A. 怎么找基因序列
据基因的构成原理寻找基因序列，如下：
A、C、G和T分别代表组成DNA的四种核苷酸——腺嘌呤，胞嘧啶，鸟嘌呤，胸腺嘧啶。每个字母代表一种碱基，两个碱基形成一个碱基对，碱基对的配对规律是固定的，即是：A-T,C-G。典型的他们无间隔的排列在一起，例如序列AAAGTCTGAC。
任意长度大于4的一串核苷酸被称作一个序列。关于它的生物功能，则依赖于上下文的序列，一个序列可能被正读，反读；包含编码或者无编码。DNA序列也可能包含“junk DNA”。
注：带有遗传讯息的DNA片段称为基因，其他的DNA序列，有些直接以自身构造发挥作用，有些则参与调控遗传讯息的表现。组成简单生命最少要265到350个基因。
(1)如何查询微生物基因组扩展阅读：
基因诊断
当环境中的有害物质进入受精卵或母体，当父母有一定的共同血缘或有一定相同数目的遗传基因关系，在这些情况下，后代的基因组里的基因会发生缺陷，产生疾病。通过使用基因芯片等技术分析人类基因组，可找出致病的遗传缺陷基因区域。
癌症、糖尿病等，都是遗传基因缺陷引起的疾病。医学和生物学研究人员将能在数秒钟内鉴定出最终会导致癌症等的突变基因。借助一小滴测试液，医生们能预测药物对病人的功效，可诊断出药物在治疗过程中的不良反应，还能当场鉴别出病人受到了何种细菌、病毒或其他微生物的感染。利用基因芯片分析遗传基因，将使10年后对糖尿病的确诊率达到50%以上。
未来人们在体检时，由搭载基因芯片的诊断机器人对受检者取血，转瞬间体检结果便可以显示在计算机屏幕上。利用基因诊断，医疗将从千篇一律的“大众医疗”的时代，进一步精确到依据个人遗传基因而异的“定制医疗”的时代，也可以抽羊水进行产前基因诊断。
B. 在NCBI中怎么用已知的引物找目的基因（微生物）
在NCBI中需要选核算那个选项，然后写出微生物英文缩写名称，另外最好写上该基因片段名称。点击搜索即可。会搜到很多基因，找几个典型的基因，然后复制到txt文档里，用DNAStar的editseq来查询已知引物所在位置。不懂继续问。还望采纳哈~
C. 如何判断一段基因序列是否为质粒基因组
DNA序列或基因序列是使用一串字母表示的真实的或者假设的携带基因信息的DNA分子的一级结构。部分DNA序列或基因序列使用一串字母表示的真实的或者假设的携带基因信息的DNA分子的一级结构。DNA序列可能的字母只有A，C，G和T，分别代表组成DNA的四种核苷酸——腺嘌呤，胞嘧啶，鸟嘌呤，胸腺嘧啶。每个字母代表一种碱基，两个碱基形成一个碱基对，碱基对的配对规律是固定的，即是：A-T,C-G。典型的他们无间隔的排列在一起，例如序列AAAGTCTGAC。任意长度大于4的一串核苷酸被称做一个序列。关于它的生物功能，则依赖于上下文的序列，一个序列可能被正读，反读；包含编码或者无编码。DNA序列也可能包含"junk DNA"。质粒（plasmid）是细菌染色体外的遗传物质，存在于细胞质中，具有自主复制能力，使其在子代细胞中也能保持恒定的拷贝数，并表达所携带的遗传信息，是闭合环状的双链DNA分子。质粒不是细菌生长繁殖所必需的物质，可自行丢失或人工处理而消除，如高温、紫外线等。质粒携带的遗传信息能赋予宿主菌某些生物学形状，有利于细菌在特定的环境条件下生存。根据质粒能否通过细菌的接合作用，可分为接合性质粒和非接合性质粒。接合性质粒带有与接合传递有关的基因。非接合质粒在一定条件下通过与其共存的接合质粒的诱动或转导而传递。
D. 如何查微生物的基因组大小 cbs
NCBI里有现成的，可以输入菌种名或代号直接进去查
E. 哪个网站可以查到已经全测序的微生物基因组有多少种了
基因测序是一种新型基因检测技术，能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理，如癌症或白血病，运动天赋，酒量等。基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用，可以说基因测序技术，是下一个改变世界的技术。
基因组大小（size of genome）是指单倍体细胞核中的所含的DNA的总量.在可以进行基因组测序之前,生物学家是用质量来衡量不同生物之间基因组的大小.通常使用的单位为pg（10e-12）,这个值简称为C-value.通过简单的换算就可以知道大概的碱基的数量.不过,对于已经测序的基因组,直接数数就可以了,如 vihole所述.不过对于目前测序的基因组还是很少,估计在1千左右,而现存物种按照最保守的估计也有200万种（Ref 1）,因此C-value在估计基因含量和生物复杂度方面还是有非常大的应用潜力.
F. 如何在NCBI上找到某个生物的完整基因组
SARS coronavirus, complete genome
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=nucleotide&val=NC_004718
Length: 29,751 nt
Genes: 13
Protein coding: 14
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=genome&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=17014
G. 如何读懂微生物测序数据质量
如何读懂微生物测序数据质量
宏基因组是指特定环境中全部生物（微生物）遗传物质的总和。宏基因组测序是利用高通量测序技术对环境样品中全部微生物的基因组进行测定，以获得单个样品的饱和数据量，可进行微生物群体的基因组成及功能注释，微生物群体的物种分类，多样性分析，群落结构分析，样品间的物种或基因差异以及物种间的代谢网络研究，探索微生物与环境及宿主之间的关系，发掘和研究新的具有特定功能的基因等。与传统方法相比，基于高通量测序的宏基因组研究无需构建克隆文库，这避免了文库构建过程中利用宿主菌对样品进行克隆而引起的系统偏差，简化了实验操作，提高了测序效率。此外，宏基因组测序研究摆脱了微生物分离纯培养的限制，扩展了微生物资源的利用空间，为环境微生物群落的研究提供了有效工具。通过宏基因组深度测序可以揭示或估计环境中真实的物种多样性和遗传多样性，挖掘具有应用价值的基因资源，应用于开发新的微生物活性物质，为研究和开发新的微生物活性物质提供有力支持。
H. 微生物的基因组分析后会得到哪些重要信息
微生物全基因组测序中完成Gap closure的意义与方法
微生物是地球上种类最多、数量最大、分布最广的生物群，与人类、动植物和环境有着密切的相互作用，同时也是工业生物技术的核心及重要的国际竞争战略资源。随着测序技术的不断进步以及测序成本的不断降低，越来越多的微生物基因组序列得到测定，其中包括一些重要的病原微生物、工业微生物、极端微生物以及生物学研究中有重要意义的一些模式微生物。
随着新一代测序技术的商业化应用，使得测序成本不断降低，测序通量不断提高，越来越多的微生物基因组得到测定，极大地促进了微生物基因组学的发展。然而，由于测序读长短、数据量大、基因组结构复杂以及测序过程中的偏向性等原因，使得已完成测序的一些物种的基因组中含有数目不等的空缺区域。据统计，自2008年以来GenBank释放的5276个微生物基因组序列中仅有32% (1692)是完整序列。基因组空缺区域中可能存在重要的生物学信息，如果不能补齐所有的Gap，不仅无法获得完整的基因组图谱，还会给后续的基因组信息解读(操纵子结构、基因调控、SNP分析以及比较基因组等)造成困难。因此，完整微生物基因组序列的获得需要在完成测序之后对空缺区域进行填充，即将测序拼装后生成的叠联群(Contig)之间的Gap进行填充，然后按照一定的次序和方向拼装生成一条完整的基因组序列(完成图)，这个过程称之为基因组的Gap closure(或补洞)。
Gap closure的关键在于准确定位不同Contig之间的相对位置关系(Linkage关系)，一旦位置关系确定，即可通过PCR扩增Gap区域序列或是文库克隆步移测序的方式补齐Gap区域。然而，由于一些微生物基因组GC含量高、重复序列数目多且长度大(插入序列、rDNA操纵子、大片段重复等)以及NGS测序读长较短等原因造成测序偏向性高、拼接后生成过多的Contig，从而增加了Gap closure的难度。此外，缺少基因组参考序列或是与参考序列比对同源性低等因素，使得生成的Contig无法有效定位，也会导致Gap closure难度增加，因此Contig定位被认为是微生物基因组Gap closure过程中最困难和最耗时的阶段。一些生物信息学软件被开发用于微生物基因组的Gap closure，并取得了一定的效果；但对于基因组中的高度重复区域和低覆盖率区域的干扰仍无法有效解决，必需借助实验手段获得额外的序列信息才能最终完成基因组的Gap closure，因而应用的范围和准确性受到一定限制。
提高测序覆盖率在一定程度上可以有效减少基因组中的Gap，但成本相对较高，并且对于一些复杂的微生物基因组效果有限，如454二代测序覆盖率为10×时，喜温硫杆菌SM-1测序后生成的Gap数目为400个；测序覆盖率提高至25×时，Gap数目减少至280个；但当测序覆盖率继续提高至38×时，Gap数目进入平台期(276个)，相比25×测序覆盖率时仅减少了4个，已经不能再单纯通过提高覆盖率来减少Gap数目。因此，对于复杂的微生物基因组，需要将基因组的Gap closure分为几个阶段，针对不同阶段采用相应的策略进行：如果Gap数目大于200个，可以通过构建基因组文库、Paired-End测序或者采用基因组光学图谱技术的策略确定Contig之间的相对位置和顺序，然后再依次关闭Contig之间的Gap区域；当Ga数目小于100个时，可以采用多引物PCR的策略寻找Linkage信息，关闭所有能够关闭的Gap；如果最后还剩余几个Gap无法关闭，则可以采用基因组步移或文库筛选的策略，如在对喜温硫杆菌SM-1基因组Gap closure时，通过结合构建基因组文库、Paired-End测序、多引物PCR以及Fosimid文库筛选等多种策略最终完成了SM-1基因组的Gap closure。
I. 中国微生物菌种查询网上怎么查询菌种编号怎么购买
他们网站右上角有一个查询的框，不管是菌种中文名称还是拉丁名，输进去点击查询就出来了，很简单的。
