⑴ 目前常用生物信息学分析方法有哪些
现在比较热门的数据库包括GEO、TCGA
GEO分析主要是芯片做差异分析,得到差异基因,差异基因可以做GO、KEGG功能富集分析
TCGA数据库是癌症分析的利器,可以做差异基因,差异miRNA,差异lncRNA,下载和整理临床数据,做生存分析,高难度的COX分析
这两个数据库可以发到不错的文章
⑵ 生物检测新方法
生物检测法包括:(1)生物毒性试验法。小鼠生物法是AOAC推广的检测麻痹性贝类毒素的标准方法,是国际上都能接受的唯一的方法。该方法在检测样本总毒性方面相当成功,但是无法准确定性样本中单个毒素。
此外,还有家蝇生物分析法、蝗虫生物分析法。上述3种生物分析技术原理相似。 (2)细胞毒性试验法。石房蛤毒素具有Na+通道阻滞剂的特性,可拮抗箭毒、藜芦碱的作用,以减少或“解救”细胞形态的改变及细胞裂解死亡,且该拮抗或“解救”作用与毒素的量呈对应关系。
根据该对应关系可以计算出毒素的含量。早期建立的方法是用显微镜计数活细胞数以检测PSP毒素的量,但试验时间长,操作繁琐,所需细胞量大。 在该原理之上发展起来一种STX的快速诊断装置MIST,已成功用于酸性粗毒中PSP总毒性的测定及STX、neoSTX、GTX和dcSTX相关毒性的测定,该装置的灵敏度高,检测迅速且无需组织培养的设备及专业知识。
(3)免疫分析技术。随着抗STX抗体的获得,免疫分析技术如血球凝聚反应、放射免疫分析(RIA)和酶联免疫分析(ELISA)等逐渐发展起来,其中直接竞争ELISA法是最常用的一种方法,检测限可达3pg/ml,间接ELISA的检测限也可达到10pg/ml。
免疫方法灵敏度高,方便迅速,但抗体的获得是其关键,各毒素的交叉反应低,不能完全体现样品的毒性来源。(4)受体分析法。即固相受体结合法(solid-phase receptor binding assay),主要是根据PSP毒素能与Na+通道蛋白质结合的特点,应用同位素标记以检测PSP类毒素的量,具有快速、可靠、准确的特点。
Llewellyn等以一种特异结合STX的类似转铁蛋白Saxiphilin代替Na+通道蛋白质,其对STX的鉴定具有专一性,从而与TTX的鉴定相区别。
⑶ 建立生物样品分析方法,对定量分析方法进行验证包括哪些内容
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生物样品定量分析方法验证指导原则
1.
范围
准确测定生物基质(如全血、血清、血浆、尿)中的药物浓度,对于药物和制剂研发非常重要。这些数据可被用于支持药品的安全性和有效性,或根据毒动学、药动学和生物等效性试验的结果做出关键性决定。因此,必须完整地验证和记录应用的生物分析方法,以获得可靠的结果。
本指导原则提供生物分析方法验证的要求,也涉及非临床或临床试验样品实际分析的基本要求,以及何时可以使用部分验证或交叉验证,来替代完整验证。
生物样品定量分析方法验证和试验样品分析应符合本指导原则的技术要求。应该在相应的生物样品分析中遵守GLP原则或GCP原则。
2.
生物分析方法验证
2.1
分析方法的完整验证
分析方法验证的主要目的是,证明特定方法对于测定在某种生物基质中分析物浓度的可靠性。此外,方法验证应采用与试验样品相同的抗凝剂。一般应对每个物种和每种基质进行完整验证。当难于获得相同的基质时,可以采用适当基质替代,但要说明理由。
一个生物分析方法的主要特征包括:选择性、定量下限、响应函数和校正范围(标准曲线性能)、准确度、精密度、基质效应、分析物在生物基质以及溶液中储存和处理全过程中的稳定性。
有时可能需要测定多个分析物。这可能涉及两种不同的药物,也可能涉及一个母体药物及其代谢物,或一个药物的对映体或异构体。在这些情况下,验证和分析的原则适用于所有涉及的分析物。
⑷ 生物样品分析方法验证应包含哪些内容,如何验证及评价
那要看是哪一类的生物样品,主要风险控制在于哪个方向。 一般要根据样品的种类,所要测定的成份,来确定使用什么药品什么测定方法。 对于植物主要是重金属和农残,铅砷铬镉铜和DDt,666等 对于动物主要是抗生素、寄生虫药等兽药残留和激素等
⑸ 简述酶法分析生物药物和基因工程药物的原理,主要有哪些方法
酶分析法在生物药物分析中的应用主要有两个方面:第一,以酶为分析对象,根据需要对生物药物生产过程中所使用的酶和生物药物样品所含的酶进行酶的含量或酶活力的测定,称为酶分析法;第二,利用酶的特点,以酶作为分析工具或分析试剂,用于测定生物药物样品中用一般化学方法难于俭测的物质,如底物、辅酶、抑制剂和激动剂(活化剂)或辅助因子含量的方法称为酶法分析。
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特定及优势
而如果有仅作用于被测物质的酶,利用酶的特异性,不需要分离就能辨别试样中的被测组分,从而对被测物质进行定性和定量分析。所以,酶法分析常用于复杂组分中结构和物理化学性质比较相近的同类物质的分离签定和分析,而且样品一般不需要进行很复杂的预处理。酶法分析具有特异性强,干扰少,操作简便,样品和试剂用量少,测定快速精确,灵敏度高等特点。通过了解酶对底物的特异性。可以预料可能发生的干扰反应并设法纠正。在以酶作分析试剂测定非酶物质时,也可用偶联反应;而且偶联反应的特异性,可以增加反应全过程的持异性。此外,由于酶反应一般在温和的条件下进行,不需使用强酸强碱,它还是一种无污染或污染很少的分析方法。很多需红使用气相色谱仪、高压液相色谱仪等贵重的大型精密分析仪器才能完成的分析检验工作,应用酶法分析方法即可简便快速地进行。酶法分析目前主要广泛应用于医药、临床、食品和生化分析检测中,如尿素、各种糖类、氨基酸类、有机酸类、维生素类、毒素等物质的定性和定量分析。