulkerson
  61. //邻接矩阵DFS
  62. #include<stdio.h>
  63. #include<string.h>
  64. #include<algorithm>
  65. usingnamespacestd;
  66. #defineMAXN205
  67. #defineinf2100000000
  68. intc[MAXN][MAXN];
  69. intpass[MAXN];
  70. intdfs(intn,ints,intt,intlow)
  71. {
  72. inti,flow;
  73. if(s==t)returnlow;
  74. if(pass[s])return0;
  75. pass[s]=1;
  76. for(i=1;i<=n;++i)
  77. {
  78. if((c[s][i])&&(flow=dfs(n,i,t,low<c[s][i]?low:c[s][i])))
  79. {
  80. c[s][i]-=flow;
  81. c[i][s]+=flow;
  82. returnflow;
  83. }
  84. }
  85. return0;

    Gephi是一款开源免费跨平台基于JVM的复杂网络分析软件, 其主要用于各种网络和复杂系统,动态和分层图的交互可视化与探测开源工具。可用作:探索性数据分析,链接分析,社交网络分析,生物网络分析等。

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