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wgs在生物是什么

发布时间:2023-03-29 10:56:29

1. 什么是WGS测序

WGS全称为whole-genome shotgun就是全基因组鸟枪法
它的作法是把基因组直接打碎成3kb(也有地方写的是2Kb……)左右的小片段,测序并拼接。并且,WGS在现在的测序项目中使用得越来越广泛。例如水稻基因的测序,就是使用的WGS策略。
网络给的是
基因测序的方法 是在获得一定的遗传及物理图谱信息的基础上,绕过bac克隆逐个排序的过程,将基因组dna分解成2kb左右的小片段进行随机测序,辅以一定数量的10kb的克隆和bac克隆的末端测序,利用超级计算机进行整合进行序列组装

2. 生物信息学计算机知识和CS专业计算机知识有多大不同

计算生物学(通常翻译为Computational Biology)和生物信息学(通常翻译为Bioinformatics)暂时还没有统一的定义。但是从对计算机,生物和医学知识的要求方面,可以简约分成两类。

第一类对计算机方面要求更高,更多专注于算法,数据结构。强调工具的效率和通用性。比方说通常提到的比对(Alignment)和组装(Assembly)问题。一个高效通用的比对算法可以用在DNA,RNA,Epi等不同方面的分析当中,比方说当前被大量使用的BWT转换(Burrows-Wheeler Transformation,生物信息常用变体包括双向BWT转换,FM-index,分区FM-index),动态规划(Dynamic Programming,生物信息里常用变体包括Banded DP, Myers' bit-vector)。为了提高效率,在硬件允许的情况下还会用到SIMD,GPU,MIC和FPGA等专用加速设备。这部分的专家还会参与到文件格式和API标准的制定,比方说BAM和VCF文件格式和GA4GH API标准的制定。对于推进工业化的进程,这方面的专家会因应需求,制作在线或者本地部署的平台以应付日益增长的对项目、数据和知识的分析、总结和共享的需求。相比较项目分析(第二类)而言,从事了这方面的研究,时间投入较大,较难出成果,更难销乱绝对生物信息分析中的多个分支有全面的了解。但是这部分专家的技能较难替代,回报也相对较大。一个优秀的工具可能被引用上百次甚至上千次。这部分专家从就业的角度并不局限于生物信息,积累下来的算法,数据结构,计算机,数据挖掘,机器学习方面的技能能平行运用到金融等其他领域,一个例子是Morgan Stanley总部去年招Engineers和Quants特别青睐生物信息方面毕业的博士。

第二类对生物和医学方面要求更高,更多专注于对研究对象和数据的理解。比方说通常人方面提到的全基因组(WGS),全外显子组(WES),癌症基因组,辅助制药,表观分析(WGBS,RRBS,Chip-SEQ,Hi-C),单细胞等,非人方面的包括育种,宏基因组,亏姿基因组组装等。不同方向之间共享一部分的基础知识,比方说质控。不同方向对知识储备和经验有不同的要求,比方说癌症基因组对医学和临床的要求较高,基因组组装对计算机方面的要求较高。一个人可以是一个方向,也可以是多个方向的专家。这些人能把多个基础工具结合在一起产生1+1>2的效果(有时候连第一类写工具的人都想不到自己的工具可以被这么使用)。这些专家的经验比较难通过项目之外的其他途径获得(不是说书本无用,但肯定不够用)。这方面的研究对出成果有更好的保证(无论大小,一个项目一个成果)。这方面的人才在这个时间点上比较容易获得海外博士以及博士后的机会。但是毕业后转换工作机会成本较大,工作的选择也较为局限。需要尽早对职业进行规划,找到机会逃出自己的舒适区,扩展知识面,或者根据自己的能力,做好进入管理岗等其他通道的准备。

随着生物信息的发展,在陪模下一个Solexa技术出来之前,市场对这两类人的要求必然更加精细化,第一类人提供更好的平台和工具,第二类人更高效和全面地发现问题和解决问题。

3. 高中生物植物激素的字母简称都是什么 生长素,赤霉素,乙烯,细胞分裂素,脱落酸

脱落酸(abscisic acid,ABA) 赤霉素(英语:Gibberellin,简称为GA)
生长素(auxin英文简称IAA) 乙烯(ethylene)
细胞分裂素 (cytokinin, CTK)

4. WGS测序的优缺点及如何在医学研究中的应用

wgs即“鸟枪法”优点是速度快,简单易行,成本较低。缺点是真核生物因含有内含子,所以 不宜使用 。

医学研究中可以用来测某一个基因的全长

5. G1 G2,S,M在生物学中分别代表什么期

G1,G2,S都属于分裂间期,M属于分裂期,G1期是合成与DNA合成有关的蛋白质,S是DNA合成,G2是合成另一些蛋白质,为M期准备。

6. 生物 大脑皮层语言区怎么记。什么S W H V区。求窍门

楼主你好,可以采用单词记忆法,w可以理解为write,s为speak,v为vision(此词为视觉的名词),h为hear。这样可以形象一点,还有,必修三这个图的出题性不是很大,楼主须记住"运动性失语症"便可。望采纳

7. 国自然标书里测序分析怎么写

标书写作技巧
一、概述
1.概述:简要描述测序分析的基本原理,以及作为生物科学研究的重要性。
2.技术:介绍常用的测序分析方法,如Sanger测序,高通量测序,质谱分析等。
3.优势:介绍测序分析技术的优势,如可提供准确、快速和可重复性的结果,可提供全面的基因组结构信息等。
4.应用:简要介绍测序分析在生物学研究中的应用,如研究基因组结构、进化关系、物种分类等。
二、正文
测序分析是指利用一定的技术方法,对样品中的DNA、RNA或蛋白质的结构进行测定,获取其序列的过程。这种技术可以为生物科学研究提供重要的信息,对于我们对生轮手物基因的进一步解析具有重要意义。
常用的测序分析方法主要有Sanger测序、高枝帆通量测序和质谱分析等。Sanger测序是一种改良的DNA测序方法,它可以获得准确、快速和可重复性的结果,是在发展测序技术的过程中的重要进步。高通量测序是一种新型的基因测序技术,它可以在短时间内对大量样品进行测序,可以提供全面的基因组结构信息,是研究生物基因组结构和进化关系的重要腊搭嫌手段。质谱分析也是一种比较常用的测序分析方法,它可以准确地测定DNA序列,并可以检测和鉴定DNA片段中的异常碱基对。
测序分析技术在生物学研究中有广泛的应用,包括研究基因组结构、进化关系、物种分类、微生物多样性、基因定位、基因表达调控等。它可以提供准确、快速和可重复性的结果,为生物学研究奠定了基础。
三、结论
综上所述,测序分析技术是一种重要的生物学研究工具,其准确、快速和可重复性的结果为生物学研究奠定了基础,可以提供全面的基因组结构信息,在生物学研究中有广泛的应用。

8. G1 G2,S,M在生物学中分别代表什么期

G1,G2,S都属于分裂间扮猛期,M属于分裂期,G1期罩缺则是合成与DNA合成有关的蛋物棚白质,S是DNA合成,G2是合成另一些蛋白质,为M期准备。

9. 高中生物植物激素的字母简称都是什么生长

1、脱落酸(abscisic acid,简称ABA):强烈地抑制生长,并使衰老的过程加速。

2、赤霉素(Gibberellin,简称GA):夏季使植物继续生长,冬季使芽进入休眠状态。

3、生长素(auxin,简称IAA):能促进细胞伸长,体积增大,使植株生长。

4、乙烯(ethylene):对细胞生长的抑制作用。

5、细胞分裂素(cytokinin,简称CTK):促进细胞分裂,使植株的细胞数目增多,从而促进植物生长。



(9)wgs在生物是什么扩展阅读

植物生长调节剂的应用

1、剩用乙烯利催熟,如凤梨的有计划上市,香蕉、柿子、番茄等上市前的催熟。

2、利用赤霉素溶液处理芦苇,增加纤维长度,如在芦苇生长期用一定浓度的赤霉素溶液处理,就可以使芦苇的纤维长度增加50%左右。

3、用赤霉素处理大麦,可使大麦种子无须发芽就可产生α一淀粉酶。

4、青鲜素可以抑制发芽,延长马铃薯、大蒜、洋葱的贮藏期。

10. 什么是WGS测序

Whole genome sequencing的缩写,全基因组测序的意思。

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