导航:首页 > 生物信息 > 哪个网站可以查询微生物基因代谢图谱

哪个网站可以查询微生物基因代谢图谱

发布时间:2022-07-30 06:00:10

❶ 【求助】想知道某种微生物代谢产物的产生基因并对该基因进行研究,该如何操作论文也行

如果是已知的物质的话,就要去查找资料,可以上NCBI上检索或看相关英文文献。
如果是新发现的物质就比较麻烦了,这方面的话可以从该物质的结构上入手。
比如该物质是个聚酮化合物(有好多次级代谢产物是属于聚酮化合物的),那么合成该物质的基因簇中必然含有一个PKS或NRPS基因,进而根据PKS或NRPS基因的保守区域对基因组进行比对,找出相应的PKS或NRPS基因,再通过对PKS或NRPS基因的功能结构域分析,排除几个干扰项,最后则是通过基因敲除或RNAi的方法来准确定位。
上述例子是我听讲座听到的,所以只能讲个大概。
相关文献的话,有很多。你可以找几个相同结构的物质,然后检索中文综述,从综述中可以找到该物质的研究进展。
我这有篇关于美伐他汀的文章,可以参考下:
《美伐他汀生物合成基因簇的研究进展》

❷ 哪个网站可以查到已经全测序的微生物基因组有多少种了

基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理,如癌症或白血病,运动天赋,酒量等。基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术。
基因组大小(size of genome)是指单倍体细胞核中的所含的DNA的总量.在可以进行基因组测序之前,生物学家是用质量来衡量不同生物之间基因组的大小.通常使用的单位为pg(10e-12),这个值简称为C-value.通过简单的换算就可以知道大概的碱基的数量.不过,对于已经测序的基因组,直接数数就可以了,如 vihole所述.不过对于目前测序的基因组还是很少,估计在1千左右,而现存物种按照最保守的估计也有200万种(Ref 1),因此C-value在估计基因含量和生物复杂度方面还是有非常大的应用潜力.

❸ 怎么在基因库下载微生物的DNA序列

基因库是一个虚拟的概念。指一个种群里所有个体的所有基因。
基因文库是贮存某物种基因的一个微生物群体。比如,我们可以把人类的所有基因用限制酶切割后,用DNA连接酶将这些基因片断和运载体连接,导入到细菌细胞,然后大量培养这些细菌细胞,就形成了一个基因文库。这些基因文库含有某物种的全部种类的基因,又叫基因组文库。所以,基因文库包括基因组文库。

❹ 如何查找一个基因参与的代谢通路

代谢通路:目前在通路数据库(PATHWAYdatabase)中代谢通路是建立得最好的,有大约90个参考代谢途径的图形。每个参考代谢途径是一个由酶或EC号组成的网络。

利用如下方法可通过计算机构建出生物体特有的代谢通路:

  1. 先根据基因的序列相似性和位置相关性确定基因组中酶的基因。

  2. 然后合理地安排EC号。

  3. 最后将基因组中的基因和参照通路中用EC号编号的基因产物结合起来。


❺ 人体肠道微生物OTU数据在哪里下载

人体肠道中庞大而复杂的微生物群落对人体自身代谢表型有深远的影响。肠道微生物群落在亚种或菌株水平上表现出极大的多样性。利用微生物分子生态学、元基因组学和代谢组学研究方法,发现肠道微生物与宿主表现出共进化的特点,肠道微生物群落及其基因组为宿主提供了互补的遗传和代谢功能,表现出互惠共生关系。但是,肠道微生物群落中影响宿主代谢表型的关键功能菌鉴定及其作用模式问题仍然悬而未决,综合运用多种高通量研究方法和多维数据分析方法可能成为解决这个问题的突破口。

❻ 怎么在ncbi中查询关于代谢综合征的基因表达谱

佳学基因,人类基因信息解读和应用专家。有各种代谢综合征基因解码基因检测,检测是在基因解码研究中心进行的。

❼ 微生物属的生理环境在哪里查

微生物菌种查询网或者查文献 。
1 、调整期:细菌代谢活跃,大量合成细胞分裂所需的酶类、ATP以及其他细胞成分 2 、对数期:细菌代谢旺盛,个体的形态和生理特性比较稳定 (调整期和对数期的细菌几乎不存在种内斗争) 3 、稳定期:有害代谢产物积累,新增细胞数目与死亡细胞数目达到动态平衡,次级代谢产物大量积累,形成芽孢 (稳定期的细菌种内斗争最激烈) 4 、衰亡期:细菌数目急剧下降,出现畸形细菌 (衰亡期的细菌和无机环境的斗争最激烈)。

阅读全文

与哪个网站可以查询微生物基因代谢图谱相关的资料

热点内容
word中化学式的数字怎么打出来 浏览:745
乙酸乙酯化学式怎么算 浏览:1410
沈阳初中的数学是什么版本的 浏览:1361
华为手机家人共享如何查看地理位置 浏览:1052
一氧化碳还原氧化铝化学方程式怎么配平 浏览:892
数学c什么意思是什么意思是什么 浏览:1419
中考初中地理如何补 浏览:1310
360浏览器历史在哪里下载迅雷下载 浏览:710
数学奥数卡怎么办 浏览:1399
如何回答地理是什么 浏览:1033
win7如何删除电脑文件浏览历史 浏览:1062
大学物理实验干什么用的到 浏览:1492
二年级上册数学框框怎么填 浏览:1711
西安瑞禧生物科技有限公司怎么样 浏览:996
武大的分析化学怎么样 浏览:1254
ige电化学发光偏高怎么办 浏览:1344
学而思初中英语和语文怎么样 浏览:1663
下列哪个水飞蓟素化学结构 浏览:1429
化学理学哪些专业好 浏览:1492
数学中的棱的意思是什么 浏览:1069