㈠ ssp intein是什么
ssp ： 生物学 亚种 ；intein：指蛋白质的内含子。同mRNA一样，一些前体蛋白质具有内含子(intein)序列，位于多肽序列的中间，经加工切除后，两端的蛋白质外显子 (extein)连接为成熟蛋白质分子，典型的intein在N-末端通常有150个氨基酸序列在C-末端有约50个氨基酸序列。
㈡ SSP菌肥有什么特点吗
1、我知道的最大的特点就是它经过发酵后的菌群数可以达到10的11次方,这个是比较强悍的.毕竟菌肥看的就是菌群数.
2、降低成本,SSP微生物菌肥其特有的微生物原理能很简单的改良土壤,被改良过的土壤2-3年内,几乎不需要施用化肥就能让作物高产,最保守估计能增产40%.
3、用SSP制备有机肥的同时,其特有的除臭菌和强大的分解转化能力,解决了猪粪、牛粪等环境污染问题.
㈢ 微生物（Microbe）名称---A
Abiotrophia defectiva 缺陷乏养菌
Acetobacter aceti醋酸杆菌
Acetobacter pasteurianus巴氏醋杆菌
Acetobacter pasteurianus ssp pasteurianus 巴氏醋杆菌巴氏亚种
Acholeplasma laidlawii 莱氏无胆甾原体
Achromobacter denitrificans反硝化无色杆菌
Achromobacter insolitus insolitus无色杆菌属
Achromobacter piechaudii皮氏无色杆菌
Achromobacter ruhlandii ruhlandii 无色杆菌属
Achromobacter sp 无色杆菌属某些种
Achromobacter spanius spanius无色杆菌属
Achromobacter xylosoxidans木糖氧化无色杆菌
Achromobacter xylosoxidans ssp xylosoxidans木糖氧化无色杆菌木糖氧化亚种
Acidaminococcus fermentans 发酵氨基酸球菌
Acidaminococcus intestini 氨基酸球菌属
Acidiphilium acidophilum acidophilum 嗜酸菌属
Acidovorax avenae ssp avenae 燕麦噬酸菌燕麦亚种
Acidovorax avenae ssp citrulli燕麦噬酸菌西瓜亚种
Acidovorax defluvii DSM defluvii 嗜酸菌属
Acidovorax delafieldii 德氏噬酸菌
Acidovorax facilis敏捷食酸菌
Acidovorax konjaci konjaci 嗜酸菌属
Acidovorax temperans 中等食酸菌
Acinetobacter baumannii鲍氏不动杆菌
Acinetobacter baylyi baylyi不动杆菌属
Acinetobacter bouvetii bouvetii不动杆菌属
Acinetobacter calcoaceticus 醋酸钙不动杆菌
Acinetobacter gerneri gerneri不动杆菌属
Acinetobacter guillouiae guillouiae 不动杆菌属
Acinetobacter haemolyticus 溶血不动杆菌
Acinetobacter johnsonii 约氏不动杆菌
Acinetobacter junii 琼氏不动杆菌
Acinetobacter lwoffii 鲁氏不动杆菌
Acinetobacter nosocomialis医院不动杆菌
Acinetobacter parvus parvus不动杆菌属
Acinetobacter pittii皮特不动杆菌
Acinetobacter pittii Serovar pittii Serovar不动杆菌属
Acinetobacter radioresistens 抗辐射不动杆菌
Acinetobacter schindleri schindleri 不动杆菌属
Acinetobacter sp 不动杆菌某些种
Acinetobacter tandoii tandoii不动杆菌属
Acinetobacter tjernbergiae tjernbergiae不动杆菌属
Acinetobacter towneri towneri 不动杆菌属
Acinetobacter ursingii乌尔辛不动杆菌
Actinobacillus delphinicola delphinicola不动杆菌属
Actinobacillus equuli ssp equuli equuli ssp equuli不动杆菌属
Actinobacillus lignieresii lignieresii不动杆菌属
Actinobacillus pleuropneumoniae胸膜肺炎放线杆菌
Actinobacillus rossii罗斯放线杆菌
Actinobacillus suis 猪放线杆菌
Actinobacillus ureae尿放线杆菌
Actinobaculum schaalii schaalii 放线菌属
Actinobaculum suis suis放线菌属
Actinobaculum urinale urinale放线菌属
Actinocorallia libanotica libanotica放线菌属
Actinomyces bovis牛型放线菌
Actinomyces bowdenii bowdenii放线菌属
Actinomyces canis canis放线菌属
Actinomyces cardiffensis cardiffensis放线菌属
Actinomyces catuli catuli放线菌属
Actinomyces coleocanis coleocanis放线菌属
Actinomyces dentalis dentalis放线菌属
Actinomyces denticolens齿垢放线菌
Actinomyces europaeus欧洲放线菌
Actinomyces funkei funkei放线菌属
Actinomyces gerencseriae戈氏放线菌
Actinomyces graevenitzii graevenitzii 放线菌属
Actinomyces hordeovulneris hordeovulneris 放线菌属
Actinomyces hyovaginalis hyovaginalis 放线菌属
Actinomyces israelii 衣氏放线菌
Actinomyces marimammalium marimammalium 放线菌属
Actinomyces meyeri 迈尔放线菌
Actinomyces naeslundii 内氏放线菌
Actinomyces nasicola 纽氏放线菌
Actinomyces neuii诺伊放线菌
Actinomyces neuii ssp anitratus诺伊放线菌无硝亚种
Actinomyces neuii ssp neuii诺伊放线菌诺伊亚种
Actinomyces odontolyticus 龋齿放线菌
Actinomyces oris口腔放线菌
Actinomyces radicidentis口腔放线菌
Actinomyces radingae 瑞丁放线菌
Actinomyces ruminicola ruminicola 放线菌属
Actinomyces sp放线菌属某些种
Actinomyces suimastitidis suimastitidis放线菌属
Actinomyces turicensis 苏黎世放线菌
Actinomyces urogenitalis urogenitalis 放线菌属
Actinomyces vaccimaxillae vaccimaxillae 放线菌属
Actinomyces viscosus 粘放线菌
Adlercreutzia equolifaciens Adlercreutzia
equolifaciens Aerococcus christensenii气球菌属
Aerococcus sanguinicola 气球菌属
Aerococcus urinae脲气球菌
Aerococcus urinaehominis 气球菌属
Aerococcus viridans绿色气球菌
Aeromicrobium flavum flavum气微菌属
Aeromonas bestiarum bestiarum 气单胞菌属
Aeromonas caviae豚鼠气单胞菌
Aeromonas encheleia encheleia气单胞菌属
Aeromonas enteropelogenes enteropelogenes气单胞菌属
Aeromonas eucrenophila肠棕气单胞菌
Aeromonas hydrophila嗜水气单胞菌
Aeromonas hydrophila ssp anaerogenes 嗜水气单胞菌
Aeromonas hydrophila ssp hydrophila嗜水气单胞菌嗜水气亚种
Aeromonas hydrophila ssp ranae 嗜水气单胞菌
Aeromonas ichthiosmia嗜水气单胞菌
Aeromonas jandaei简氏气单胞菌
Aeromonas media 中间气单胞菌
Aeromonas molluscorum molluscorum气单胞菌属
Aeromonas popoffii popoffii气单胞菌属
Aeromonas punctata ssp caviae punctata ssp caviae气单胞菌属
Aeromonas salmonicida ssp masoucida 杀鲑气单胞菌杀日本鲑亚种
Aeromonas salmonicida ssp pectinolytica pectinolytica 杀鲑气单胞菌属
Aeromonas salmonicida ssp salmonicida 杀鲑气单胞菌杀鲑亚种
Aeromonas schubertii 舒氏气单胞菌
Aeromonas simiae simiae 气单胞菌属
Aeromonas sobria 温和气单胞菌
Aeromonas sp 气单胞菌属某些种
Aeromonas veronii维罗纳气单胞菌
Afipia broomeae布氏阿菲波菌
Afipia felis猫阿菲波菌
Afipia massiliensis 阿菲彼亚杆菌属
Aggregatibacter actinomycetemcomitans 伴放线凝聚杆菌
Aggregatibacter segnis惰性凝聚杆菌
Agrococcus jenensis jenensis壤霉菌属
Agromyces bracchium bracchium壤霉菌属
Agromyces cerinus ssp cerinus蜡黄色壤霉菌蜜黄色亚种
Agromyces cerinus ssp nitratus 蜡黄色壤霉菌解亚硝盐亚种
Agromyces fucosus 岩藻糖壤霉菌
Agromyces hippuratus 马尿酸壤霉菌属
Agromyces humatus humatus壤霉菌属
Agromyces italicus italicus壤霉菌属
Agromyces lapidis lapidis壤霉菌属
Agromyces mediolanus mediolanus壤霉菌属
Agromyces neolithicus neolithicus壤霉菌属
Agromyces rhizospherae rhizospherae 壤霉菌属
Agromyces salentinus salentinus壤霉菌属
Agromyces subbeticus subbeticus 壤霉菌属
Alcaligenes faecalis 粪产碱杆菌
Alcaligenes faecalis ssp faecalis 粪产碱杆菌粪亚种
Alcaligenes faecalis ssp parafaecalis parafaecalis粪产碱杆菌属
Alcaligenes faecalis ssp phenolicus phenolicus粪产碱杆菌属
Alcaligenes sp 产碱杆菌某些种
Alicyclobacillus acidocaldarius ssp acidocaldar酸热脂环酸芽孢杆菌酸热亚种
Alicyclobacillus acidocaldarius ssp rittmannii 酸热脂环酸芽孢杆菌
rittmannii亚种
Alicyclobacillus acidoterrestris 酸土脂环酸芽孢杆菌
Alicyclobacillus cycloheptanicus 环庚基脂环酸杆菌
Aliivibrio fischeri 别弧菌属
Alishewanella fetalis别许旺氏菌属
Alistipes finegoldii finegoldii另枝菌属
Alistipes onderdonkii onderdonkii另枝菌属
Alistipes shahii shahii另枝菌属
Alkalibacillus haloalkaliphilus haloalkaliphilus碱杆菌属
Alloiococcus otitis 耳炎差异球菌
Alloscardovia omnicolens omnicolens另类斯卡多维亚氏菌属
Alternaria alternata alternata交链孢霉
Amycolatopsis alba 白拟无枝酸菌
Amycolatopsis azurea 天蓝色拟无枝酸菌
Amycolatopsis balhimycina balhimycina拟无枝酸菌
Amycolatopsis coloradensis 科罗拉多拟无枝酸菌
Amycolatopsis fastidiosa 苛求拟无枝酸菌
Amycolatopsis japonica japonica拟无枝酸菌属
Amycolatopsis kentuckyensis kentuckyensis 拟无枝酸菌属
Amycolatopsis keratiniphila ssp
keratiniphila keratiniphila ssp keratiniphila拟无枝酸菌属
Amycolatopsislexingtonensis lexingtonensis拟无枝酸菌属
Amycolatopsis lurida lurida拟无枝酸菌属
Amycolatopsis mediterranei 地中海拟无枝酸菌
Amycolatopsis minnesotensis minnesotensis拟无枝酸菌属
Amycolatopsis pretoriensis pretoriensis 拟无枝酸菌属
Amycolatopsis sulphurea sulphurea 拟无枝酸菌属
Amycolatopsis tolypomycina 带颗粒拟无枝酸菌
Anaerococcus hydrogenalis hydrogenalis
Anaerococcus lactolyticus解乳厌氧球菌
Anaerococcus murdochii murdochii 厌氧球菌属
Anaerococcus octavius octavius厌氧球菌属
Anaerococcus prevotii prevotii厌氧球菌属
Anaerococcus sp 厌氧球菌属某些种
Anaerococcus tetradius四联消化厌氧球菌
Anaerococcus vaginalis vaginalis厌氧球菌属
Anaerotruncus colihominis colihominis 厌氧球菌属
Aneurinibacillus aneurinilyticus 解硫胺素解硫胺素芽孢杆菌
Aneurinibacillus migulanus migulanus芽孢杆菌属
Aquincola tertiaricarbonis tertiaricarbonis水居菌属
Arcanobacterium haemolyticum 溶血隐秘杆菌
Arcanobacterium hippocoleae hippocoleae隐秘杆菌属
Arcanobacterium phocae phocae隐秘杆菌属
Arcanobacterium pluranimalium pluranimalium隐秘杆菌属
Arcobacter butzleri 布氏弓形菌
Arcobacter cibarius cibarius 弓形菌
Arcobacter cryaerophilus 嗜冷气弓形菌
Arcobacter halophilus halophilus弓形菌
Arcobacter nitrofigilis 硝化弓形菌
Arcobacter skirrowii斯氏弓形菌
Aromatoleum alkani Aromatoleum alkani
Aromatoleum tolulyticus Aromatoleum tolulyticus
Aromatoleum aromaticum Aromatoleum aromaticum
Aromatoleum bremensis Aromatoleum bremensis
Aromatoleum buckelii Aromatoleum buckelii
Aromatoleum diolicum Aromatoleum diolicum
Aromatoleum evansii Aromatoleum evansii
Aromatoleum pretroleum Aromatoleum pretroleum
Aromatoleum terpenicum Aromatoleum terpenicum
Aromatoleum tolulyticus Aromatoleum tolulyticus
Aromatoleum toluolicum Aromatoleum toluolicum
Aromatoleum toluvorans Aromatoleumtoluvorans
Arsenophonus nasoniae飞虫杀雄菌
Arthroascus schoenii schoenii节囊酵母属
Arthrobacter ardleyensis ardleyensis节杆菌属
Arthrobacter arilaitensis arilaitensis 节杆菌属
Arthrobacter aurescens金黄节杆菌
Arthrobacter bergerei bergerei节杆菌属
Arthrobacter castelli castelli 节杆菌属
Arthrobacter chlorophenolicus
chlorophenolicus节杆菌属
Arthrobacter citreus 柠檬节杆菌
Arthrobacter creatinolyticus
creatinolyticus 节杆菌属
Arthrobacter crystallopoietes CIP 102717成晶节杆菌
Arthrobacter cumminsii 卡明斯节杆菌
Arthrobacter flavus flavus节杆菌
Arthrobacter gandavensis gandavensis节杆菌
Arthrobacter globiformis球形节杆菌
Arthrobacter histidinolovorans 噬组氨醇节杆菌
Arthrobacter ilicis 冬青节杆菌
Arthrobacter kerguelensis kerguelensis节杆菌
Arthrobacter koreensis 韩国节杆菌
Arthrobacter luteolus luteolus节杆菌
Arthrobacter monumenti monumenti节杆菌
Arthrobacter mysorens 迈索尔节杆菌
Arthrobacter nasiphocae nasiphocae节杆菌
Arthrobacter nicotianae烟草节杆菌
Arthrobacter nicotinovorans噬尼古丁节杆菌
Arthrobacter nitroguajacolicus
nitroguajacolicus节杆菌
Arthrobacter oxydans 氧化节杆菌
Arthrobacter parietis parietis节杆菌
Arthrobacter pigmenti pigmenti节杆菌
Arthrobacter polychromogenes 多色节杆菌
Arthrobacter protophormiae 原玻璃蝇短杆菌
Arthrobacter psychrolactophilus
psychrolactophilus节杆菌
Arthrobacter psychrophenolicus
psychrophenolicus节杆菌
Arthrobacter pyridinolis吡啶酚节杆菌
Arthrobacter ramosus 分枝节杆菌
Arthrobacter roseus玫瑰色节杆菌
Arthrobacter russicus russicus节杆菌
Arthrobacter scleromae硬节节杆菌
Arthrobacter sp 节杆菌属
Arthrobacter stackebrandtii stackebrandtii节杆菌
Arthrobacter sulfonivorans sulfonivorans节杆菌
Arthrobacter sulfureus 硫磺节杆菌
Arthrobacter tecti tecti节杆菌
Arthrobacter tumbae tumbae节杆菌
Arthrobacter uratoxydans 尿酸氧化节杆菌
Arthrobacter woluwensis woluwensis节杆菌
Arthroderma benhamiae 皮肤癣霉菌
Arthrographis_kalrae[ana] (Eremomyces_lang
kalrae爪甲白癣菌Aspergillus brasiliensis巴西曲霉
Aspergillus flavus 黄曲霉
Aspergillus fumigatus烟曲霉
Aspergillus niger 黑曲霉
Aspergillus terreus土曲霉
Aspergillus versicolor 杂色曲霉
Aspergillus_thermomutatus thermomutatus曲霉
Atopobium minutum小阿托波氏菌
Atopobium parvulum极小阿托波氏菌
Atopobium rimae 裂阿托波氏菌
Atopobium sp阿托波氏菌属
Atopobium vaginae vaginae阿托波氏菌
Aureimonas altamirensis Aureimonasaltamirensis
Aureobasidium pullulans 出芽短梗霉菌
Austwickia chelonae chelonae放线菌
Avibacterium avium avium杆菌
Avibacterium endocarditidis 禽心内膜炎杆菌
Avibacterium gallinarum副鸡禽杆菌
Avibacterium volantium volantium杆菌
Azoarcus communis 普通固氮弧菌
Azoarcus indigens需求固氮弧菌
Azoarcus sp 固氮弧菌属
Azohydromonas lata 阿特拉津降解菌
（出处:http://www.doczj.com/doc/3f93df64c77da26924c5b035.html）
㈣ 微生物可以分成哪“三行八大类”啊详细点！谢谢啊!
微生物的分类,鉴定及命名
1,生物界的分类
地球上的物种估计大约有150万,其中微生物超过10万种,而且其数目还在不断增加.
在生物进化历史过程中演化形成生物种类和种群的多样性.
生物分类就是通过研究生物的系统发育及其进化历史,揭示各类生物的多样性及其系统关系,编制分类系统,还原生物的自然历史位置.
高等动植分类
化石资料,形态学,比较胚胎学
较正确反映其系统发育
微生物分类的难题:
绝大部分微生物个体小,形态简单,易受环境影响而变异,缺少有性繁殖,缺乏化石资料.
生物分类的二种基本原则:
a)根据表型(phenetic)特征的相似程度分群归类,这种
表型分类重在应用,不涉及生物进化或不以反映生
物亲缘关系为目标;
b)按照生物系统发育相关性水平来分群归类,其目标
是探寻各种生物之间的进化关系,建立反映生物系
统发育的分类系统.
★从两界系统经历过三界系统,四界系统,五界系统甚至六界系统,最后又有了三原界(或三总界)系统.
★传统的,为多数学者所接受的是1969年魏塔克(R.H.Whittaker)在《Science》上提出的五界学说,它以纵向显示从原核生物到真核单细胞生物再到真核多细胞生物的三大进化过程.
生物的界级分类学说
利用16SrRNA建立分子进化树的美国科学家
Carl Woese
三域学说的建立
(1)古细菌原界(Archaebacteria) ,包括产甲烷细菌,极端嗜盐菌和嗜热嗜酸菌;
(2)真细菌原界(Eubacteria) ,包括蓝细菌和各种除古细菌以外的其它原核生物;
(3)真核生物原界(Eucaryotes),包括原生生物,真菌,动物和植物.
2,微生物分类学
经典分类学:按微生物表型分类
微生物系统学:按亲缘关系和进化规律分类
发展
表型特征:形态学,生理生化学,生态学等,推断微生物的系统发育.
表型特征结合分子水平上比较微生物的基因型特征(如16S rRNA)探讨微生物进化,系统发育和分类鉴定.
★微生物分类学的三个任务:分类,鉴定及命名
☆分类是根据微生物的相似性和亲缘关系,将微生物归入不同的分类类群.
☆鉴定是确定一个新的分离物属于已经确认的分类单元的过程.
☆命名是根据国际命名法规给微生物分类单元以科学的名称.
以啤酒酵母为例,它在分类学上的地位是:
界(Kindom):真菌界
门(Phyllum):真菌门
纲(Class):子囊菌纲
目(Order):内孢霉目
科(Family):内孢霉科
属(Genus):酵母属
种(Species):啤酒酵母
3,微生物的分类单位
界,门,纲,目,科,属,种
种是最基本的分类单位
每一分类单位之后可有亚门,亚纲,亚目,亚科...
种(species):是一个基本分类单位;是一大群表型特征高度相似,亲缘关系极其接近,与同属内其他种有明显差别的菌株的总称.
菌株(strain): 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一切后代(起源于共同祖先并保持祖先特性的一组纯种后代菌群).因此,一种微生物的不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株.菌株强调的是遗传型纯的谱系.
例如:大肠埃希氏杆菌的两个菌株:
Escherichia coli B 和Escherichia coli K12
★菌株的表示法:
★种是分类学上的基本单位,菌株是实际上应用的基本单位,因为同一菌种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上会有很大的不同和差别!
亚种(subspecies)或变种(variety):
为种内的再分类.
当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传形状,而又不足以区分成新种时,可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元——亚种.
变种是亚种的同义词,因"变种"一词易引起词义上的混淆,从1976年后,不在使用变种一词.通常把实验室中所获得的变异型菌株,称之为亚种.
如:E.coli k12(野生型)是不需要特殊aa的,而实验室变异后,可从k12获得某aa的缺陷型,此即称为E.coli k12的亚种.
型(form):
常指亚种以下的细分.当同种或同亚种内不同菌株之间的性状差异不足以分为新的亚种时,可以细分为不同的型.
例如:按抗原特征的差异分为不同的血清型;
学名—是微生物的科学名称,它是按照有关微生物分类国际委员会拟定的法则命名的.学名由拉丁词,或拉丁化的外来词组成.学名的命名有双名法和三名法两种.
①双名法:
学名=属名+种名+(首次定名人)+现定名人+定名年份
属名:拉丁文的名词或用作名词的形容词,单数,首字母大写,表示微生物的主要特征,由微生物构造,形状或由科学家命名.
种名:拉丁文形容词,字首小写,为微生物次要特征,
如微生物色素,形状,来源或科学家姓名等.
4,微生物的命名
必要,用斜体表示
可省略,用正体字
微生物的名字有俗名和学名两种.如: 红色面包霉———粗糙脉孢霉
绿脓杆菌———铜绿假单胞菌
例:大肠埃希氏杆菌
Escherichia coli (Migula)Castellani et Chalmers 1919
金黄色葡萄球菌
Staphylococcus aureus Rosenbach 1884
◆当泛指某一属微生物,而不特指该属中某一种(或未定种名)时,可在属名后加sp.或ssp.(分别代表species 缩写的单数和复数形式)
例如:Saccharomyces sp.
表示酵母菌属中的一个种.
◆菌株名称——在种名后面自行加上数字,地名或符号等,如: Bacillus subtilis AS1.389 AS=Academia Sinica
Bacillus subtilis BF7658 BF=北纺
Clostridium acetobutylicum ATCC824 丙酮丁醇梭菌
ATCC=American Type Culture Collection美国模式菌种保藏中心
◆当文章中前面已出现过某学名时,后面的可将其属名缩写成1~3个字母.
如:Escherichia coli 可缩写成 E.coli
Staphylococcus aureus可缩写成 S. aureus
②三名法:用于对亚种的命名,这时在属和种名后加写一个subsp.,然后再附上亚种名称(斜排体). 如:
Bacillus thuringiensis subsp. galleria
苏云金芽孢杆菌腊螟亚种
形态结构,生理生化,少量的化石资料,行为习性,等等
表型特征:
5, 进化指征的选择:
b)形态特征在不同类群中进化速度差异很大,仅根据形态推断进化关系往往不准确;
缺点:
a)由于微生物可利用的形态特征少,很难把所有生物放在同一水平上进行比较;
蛋白质,RNA和DNA序列进化变化的显着特点是进化速率相对恒定,也就是说,分子序列进化的改变量(氨基酸或核苷酸替换数或替换百分率)与分子进化的时间成正比.
生物大分子作为进化标尺依据
a)在两群生物中,如果同一种分子的序列差异很大时,
------------进化距离远,进化过程中很早就分支了.
b)如果两群生物同一来源的大分子的序列基本相同,
------------处在同一进化水平上.
大量的资料表明:功能重要的大分子,或者大分子中功能重要
的区域,比功能不重要的分子或分子区域进化变化速度低.
RNA作为进化的指征
16S rRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的"分子尺":
1)rRNA具有重要且恒定的生理功能;
2)在16SrRNA分子中,既含有高度保守的序列区域,又有中度保守和高度变化的序列区域,因而它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究;
3)16SrRNA分子量大小适中,便于序列分析;
4)rRNA在细胞中含量大(约占细胞中RNA的90%),也易于提取;
5)16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中(真核生物中其同
源分子是18SrRNA).因此它可以作为测量各类生物进化的工具.
Eubacteria
(真细菌界)
Archaebacteria
(古细菌界)
Eukarya
(真核生物界)
Carl Woese利用16SrRNA建立分子进化树
微生物
(病毒)
古生菌(Archaea)
细菌(Bacteria)
真菌(酵母,霉菌,蕈菌等),
单细胞藻类,原生动物等
非细胞型
细胞型
原核微生物
真核微生物(Eukarya)
古生菌在进化谱系上与真细菌及真核生物相互并列,且与后者关系
更近,而其细胞构造却与真细菌较为接近,同属于原核生物.
6,微生物分类鉴定的特征和技术
形态学特征,
生理学特征,
生态学特征
6.1 生物分类的传统指标:
☆形态学特征
培养特征,
运动性,
特殊的细胞结构,
细胞形态及其染色特性,
等等
微生物分类和鉴定的重要依据之一:
a)易于观察和比较,尤其是真核微生物和具有特殊
形态结构的细菌;
b)许多形态学特征依赖于多基因的表达,具有相对
的稳定性;
☆生理生化特征�
与微生物的酶和调节蛋白质的本质和活性直接相关;
代谢产物等
营养类型;
与氧的关系;
对温度的适应性;
对pH的适应性;
对渗透压的适应性;
酶及蛋白质都是基因产物;
对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较;
测定生理生化特征比直接分析基因组要容易得多;
常借助特异性的血清学反应来确定未知菌种,亚种或菌株.
★生态特性
包括在自然界的分布情况,与其他生物有否寄生或共生关系, 宿主种类及与宿主关系, 有性生殖情况, 生活史等.
★血清学反应
6.2 核酸的碱基组成和分子杂交
特点:
与形态及生理生化特性的比较不同,对DNA的碱基
组成的比较和进行核酸分子杂交是直接比较不同微
生物之间基因组的差异,因此结果更加可信.
(1) DNA的碱基组成(G+Cmol%)
DNA碱基因组成是各种生物一个稳定的特征,即使个别基因突变,碱基组成也不会发生明显变化.
分类学上,用G+C占全部碱基的克分子百分数(G+Cmol%)来表示各类生物的DNA碱基因组成特征.
◆每个生物种都有特定的GC%范围,因此后者可以作为分类鉴定的指标.细菌的GC%范围为25--75%,变化范围最大,因此更适合于细菌的分类鉴定.
◆GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌作出鉴定,并可检验表型特征分类的合理性,从分子水平上判断物种的亲缘关系.
使用原则:
G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定
每一种生物都有一定的碱基组成,亲缘关系近的生物,
它们应该具有相似的G+C含量,若不同生物之间G+C含
量差别大表明它们关系远.
但具有相似G+C含量的生物并不一定表明它们之间具有近的亲缘关系.
同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4～5%以下;同属不同种的差别应低于10～15%;G+C含量已经作为建立新的微生物分类单元的一项基本特征,它对于种,属甚至科的分类鉴定有重要意义.
若二个在形态及生理生化特性方面及其相似的菌株,如果其G+C含量的差别大于5%,则肯定不是同一个种,大于15%则肯定不是同一个属.
在疑难菌株鉴定,新种命名,建立一个新的分类单位时,G+C含量是一项重要的,必不可少的鉴定指标.
其分类学意义主要是作为建立新分类单元的一项基本特征和把那些G+C含量差别大的种类排除出某一分类单元.
G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定
(2) 核酸的分子杂交
不同生物DNA碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲缘关系的远近,碱基排列顺序差异越小,它们之间的亲缘关系就越近,反之亦然.
核酸分子杂交(hybridization)间接比较不同微生物DNA碱基排列顺序的相似性
a)DNA-DNA杂交;
(亲缘关系相对近的微生物之间的亲缘关系比较)
b)DNA-rRNA杂交;
(亲缘关系相对远的微生物之间的亲缘关系比较)
c)核酸探针;
(利用特异性的探针,用于细菌等的快速鉴定)
(3) 16SrRNA或18SrRNA的核酸序列分析
16SrRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的"分子尺":
16SrRNA的序列高度保守,可精确指示细菌之间的亲缘关系
16SrRNA的大小为1500bp左右,所含信息能反映生物界进化关系,易操作,适用于各级分类单元
目前常用的是建立在PCR技术基础上的16SrRNA基因的直接测序法,方便快捷.
《伯杰氏鉴定细菌学手册》
(Bergey's Manual of Determinative Bacteriology)
美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937)
1957年第七版后,由于越来越广泛地吸收了国际上细菌分类学家参加编写(如1974年第八版,撰稿人多达130多位,涉及15个国家;现行版本撰稿人多达300多人,涉及近20个国家),所以它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的最新成果,因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位.
7.1 细菌分类系统
7,微生物分类系统
《伯杰氏系统细菌学手册》
(Bergey's Manual of Systematic Bacteriology)
伯杰氏手册是目前进行细菌分类,鉴定的最重要依据,其特点是描述非常详细,包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法.
(20世纪80年代末期)
7.2 真菌分类系统
真菌界分类系统很多,各国采用不同的系统,比较混乱.近年来为较多人接受的是Ainsworth的纲要.
俗名—common name简洁易懂,方便记忆,但涵义往往不够准确,还有适用范围和地区性的限制.
命名—scientific name菌种的科学名称.菌种的学名是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认,并通用的名称.
命名原则:
学名=属名+种的加词+(首次定名人)+现名定名人和鲜明定名年份
规定与常识:属名应大写首字母,单数,可以组合外而成.种的加词代表一个种的次要特征,首字小写
㈤ SSP是什么
SSP是一组超强有益菌群的名称，其最大的优点是能随时唤醒休眠态的微生物菌群，这是世界难题，国内几乎占绝大多数的菌肥产品在生产过程中成活菌群数达到10的7次方8次方，但经过商品流通环节后，到客户手里成活菌群数已只剩下10的3次方，甚至全军覆灭，造成无效或效果不明显，给菌肥的推广带来了无法解决的瓶颈，而ssp技术，经过唤醒后能达到10的12次方。该细菌不仅能给植物带来快速生长植物根系的作用，并具有提高土壤肥力，改良土壤，增强作物抗病能力，促进生长提早成熟，提高产量，改善品质等功能。更主要的是能防治非寄生性植物病原体（有害根际细菌和有害根际真菌），以及对寄生植物病原体的作用。原因是因为ssp能产生铁载体（含铁低分子络合物），能提高铁的可络性，ssp生产铁载体将铁络合起来限制了有害微生物的生长。所以能抵制根瘤病、寄生虫、土壤线虫等植物根部的病害和菌害
㈥ 谁能介绍一个“生物分类索引”给我
这个工程太庞大了
你还是看看那么一大摞中国动物志，中国植物志，藓类植物分类索引等等
可知分类学是多么庞杂
另外，你所列举的都是中文名，是不科学的
分类学上称之为俗名
真正的学名是拉丁文
也就是常说的双名法来表示
前面是属名，后面是种加词，通常还要加上命名者的姓名
如白菜：Brassica campestris L. ssp．Chinensis (L.) Makino. Var. cammunis Tsen et Lee
var表示变种
现在你知道有多复杂了吧
另外
现在分类学界对分类学的单位也有争论
三界学说
五界学说
都有道理