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生物有哪些序列

发布时间:2022-10-30 15:01:28

‘壹’ 真核生物的DNA序列可分为几种类型

DNA序列
部分DNA序列DNA序列或基因序列使用一串字母表示的真实的或者假设的携带基因信息的DNA分子的一级结构。
可能的字母只有A, C, G和T,分别代表组成DNA的四种核苷酸-腺嘌呤, 胞嘧啶, 鸟嘌呤, 胸腺嘧啶。典型的他们无间隔的排列在一起,例如序列AAAGTCTGAC。任意长度大于4的一串核苷酸被称作一个序列。 关于它的生物功能,则依赖于上下文的序列,一个序列可能被正读,反读;包含编码 或者无编码。DNA序列也可能包含"junk DNA".

‘贰’ 真核生物DNA的碱基序列在组成上有哪些特

真核生物的DNA序列表现为碱基ACGT的序列
原核生物的DNA序列表现为碱基ACGU的序列
真核生物DNA只存在少量的稀有碱基
原核生物的DNA中,稀有碱基种类和数量相对校多
真核生物DNA仅有少量的重复序列和基因
原核生物的染色体分子量较小,基因组含有大量单一重复序列和基因
真核生物基因组存在大量的非编码序列.包括内含子和外显子、.基因家族和假基因、重复DNA序列.真核生物的基因组的重复顺序不但大量,而且存在复杂谱系.
原核生物不存在大量非编码区
真核生物的大部分DNA序列集中在染色体上.除了核染色体以外,还存在细胞器DNA,如线粒体和叶绿体的DNA,为双链环状,可自主复制.有的真核细胞中也存在质粒,如酵母和植物.
原核生物的细胞中除了主染色体以外,还含有各种质粒和转座因子.质粒常为双链环状DNA,可独立复制,有的既可以游离于细胞质中,也可以整合到染色体上.转座因子一般都是整合在基因组中.

‘叁’ 真核生物结构基因包含哪些序列

包括编码区和非编码区,编码区又分为内含子和外显子。在一个基因中,非编码序列包括非编码区和内含子部分。

‘肆’ 高中生物短序列是什么

基因组中由寡核苷酸串联,重复排列的DNA序列,构成数量可变的串联重复序列,其中,微卫星DNA又称为短串联重复片列,是一种可遗传的不稳定的且具有高度多态性的短核苷酸重复序列,具有种类多,分布广,高度多态性等特点,这种多态性标志已广泛用于遗传病及亲子鉴定等.
短序列比对中,一般常用的算法主要有三个:
(1) 空位种子片段索引法,如MAQ、ELAND等,首先将读段切分,并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引,再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位,通过轮换种子考虑允许出现错配(mismatch)的各种可能的位置组合;
(2) Burrows Wheeler转换法,如Bowtie、BWA、SOAP2等,通过B-W转换将基因组序列按一定规则压缩并建立索引,再通过查找和回溯来定位读段,在查找时可通过碱基替代来实现允许的错配;
(3) Smith-Waterman动态规划算法,如BFAST,SHRiMP等,利用初始条件和迭代关系式计算两个序列的所有可能的比对分值,并将结果存放于一个矩阵中,利用动态规划的方法回溯寻找最优的比对结果。

‘伍’ 真核生物基因组中的DNA重复序列主要有哪些类型

1.高度重复序列
重复几百万次,一般是少于10个核苷酸残基组成的短片段。如异染色质上的卫星DNA。它们是不翻译的片段。
2.中度重复序列
重复次数为几十次到几千次。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角蛋白等)的基因。
3.单一序列
在整个基因组中只出现一次或少数几次的序列(也称为单拷贝序列或单拷贝基因),在小鼠中约占基因组的70%。如珠蛋白基因、卵清蛋白基因、丝心蛋白基因等。实验证明,所有真核生物染色体可能均含重复序列而原核生物一般只含单一序列。高度和中度重复序列的含量随真核生物物种的不同而变化。

‘陆’ 基因有哪些存在形式,真核生物DNA序列有哪些种类

DNA序列
部分DNA序列DNA序列或基因序列使用一串字母表示的真实的或者假设的携带基因信息的DNA分子的一级结构.
可能的字母只有A, C, G和T,分别代表组成DNA的四种核苷酸-腺嘌呤, 胞嘧啶, 鸟嘌呤, 胸腺嘧啶.典型的他们无间隔的排列在一起,例如序列AAAGTCTGAC.

‘柒’ 原核生物启动子的保护共有序列是什么

动子都存在保守的共同序列,包括RNA聚合酶识别位点和结合位点。
(1)、-10序列在转录起点上游大约-10处,有一个6bp的保守序列TATAAT,称Pribnow框。此段序列出现在-4到-13bp之间,每个位点的保守性在45%-100%。
频度:T89A89T50A65A65T100
据预测,Pribnow框中,一开始的TA和第6位最保守的T在结合RNA聚合酶时起十分重要的作用。
目前认为,Pribnow框决定转录方向。酶在此部位与DNA结合形成稳定的复合物,Pribnow框中DNA序列在转录方向上解开,形成开放型起始结构,它是RNA聚合酶牢固的结合位点,是启动子的关键部位。
RNA聚合酶的结合,诱导富含AT的Pribnow框的双链解开,然后进一步扩大成17个核苷酸长度的泡状物,在泡状物中RNA聚合酶从模板链开始转录RNA产物。
(2)、-35序列
只含-10序列的DNA不能转录,在-10序列上游还有一个保守序列,其中心约在-35位置,称为-35序列,此序列为RNA酶的识别区域。
各碱基出现频率如下:T85T83G81A61C69A52,其中TTG十分保守。
-35序列的功能:它是原核RNA聚合酶全酶依靠σ因子的初始识别位点。因此,-35序列对RNA聚合酶全酶有很高的亲和性。-35序列的核苷酸结构,在很大程度上决定了启动子的强度,RNA聚合酶易识别强的启动子。
-35序列提供RNA聚合酶识别信号,
-10序列有助于DNA局部双链解开,启动子结构的不对称性决定了转录的方向。

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