㈠ 基因测序将如何发展
基因组测序 这块未来应该会以第三代测序等长读长测序方法垄断。长读长可以大大降低基因组拼接的难度。无论是微生物组,还是复杂基因组(多倍体、多重复区),三代已优势尽显。表观遗传测序 这块得细分,DNA甲基化,三代方法可以直接测得修饰碱基,因此有优势。转录因子大部分为窄峰,二代比较适合。而RNA Poly II以及组蛋白修饰,大多为宽峰,三代应该没问题。小RNA测序,二代绝对优势项目。长读长没有任何用。靶向外显子组测序,三代优势项目。不但可以直接读取全长,也可以分析大规模的结构变异与重排。转录组测序ISO-seq 以三代测序为代表的长读长测序方法。该测序的目的是弄清整个转录组的序列、外显子构成在基因组上的位置、可变剪切模式等。但由于三代测序本身建库和测序的特点,导致它无法定量(不同的SMRT Cell,不同长度reads之间难以normalization)。RNA-seq 以二代测序为代表的短读长测序方法,由于可以做RNA定量,将仍占有一席之地。但由于RNA-seq原先相对于芯片平台的优势(新序列发现、可变剪切)被ISO-seq取代,将面临相关芯片产品的竞争。以上应该是科研视角。具体商业应用上,我个人比较倾向于定制芯片或者PCR Array等产品,优点是比较容易把平台做到封闭、稳定。再补充点其他的,因为老有人把测序成本降低幅度、测序速度来提摩尔定律。摩尔定律持续了半个世纪,许多外行觉得可能在测序上也会重演这一幕。我的观点是:摩尔定律形成原因是当时半导体物理理论的积淀远超当时的工业水平。
㈡ 表观组与转录组联合分析简介
表观遗传(Epigenetics)是指在核酸(DNA)序列不发生改变的情况下,基因的表达、调控和性状发生可遗传的改变(根本原因是表观遗传修饰的不同),即在未改变基因型的前提下改变表型。利用表观遗传学可用于研究某一组织生理病理变化。结合单细胞测序技术,可用于研究肿瘤疾病的发病机制、早期诊断、晚期控制等。
表观组学测序(Epigenomics Sequencing)是以高通量测序平台为基础,研究基因表达及调控的可遗传变化的技术。根据研究内容可将表观组学分为两类:DNA/RNA的化学修饰和DNA/RNA与蛋白质相互作用。常用的表观遗传学测序方法包括BS-seq和ChIP-seq。
代表文献:
参考链接:
表观组学 - 甲基化分析 - 知乎 (hu.com)
表观组学测序 BS-seq_ChIP-seq 测序原理/流程_南京铭研生物 (merrybio.com.cn)
㈢ 广州表观生物科技会泄密吗
广州表观生物科技会泄密吗,广州表观生物科技一般不会泄密,都有做很好的放泄密措施,但是凡事有另一种可能性。