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生物学中gbm是什么意思

发布时间:2022-10-31 12:49:47

㈠ GBM & GBDT详解

在理解GBDT之前,我们需要知道什么是GBM,GBM的全称是Gradient Boosting Machines,它是1999年被Jerome Friedman在他的论文中提出来的,从名字中我们可以知道这个算法的关键词:G(Gradient)、B(Boosting)。

为了理解GBM,首先我们需要知道什么是B(Boosting):
Boosting是集成方法中的一种, 集成方法的主要思想是利用一定的手段学习出多个基学习器,而且这多个基学习器要求是弱学习器,然后将多个基学习器进行组合。boosting方法通过分步迭代(stage-wise)的方式来构建模型,每一步迭代构建的弱学习器都是为了弥补已有模型的不足。

G(Gradient)是指用来最小化损失函数的方法,传统的Boosting模型,如Adaboost,最小化损失函数的方式是,每次迭代后,通过更新样本权重分布(分对的样本权重变小,分错的样本权重变大),让后一个基学习器更加关注分错的样本,这样一轮轮的迭代下去,从而达到使损失函数最小化的目标。Adaboost的损失函数是指数损失函数,所以比较好用数学推导的方式去计算每一次迭代时让损失函数达到最小值的最优解,但是其它的损失函数可能不那么容易优化,为了找到一种通用的最优化损失函数的方法,Gradient Boosting被提出来了,Gradient Boosting是指每一步迭代,都是用损失函数的负梯度来拟合弱学习器,以达到使损失函数最小化的目的,GBM 在损失函数的选择上有更大的灵活性。这和梯度下降法的思想是一样的,通过找到使损失函数下降最快的方向,一步一步逼近最小值点,大家可以参考我的另外一篇文章:‘梯度下降和牛顿法’。

我们用 来表示我们的总模型,其中第m步后的模型,可以用上一轮迭代之后的模型 加上本轮学习的基学习器 然后再乘以一个 表示, 和梯度下降中的步长意义是一样的,表示这一步应该走多远:

让我们来看看GBM的训练步骤(以下图片来自维基网络)

GBM中最常用的基学习器是CART回归树,该类GBM算法也叫GBDT。

为什么要选择决策树做基学习器呢,因为决策树有很多优点:

因为基学习器是决策树,所有GBDT在GBM算法的基础上做了一点修改,以更好的发挥决策树的优点。
因为是树模型,所以 可以用 表示,其中 是第m个基决策树的叶子节点数, 是每个叶子节点的值,那么原先的 就可以写成

把 放到求和里面去,就变成了

我们来看看GBDT的训练步骤:

大家可能会有一个疑问,按照上面的步骤,好像(2.1)和(2.2)没什么作用,其实(2.1)和(2.2)是用来确定树结构的,训练后树的每个叶子节点的值通过(2.3)的方式确定,有几个叶子节点,就有几个 值,这样每一步迭代就有多个参数可以调节来进一步改善拟合的质量,使损失函数最小化。

不管是分类问题,还是回归问题,GBDT使用的决策树都是CART回归树,为什么回归树可以解决分类问题呢,因为GBDT基学习器拟合的是负梯度值,负梯度是一个实数,所以基学习器解决的其实是一个回归问题。

回归问题最常见的损失函数有误差平方和、绝对误差等损失函数。

如果损失函数是误差平方和:
此时我们把它叫做 LS_TreeBoost ,具体实现如下:

如果损失函数是绝对误差:
此时我们把它叫做 LAD_TreeBoost ,具体实现如下:

分类问题最常见的损失函数有对数损失函数和指数损失函数。

如果损失函数为对数损失:
其中,
此时我们把它叫做 _TreeBoost ,具体实现如下:

最后应用的时候,还需要通过sigmoid函数,将输出结果转换成概率p,转换公式如下:



上式是作者论文中关于 _TreeBoost 的算法流程图,在2.1中,其实我们无法一眼看出这个负梯度值究竟是什么。
现在我们将 改为 ,损失函数为 ,其中
算法流程如下:

现在我们以分类问题,损失函数为对数损失函数,来推导初始化值、负梯度、叶子节点的值的由来。

已知:

损失函数为 ,其中

1、负梯度值推导

将 值带入 中,得




对上式求导,并取负,则得到我们的负梯度值:

2、初始化值推导
我们知道,初始化值的目标是:
对损失函数求导,并令导数=0,则可求出最优的

导数的运算法则有:
由上可知,每个样本的导数(梯度)为:
加总所有样本的导数,得到总体样本的导数为:
令导数=0,得
又因为对所有的样本,初始化的 都是一样的,所有上式可以写成
从而可得到:

3、叶子节点值
我们知道,每个叶子节点对应的最优的

上式没有闭式解,我们用近似值去替代它,这里用到二阶泰勒展开式去近似:

由于 已知,上面的一阶导、二阶导和 是一个常数
其中:

上式其实就是一个一元二次方程 ,我们知道,一元二次方程取极值的地方就是 ;
当 >0时, 为最小值, 当 <0时, 为最大值;
上式 是一个大于0的值,所以当 时取到最小值
带入上式得:
最终:

在实际应用中,为了防止GBDT过拟合,我们一般有如下处理操作:

4和5都是对每颗树的复杂度进行处理,其他任何控制决策树生长的方法都可以使用。

㈡ 机械组织细胞的特点

机械组织对植物起主要支持作用的组织。 特点:它有很厚的细胞壁,因此具有很强的抗压抗张力,抗曲绕能力,使植物能挺立空间
植物细胞的分化过程中,形成了各类组织,它们组成了植物的营养器官和生殖器官。这些具有相同生理机能和形态结构的细胞群——组织,根据它们功能和结构的不同,分为分生组织、基本组织、保护组织、输导组织、机械组织和分泌组织。后5种组织都是在器官形成时由分生组织衍生的细胞发展而成的,有人把它们总称为成熟组织。

厚角组织的细胞壁加厚只出现在角隅,而且厚角组织是有生命的组织,含有的细胞是活细胞,而大部分机械组织都是由死亡的角质加厚的细胞组成的厚壁组织.
机械组织(mechanical tissue),是对植物起主要支撑和保护作用的组织。它有很强的抗压、抗张和抗曲挠的能力,植物能有一定的硬度,枝干能挺立,树叶能平展,能经受狂风暴雨及其他外力的侵袭,都与这种组织的存在有关。根据细胞结构的不同,机械组织可分为厚角组织(collenchyma)和厚壁组织(sclerenchyma)二类。

机械组织的共同特点是其细胞壁局部或全部加厚。

中文名称
机械组织
外文名称
echanical tissue
主要分类
厚角组织和厚壁组织两类
应用学科
植物学-植物解剖学
作用
主要支撑和保护作用
银杏学科网植物细胞结缔组织光合作用反应式元尊小说360网络细胞分化口腔上皮细胞万古神帝360网络植物的组织
基本信息
机械组织存在于尚在生长的各种器官周围,和很少或完全没有次生生长的草本植物的成熟器官中。厚角组织均由活细胞组成,厚角组织细胞壁的可塑性比韧皮部纤维还大,并具有相当大的张应力,如芹菜叶柄中厚角组织束的强度比同一叶柄中的维管束大。(见彩图) 机械组织厚角组织细胞最明显的特征是细胞壁具有不均匀的增厚,而且这种增厚是初生壁性质的。壁的增厚通常在几个细胞邻接处的角隔上特别明显,故称厚角组织。

但也有些植物的厚角组织是细胞的弦向壁特别厚。厚角细胞壁的化学成分,除纤维素外,还含有大量的果胶和半纤维素,不含木质。由于果胶有强烈的亲水性,因此,壁中含有大量的水分,在光学显微镜下,增厚的壁显出特殊的珠光,很容易与其他组织相区别。

但当制成永久切片时,材料一经脱水,增厚的壁会变薄,同时珠光也会消失。厚角组织与薄壁组织具有许多相似性,除细胞壁的初生性质外,厚角组织也是生活细胞,也经常发育出叶绿体,细胞亦具有分裂的潜能,在许多植物中,它们能参与木栓形成层的形成。因此,也有人将它归类于特殊的薄壁组织。

细胞特征:细胞多角形,具有不均匀增厚的初生壁,细胞壁一般在相邻细胞的角隅处加厚,增厚物质是纤维素和果胶,而不是木质素,是含有原生质体的生活细胞,具有一定的分裂潜能,常含叶绿体。厚角组织多柔韧,有一定的可塑性和延伸性,可以支持器官直立,也适应于器官的迅速生长。可分为三类:真厚角组织:加厚部分在角隅处;板状厚角组织:切向壁加厚;腔隙厚角组织:对着细胞间隙的胞壁部分加厚。

组织作用:厚角组织主要是正在生长的茎和叶的支持组织,一方面由于厚角细胞为长柱形,相互重叠排列,初生壁虽然比较软,但许多细胞壁的增厚部分集中在一起形成柱状或板状,因而使它有较强的机械强度;另一方面厚角组织分化较早,但壁的初生性质使它能随着周围细胞的延伸而扩展。因此,它既有支持作用,又不妨碍幼嫩器官的生长。大部分植物的茎和叶柄在继续发育时,在较深入的部位又发育出厚壁组织,这时,厚角组织的支持作用便成为次要的了。在许多草质茎和叶中,如不产生很多厚壁组织时,厚角组织就能继续成为主要的支持组织。

厚壁组织
厚壁组织与厚角组织不同,细胞具有均匀增厚的次生壁,并且常常木质化。细胞成熟时,原生质体通常死亡分解,成为只留有细胞壁的死细胞。

根据细胞的形态,厚壁组织可分为石细胞(sclereid或 stone cell)和纤维(fiber)二类。

㈢ 医学上kfca是什么意思

【以下是常用医学名称英文缩写简介,但是我始终没有找到您说的“KFCA” 这个名称,很抱歉!】

ABI:踝-指数

ACEI:血管紧张素转换酶抑制剂

ACS:急性冠脉综合征

ACTH:促肾上腺皮质激素

ADA:美国糖尿病协会

AHA:美国心脏学会

AKI:急性肾损伤

ALD:美国酒精性肝病

ARB:血管紧张素

AN:镇痛剂肾病

ASH:美国高血压协会

ATN:急性肾小管坏死

BB:β-受体阻滞剂

BHS:英国高血压学会

CA,CCB:钙拮抗剂

CAD:冠状动脉硬化性心脏病

CAPD:连续非卧床腹膜透析
CDS:中华医学会糖尿病学分会

CHD:冠心病

CHF:充血性心力衰竭

CIN:慢性间质性肾炎

CKD:慢性肾脏病

CRP:C-反应蛋白
CRS: 心肾综合征
Ⅰ型CRS:急性心肾综合征

Ⅱ型CRS:慢性心肾综合征

Ⅲ型CRS:急性肾心综合征

Ⅳ型CRS:慢性肾心综合征

Ⅴ型CRS:继发性心肾综合征

CVD:心血管疾病

CVVH:持续性静脉静脉血液滤过

CTX:环磷酰胺

DKD(新名称),DN(旧名称):糖尿病肾病

DPI:每日蛋白质摄入(饮食蛋白摄入)

DM:糖尿病

DNA:染色体

DSA:数字减影血管造影
DSP:舒张压

ECG:心电图

EPO:促红细胞生成素

ESH:欧洲高血压学会

ESC:欧洲心脏学会

ESRD:终末期肾病

FSGS:局灶节段性肾小球硬化

GBM:肾小球毛细血管滤过屏障

GC:糖皮质激素

GFR:肾小球滤过率

CRRT:连续性肾脏替代治疗

HBV-GN:乙型肝炎病毒相关性肾炎

HD:血液透析

HPA轴:下丘脑-垂体-肾上腺皮质轴

HR:危害/险比

HRS:肝肾综合征

IDF:国际糖尿病联盟

IDDM:胰岛素依赖性糖尿病(1型糖尿病)

IFG:空腹血糖受损

IHD:间断血液透析

IRRT:间歇性肾脏替代治疗

IMN:特发性膜性肾病

ISH:单纯收缩期高血压

JNC:美国高血压预防、监测、评估和治疗委员会

LN: 狼疮性肾炎

LPD:低蛋白饮食

LVH:左心室肥厚

MAU:微量白蛋白尿

MCD:微小病变肾病

MI:非致死性心肌梗死

MetS:代谢症候群

MHD:维持性血液透析

MRA:核磁共振血管成像
MPGN:膜增生性肾小球肾炎
MS:代谢综合征
MsPGN:系膜增生性肾小球肾炎
MN:膜性肾病

NICE/BHS:英国国家健康和临床优化研究所(NICE)和英国高血压学会(BHS)

NIDDM:非胰岛素依赖性糖尿病(2型糖尿病)

NKF:美国肾脏基金会

NS:肾病综合征

NSAIDs:非甾体类镇痛剂

OD:亚临床器官损害

PAD:周围血管疾病

PCI:冠状动脉介入治疗
PCR:蛋白分解率
PD:腹膜透析

PPG:餐后血糖

PTH:甲状旁腺素
PVD:周围血管病变
RAS:血管紧张素系统
SBP:收缩压
SLE:系统性红斑狼疮
TGF-β:转化生长因子-β
VLPD:极低蛋白饮食
WHO:世界卫生组织

㈣ 国家标准职业分类与代码

本表所列职业名称和分类均严格按照1999年我国政府正式颁布的《中华人民共和国职业分类大典》,每个职业均按照大类(如2-01科学研究人员)到中类(如2-01-15生物科学研究人员),再是细类(即职业,如2-01-15-00 生物科学研究人员)的顺序排列,各类职业分类代码后的括号中的标志(如GBM 1-1/1-2)指国家技术监督局公布的国标码。每个职业对应了一个或若干个工种(按照1993年原劳动部和行业部委联合颁布的《工人技术等级标准》所列工种和代码),此处未列。

第二大类、专业技术人员

2-01(GBM 1-1/1-2)科学研究人员 2-01-15(GBM 1-26)生物科学研究人员

2-01-15-00 生物科学研究人员

2-01(GBM 1-1/1-2)科学研究人员 2-01-16(GBM 1-27)农业科学研究人员

2-01-16-00 农业科学研究人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员2-02-21(GBM 1-53)建筑工程技术人员

2-02-21-04 风景园林工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-01 林业生态环境工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-02 森林培育工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-03 园林绿化工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-04 野生动物保护与繁殖利用工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-05 自然保护区工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-06 森林保护工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-07 木、竹材加工工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-08 森林采伐和运输工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-09 经济林和林特产品加工工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-10 森林资源管理与监测工程技术人员

2-02(GBM 1-3/1-4/1-5/1-6)工程技术人员 2-02-23(GBM1-55)林业工程技术人员

2-02-23-99 其他林业工程技术人员

2-10(GBM 2-5)文学艺术工作人员 2-10-07(GBM 2-57)工艺美术专业人员

2-10-07-04装潢美术设计人员

2-10(GBM 2-5)文学艺术工作人员 2-10-07(GBM 2-57)工艺美术专业人员

2-10-07-06室内装饰设计人员

㈤ 足细胞的生物性状

足细胞呈星型多突状,胞体较大,由胞体伸出许多突起,又称足突(FP),呈指状交叉覆盖于GBM外表面,并通过黏附分子和蛋白多糖分子与GBM相连。扫描电镜观察,可见胞体伸出几个大的初级足突,进而分出许多指状的次级突起。相邻两个足细胞之间的次级突起相互交错穿插,形成栅栏状,紧贴于毛细血管基膜外面。两相邻的足细胞之间的裂隙称为裂孔,直径约为25nm(也有的书刊标注为40nm),其表面覆盖着一层拉链状的结构-裂孔膜,厚度约为4-6nm,是血浆蛋白滤液的最后屏障,也是液体进出足细胞的地方。裂孔表面有硫酸蛋白多糖等组成阴离子外衣,是肾小球电荷屏障的重要组分之一。足突通过肌动蛋白、肌球蛋白等结构蛋白组成的动态的舒张系统调调解着GBM的肌原张力,从而使足细胞连同肾小球内皮细胞和其基膜一起共抵抗毛
细血管内的静水压,维持着毛细血管襻的结构稳定。并且足突也可以通过其收缩与扩张改变裂孔的大小和滤过膜的面积,即而改变超滤稀疏,调节肾小球的过滤功能。
足细胞在正常情况下可以分泌GBM的主要组成成分IV型胶原和纤维连接蛋白(FN),在促肾纤维化引资等刺激下还能分泌具有降解GBM作用的基质金属蛋白酶(MMPs)和组织蛋白酶,从而在GBM的代谢平衡中发挥重要作用。

㈥ gbm医学意思

两个意思

一是:多形性胶质母细胞瘤

二是:基底膜

㈦ 什么是细胞瘤

骨巨细胞瘤常称良性骨巨细胞瘤或破骨细胞瘤。它是比较多见的原发骨组织肿瘤之一。其主要组织成分为类似破骨细胞的巨细胞和比较瘦小的梭形或圆形的基质细胞。近十数年来对它的认识更深入了一步。它是一种局部破坏性较大、生长活跃的肿瘤,经过搔刮治疗以后,有相当数量的病例可能复发,甚而恶变,并发生远处转移。部分病例因局部感染、外伤或经久不治而发生恶变,另有一小部分病例,其组织形态一开始就有趋向恶性的征象,或基本上是一种含有多量巨细胞的恶性巨细胞瘤。因此,把它们一律称为良性骨巨细胞瘤不符实际,而且给大以不应有的假安全感。

㈧ 胶质母细胞瘤

胶质母细胞瘤是星形细胞肿瘤中恶性程度最高的胶质瘤,不具有传染性。最近有研究发现它可能和一种病毒,可能SV40或者巨细胞病毒有关。胶质母细胞瘤似乎与游离辐射也有轻微关系。所以不必慌张。 建议你还是为即将到来的放化疗做准备比较好,手术很伤身,放化疗更伤身。所以应该采取一些辅助放化疗的方式,比如配合中药之类的。

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