‘壹’ ngs是什么意思
ngs是高通量测序技术。
高通量测序技术(High-throughputsequencing)又称“下一代”测序技术(“Next-generation”,sequencingtechnology),简称“Ngs”,以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。
高通量测序技术是将DNA(或者cDNA)随机片段化、加接头,制备测序文库,通过对文库中数以万计的克隆(Colony)进行延伸反应,检测对应的信号,最终获取序列信息。
‘贰’ NGS 检测干什么用的
NGS 检测:高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。
1、高通量测序在精准医学的应用:
包括疾病基因的筛查,大规模测病人和正常人的基因,通过基因比较,得出与疾病可能相关的基因,后续再诊断这一疾病,即可筛查病人是否有这些基因的突变。比如乳腺癌,现已有较成熟的基因筛查方法。
2、古基因组学的应用:
对于已经灭绝的生物,可通过考古获得的动物毛发、骨骼对该物种测序,还可通过样品中微生物基因组分析,判断该物种当时的生活环境。
如猛犸象线粒体基因组的测序,发现猛犸象基因复杂度低,存在高度不稳定性,可能这导致了该物种适应环境能力低,在一部分程度上导致了该物种的灭绝。
(2)ngs病原微生物检测是什么意思扩展阅读:
高通量测序技术的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件。该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降, 以人类基因组测序为例, 上世纪末进行的人类基因组计划花费 30 亿美元解码了人类生命密码;
而第二代测序使得人类基因组测序已进入万(美)元基因组时代。如此低廉的单碱基测序成本使得我们可以实施更多物种的基因组计划从而解密更多生物物种的基因组遗传密码。同时在已完成基因组序列测定的物种中, 对该物种的其他品种进行大规模地全基因组重测序也成为了可能。
‘叁’ 第二代测序技术(NGS)是什么,有什么优势
NGS又叫高通量测序,当传统的癌症治疗不起作用,或者医生不能确定患者的癌症起源(原发灶)时,NGS(二代测序)可以帮助确定肿瘤中的基因突变,这些突变可能与某些针对特定变异的药物相匹配。NGS主要优势是通量大,可以得到海量的数据,高通量最小的数据量单位是G,而一代测序一次只能产生1K的数据。
NGS对晚期癌症患者的用处有多大,有研究表明:
1、在80.5%的患者中发现了潜在的可操作的基因组变异;
2、在接受测序指导治疗的132名患者中,37.1%的患者取得了临床获益,19.7%的患者获得了超级应答(定义为将他们的疾病控制至少一年);
3、对于原发灶不明癌患者,在近一半(50.9%)的病例中,NGS解决了组织溯源问题,为医生提供更好的线索,了解哪些标准疗法和靶向疗法可能会有所帮助;
4、在15.8%的癌症患者中发现了潜在的可遗传胚系致病变异(增加患癌风险),其中4.8%与靶向治疗相关。
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‘肆’ NGS究竟是一项怎样的技术
就是高通量基因测序,能够一次测序很多基因。甚至是一个人的全部的基因序列都能一次检测出来。相比第一代测序第二代测序在大规模测序方面有着无可匹敌的优势,压缩成本很厉害。但是对于少量检测成本有很高。很多基因检测公司都在做二代测序服务。
‘伍’ 呼吸科ngs是什么
高通量测序 ,又叫“下一代”测序技术(NGS),是通过并行测序的方法,一次对几十万到几百万条DNA进行序列测定,广泛应用于肿瘤、病原学、遗传等领域。对于感染送检标本,通过分析其中微生物的DNA或RNA含量与丰度判断致病菌,显着提高病原检测的敏感度,缩短了检测时间,对罕见病原体感染的诊断具有优势,可用于临床疑难感染病原体检测。
先来看看NGS能做什么?
全基因测序(WGS)、全外显子测序(WES)在理论上可用于检测基因突变、拷贝数变异(CNV)、纯合状态(LOH)、单亲二体(UPD),延伸开来还可用于易位、倒位等染色体结构异常的判断。内容太多,就先挑几个最重要的来准备吧。
1、基因突变,NGS的最基本应用。
WES可能出错的地方:探针覆盖不全、测序深度不足、测序错误、重复序列、同源序列等。
基本的技术准备:Sanger测序。
虽然看起来NGS老牛气了,简直啥都能干。不过老话说得好,十八般武艺样样都通,难免样样稀松。WES一次能查出来几万个位点,总有一些不那么靠谱的,像测序深度太低或者测序的末端,还有第一外显子等探针比较少的地方,还有一些是内含子上较远的位置,在WES里面都是有可能出错的。所以,WES的结果依然需要Sanger测序来验证。而且,NGS也不是包打天下的,对于WES探针未覆盖到的区域,或者重复序列之类的结构特别之处,WES都会歇菜,还需要Sanger测序来补充。所以Sanger测序的作为技术储备是必不可少的。
除此以外,还有Sanger测序的升级版,比如需要Long Range PCR+Sanger测序,用于分析SMA、HLA等同源序列的区域;Sanger测序的精简版,毛细管电泳,用于亨廷顿、脆X等STR区域检测等。这些技术也得准备好,要知道患者可不会按着你的检测目录来生病,等病人都来了再手忙脚乱地到处找方案容易忙中出错。
必要的知识储备:遗传学知识和文献检索技能。
常见病大家都熟,便宜、快速又准确的检测方法也很多。所以能摊上NGS的,都是少见或者罕见的疾病。可是少见病和罕见病见得少啊,都不熟,这个时候,充分的知识储备、完善的文献检索技能、还有谨慎的态度,就很重要了。
‘陆’ ngs基因检测什么意思Ngs和基因检测是一样的吗
摘要 可以是外周血,也可以是手术中活检
‘柒’ 什么叫病原微生物检测
病原微生物检测是直接检测病原微生物,或其抗原、代谢产物、核酸等。