‘壹’ 原核生物的rna聚合酶有几种
在细菌等原核生物中,相同的RNA聚合酶催化三种RNA的合成:信使RNA (mRNA)、核糖体RNA (rRNA)及转运RNA (tRNA)。
细胞RNA聚合酶是相对大的分子。 细菌RNA聚合酶是相对大的分子。核心酶有5个亚基(~400 kDa):核心酶有5个亚基(~400 kDa):
α 2 :这两个α亚基组合成酶及辨认调节因子。每个亚基有两个区,αC末端区及αN末端区,分别与启动子结合及与聚合酶的其他部份结合。每个亚基有两个区,αC末端区及αN末端区,分别与启动子结合及与聚合酶的其他部份结合。
β:有着聚合酶的活动,负责催化RNA的合成。
β':与DNA结合。
ω:还未清楚它的功能。但是它在耻垢分枝杆菌中似乎是提供保护功能予β'亚基。但是它在耻垢分枝杆菌中似乎是提供保护功能予β'亚基。
为着与启动子的特定区域结合,核心酶须有其他亚基,称为σ。为着与启动子的特定区域结合,核心酶须有其他亚基,称为σ。 σ因子大大减低RNA聚合酶与非特定的DNA的关系,视乎σ因子本身而增加对某些启动子区域的独特性。 σ因子大大减低RNA聚合酶与非特定的DNA的关系,视乎σ因子本身而增加对某些启动子区域的独特性。所以完整的全酶有着6个亚基:α 2 、β、β'、σ及ω(~480 kDa)。所以完整的全酶有着6个亚基:α 2 、β、β'、σ及ω(~480 kDa)。 RNA聚合酶的结构就有一个长约55Å(即5.5奈米)的沟道及直径为25Å(2.5奈米)。 RNA聚合酶的结构就有一个长约55Å(即5.5奈米)的沟道及直径为25Å(2.5奈米)。这个沟道正好适合20Å(2奈米)的DNA双股。这个沟道正好适合20Å(2奈米)的DNA双股。 55Å的长度可以接受16核苷酸。 55Å的长度可以接受16核苷酸。
‘贰’ 转录需要哪些酶的参与和这些酶的作用
转录需要RNA聚合酶的参与,这些酶的作用是催化RNA合成。
在原核生物转录的过程中只有一种RNA聚合酶,催化所有RNA的合成。
在真核生物中则有RNA聚合酶Ⅰ、RNA聚合酶Ⅱ和RNA聚合酶Ⅲ三种不同酶。RNA聚合酶Ⅰ存在于细胞核内,催化合成除5SrRNA以外的所有rRNA的合成;RNA聚合酶Ⅱ催化合成mRNA前体,即不均一核RNA(hnRNA)的合成;RNA聚合酶Ⅲ催化tRNA和小核RNA的合成。
RNA聚合酶通过与一系列组分构成动态复合体,完成转录起始、延伸、终止等过程。生成的mRNA携有的密码子,进入核糖体后可以实现蛋白质的合成。
转录仅以DNA的一条链作为模板,被选为模板的单链称为模板链,亦称无义链;另一条单链称为非模板链,即编码链,因编码链与转录生成的RNA序列一致,所以又称有义链。
(2)原核生物转录的聚合酶有哪些扩展阅读 :
转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。
转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA合成酶作为催化剂,合成前体mRNA。
在体内,转录是基因表达的第一阶段,并且是基因调节的主要阶段。转录可产生DNA复制的引物,在反转录病毒感染中也起到重要作用。
转录仅以DNA的一条链作为模板。被选为模板的单链叫模板链,又称信息链、无义链;另一条单链叫非模板链,又称编码链,有义链。DNA上的转录区域称为转录单位(transcription unit)。
RNA聚合酶合成RNA时不需引物,但无校正功能。
转录组测序具有以下优势:
(1)可以直接测定每个转录本片段序列、单核苷酸分辨率的准确度,同时不存在传统微阵列杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题;
(2)灵敏度高,可以检测细胞中少至几个拷贝的稀有转录本;
(3)可以对任意物种进行全基因组分析,无需预先设计特异性探针,因此无需了解物种基因信息,能够直接对任何物种进行转录组分析,同时能够检测未知基因,发现新的转录本,并准确地识别可变剪切位点及cSNP,UTR区域。
(4)检测范围广,高于6个数量级的动态检测范围,能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。
RNA的降解严重影响测序的质量,RNA降解后,加入poly-A后无法捕获纯化mRNA,因此,随机引物反转录无法得到全部的cDNA,导致测序结果出现明显的3‘-和5’-偏向。
文库中的poly-A多聚物的存在会对测序信号产生干扰,影响测序结果的准确性;同时由于转录组中转录本的丰度不一致,实验前需要对样本进行均一化处理,否则高丰度的表达基因会掩盖低丰度表达基因,导致寻找新基因失败或者是获得大量无意义的重复序列。
‘叁’ 原核生物与真核生物的DNA聚合酶各有哪些种类
原核生物DNA聚合酶分为Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ。
Ⅰ主要是起修复的作用(比如光修复),还有就是把RNA引物切除后的空隙填补起来。
Ⅱ是参与原核生物SOS修复的酶。
Ⅲ是原核生物在DNA延长中起主要作用的酶。
再来说真核生物,真核生物的DNA聚合酶分为α,β,γ,δ,ε,。
ε类似于原核生物DNA聚合酶Ⅰ,β类似于原核生物DNA聚合酶Ⅱ,δ类似于原核生物DNA聚合酶Ⅲ。α具有引物酶活性,而γ则是作为复制真核生物线粒体内的DNA所需要的酶。
(3)原核生物转录的聚合酶有哪些扩展阅读
一般来说,DNA聚合酶具有以下特点:
1.这种酶也被称为依赖DNA的DNA聚合酶,因为它需要DNA模板。
2.RNA或DNA是必需的引物,这意味着DNA聚合酶是不被初始催化的。
3.将DnTP以1000nt/min的速度催化添加到引物的3'-OH端,DNA合成方向为5'~3'。
4.这三种DNA聚合酶都是多功能酶,在DNA复制和修复过程的不同阶段起作用。
‘肆’ 原核生物的RNA聚合酶的特点
原核生物转录需要RNA聚合酶.原核生物的RNA聚合酶由多个亚基组成:α2ββ'称为核心酶,转录延长只需核心酶即可.α2ββ'σ称为全酶,转录起始前需要σ亚基辨认起始点,所以全酶是转录起始必需的.真核生物RNA聚合酶有RNA-polⅠ、Ⅱ、Ⅲ三种,分别转录45s-rRNA; mRNA(其前体是hnRNA);以及5s-rRNA、snRNA和tRNA. 亚基 功能
α 决定哪些基因被转录
β 与转录全过程有关(催化)
β' 结合DNA模板
σ 辨认起始点
ω 未知