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有哪些查询生物信息的网站

发布时间:2023-02-02 00:50:46

⑴ 谁能提供一下生物文献方面的网站 谢啦!!!

免费的有很多,比如生物谷,生物探索、大分子生物医药网等等,文献资料都比较多的

⑵ 国内有哪些好的生物资讯网站

中国科学院微生物研究所
中国科学院水生生物研究所
中国科学院生物物理研究所
中国科学院遗传与发育生物研究所
中国科学院成都生物研究所
中国科学院南京地质古生物研究所
中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所
中国农业科学院生物技术研究所
中国科学院西北高原生物研究所
中国科学院病原生物研究所
中国科学院青岛生物能源与过程研究所
中国医学科学院生物医学工程研究所
上海生物制品研究所
长春生物制品研究所
武汉生物制品研究所
北京生物制品研究所
兰州生物制品研究所
成都生物制品研究所
广东省微生物研究所
山东省科学院生物研究所
陕西省微生物研究所
安徽省生物研究所
云南省微生物研究所
湖南省生物研究所
江苏省生物研究所
福建省生物研究所
吉林省生物研究所
河北省生物研究所
河南省生物研究所
山西省生物研究所
贵州省生物研究所
辽宁省生物研究所
甘肃省生物研究所
海南省生物研究所
浙江省生物研究所
福州大学生物工程研究所
北京大学系统生物医学研究所
西安交通大学生物工程医学研究所
南京大学生物物理研究所

⑶ 学习生物信息学有哪些比较好的网站或论坛

首先,生物信息学这个概念太大了,没有详细的方向。
1.如你想走序列分析可以参考NCBI,RDP,这两个网站是做生物分子研究最常用的,下面这个里面的推荐网站可以看看,建议不要都去研究(如果你精力有限的话,学好NCBI这个是基础),http://blog.renren.com/share/221052439/453520050和http://www.cnblogs.com/emanlee/archive/2011/08/07/2130360.html。
2.论坛的话:生物秀,小木虫,生物信息学天空,丁香园等等

建议根据自己的需要或者研究方向,专门去攻破一项,比如核苷酸,比如蛋白质等等。要想全部学习构建完整系统的生物信息学框架,我个人觉得相对比较难。以上仅供参考,自己斟酌。加油。

⑷ 请问有哪些关于生物方面较好的网站,有专家的联系方式那是最好的了

http://www.bioon.com/生物谷www.ebiotrade.com生物通www.bioguider.com生物导航网www.bio-equip.com中国生物器材网www.bio-soft.net生物软件网www.biosino.org中国生物信息www.shengwu.com.cn中国生物教学网cmbi.bjmu.e.cn中国医学生物信息网www.biotech.org.cn中国生物技术信息网www.ibioo.com绿谷生物网

⑸ 国际上三个大的生物信息中心有哪些

一 美国国家生物技术信息中心NCBI(National Center for
Biotechnology Information)
NCBI是一个极具人性化的网站,网站的主页清晰的阐明了NCBI所做的工作及相关领域最新的热点内容,新闻等。为了方便使用者更加熟练使用网站资源,NCBI在主页清晰的标注了站点导航,非常便于初学者熟悉和掌握NCBI的站内资源。
另外,NCBI将其网站资源列于主页左侧,其中包括:SITE MAP, About NCBI, GenBank, Literature
databases, Molecular databases, Genomic biology, Tools, Research at
NCBI, Software engineering, Ecation, FTP site, Contact
information等等。
二EBI(European
Bioinformatics Institute)欧洲生物信息研究所The European
Bioinformatics Institute(EBI)是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一,位置座落于英国The Wellcome Trust
Genome Campus。EBI的任务就是确保分子生物与基因体的研究信息可以公开并且免费提供给科学社群,以促进科学进步。
EBI所提供的服务包括建立/维护数据库、提供分子生物相关信息服务、执行分子生物与计算分子生物研究;所服务的对象与研究人员扩及各产业,包括分子生物、基因体、医学与农业学术研究、农业、生物技术、化学与制药工业。
三DDBJ(DNAData Bank of
Japan)日本核酸数据库
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)
设立在日本国家遗传研究所(NIG),于1986年开始DNA数据库的构建工作。从一开始,DDBJ就作为国际性DNA数据库之一,发挥着重要的作用。它
首先反映的是日本国内数据库的资源,并与NCBI,EBI进行频繁的国际性合作。DNA序列中蕴含了大量的数据资源,比起其它生物学数据,它在阐述进化方面的作用更为直接。因此,探求DNA数据库,不仅是在生命科学方面的研究,更是为人类的发展谋福利。
DDBJ是日本唯一的DNA数据库,它从研究者那里收集DNA 序列并且给数据提交者一个国际公认的编码。DDBJ
主要从日本研究者那里收集数据,当然,它也接受外国研究者的数据并给以编码。

⑹ 国外与生物信息学相关的网站有哪些

国外与生物信息学相关的网站有哪些
生物信息学高度依赖于网络。实际上,你需要的几乎所有资源,都可以从网上下到。你需要关注你研究领域所需要的那些,而不是全部的资源。

我原来常用的:

NCBI:持有INSDC的节点。网站上有核酸、蛋白、基因名、基因组名等等的搜索工具,以及BLAST序列比对搜索工具,PUBMED文献数据库,Taxonomy数据,COG蛋白家族库等等。FTP可以下到它全部的数据库,BLAST的单机程序,以及各种工具程序。

EBI:和NCBI类似,欧洲搞的对等物。感觉EBI网站比NCBI要清楚简洁。另外EBI网站整合了更多的工具,比如多序列比对。

Uniprot:全蛋白库。NCBI和EBI的蛋白库来源于此。目前包括两部分:SwissProt是人工校对过的,TrEMBL是自动校对的。

Pfam:蛋白家族库。可以使用配套的HMMER进行搜索。比BLAST能找到更远缘的东西,而且找到的东西是结构域。
Rfam:RNA的,类似Pfam。

RDP:16S rRNA库。除了序列,它还有一个基于K-mer naive Bayesian model的rdp classifier,可以对输入序列进行物种分类,效率和准确性较直接使用BLAST更高。
GreenGenes:也是16S库,不过它只收集比较全的序列。它提供了一个16S的标准化比对,并基于这个东西搞了个物种分类工具。

EMBOSS:一个工具包,提供了几百个进行序列操作的工具。

BioPerl、BioPython:Perl和Python的生物学模块。
R:类似matlab的语言,有一大堆的生物学包。

SOAP:华大基因搞的高通量测序工具包,有de-novo拼接的,有mapping的,还有一些后续分析的。
bowtie:一个用于序列mapping的软件。
samtools:用于操纵、分析高通量序列mapping的结果。功能非常灵活,但有点复杂。
fastx toolkit:用来操纵高通量测序序列的工具包。

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