生物信息学分析主要用什么语言

⑴ 生物信息学家为什么喜欢使用r语言ggplot2软件包主要有什么用途

语言，让无基础的人也能轻松编程。
价值和特点:
·从实际课题出发，提出解决问题的思路，结合原理或基础知识，但更偏重解决问题的框架和流程拦余，选用简单易学但功能强大的R语言，把讲解延伸到具体程序代码，让读者100%经历整个课题研究过程。
·由多名R领域专家（均为一线科研工作者）通过互联网联手写作。通过前期网上调研，了解并在书中突出大多数人普遍关心而又难寻相关资料的问题。
·所见即所得，学到的知识可以通过简单编程（仅仅代码拷贝粘贴）加以实现，印象深刻，学了不易忘。提出三板斧学习法，让余衡瞎无基础的人也能编程。
·作者通过QQ群直竖空接面向读者答

⑵ Perl，R，Python在生物信息学中是怎样的角色

应该说Python/Perl是相互替代的脚本语言，但个人推荐用Python, 虽然很多老的生物信息软件是用Perl,Python学习曲线好，功能也更强大，是发展趋势。哗汪液这两个语言主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发，系统管理和pipeline搭建等工作。R语言主要的优势是大量的统计包的支持，数据统计陵备分析中非常常用。Python和R有良好的接口。关于绘图很多人用R,其实Python的Matplotlib的绘图效果比它漂亮很多，也更强大。对pipeline的搭建shell编程更适合，是一个不可缺少的技能。与数据库相关的工作需要用到乱物SQL， Linux : 操作系统，是基础。 生物信息对Linux的要求其实并不高，并不是要做系统开发者或管理员，只需要会用就行。复制粘贴、处理数据、安装软件等。生物信息软件：标准数据分析。 生物信息学的数据格式已经基本标准化，大部分工作可以直接用软件完成。Perl和Python：处理个性化问题、软件之间的对接。 这两门语言至少应该熟练掌握一门自己写程序用，另外一门要能看得懂。 写点小脚本感觉差别不大，但是perl写大程序不合适。 很多人认为python是趋势，但至少截止目前更多生信软件是用perl写的。 所以，如果刚开始学，建议主打python, 看懂perl。R ：数据处理、统计、绘图、数据分析。 R语言的数据结构跟其他语言差异较大、而且总感觉语法比较散，不好记。但是R的软件包却异常强大。数据处理的reshape2, dplyr；绘图的ggplot2；还有Bioconctor里的几千个包。不得不会。

⑶ 搞生物信息学研究需要哪些计算机语言基础

熟练掌握一门就好了，非常推荐Python，当然生物信息学领域用的最多的还是Perl

对C,R什么的也得了解一点，能读别人的代码最好了。

⑷ 你是生物信息专业的你们学编程没都学了些什么语言

以前上课学的C/Java/C#/汇编 。居然没学过c++
自学的perl/python/matlab/R/等等

现在还在生物信息这条船上没跳走。

----------
补充下：
其实用什么语言搞科研主要看老板，
我最初老板和组里其他人都用perl.我也学perl。这样方便大家交换程序
现在的老板用python，我就开始学python了。
其实觉得bioinformatics的本科都会教c或者java.会了c/java其中任何一个，再学perl或者python或者matlab就都是非常非常容易的

现在这个领域里用的最多的我觉得是python,正在慢慢取代perl。matlab因为不免费，流行不广不如python,perl,java。但是我觉得确实最最最方便最适合搞计算方面研究的（如bioinformatics）

⑸ 生物信息学，需要掌握C++吗

首先生物信息学也是计算机相关学科。凡是和编程和算法相关的专业，我觉得C语言是基础，是必须要学一学的。C语言能教给你的最重要的事情，就是让你对“计算机计算”这件事情有一个不错的了解。对计算机能做的事情充分掌握。当然这些东西通过学习计算理论、计算机系统结构、算法导论等课程都能掌握，听起来也没有什么非学C的必要。不过使用C/C++编程的时候对这些的亲身体会更为重要一些。如果你自己觉得自己是非计算机的，比如本科是生物或者医学出身的知漏。算法和程序不需要了解太深，那么不学C也是可以的。相对的，你也只能处在底层的利用别人的工具分析的阶段，一旦这些工具中出什么问题或者想针对自己的需求修改这些工具的结果就很困难了。再加上数据挖掘、机器学习其实离生物信息学并不是那么远。而且只会搭派烂C/C++肯定是不行的，选择方便自己的工具也是很重要的。C/C++也只是工具的一种。在统计分析方面R就很方便。如果想自己做神经网络结构的话，python也羡指很好用。不过到了实用的方面，你做的东西走向产品化。C++就变得非常重要了。C++经常被使用在需要效率的地方，而生物信息学不少方面的数据处理的数据量并不小。重构过一个关于DNA数据分析的python->C++的优化，目的就是提高效率，结果是快了约1000倍。现在看到有些人为了继续提高效率都开始上FPGA了。所以做生物信息不需要关注效率可能是个伪命题。

⑹ 生物信息学什么计算机语言

编程语言按照重要程度排序：R语言、Python、Perl。
另外对Linux操作系统必须非常熟悉，因为生物信息学很多软件都在Linux系统运行

⑺ 生物信息学编程，选Python语言可行吗

python对于业余人士，特别是科研人员来说，非常好。目前看来，几乎是最好的语言。

不过，这个要看你们学校里，或者是科研单位上用什么语言。

比如你们学校里流行java或者是C语言，那么你用python编程可能就有不合群的感觉。

不过国外的大学里，大部分都将python作为一个基本工具来用的。几乎每个教授都在用它做教学科研。

⑻ 生物信息学用不用java

在2014年暑期的国家“龙星课程”上，美国癌症中心的Han Liang教授说过，做生物信息学一定要精通一门编程语言，不论哪种，一种就够。就本人学生物信息学以来的了解，就知道可以用C、C++、MATLAB、R、python、SPSS等语言作出相同的结果，不同的语言有不同的好处，只是处理的方式、快慢、方便不一样，虽然我不了解Java，但是感觉殊途同归，Java是可以进行图像处理的好软件，说明是可以进行算法编译的，如果你是做生物信息算法的，那么可以与MATLAB相同的功能，如果你做数据库统计，那么需要你自己开发了，虽然不如R语言，怎么说也是可以开发的。生物信息学中的编程语言只是工具，和英语是一样的地位，主要是你做的研究，别人只会看到你做的东西的结果和算法过程，而不会过问程序编译。希望能够帮到你。