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生物信息用什么系统比较好

发布时间:2022-09-12 02:47:10

A. 请问作为生物信息学专业的人用,这个本本的配置如何

生物信息的计算量很大,对电脑的要求主要集中在操作系统、CPU和内存
显卡、光驱和硬盘不是那么重要
计算机系统 Microsoft Windows XP Professional (32位/Service Pack 3) 最好64位,运算速度快
CPU (英特尔)Intel(R) Celeron(R) M CPU 440 @ 1.86GHz(1866 MHz) 型号比较低
内存 1GB(南亚 PC2-4200 SO-DIMM 533MHz) 现在2G内存应该是主流,主板支持的话4G也好
价格的好,不会贵多少

B. 为什么很多科研工作者用unix/linux系统而不是windows做生物信息学

linux速度快啊,很老的机器都可以跑linux,windows就不行
linux自由,可以自己裁剪、编译内核,可以自己定制、编译文件系统,可大可小。很多路由器就几M的存储空间,可以运行linux,装个windows试试。
linux有强大的命令行shell。比如要替换所有文件中的某个关键词,一个命令就完成了。
linux开放,本身源代码公开,linux上跑的绝大多数软件都是开源的
linux是免费的

C. 生物信息学入门,Linux 系统

http://wenku..com/course/view/4fdf50e2524de518964b7d00 这里有视频教程 看看吧

D. 我进行生物信息学分析,请问,用什么好

生物信息学(Bioinformatics)是在生命科学的研究中,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究重点主要体现在基因组学(Genomics)和蛋白质组学(Proteomics)两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构功能的生物信息。
生物信息学是在大分子方面的概念型的生物学,并且使用了信息学的技术,这包括了从应用数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种方法,并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分子相关的信息。(Luscombe,2001)
具体而言,生物信息学作为一门新的学科领域,它是把基因组DNA序列信息分析作为源头,在获得蛋白质编码区的信息后进行蛋白质空间结构模拟和预测,然后依据特定蛋白质的功能进行必要的药物设计。基因组信息学,蛋白质空间结构模拟以及药物设计构成了生物信息学的3个重要组成部分。从生物信息学研究的具体内容上看,生物信息学应包括这3个主要部分:⑴新算法和统计学方法研究;⑵各类数据的分析和解释;⑶研制有效利用和管理数据新工具。
生物信息学是一门利用计算机技术研究生物系统之规律的学科。
目前的生物信息学基本上只是分子生物学与信息技术(尤其是因特网技术)的结合体。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据,其研究工具是计算机,研究方法包括对生物学数据的搜索(收集和筛选)、处理(编辑、整理、管理和显示)及利用(计算、模拟)。
1990年代以来,伴随着各种基因组测序计划的展开和分子结构测定技术的突破和Internet的普及,数以百计的生物学数据库如雨后春笋般迅速出现和成长。对生物信息学工作者提出了严峻的挑战:数以亿计的ACGT序列中包涵着什么信息?基因组中的这些信息怎样控制有机体的发育?基因组本身又是怎样进化的?
生物信息学的另一个挑战是从蛋白质的氨基酸序列预测蛋白质结构。这个难题已困扰理论生物学家达半个多世纪,如今找到问题答案要求正变得日益迫切。诺贝尔奖获得者W. Gilbert在1991年曾经指出:“传统生物学解决问题的方式是实验的。现在,基于全部基因都将知晓,并以电子可操作的方式驻留在数据库中,新的生物学研究模式的出发点应是理论的。一个科学家将从理论推测出发,然后再回到实验中去,追踪或验证这些理论假设”。
生物信息学的主要研究方向:基因组学 - 蛋白质组学 - 系统生物学 - 比较基因组学,1989年在美国举办生物化学系统论与生物数学的计算机模型国际会议,生物信息学发展到了计算生物学、计算系统生物学的时代。
姑且不去引用生物信息学冗长的定义,以通俗的语言阐述其核心应用即是:随着包括人类基因组计划在内的生物基因组测序工程的里程碑式的进展,由此产生的包括生物体生老病死的生物数据以前所未有的速度递增,目前已达到每14个月翻一番的速度。同时随着互联网的普及,数以百计的生物学数据库如雨后春笋般迅速出现和成长。然而这些仅仅是原始生物信息的获取,是生物信息学产业发展的初级阶段,这一阶段的生物信息学企业大都以出售生物数据库为生。以人类基因组测序而闻名的塞莱拉公司即是这一阶段的成功代表。
原始的生物信息资源挖掘出来后,生命科学工作者面临着严峻的挑战:数以亿计的ACGT序列中包涵着什么信息?基因组中的这些信息怎样控制有机体的发育?基因组本身又是怎样进化的?生物信息学产业的高级阶段体现于此,人类从此进入了以生物信息学为中心的后基因组时代。结合生物信息学的新药创新工程即是这一阶段的典型应用。
折叠

E. 求高手指教,生物信息序列处理的软件clustal x有没有适用于vista系统的

win7系统是可以用的。 还没有发现专门为vista系统开发的clustalx

F. 生物信息采集系统 是什么

比如medlab。
就是可以采集心电、脑电、肌肉收缩等等生物信号的系统。

G. 人体协调内部的生物信息主要涉及哪两大系统

人体协调内部的生物信息主要涉及两大系统:神经系统-协调内、外;内分泌系统-主要协调外部。
哺乳动物和其他较为低等的动物亦有这两个系统。

H. 学习生物信息必须学习unix操作系统吗

你想怎么指点?基本上,是必须要掌握unix系统的,因为很多软件的分析都是在linux下运行的

I. 生物信息学中甲基化处理使用软件的Bismark是用Windows系统安装使用吗

最好在linux系统,多个线程跑。在windows下,你自己电脑吗?如果是的话,内存占的有点大,而且临时文件近1T

J. 生物信息学一些基本的常用软件有哪些

最常用的东西:
1,你需要会用 Linux,会使用 bash

2,高于入门级的统计学知识,以及一门统计语言,比如 R

3,至少一门编程语言,一般来讲 C++, Perl, Python, Java 这几种中的一种。

4,对于你工作的领域,需要懂这方面的生物学知识,也需要知道目前人们在这个领域里都用什么其他软件。

以上四点我觉得必不可少。其他的知识则取决于你是什么领域。比如如果你要研发高性能的序列比对软件,则算法和并行计算的知识必不可少。——本人自己算法很渣,所以没有把算啊列在以上必备的知识里。如果要频繁存取大量数据,则懂得一种数据库必不可少,比如MySQL。

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