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生物信息学需要哪些证件

发布时间:2022-12-31 00:30:49

生物信息学专业需要学习哪些东西

目前的生物信息学我认为有两个大的方向,一个是与实验紧密结合的生物信息学,依靠实验数据出成果,第二个是与数学紧密结合的生物信息学,依靠算法和编程出成果。

我是第一种,以微生物为主,所以我只能就我自己来看。读到现在我觉得,对我用处最大的几门是生物化学、分子生物学、细胞生物学、微生物学以及专讲生物信息学的一些专业书籍。

本科期间除了打好语言基础(的确很重要,否则将来走起来很困难,这里边的语言包括英语以及一门编程语言,任意的都可以,主要是建立编程思想)之外,最好对本领域的前沿研究成果有一定的了解,甚至可以形成一些小的文章练练手。

算法那一方向我不太懂,也不敢乱说,希望以上的能帮到你。

② 生物信息分析师什么时候有资格证可以考

关于生物信息分析师的资格证书,目前国家还没有出台相关的资格证书考核的政策,2018年以前通过华大基因有一个挂在全国高新技术认证类的(生物信息分析员)可以考,不过近两年国家对各行各业的培训证书进行了整顿,这个华大基因的认证也被取消了。同时也有其他很多资格证书被取消的。说明国家在职业资格证书上面的管理已经更上一层楼了。
那么问题来了,这个岗位真的没有一个东西可以证明自己的能力吗?也是有的。所谓有市场,国家还是比较鼓励培训机构代为考核一些专业性比较强的技能。比如国家建的这个中国国家培训网,里面就有很多这种专业技能培训的项目,颁发的是《专业技能培训证书》当然,包括生物信息分析师,据相关ICP查询等,这个确实是国家单位,所以这个证书和很多培训单位印刷的结业类证书还是比较靠谱一点的。当然了,如果你本专业是生物信息学或者生物信息工程之类的,或许很多用人单位并不看重这个证书,但如果你不是,又想做相关工作,考个证书也是可以的。
现在各种培训琳琅满目,不过在网上都是可以查证的

③ 生物医学工程有什么证书可以考吗

生物工程可以考的证书有:药师证、执业医师证、医药销售师证、营养师证、注册会计证、一级建造工程师证、二级建造工程师证、注册化工工程师证、注册环评工程师证、注册安全工程师证、注册物流师证等。生物工程可以考的证书种类繁多,自己要根据自身情况选择适合自己的证书。

④ 生物化学与分子生物学研究生可以考什么证

生物化学与分子生物学研究生可以考什么证
生物化学与分子生物学专业 可以考没专业要求的证书。比如:英语等级证书,计算机等级证书。
生物化学与分子生物学专业主要是从微观即分子的角度来研究生物现象,涉及物理、化学、数学、生物学等多学科的交叉。生物化学与分子生物学渗透于生物学的其他专业之中,属于基础性研究专业。
生物化学与分子生物学专业是在多年开展生物化学、生物信息学、基因工程、发酵工程和分子生物学等课程教学,以及生化药物、基因工程药物、免疫学、植物与微生物相互作用、转基因抗逆植物等相关科研工作的基础上,以研究明确生物体的生物化学代谢过程为基础、利用分子生物学手段揭示其代谢变化的机理为生长点,重点开展资源生物活性物质例如药物、酶类、抗生素类、毒素类等的分离提纯、富集、结构鉴定、改造或创造,探讨免疫处理无脊椎动物和重要农作物激发并增强其潜在抗病、抗环境污染、抗旱等能力的的方法和分子机制,预测和证实一些特殊大分子物质的结构与功能,明确动物尤其是昆虫系统进化过程中的分子机理等,为大力推进相关学科的快速发展,尤其是为医药、食品、农业及资源物质的保存、开发与利用提供坚实的理论依据及技术基础。

⑤ 生物信息学入门需要具备什么能力

1.编程

Linux:会用Editor(e.g. VIM) 和 Shell Script (e.g. bash);推荐《鸟哥的Linux私房菜-基础学习篇》

Python/Perl:《Python编程入门(第3版)》,Perl推荐小骆驼

R/MATLAB:《R语言实战(R in action)》

如果做数据库或者server,推荐再学PHP,MySQL,JavaScript

2.课程

Bioinformatics: 生物信息导论和方法(北大高歌老师的课程,讲解逻辑清晰,由浅入深),MOOC。

因为生信有好多分支,如对基因组、蛋白质组学数据分析并给出生物学解释;在研究算法方面,如利用机器学习的各种原理来解决生物学问题(对基因序列原件的注释,如对TSS,splicing sites,promoters,enhancers,positioned nucleosomes等功能区域的注释;通过对RNA-seq,microarray,ChIP-seq等数据的分析,区分不同的疾病类型或疾病的分子标志物(biomarkers);对基因功能的注释,如Gene Ontology term;以及基因间互作调控网络的分析);比如运用统计学知识改进已有的生信软件的算法,等等。可以根据将来要做什么继续补充知识,比如看一下斯坦福大学的Andrew Ng在coursera的机器课程呀 ,看一下统计学原理呀之类的。

3.文献和实战练习

如果是做基因组学的生信公司

3.1 RNA数据分析流程

RNA-seq:可以重复一下文章中的分析Differential gene and transcript expression analysis of RNA-seq experiments with TopHat and Cufflinks当然入门之后可以更多了解相关软件啦,比如STAR,feature counts, Gfold, EdgeR, DESeq2,
DESeq等。

找lncRNA:Recurrently deregulated lncRNAs in hepatocellular carcinoma. 这篇文章中有如何找新lncRNA的流程,可以根据文章提供的方法重复一下。

3.2 DNA数据分析流程

GATK那一套流程检测

同时variant与疾病、eQTL等关联分析的话,可以了解一下STATA

3.3
结合机器学习和基因组学的话,可以看一下以下文献:

DeepVariant:由谷歌Deep mind公司研发,利用卷积神经网络(convolutional neural network, CNN)检测基因组上单碱基突变(SNP)和小的插入缺失(Indel),比现有的GATK软件有更高的精确度。

DeepWAS:根据功能单元选择出一组SNP的集合,与现有的基因组关联分析(GWAS)检测基因组上一个SNP与疾病的关系相比,DeepWAS能够更综合地分析致病基因突变,在寻找调控区域的基因突变也更为直接。
DeepSEA:预测人类基因组非编码区有功能的变异。

DeepBind:预测DNA,RNA结合蛋白的序列特征,并能识别有害的基因突变。

DeepCpG:在表观遗传学层面上,应用深度神经网络算法,研发了通过单细胞测序的DNA序列和不完整的甲基化修饰数据的,用来预测细胞细胞层面是否会发生甲基化,其效果优于现有软件。

⑥ 有关生物信息学

最近好像蛮多人问生物信息学方面的问题啊,考研的热门专业。
要从事生物信息学,分子生物学和遗传学的理论知识要比较扎实,这门课对专业英语的要求也很高。计算机方面倒是还好,初步的话要学会几个软件,像DNAman,这个软件我用过,还挺方便的,也可以制图。还要掌握NCBI(www.NCBI.com)这个数据库的使用,因为这网站里有所有物种的序列参照,基本上学生物信息学是离不开这个网站的。

⑦ 生物信息分析师都需要具备哪些技能

1. 计算生物学、统计学、机器学习、生物信息学等相关专业
2. 国内毕业者需硕士学位或以上 (或国内本科及两年以上相关工作经验) / 海归人员需国外的本科学位或以上
3. 熟悉Linux/Unix操作系统,有HPC环境背景优先考虑
4. 熟悉生信流程创建
5. 精通PerI、R (如会Matlab、Python、C/C++中两种以上编程语言可加分)
6. 具备较强的中英文文献查询与阅读能力,并做英文书面报告
7. 精通单细胞、高通量测序数据的分析全流程者优先考虑

⑧ 生物信息学专业需要学习哪些东西

生物信息学专业主要的课程有:
主干课程:生物学、数学、计算机科学。
课程设置:
普通生物学、生物化学、分子生物学、遗传学、生物信息学、计算生物学、基因组学、生物芯片原理与技术、蛋白质组学、模式识别与预测、数据库系统原理、Linux基础及应用、生物软件及数据库、Perl编程基础等。

⑨ 如何自学生物信息学

一、计算机基础,需要看三本书,一步步的学会学通,不需要刻意去找哪个书,一般linux是鸟哥私房菜,perl是小骆驼咯,R是R in action,但是看一本书只能入门,真正想成为菜鸟,必须每个要看五本书以上!我云盘里面有这基本上的高清打印版,大家可以去淘宝打印一下才几十块钱还包邮,对书比较讲究的也可以买正版,也不过是一百多块钱而已!

二、生信基础知识,测序方面,在网络文库找十几篇一代二代三代测序仪资料仔细研读,然后去优酷下载各大主流测序仪的动画讲解,再看看陈巍学基因的讲解;数据库先看看三大主流数据库——NCBI,ENSEMBL,UCSC,还有一些也可以了解一些(uniprot,IMGT,KEGG,OMIN,TIGR,GO)同样也是网络文库自己搜索资料,但是这次需要自己去官网一个个页面点击看,一个个翻译成中文理解吃透;数据格式讲起了就多了,这个主要是在项目流程中慢慢学,或者你有机会去上课,不然你看来也是立马忘记的,主要有sam,vcf,fasta,fastq,bed,gtf,gff,genbank,ensembl,psl等。

三、生信研究领域,各个领域主要是软件繁多,合起来常用的估计有上百个软件了,一般只有从业五六年以上的人才有可能把它们全部用过一遍,而且这也完全需要项目来训练,而不能仅仅是看看软件手册,但是研究领域最重要的是背后的原理,需要看各大牛的综述。

a) 生信基础软件(blast++套件,fastqc,flash,blast,solexaQA,NGS-QC-toolkit,SRA-toolkit,fastx-toolkit)。

b) snp-calling相关软件(bwa,bowtie,samtools,GATK,VarScan.jar,annovar)。

c) 基因组相关软件(velvet,SOAPdenovo2,repeatmasker,repeatscount,piler,orthMCL,inparanoid,clustw,muscle,MAFFT,quickparanoid,blast2go,RAxML,phyML)。

d) 转录组相关软件(trinity,tophat,cufflinks,RseQC,RNAseq,GOseq,MISO,RSEM,khmer,screed,trimmomatic,transDecoder,vast-tools,picard-tools,htseq,cuffdiff,edgeR,DEseq,funnet,davidgo,wego,kobas,KEGG,Amigo,go)。

四、生信应用领域,讲这一块其实已经脱离了生信菜鸟的解释范围了,主要是想说社会上为什么需要搞生信的人才,全是因为在肿瘤筛查,产前诊断,流行病学,个性化医疗等领域有所应用,可以造福人类!这方面政策不确定,产业不定型,所以也这绝对是蓝海,但是也绝对不会有现成的资料直接培训人才,我们必须关注各种微信公众号,逛各种测序,医学相关论坛,紧跟业界精英的脚本,同时追着大牛的文献阅读,如此这般才能保住菜鸟的身份!

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