‘壹’ 真核生物基因启动子
启动子
启动子区域通常是指被转录的基因转录起始位点上游的序列，是特定调控元件结合的地方，能够帮助RNA转录。真核生物至少需要七个转录因子才能使RNA聚合酶II（一种真核生物特异性RNA聚合酶）与启动子结合。启动子控制RNA聚合酶与DNA的结合，RNA聚合酶将DNA转录成mRNA，并最终翻译成功能蛋白。
—addgene
“启动子”实际上是一个模糊不精确的描述。启动子区域内通常具有特定的序列，但有时也指延伸的启动子区域，可能包括基因上游较远的序列，这些序列可能有助于增强或抑制特定细胞中即将转录的特定基因。
—NHGRI
组成启动子的主要部分有三个：核心启动子，近端启动子和远端启动子。
核心启动子
核心启动子区域位于最接近起始密码子的位置，并包含RNA聚合酶结合位点，TATA框和转录起始位点（TSS）。RNA聚合酶将稳定地结合到该核心启动子区域，并启动模板链的转录。TATA盒是核心启动子区域内的DNA序列（5'-TATAAA-3'），一般转录因子蛋白和组蛋白可以结合在该区域。组蛋白是在真核细胞中发现的将DNA包装成核小体的蛋白质。组蛋白结合阻止转录的启动，而转录因子促进转录的启动。核心启动子的3'端部分（最接近基因的起始密码子）是TSS，它实际上是转录开始的地方。但是，只有真核生物和古细菌包含此TATA盒。大多数原核生物包含一个被认为功能上等效的序列，称为Pribnow盒，通常由六个核苷酸TATAAT组成。
近端启动子
在核心启动子的更上游，近端启动子包含许多主要调控元件。在TSS上游约250个碱基对处发现了近端启动子，它是一般转录因子结合的位点。
远端启动子
启动子区域的最后部分称为远端启动子，它位于近端启动子的上游。远端启动子也含有转录因子结合位点，但主要是含有调控元件。
‘贰’ 关于pribnow box和TATA box
TATA box指的是古菌和真核生物启动子区域里面的叫法，细菌中tata box的同系物被叫做pribnow box。两者功能类似但是pribnow box的序列相对较短，一般在-10 有6bp，在-35有8-12bp