怎么使用ncbi查基因生物帮

⑴ 如何用NCBI查找某个菌属下所有菌种的某个基因

1,sp.是圆厅species的缩写,也就是物种,而spp.代表一个类群,比如一个属的一群微生物 2,首先打开NCBI网站首橘蔽隐页,然后在search一栏中选择nucleotide,在框中输入你要的并空基因序列名称,点击search就行.然后会出来很多结果,因为很多基因是同名的,或是一个基因在不同种属中不一样,寻找你要的基因序列就行了.注意的是,要确定你的基因名称是否是统一的.

⑵ 如何使用 NCBI 查找基因序列，mRNA，Promoter

1、在NCBI上查找基因的mRNA序列。
2、Messenger RNA (mRNA）——信使核糖核酸信使核糖核酸
携带遗传信息，在蛋白质合成时充当模板的RNA。悉基信使RNA
从脱氧型陆模核糖核酸（DNA）转录合成的带有遗传信息的一类单卜缓链核糖核酸（RNA）。它在核糖体上作为蛋白质合成的模板，决定肽链的氨基酸排列顺序。mRNA存在于原核生物和真核生物的细胞质及真核细胞的某些细胞器（如线粒体和叶绿体）中。

⑶ 怎样在NCBI上查找基因的cDNA序列

以上即是基本步骤。

⑷ 怎样在NCBI中查找基因

在NCBI 上查找基因，挺多人都在问这个。当然，对于经常泡NCBI 的人来说，查找基因是
入门的、基础的，对高手来讲根本不是个问题。但新手就不同了。
当然了，直到现在，虽说已经会了一些，但在NCBI 查找基因，虽说是基础但也是挺复杂的
今天要讲的。
今天用“苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase，PAL)”来作为例子，物种是豆科的。
1，打开NCBI，选择核苷酸（Nucleotide）数据库，填上Phenylalanine ammonia-lyase，
点击GO，搜索
2，我们来看结果，总共有1022 个，结果太多了，有时候刚好你要的结果在第一页的话，
那就好办。不是的话，你慢慢的找，实在不是办法。特别是网络不好时，上NCBI 又很慢，
的确是一种折磨。
3，这个时候我们可以再想办法缩少范围，比方你要找的是豆科的，我们来大豆（soybean）
来作例子。在搜索时加上soybean，结果将会大大减少。
4，这时候结果已经一目了然此亩蚂，这里需要再介绍另外一种搜索的方法。这种方法是比较精确
的。首先在taxonomy 数据库查到soybean 的 taxonomy ID，再回到Nucleotide 数据库，
搜索” Phenylalanine ammonia-lyase txid3847 “，txid 是taxonomy ID 是缩写，3847 是大豆
soybean 的taxonomy ID。这样子，将搜索范围锁定在大豆。
5，看下图，出来的结果都是大豆的，这时基本上就耐哗大功告成了。找到了大豆苯丙氨酸解氨酶的序列
6，进入序列页面，默认是GenBank 格式，你也可以选择Fasta 格式，一般都是森埋保存为Fasta格式。

⑸ 怎样使用NCBI搜索并下载基因序列

工具/材料

NCBI官网

首先，我们打开NCBI官网页面，在页面上方搜索框中，选择要下载的基因序列类别，这里我们需要选择“Nucleotide”选项。

接下来，我们就需要输入具体的名称了，这里我输入的是Kinase，代表一种酶，然后点击“search”按钮，即可出现搜索结乎老丛岁樱果。

点击进入所需要的搜索结果，在页面中左侧，点击“FASTA”按钮。

在接下来打开的页面右侧，点击“Send to”选项，然后选择“File”，点击“Creat File”按钮。

最后，我们即可调用浏览器含梁下载该基因序列文件了，选择好文件存储位置之后，点击“下载”按钮。

⑹ 怎样从NCBI上查载体基因序列，如果NCBI上没有的话要到哪查例如：pROK II

首先打开NCBI网站首页，然后在search一栏中选择nucleotide，在框中输入你要的基因序列名称，点击search就行。然后会出来很多结果，因为很多基因是同名的，或是一个基因在不同种属中不一样，寻找你要的基因序列就行了。注意的是禅灶，要确定你的基因名称是否是统贺闭扮一的，我以前就是找一个基因费了很多事，之后发现是自己没有用通用的。找到基因序列，蛋白序列就很容易了，因为结果中会显示该基因的蛋白序列。你也可以在开始search的时候选protein，找到的就是蛋白序列了。多尝试就好了，其实很简单，英文不错的话，更简单。要有耐心。
只要已经测过序的基因上边都态镇有，而且这是最全的基因库。其他的不用考虑，找不到就只能考虑上边本人的经验。

⑺ 在NCBI中如何查询基因的功能

知道了名字，在搜索框里输入后可以看到相应的搜索结果，然后点击进去，有个“MIM”（在线孟德尔遗传）就可以看到它的功能。
ORF是开放阅读框，指的是mRNA上编码氨基酸的那段序列，从AUG开始，直到终止子，但是不包括终止子。ORF的数据在进入NCBI主页的右下侧一个叫ORFfinder的超链接里，点击进去后输入相应序列的mRNA序列，然后再点击ORF find就可以预测处它的ORF，但是往往会有很多结果，一般来说第一个结果是真实的，其余的都是假阳性的。
fasta格式指配余的就是一个大于号开头，后面跟上这段序列的描述，然后另起一行就是数列，给你个例子你就知道了，如下培纳滚，这就是茄歼人类USF1 mRNA的fasta格式
>gi|46877100|ref|NM_007122.3| Homo sapiens upstream transcription factor 1 (USF1), transcript variant 1, mRNA


























AAAAAAAAAAA
这就是fasta格式，你可以以TXT的方式保存，也可以以后缀名为.fasta的方式保存，然后以文本文件打开就行了，说白了就是个文本文件呵呵。一般情况下这样就可以了，但是如果用blast2go来做GO分类的话，就必须用.fasta来保存，否则该软件不识别。详细的在NCBI上都有的，自己可以去看。