A. 想自学生物信息学,不知道怎么开始,有没有什么好的推荐
想学习生物信息学可以首先购买相应的书籍,其次可以关注慕课或者是一些其他的网站,上面有很多免费的一些课程可以自己看。
B. 生物信息学方面有什么适合自学者而且能够反映最新进展的书籍
建议直接看最新的论文,比如NAR、bioinformatics,nature genetics上的。
你要是看书籍的话,一般英文的书籍要落后论文1-3年,而中文的书籍要落后最新论文3-5年。
现在最火的就是二代测序了,国内的二代测序书籍基本没有!中文方面的论文也较少,英文就很多了。有问题可以hi我!
C. 《生物信息学参考书》哪本比较适用初学者
生物信息学书都比较宽泛 泛泛而谈 面面俱到。最好看你做的实验相关的文献。
要看的话 推荐 许忠能 生物信息学 还算详细。
D. 如何自学生物信息学
一、计算机基础,需要看三本书,一步步的学会学通,不需要刻意去找哪个书,一般linux是鸟哥私房菜,perl是小骆驼咯,R是R in action,但是看一本书只能入门,真正想成为菜鸟,必须每个要看五本书以上!我云盘里面有这基本上的高清打印版,大家可以去淘宝打印一下才几十块钱还包邮,对书比较讲究的也可以买正版,也不过是一百多块钱而已!
二、生信基础知识,测序方面,在网络文库找十几篇一代二代三代测序仪资料仔细研读,然后去优酷下载各大主流测序仪的动画讲解,再看看陈巍学基因的讲解;数据库先看看三大主流数据库——NCBI,ENSEMBL,UCSC,还有一些也可以了解一些(uniprot,IMGT,KEGG,OMIN,TIGR,GO)同样也是网络文库自己搜索资料,但是这次需要自己去官网一个个页面点击看,一个个翻译成中文理解吃透;数据格式讲起了就多了,这个主要是在项目流程中慢慢学,或者你有机会去上课,不然你看来也是立马忘记的,主要有sam,vcf,fasta,fastq,bed,gtf,gff,genbank,ensembl,psl等。
三、生信研究领域,各个领域主要是软件繁多,合起来常用的估计有上百个软件了,一般只有从业五六年以上的人才有可能把它们全部用过一遍,而且这也完全需要项目来训练,而不能仅仅是看看软件手册,但是研究领域最重要的是背后的原理,需要看各大牛的综述。
a) 生信基础软件(blast++套件,fastqc,flash,blast,solexaQA,NGS-QC-toolkit,SRA-toolkit,fastx-toolkit)。
b) snp-calling相关软件(bwa,bowtie,samtools,GATK,VarScan.jar,annovar)。
c) 基因组相关软件(velvet,SOAPdenovo2,repeatmasker,repeatscount,piler,orthMCL,inparanoid,clustw,muscle,MAFFT,quickparanoid,blast2go,RAxML,phyML)。
d) 转录组相关软件(trinity,tophat,cufflinks,RseQC,RNAseq,GOseq,MISO,RSEM,khmer,screed,trimmomatic,transDecoder,vast-tools,picard-tools,htseq,cuffdiff,edgeR,DEseq,funnet,davidgo,wego,kobas,KEGG,Amigo,go)。
四、生信应用领域,讲这一块其实已经脱离了生信菜鸟的解释范围了,主要是想说社会上为什么需要搞生信的人才,全是因为在肿瘤筛查,产前诊断,流行病学,个性化医疗等领域有所应用,可以造福人类!这方面政策不确定,产业不定型,所以也这绝对是蓝海,但是也绝对不会有现成的资料直接培训人才,我们必须关注各种微信公众号,逛各种测序,医学相关论坛,紧跟业界精英的脚本,同时追着大牛的文献阅读,如此这般才能保住菜鸟的身份!
E. 生物信息学基础书目有哪些怎么样才能快速入门
钟扬的书 简明生物信息学 郝柏林 生物信息学手册 杨子恒的PAPER 张春霆老先生的文献多看
学习简单的计算机语言
多看PAPER
F. 谁能介绍几本经典的生物学教材
生化:杨丽萍《生物化学简明教程》第五版、杨荣武《生物化学原理》第二版 《生物化学》王镜岩,沈同等
细胞:翟中和《细胞生物学》第四版
遗传:刘祖洞《遗传学》
生理:朱大年《生理学》人卫、管又飞《医学生理学》北大医学出版社
植生:李合生《植物生理学》第三版
生态:孙儒泳《基础生态学》第二版
动行:尚玉昌《动物行为学》第二版
植物:马炜良《植物学》、陆时万《植物学》第二版(上、下)
动物:刘凌云《普通动物学》
生物信息学:陈铭《生物信息学》第二版
进化生物学:沈银柱《进化生物学》第三版
微生物:沈萍《微生物学》 周德庆 《微生物学教程》 第三版
分子生物学: 《分子生物学》朱玉贤、李毅
G. 生物信息学和蛋白质化学方面有什么比较不错的书
科学出版社的《精编蛋白质科学实验指南》
H. 求问复旦大学生物信息学的参考用书,729进化生物学和875生物信息学
一、复旦大学的生物信息学的参考用书个人推荐生物化学的王镜岩版本的,在727生物化学和729金华生物学哪个比较简单,这个不太清楚,但是727的一些资料以及历年的真题都较清楚的好找些。
二、你也可以前往复旦大学研究生院中的招生公告中看是否会公布此专业的参考书目,也可清晰的了解。如果觉得官网公布的不够清楚可前往鸿知复旦考研中,寻找考试范围、参考书目、以及复习经验等。
I. 如何自学生物信息学
首先得了解生物信息学做什么。推荐一本入门的书:《探索基因组学、蛋白质组学和生物信息学》,这本书基本上把现在用到的生物信息的基本技术讲了一遍。
然后是学会如何应用现有的工具。现在有很多已经写好的工具,只要会看帮助文档,对于解决手头的工作是提供了相当大的帮助。
学习一门语言。python,perl,R,都可以,只要能够帮自己解决问题就好。