A. 请问ORF与CDS的区别是什么
CDS就是编码区,不多解释了。
ORF,开放阅读框,实际上我们得到了一段序列后,在研究中,特别是生物信息学,发现三个三个密码子阅读后,他可以编码某种蛋白质,但是实际上他在自然条件下会不会编码蛋白质,是不一定的,我们是不清楚的。比如I型内含子中有编码内切核酸酶的ORF。据我们老师说ORF不含终止密码,但是我看到网上有些人说含有终止密码,我不确定。
B. 基因的cds和orf的区别
CDS是Coding sequence,蛋白编码序列.
ORF是open reading frame,开放阅读框.
⑴开放阅读框是不被终止子打断的一段核酸序列,可能包含编码蛋白的碱基序列;不是所有开放阅读框都能被表达出蛋白产物,或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白.
⑵CDS,就是编码一段蛋白产物的序列.
⑶cds必定在一个ORF里,但也可能包括很多ORF.
⑷反之,每个ORFf不一定都有CDS.
PS:网络上的说法略有出入,我改了改
C. 解释CDS、cDNA、EST、mRNA、ORF间的区别
ORF的英文展开是open reading frame(开放阅读框)。
CDS的英文展开是coding sequences (编码区)。
ORF是理论上的氨基酸编码区,一般是在分析DNA核酸图谱中(主要是利用电脑程序)得到的。程序会自动在DNA序列中寻找启动因子(ATG或AUG),然后按每3个核酸一组,一直延伸寻找下去,直到碰到终止因子(TAA或TAG)。程序把这个区域当成ORF区,认为理论上可以编码一组氨基酸。
但问题是,在一个整体核酸序列中寻找ATG并不靠谱。因为寻找到的ATG很可能是两个氨基酸编码片段的尾和头的混合体。比如AACGCATGCAGC.
看上面这个小序列,如果以T为中心,会有三种编码组合的可能。即
(1)ATG(T在中心)电脑程序发现的启动因子的组合
(2)CAT(T在最右侧)
(3)TGC(T在最左侧)本例中实际核酸编码的组合。
这就是ORF三种框架的来源。实际上,DNA序列可以按六种框架阅读和翻译(每条链三种,对应六种不同的三联密码子)。
所以,我们说ORF只是理论上的编码区,与真实的情景可能并不一样。
而CDS是检查cDNA后得到的编码组合序列,和实际情景比较接近。
D. ORF在基因中有什么作用
ORF是开放阅读框,里边所包含的DNA序列是否能编码蛋白质是不清楚的,如果一旦发现ORF里的DNA可以编码蛋白质,那它就变成了一个基因。所以每一个开放阅读框都是潜在的基因(也许是真基因只是人们还没研究出来,也有可能这个OFR压根儿也就不编码蛋白质)
E. 请问CDS和ORF有什么区别谢谢回答详细一点。
1、含义不同。
ORF的英文展开是open reading frame(开放阅读框)。 CDS的英文展开是coding sequences (编码区)。
2、来源不同。
ORF只是理论上的编码区,与真实的情景可能并不一样。 而CDS是检查cDNA后得到的编码组合序列,和实际情景比较接近。
(5)生物中orf是什么扩展阅读:
ORF三种框架的来源:
(1)ATG(T在中心)电脑程序发现的启动因子的组合
(2)CAT(T在最右侧)
(3)TGC(T在最左侧)本例中实际核酸编码的组合。
F. 什么是ORF表达载体
表达载体,指在ORF前有转录
启动子
,ORF后有
转录终止子
,这样ORF可表达为蛋白质;另有些附加原件,如
复制子
,筛选
标记基因
,
报告基因
等。
G. 什么是orf在基因注释中orf有何意义
如果你是基因组序列的话,并不能用NCBI里面的那个ORF finder工具,该工具只是简单的将你所输入的序列按6种可能的阅读框进行翻译,然后输出编码最长氨基酸的那种阅读框,你是基因组序列,你得先知道该基因编码的mRMA序列,你知道了cDNA序列你才能进一步分析该基因中的外显子和内含子,甚至该基因的启动子,找cDNA序列,可以用ncbi的blast搜索
H. 基因的cds和orf的区别
CDS是Coding sequence,蛋白编码序列。
ORF是open reading frame,开放阅读框。
⑴开放阅读框是不被终止子打断的一段核酸序列,可能包含编码蛋白的碱基序列;不是所有开放阅读框都能被表达出蛋白产物,或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白。
⑵CDS,就是编码一段蛋白产物的序列。
⑶cds必定在一个ORF里,但也可能包括很多ORF。
⑷反之,每个ORFf不一定都有CDS。
PS:网络上的说法略有出入,我改了改