A. 世界上三大文献检索数据库是哪几个
SCI--Science Citation Index《科学引文索引》 - EI—Engineering Index《工程索引》 - ISTP—Index to Scientific & Technical Proceedings 《科技会议录索引》 - SCI SCI(《科学引文索引》,英文全称为Science Citation Index)是美国科学情报研究所(In stitute for Scientific Information,简称ISI)出版的一部世界着名的期刊文献检索工具,其出版形式包括印刷版期刊和光盘版及联机数据库,现在还发行了互联网上Web版数据库。 SCI收录全世界出版的数、理、化、农、林、医、生命科学、天文、地理、环境、材料、工程技术等自然科学各学科的核心期刊约3500种。ISI通过它严格的选刊标准和评估程序挑选刊源,而且每年略有增减,从而做到SCI收录的文献能全面覆盖全世界最重要和最有影响力的研究成果。ScI所谓最有影响力的研究成果,指的是报道这些成果的文献大量地被其它文献引用。为此,作为一部检索工具,SCI一反其它检索工具通过主题或分类途径检索文献的常规做法,而设置了独特的“引文索引”(Citation Index)。即通过先期的文献被当前文献的引用,来说明文献之间的相关性及先前文献对当前文献的影响力。 SCI以上做法上的特点,使得SCI不仅作为一部文献检索工具使用,而且成为科研评价和的一种依据。科研机构被SCI收录的论文总量,反映整个机构的科研、尤其是基础研究的水平;个人的论文被SCI收录的数量及被引用次数,反映他的研究能力与学术水平。 此外,ISI每年还出版JCR(《期刊引用报告》,全称Journal Citation Reports)。JCR对包括SCI收录的3500种期刊在内的4700种期刊之间的引用和被引用数据进行统计、运算,并针对每种期刊定义了影响因子(Impact Factor)等指数加以报道。一种期刊的影响因子,指的是该刊前二年发表的文献在当前年的平均被引用次数。一种刊物的影响因子越高,也即其刊载的文献被引用率越高,一方面说明这些文献报道的研究成果影响力大,另一方面也反映该刊物的学术水平高。因此,JCR以其大量的期刊统计数据及计算的影响因子等指数,而成为一种期刊评价工具。图书馆可根据JCR提供的数据制定期刊引进政策;论文作者可根据期刊的影响因子排名决定投稿方向。 EI Ei Compendex是全世界最早的工程文摘来源。Ei Compendex数据库每年新增的50万条文摘索引信息分别来自5100种工程期刊、会议文集和技术报告。Ei Compendex收录的文献涵盖了所有的工程领域,其中大约22%为会议文献,90%的文献语种是英文。Ei公司在1992年开始收录中国期刊。1998年Ei在清华大学图书馆建立了Ei中国镜像站。 SCI、SSCI 简介 目前,在国际科学界,如何正确评价基础科学研究成果已引起越来越广泛的关注。而被SCI、SSCI收录的科技论文的多寡则被看作衡量一个国家的基础科学研究水平、科技实力和科技论文水平高低的重要评价指标。那么,究竟什么是SCI和SSCI呢?我们根据所掌握的资料,简介如下: 一、SCI简介-- SCI即《科学引文索引》(Science Citation Index),是由美国科学信息研究所(Institute for Scientific Information 简称ISI)创建的,收录文献的作者、题目、源期刊、摘要、关键词,不仅可以从文献引证的角度评估文章的学术价值,还可以迅速方便地组建研究课题的参考文献网络。SCI创刊于1961年。经过40年的发展完善,已从开始时单一的印刷型发展成为功能强大的电子化、集成化、网络化的大型多学科、综合性检索系统。-- SCI从来源期刊数量划分为SCI和SCI-E。SCI指来源刊为3500多种的SCI印刷版和SCI光盘版(SCI Compact Disc Edition, 简称SCI CDE),SCI-E(SCI Expanded)是SCI的扩展库,收录了5600多种来源期刊,可通过国际联机或因特网进行检索。SCI涵盖学科超过100个,主要涉及农业、生物及环境科学;工程技术及应用科学;医学与生命科学;物理及化学;行为科学。-- 二、SSCI简介-- SSCI即社会科学引文索引(Social Sciences Citation Index),为SCI的姊妹篇,亦由美国科学信息研究所创建,是目前世界上可以用来对不同国家和地区的社会科学论文的数量进行统计分析的大型检索工具。1999年SSCI全文收录1809种世界最重要的社会科学期刊,内容覆盖包括人类学、法律、经济、历史、地理、心理学等55个领域。收录文献类型包括:研究论文,书评,专题讨论,社论,人物自传,书信等。选择收录(Selectively Covered)期刊为1300多种。 三、SCI、SSCI交叉关系-- SSCI对其收录期刊范围的说明中明确告知该数据库中有一部分内容与SCI重复,这是因为学科之间本身有交叉,是社会科学与自然科学相结合的跨学科的研究在文献中的自然反映。 另外,SSCI从3400余种自然科学期刊中,通过计算机检索文章主题和引文后,生成一个与社会科学有关的文献目录,此目录再经ISI编委会审核,选择与社会科学密切相关的文献加入SSCI。因此SSCI也收录了相当数量的自然科学文献,二者的交叉关系更为密切。 EI简介 EI是美国《工程索引》(The Engineering Index)的简称。EI创刊于1884年,由美国工程情报公司(Engineering Information Co.)出版发行。EI是工程技术领域内的一部综合性检索工具,报道内容包括:电类、自动控制类、动力、机械、仪表、材料科学、农业、生物工程、数理、医学、化工、食品、计算机、能源、地质、环境等学科。- ISTP简介 ISTP是Index to Scientific & Technical Proceedings的缩写,是美国科学情报研究所的网络数据库Web of Science Proceedings中两个数据库(ISTP和ISSHP)之一。专门收录世界各种重要的自然科学及技术方面的会议,包括一般性会议、座谈会、研究会、讨论会、发表会等的会议文献,涉及学科基本与SCI相同。 ISTP收录论文的多少与科技人员参加的重要国际学术会议多少或提交、发表论文的多少有关。我国科技人员在国外举办的国际会议上发表的论文占被收录论文总数的64.44%。 在ISTP、 EI、 SCI这三大检索系统中,SCI最能反映基础学科研究水平和论文质量,该检索系统收录的科技期刊比较全面,可以说它是集中各个学科高质优秀论文的精萃,该检索系统历来成为世界科技界密切注视的中心和焦点。
B. 生物信息数据库分为哪四大类
按大小可以分为1.公共数据库
2. 从公共数据库中取数据做进一步处理的专业数据库,提供更多的分析工具
按功能分可以有
基因库GENEBANK,蛋白库UNIPROT, 结构库PDB, 功能分类 GO库,通路库 KEGG。
不用专注于4这个数字。随着科研的进步还会有更多的数据库出来。
C. 通常说的三大生物信息学数据库指
EMBL DDBJ GenBank
D. 全世界三大免费数据库是什么
一.三大检索工具及相关数据库介绍
1.三大检索工具简
科技部下属的“中国科学技术信息研究所”从 1987 年起,每年以国外四大检索工具 SCI 、ISTP 、Ei、ISR 为数据源进行学术排行。由于 ISR(《科学评论索引》) 收录的论文与 SCI 有较多重复,且收录我国的论文偏少因此,1993年起不再把 ISR 作为论文的统计源。而其中的 SCI 、ISTP 、 Ei 数据库就是图书情报界常说的国外三大检索工具。
SCI ,即《科学引文索引》,是自然科学领域基础理论学科方面的重要期刊文摘索引数据库。它创建于1961 年,创始人为美国科学情报研究所所长 Eugene Garfield(1925.9.15).利用它,可以检索数学、物理学、化学、天文学、生物学、医学、农业科学以及计算机科学、材料科学等学科方面自 1945 年以来重要的学术成果信息;SCI 还被国内外学术界当做制定学科发展规划和进行学术排名的重要依据。
ISTP ,即《科学技术会议录索引》,创刊于 1978 年,由美国科学情报研究所编制,主要收录国际上着名的科技会议文献。它所收录的数据包括农业、环境科学、生物化学、分子生物学、生物技术、医学、工程、计算机科学 、化学、物理学等学科。从 1990-2003 年间, ISTP 和 ISSHP( 后文将要讲到 ISSHP) 共收录了 60 , 000 个会议的近 300 万篇论文的信息。
Ei,即《工程索引》,创刊于 1884 年,由 Elsevier Engineering Information Inc. 编辑出版。主要收录工程技术领域的论文(主要为科技期刊和会议录论文 ) ,数据覆盖了核技术、生物工程、交通运输、化学和工艺工程、照明和光学技术、农业工程和食品技术、计算机和数据处理、应用物理、电子和通信、控制工程、土木工程、机械工程、材料工程、石油、宇航、汽车工程等学科领域。
2.与三大检索工具相关的其它数据库介绍
SSCI,即《社会科学引文索引》,创刊于 1969 年,收录数据从 1956 年至今;是社会科学领域重要的期刊文摘索引数据库。数据覆盖了历史学、政治学、法学、语言学、哲学、心理学、图书情报学、公共卫生等社会科学领域。
A&HCI,即《艺术与人文科学引文索引》,创刊于 1976 年,收录数据从 1975 年至今;是艺术与人文科学领域重要的期刊文摘索引数据库。数据覆盖了考古学、建筑学、艺术、文学、哲学、宗教、历史等社会科学领域。
ISSHP ,即《社会科学和人文会议录索引》,创刊于 1979 年,数据涵盖了社会科学、艺术与人文科学领域的会议文献。这些学科包括:哲学、心理学、社会学、经济学、管理学、艺术、文学、历史学、公共卫生等领域。
xiaoxinsue 2006-06-03 10:35
二.如何利用三大检索工具等数据库检索相关主题文献
1.利用SCI、SSCI、A&HCI数据库检索相关主题文献
(1) 通过往TOPIC检索入口输入检索主题词获得相关主题文献
(2) 通过往TOPIC检索入口输入检索主题词,然后对检索结果进一步分析获得相关主题文献
(3) 通过往TOPIC和SOURCE TITLE检索入口同时输入检索主题词获得相关主题文献
例子:往TOPIC中输入"nano*",同时往SOURCE TITLE 中输入"ARTIFICIAL CELLS BLOOD SUBSTITUTES AND IMMOBILIZATION BIOTECHNOLOGY or BIO-MEDICAL MATERIALS AND ENGINEERING or BIOMATERIALS or CELLULAR POLYMERS or DENTAL MATERIALS or JOURNAL OF BIOACTIVE AND COMPATIBLE POLYMERS or JOURNAL OF BIOMATERIALS SCIENCE-POLYMER EDITION or JOURNAL OF BIOMATERIALS APPLICATIONS or JOURNAL OF BIOMEDICAL MATERIALS RESEARCH or JOURNAL OF MATERIALS SCIENCE-MATERIALS IN MEDICINE or MACROMOLECULAR BIOSCIENCE", 利用上面的检索式,可以检索出SCI网络版2002年数据库收录"MATERIALS SCIENCE, BIOMATERIALS"类的文章102篇。
2.利用ISTP数据库检索相关主题文献
可以通过TOPIC、SOURCE TITLE、CONFERENCE相结合的方式来检索
3.利用Ei数据库检索相关主题文献
例子:检索医学领域中含有 "pipe" 的文献
如果仅仅用 "pipe" 检索在所有字段中检索,会命中 4 万多条记录;即使同时限制在 TITLE 中检索,结果也有 1 万多条,数据冗余太大。这时,可以考虑从学科的角度进行限制检索:
先检索到从 Ei Thesaurus 中检索医学类目:
Medicine : 461.6 , Medical care : 461.7 , Medical imaging : 461.1 , Medical problems ,
Medical supplies : 462.1 , Medical computing : 723.5 , Medical diagnosis , Medical ecation ,
Medical equipment , Medical monitoring : 462.2
利用 "Expert Search" : (461.1 wn CL OR 461.6 wn CL OR 461.7 wn CL OR 462.1 wn CL OR 723.5 wn CL) AND (pipe wn TI) 命中 500 多条记录,因 723.5 类与计算机应用有关,命中记录中有许多看不出是与医学有关的,可以考虑将该类去掉检索。结果就比较令人满意。
4.利用 SCOPUS 数据库检索相关主题文献
该数据库提供了学科限制,因而相对容易。
三.如何利用三大检索工具等数据库检索论文收录情况
1.利用三大检索工具等数据库检索单位 / 集体论文收录情况
以清华大学为例
(1)利用 SCI 数据库检索单位 / 集体论文收录情况
(tsinghua univ or tsing hua univ or qinghua univ or qing hua univ or 100084) same (peoples r china or beijing or bei jing)
(2)利用 ISTP 数据库检索单位 / 集体论文收录情况
(tsinghua univ or tsing hua univ or qinghua univ or qing hua univ or 100084) same (peoples r china or beijing or bei jing)
(3)利用 Ei 数据库检索单位 / 集体论文收录情况
利用作者索引或用复杂检索,但效果均不好。
(4)利用 SCOPUS 数据库检索单位 / 集体论文收录情况
AFFIL(100084 AND tsinghua)
(5)利用 CSSCI 、《中国期刊网》、《中文科技期刊数据库》检索单位 / 集体论文收录情况
三个数据库均提供机构检索入口,可以查找单位 / 集体论文收录情况。
2.利用三大检索工具等数据库检索个人论文收录情况
以周远翔老师的论文为例子 ( 见附录 ) :
(1)利用 SCI 数据库检索个人论文收录情况
作者的文献 ( 文章或报告 ) 共有 104 篇,在这些文章中,他的合作者包括以下八人: N. Yoshimura, 关志成, H. Katoh, 严萍,梁曦东,李光范, M. Nifuku, Atsushi Satake
构建检索式: (zhou yx or yunxiang z) and (Yoshimura n or guan zc or cheng g or Katoh h or yan p or ping y or liang xd or xidong l or li gf or guangfan l or Nifuku m or Satake a or Atsushi S)
在 AUTHOR 字段中输入上述检索式,命中 9 条记录。与作者提供的论文核对后发现:这 9 条记录全是作者本人的论文。
还有几篇文献是作者单独完成的,对于这些文献,需要单独处理。
(2)利用 ISTP 数据库检索个人论文收录情况
与检索 SCI 数据库类似,用同样的检索式和同样的方法即可。
在 AUTHOR 字段中输入上述检索式,命中 14 条记录。与作者提供的论文核对后发现:这 14 条记录全是作者本人的论文。比作者事先查好的 12 篇还多 2 篇。
(3)利用 Ei 数据库检索个人论文收录情况
在高级检索中输入 (Ei 数据库作者标引与 SCI 有很大不同: Ei 一般要将姓和名写全,而 SCI 是要求姓写全,名用第一个字母 ) :
(zhou, y.x. wn AU OR zhou, yuanxiang wn AU OR yuanxiang, z. OR yuanxiang, zhou OR zhou, y.-x. wn AU OR zhou, yx wn AU) AND (Yoshimura wn AU OR guan, z.c. wn AU OR guan, z.-c. wn AU OR cheng, g wn AU OR guan, cheng wn AU OR guan, zc wn AU OR Katoh wn AU OR yan, p wn AU OR yan, ping wn AU OR ping, y. wn AU OR ping, yan wn AU OR liang, x.-d. wn AU OR liang, x.d. wn AU OR liang, xd wn AU OR xidong, liang wn AU OR liang, xidong wn AU OR xidong, l. wn AU OR li, gf wn AU OR li, g.f. wn AU OR li, g.-f. wn AU OR guangfan, l. wn AU OR guangfan, li wn AU OR li, guangfan wn AU OR Nifuku wn AU OR Satake wn AU OR Atsushi wn AU)
命中 19 条记录,这与读者自己检索的 27 条记录相差 8 条。
后经检查,发现漏检的 8 条记录中,有 7 条作者是 "zhou, y" ,有一条是 "zhou, yuanxing" 。所以,用上述检索式会漏掉一部分记录;因而我们应再修改一下检索式:
把上述检索式修改为: (zhou, y* wn AU OR yuanxiang, z. OR yuanxiang, zhou) AND (Yoshimura wn AU OR guan, z.c. wn AU OR guan, z.-c. wn AU OR cheng, g wn AU OR guan, cheng wn AU OR guan, zc wn AU OR Katoh wn AU OR yan, p wn AU OR yan, ping wn AU OR ping, y. wn AU OR ping, yan wn AU OR liang, x.-d. wn AU OR liang, x.d. wn AU OR liang, xd wn AU OR xidong, liang wn AU OR liang, xidong wn AU OR xidong, l. wn AU OR li, gf wn AU OR li, g.f. wn AU OR li, g.-f. wn AU OR guangfan, l. wn AU OR guangfan, li wn AU OR li, guangfan wn AU OR Nifuku wn AU OR Satake wn AU OR Atsushi wn AU) 命中 34 条记录,从中找出了作者有 27 篇文献被 Ei 数据库收录。
需要说明的是:利用第一个检索式基本上可以比较准确地检索到作者的文献。只所以利用第二个检索式,是考虑到 Ei 数据库在数据标引过程中可能出现的小的差错,可以基本上没有遗漏地检索出作者所有被 Ei 数据库收录的文献。
(4)利用 SCOPUS 数据库检索个人论文收录情况
(5) 利用 CSSCI 、《中国期刊网》、《中文科技期刊数据库》检索个人论文收录情况
xiaoxinsue 2006-06-03 10:35
四.如何检索论文被引用情况
1.检索单位 / 集体论文被引用情况
(1)利用 SCI 、 SSCI 、 A&HCI 检索论文被引用情况
从收录的角度检索,例子:
(tsinghua univ or tsing hua univ or qinghua univ or qing hua univ or 100084) same (peoples r china or beijing or bei jing)
(2)利用 SCOPUS 检索论文被引用情况
(3)利用《中国期刊网》检索论文被引用情况
备注: CSSCI 、《中国科技论文引文统计分析数据库》均没有提供按单位 / 集体检索论文被引用情况的入口。
2.检索个人论文被引用情况
(1) 利用SCI、SSCI、A&HCI检索论文被引用情况 从收录的角度检索,例子:
(2) 利用SCOPUS检索论文被引用情况
(3) 利用CSSCI、《中国科技论文引文统计分析数据库》、《中国期刊网》检索论文被引用情况
五.核心期刊投稿导引
1.期刊评价及评价工具
关于期刊评价,目前国内学术界有两种观点:一是核心期刊评价法,二是期刊综合评价梯度法。前者简称“ 0/1 法则”,后者简称“综合法则”。两种法则都是以传统的情报学文献离散定律、引文分析定律等为理论依据的。只是“综合法则”涵盖了“ 0/1 法则”,更加强调梯度的概念。 期刊评价的工具,国外以 JCR(Journal Citation Reports) 为代表,国内以《中文核心期刊要目总览》、《中国科技期刊引证报告》和《中国学术期刊综合引证报告》为代表。《中文核心期刊要目总览》和《中国科技期刊引证报告》是“0/1 法则”评价的结果,《中国学术期刊综合引证报告》是“综合法则”评价的结果。
2. 核心期刊的内涵及国内、国际核心期刊外延的界定
核心期刊的概念可以用一句话来概括:某一学科中高水平、高影响力的期刊。不难看出,核心期刊有两个主要特性:一是学科性,二是学术性。
一般情况下,核心期刊都是在某一个学科范围内来界定的某一个学科的核心期刊,到另一个学科就不一定是核心期刊 ( 当然,综合性学科的核心期刊,如 NATURE 、 SCIENCE 等例外 ) 。
核心期刊的学术性主要要是以期刊影响因子来测定的。关于影响因子,有两种统计方法:一种是三年统计法,一种是中期统计法。按三年统计法得出的结果就是目前我们常说的影响因子 (IF: Impact Factor :某一种期刊在第三年得到的引文数与该刊前两年的总论文数之比。 ) ,按中期统计法得出的结果叫 “ 中期影响因子”(MIF: Median Impact Factor 某一种期刊的引文累计达到 1/2 时,引文数与此时的总论文数之比 ) 。
3.如何向国内、国际核心期刊投稿
投国际刊物,请参考 JCR( 包括科技版和社科版 ) ,选择自己想要找的学科类目,按照影响因子排序,挑选适合的刊物。然后在《乌利希国际期刊指南》网站查找刊物的地址或网站信息,登陆刊物的网站,查找在线投稿信息。
投国内刊物,请参考《中文核心期刊要目总览》和《中国科技期刊引证报告》,从中选择自己想要找的学科类别,然后按照影响力,挑选适合的刊物。投稿地址信息可以参考工具书《中文核心期刊要目总览》,也可以登录“中国期刊网”,查找刊物的投稿信息。
在向核心期刊投稿的过程中,需要注意的事项:
(1)尽量不要投增刊。
(2) 单位署名要规范。写清华大学要同时写上 Beijing, Peoples Republic of China. 这在 SCI 中尤其要注意。
六.SCI 收录期刊
SCI收录全世界出版的数、理、化、农、林、医、生命科学、天文、地理、环境、材料、工程技术等自然科学各学科的核心期刊约3500种。美国科学情报研究所通过它严格的选刊标准和评估程序挑选刊源,而且每年略有增减,从而做到SCI收录的文献能全面覆盖全世界最重要和最有影响力的研究成果。
ISI所谓最有影响力的研究成果,指的是报道这些成果的文献大量地被其它文献引用。为此,作为一部检索工具,SCI一反其它检索工具通过主题或分类途径检索文献的常规做法,而设置了独特的"引文索引"(Citation Index)。即通过先期的文献被当前文献的引用,来说明文献之间的相关性及先前文献对当前文献的影响力。
SCI 以上做法上的特点,使得 SCI 不仅作为一部文献检索工具使用,而且成为科研评价和的一种依据。科研机构被 SCI 收录的论文总量,反映整个机构的科研、尤其是基础研究的水平;个人的论文被 SCI 收录的数量及被引用次数,反映他的研究能力与学术水平。
SCI 的出版形式包括印刷版期刊和光盘版及联机数据库,现在还发行了互联网上 Web 版数据库。个人通过网络就可以对 sci 期刊目录进行搜索和查找,相关链接如下:
SCI 收录期刊 ( 按字母 ) :
http://www.isinet.com/cgi-bin/jrnlst/jlresults.cgi?PC=K
SCI 收录期刊 ( 按分类 ) :
http://www.isinet.com/cgi-bin/jrnlst/jlsubcatg.cgi?PC=K
七.EI 投稿指南
为了适应我国科学技术的快速发展,为我国科技工作者向 EI 收录期刊投稿提供方便,本指南收集了 EI 收录的科技期刊中近 1900 余种刊物的最新投稿信息,其中包括通信地址、电话号码、电子邮件地址和网站的网址等。
使用说明
(1) 本目录按中国科学院图书分类法排列。
(2)各来源期刊款目的着录格式如下:
375C0005 ① ISSN 0306-4573 ②
Information Processing&Management. ③
1963. 6/yr ④ Editor-in-chief:Tefko Saracevic,School of Communication Information and Library Studies Rutgers University 4
Huntington Street New Brunswick,NJ 08903 USA. ⑤
E-mail:[email protected]
http://www.elsevier.nl/inca/publications/store/2/4/4/ ⑥
《信息处理与管理》刊载信息处理、传播、储存、利用、检索和管理,包括:计算机和自动化技术在图书馆信息工作中的应用以及信息政策等方面的研究论文、评论和简讯。 ⑦
注: ① 中图公司报刊刊号 ② 国际标准刊号 ③ 刊名 ④ 创刊年及出版周期(或全年期数) ⑤ 编委或编辑部或出版机构名称、地址、电话、传真 ⑥ 电子邮件地址和网址 ⑦ 译名和内容简介(中文或英文)
(3)指南中部分缩写解释
ISSN:International Standard Serial Number 国际标准刊号 Pub:Publisher 出版者
E. 国家基因库:人类存储健康信息的“生命银行”
深圳市大鹏新区大鹏街道下沙片区禾塘仔,这里依山傍海,环境优美,背山面海的几栋白色的建筑并不起眼,但令人难以置信的是,庞大的数据如同螺旋一般,每天从这里源源不断地涌出。这些白色的梯田造型的建筑就是中国首个获批筹建的国家基因库,也是目前全球最大的综合性基因库。
国家基因库项目一期占地面积4.75万平方米,拥有基因测序房、超级计算房以及冷冻资源房,相较于其庞大的建筑规模,它丰富的内容更是令人瞠目结舌:国家基因库目前已存储多种生物资源样本1000万份,可检索生物信息条目数已经超过一个亿,我国更是计划把它打造成为中国的诺亚方舟,建立一个巨大的生物活体库,保护和保存世界约三十万种植物、百万种动物、近千万种微生物活体资源。如此大手笔、高规格的项目究竟什么来头?建立国家基因库的意义何在?下面就让我们一起走进关于国家基因库的专业解读。
“科普中国”是中国科协携同社会各方利用信息化手段开展科学传播的科学权威品牌。
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F. 国际上三个大的生物信息中心有哪些
一 美国国家生物技术信息中心NCBI(National Center for
Biotechnology Information)
NCBI是一个极具人性化的网站,网站的主页清晰的阐明了NCBI所做的工作及相关领域最新的热点内容,新闻等。为了方便使用者更加熟练使用网站资源,NCBI在主页清晰的标注了站点导航,非常便于初学者熟悉和掌握NCBI的站内资源。
另外,NCBI将其网站资源列于主页左侧,其中包括:SITE MAP, About NCBI, GenBank, Literature
databases, Molecular databases, Genomic biology, Tools, Research at
NCBI, Software engineering, Ecation, FTP site, Contact
information等等。
二EBI(European
Bioinformatics Institute)欧洲生物信息研究所The European
Bioinformatics Institute(EBI)是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一,位置座落于英国The Wellcome Trust
Genome Campus。EBI的任务就是确保分子生物与基因体的研究信息可以公开并且免费提供给科学社群,以促进科学进步。
EBI所提供的服务包括建立/维护数据库、提供分子生物相关信息服务、执行分子生物与计算分子生物研究;所服务的对象与研究人员扩及各产业,包括分子生物、基因体、医学与农业学术研究、农业、生物技术、化学与制药工业。
三DDBJ(DNAData Bank of
Japan)日本核酸数据库
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)
设立在日本国家遗传研究所(NIG),于1986年开始DNA数据库的构建工作。从一开始,DDBJ就作为国际性DNA数据库之一,发挥着重要的作用。它
首先反映的是日本国内数据库的资源,并与NCBI,EBI进行频繁的国际性合作。DNA序列中蕴含了大量的数据资源,比起其它生物学数据,它在阐述进化方面的作用更为直接。因此,探求DNA数据库,不仅是在生命科学方面的研究,更是为人类的发展谋福利。
DDBJ是日本唯一的DNA数据库,它从研究者那里收集DNA 序列并且给数据提交者一个国际公认的编码。DDBJ
主要从日本研究者那里收集数据,当然,它也接受外国研究者的数据并给以编码。
G. 生物学数据库都有哪些
分子生物学数据库大全:核酸数据库、基因表达数据库、蛋白数据库、糖数据库、专利数据库等国际顶尖数据库列表可以在生物帮那里找到的,我一般找资料,最新资讯都是到那里的,他们比较专业,权威,也比较全面,技术文档,视频,产品都蛮丰富的。年来大量生物学实验的数据积累,形成了当前数以百计的生物信息数据库。它们各自按一定的目标收集和整理生物学实验数据,并提供相关的数据查询、数据处理的服务。
H. 国际着名的三大蛋白质数据库
国际着名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。
1、UniProt数据库
蛋白组学常用数据库UniProt(全称UniProt Protein Resource),建立于1986年,由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白质数据库联合成立的,其信息量丰富、资源广泛,是目前公认的首选免费蛋白质数据库。
2、The Human Protein Atlas数据库
The Human Protein Atlas内含近30000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息,并提供免费查询。
瑞典Knut&Alice Wallenberg基金会利用免疫组化技术,检查每一种蛋白质在人类48种正常组织,20种肿瘤组织,47个细胞系和12种血液细胞内的分布和表达,其结果用至少576张免疫组化染色图表示,并经专业人员校对和标引,保证染色结果具有充分的代表性。
3、PhosphoSitePlus数据库
PhosphoSitePlus数据库是一个由CST和NIH联合开发的免费资源数据库,总结归纳了海量通过科学研究发现的蛋白修饰位点,包括磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化等,并且包括一些CST公司发现但未发表的蛋白修饰位点。
该数据库是动态的、开放的、高度互动并持续更新的。它有助于研究PTMs在正常和病理细胞/组织中的作用,同时它也是发现新的疾病标志物和药物靶点的有力工具。
性能及历史
蛋白质数据库(HPDB),建于2005年5月,动态展示生物大分子立体结构,鼠标点击放大分子结构、原子定位、测定原子之间距离,可用于教学或科研。服务对象是能够熟练使用中文的生命科学、医学、药学、农学、林学等领域的大中专学生、教师及科技工作者。
分子结构特征描述采用汉语,同时提供英文原文以供考证。对于善于使用英文的读者,我们提倡直接访问RCSB PDB,一来可以减少网络拥挤,二来可以减少由于HPDB的翻译不妥带来的不便。
蛋白质数据库(HPDB)对每个蛋白质分子结构说明部分做了中文翻译(最新加入数据库的分子除外),内容包括分子结构定性描述、样品的来源、表达载体、宿主、化学分析方法、分子结构组成成分等。这些信息并同蛋白质分子结构数据存储于数据库,因此HPDB支持中文查询。
蛋白质数据库(HPDB)虽然翻译了“分子结构说明”部分,但为了保证数据的可靠性和准确性,HPDB对一级结构序列及大分子结构坐标数据等未做任何改动,数据库保持RCSB PDB核实后的原始实验数据文件,并保持PDB文件格式和蛋白质分子编号。
I. 分子生物信息数据库的介绍
分子生物信息数据库种类繁多。归纳起来,大体可以分为4个大类,即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构序列数据库、生物大分子(主要是蛋白质)三维空间结构数据库、以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库。
J. 世界上的三大文献检索数据库是哪几个
世界上的三大文献检索数据库是SCI(科学引文索引 )、EI(工程索引 )、ISTP(科技会议录索引 ) 。
1、SCI即《科学引文索引》(Science Citation Index),是由美国科学信息研究所(Institute for Scientific Information 简称ISI)创建的,收录文献的作者、题目、源期刊、摘要、关键词,不仅可以从文献引证的角度评估文章的学术价值,还可以迅速方便地组建研究课题的参考文献网络。
SCI创刊于1961年。经过40年的发展完善,已从开始时单一的印刷型发展成为功能强大的电子化、集成化、网络化的大型多学科、综合性检索系统。--
2、EI是美国《工程索引》(The Engineering Index)的简称。EI创刊于1884年,由美国工程情报公司(Engineering Information Co.)出版发行。
EI是工程技术领域内的一部综合性检索工具,报道内容包括:电类、自动控制类、动力、机械、仪表、材料科学、农业、生物工程、数理、医学、化工、食品、计算机、能源、地质、环境等学科。
3、ISTP是Index to Scientific & Technical Proceedings的缩写,是美国科学情报研究所的网络数据库Web of Science Proceedings中两个数据库(ISTP和ISSHP)之一。
专门收录世界各种重要的自然科学及技术方面的会议,包括一般性会议、座谈会、研究会、讨论会、发表会等的会议文献,涉及学科基本与SCI相同。
重视程度:
在国际科学界,如何正确评价基础科学研究成果已引起越来越广泛的关注。而被SCI、SSCI收录的科技论文的多寡则被看作衡量一个国家的基础科学研究水平、科技实力和科技论文水平高低的重要评价指标。
在ISTP、 EI、 SCI这三大检索系统中,SCI最能反映基础学科研究水平和论文质量,该检索系统收录的科技期刊比较全面,可以说它是集中各个学科高质优秀论文的精粹,该检索系统历来成为世界科技界密切注视的中心和焦点。
以上内容参考:网络——三大检索