A. 细菌的分子生物学鉴定要怎么做
是的,要做PCR。
首先你要提出细菌的DNA。
方法如下:
1、液体培养及保种:从斜面上挑取菌苔于液体培养基中放摇床上震荡(转速160r/min)培养16小时。吸取菌液于1.5ml的经过灭菌的EP管中,再加甘油(30-40%)进行保种。(-80摄氏度保藏2年)
2、提取DNA(CTAB法):
(1)取1.5ml菌液于1.
5ml离心管中,12000r/min离心2min,弃上清。
(2)向沉淀物中加入350ul双蒸水,重新悬浮沉淀。
(3)加入20ul10%SDS和3ul的蛋白酶K(20mg/ml),溶菌酶3ul,混匀,于50℃温育1h。
(4)加入50ul
5mol/L
NaCl溶液,充分混匀,再加入50ul
CTAB/NaCl溶液,混合后再65℃温育30min。
(6)冷却后加入等体积的酚(沉淀蛋白质):氯仿:异戊醇(增强酚的作用)(25:24:1),小心上下颠倒混匀,12000r/min离心5min,将上清液转移到新的EP管,重复此步骤2-3次,直至分层界面无白色沉淀。
(7)加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),小心颠倒混匀,12000r/min离心5min将上清液转移到新的EP管。(纯化作用)
(8)加入0.6倍体积的异丙醇,轻轻混合直到DNA沉淀下来,12000r/min离心15min弃上清。
(9)向离心管中加入75%乙醇,12000r/min离心5min洗涤DNA沉淀,小心弃上清,重复洗涤1次,弃上清将离心管倒置于吸水纸上,晾干。
(10)加入50ul(双蒸水)/
TE
Buffer溶解DNA于4℃保存。
(11)电泳检测
6、PCR扩增:(细菌的通用引物为27F和1492R)将提取得到的DNA进行PCR扩增,电泳检测扩增得到的16S
rDNA(如果菌类分明,条带清晰,PCR原液可直接送去测序,双向测通,得到测序序列后到NCBI的BLAST页面比对,得出鉴定结果)
7、酶切带型分型确定操作单元:将扩增产物用HhaI和HaeIII两种限制性内切酶进行酶切,电泳检测酶切产物,酶切带型相同的分为一个操作单元。
8、连接转化:从每一个操基此作单元中选取一株菌的16S
rDNA进行连接实验。将连接产物转入感受态细胞中,将感受态细胞涂布于含有Amp的平板上,倒置培养12-16h。
9、克隆子挑选及PCR鉴定:从上一步的平板上挑取单菌落于含有Amp的液体培养基中震荡培养12h,以培养液为模板直接进行PCR扩增鉴定(1000-2000bp)。将含有目的片段的克隆子菌液低温保存。
10、测序:将含有目的片段的克隆子菌液送去测序。
11、序列拼接:运用DNAMAN软件对测序得到的序列进行拼接。
12、建树:对拼接得到的序列用Blast进行比对,最后将比对得到的春冲所有扒锋歼序列运用MEGA6建立系统发育树。
B. 传统鉴定方法如何将环境中的微生物鉴定到属
简单的分为3步
1)观察菌落形态
2)菌体形态
3)生理生化反应
C. 如何鉴定DNA和RNA(生物)具体做法
高中粗鉴定:用吡罗红(DNA)和甲基绿(RNA)鉴定.
DNA的鉴定
(1)配制二苯胺试剂:取0.1 mL B液;滴入到10 mL A液中,混匀.
(2)鉴定:取4 mL DNA提取液放入试管中,加入4 mL二苯胺试剂,混匀后观察溶液颜色(不变蓝).用沸水浴(100℃)加热10 min.在加热过程中,随时注意试管中溶液颜色的变化(逐渐出现浅蓝色).
附1:研磨液的配制方法
Tris:10.1 g(相对分子质量为121.4),先加50 mL蒸馏水溶解,用物质的量浓度为2 mol/L的盐酸调至pH=8.0,再加下述药品.
NaCl:8.76 g(相对分子质量58.44)
EDTA:37.2 g(相对分子质量372.24)
SDS:20 g(相对分子质量288.3)
待上述药品全部溶解后,再用蒸馏水定溶至1000 mL.
若在室温低于20℃时配制药液,SDS呈沉淀析出,此时需要加温,才能将SDS溶解.如果提前配制的研磨液出现了沉淀,则应加温使沉淀溶解后再使用.
附2:研磨液中几种药品的作用
SDS(十二烷基磺酸钠):可使蛋白质变性,与DNA分离.
EDTA(乙二胺四乙酸二钠):为DNA酶的抑制剂,可以防止细胞破碎后DNA酶降解DNA.
物质的量浓度为0.15 mol/L的氯化钠溶液:能很好地溶解DNA.
Tris/HCl:提供缓冲体系,DNA在这个缓冲体系中呈稳定状态.(Tris为三羟甲基氨基甲烷)
RNA的鉴定
取RNA沉淀约O.2 g,加2 ml 10%H2SO4→沸水浴中加热2 min→加1.5 ml地衣酚试剂→沸水浴中加热→观察颜色变化。
D. 植物的生物鉴定技术是什么
根据病毒的生物学特性,特别是不同病毒对不同植物的侵染性及其所产生的症状进行区分,是植物病毒鉴定的传统技术,用来区分鉴定的寄主植物称为鉴别寄主(differential host)。有些果树病毒不能侵染草本植物,可将病株的接穗或芽嫁接在木本的感染性品种或植物上,观察其发病情况及症状,这类植物和品种一般称为指示植物(indicator plant)。还有些植物如苋色藜、心叶烟可受多种病毒侵染,苋色藜可感染51种病毒,心叶烟可感染78种病毒,但一般只产生局部枯斑而无系统症状,称为枯斑寄主(local lesion host),因可受多种病毒侵染,用它来区分不同病毒的作用不大,但可用来判断是否发生了病毒病,起到指示植物的作用。如果所产生的枯斑数目与病毒浓度呈正相关,还可用作病毒的定量寄主。有时还可用做单斑分离的试验植物。
一般进行生物鉴定时,要使用多种植物通过人工接种对其反应进行观察比较,因各种病毒所用的鉴别寄主各有不同,如对侵染某一植物的不同病毒的鉴别寄主全部进行接种,工作量非常繁重。但是,植物检疫的对象主要是可以人为传播的病毒,所检验的标样,大都是采自种子实生苗的病株及无性繁殖材料,因此,在检验上对那些不能种子传的病毒可不予考虑,另外,有些种传寄主虽可感染多种种传病毒,但并不都是该病毒的自然寄主,有些是只有人工接种才能侵染,对此也无需考虑。另外,在自然传播的种传病毒中,不一定都属于同一病毒组,病毒血清学反应和粒子形状可能不尽相同,在同一种传寄主上,粒子和血清学反应都相同的病毒就更少了。因此,可以先根据患病植物的种类、症状、传播方法、血清学反应等情况,结合有关资料,做一初步评估,尽量缩小范围,然后再用鉴别寄主进行鉴定,就可收到事半功倍之效。除鉴别寄主外,病毒的体外稳定性,特别是钝化温度和稀释终点,也都是常用的鉴定方法。
E. 介绍一下这几种生物学鉴定方法
DNA印迹技术由Southern于1975年创建,称为Southern印迹技术,RNA印迹技术正好与DNA相对应,故被称为Northern印迹杂交,与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为Western blot。 Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量。 Northern印迹杂交(Northern blot),是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。Northern 印迹杂交的RNA吸印与Southern印迹杂交的DNA吸印方法类似,只是在进样前用甲基氢氧化银、乙二醛或甲醛使RNA变性,而不用NaOH,因为它会水解RNA的2'-羟基基团。RNA变性后有利于在转印过程中与硝酸纤维素膜结合,它同样可在高盐中进行转印,但在烘烤前与膜结合得并不牢固,所以在转印后用低盐缓冲液洗脱,否则RNA会被洗脱。 Western Blot中文一般称为蛋白质印迹。它是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法。其基本原理是通过特异性抗体对凝胶电泳处理过的细胞或生物组织样品进行着色。通过分析着色的位置和着色深度获得特定蛋白质在所分析的细胞或组织中的表达情况的信息。 离子交换层析(Ion Exchange Chromatography简称为IEC)是以离子交换剂为固定相,依据流动相中的组分离子与交换剂上的平衡离子进行可逆交换时的结合力大小的差别而进行分离的一种层析方法。 (不知道这个是不是你所提到的亲和鉴定?)将具有特殊结构的亲和分子制成固相吸附剂放置在层析柱中,当要被分离的蛋白混合液通过层析柱时,与吸附剂具有亲和能力的蛋白质就会被吸附而滞留在层析柱中。那些没有亲和力的蛋白质由于不被吸附,直接流出,从而与被分离的蛋白质分开,然后选用适当的洗脱液, 改变结合条件将被结合的蛋白质洗脱下来,这种分离纯化蛋白质的方法称为亲和层析。 双脱氧末端终止测序法:核酸模板在核酸聚合酶、引物、四种单脱氧碱基存在条件下复制或转录时,如果在四管反应系统中分别按比例引入四种双脱氧碱基,只要双脱氧碱基掺入链端,该链就停止延长,链端掺入单脱氧碱基的片段可继续延长。如此每管反应体系中便合成以共同引物为5’端,以双脱氧碱基为3’端的一系列长度不等的核酸片段。反应终止后,分四个泳道进行电泳。以分离长短不一的核酸片段(长度相邻者仅差一个碱基),根据片段3’端的双脱氧碱基,便可依次阅读合成片段的碱基排列顺序。
记得采纳啊
F. 目前生物学上常用什么来鉴定生物的种类
生物学上常用显微镜来鉴定生物的种类,目前常用的是光学显微镜。
显微镜是用来鉴定生物种类的,先用显微镜鉴定生物是什么种类,然后再用检索表来明确这种生物的分类地位。
不同的生物具有不同的特征,一般鉴定生物种类首先看生物外貌,其次看生理生化特征,然后看生活环境,通过检索表最终确定。现在科技发达,有些种类长得十分相似,只能借助于基因来鉴定分类。
生物分类是研究生物的一种基本方法。生物分类主要是根据生物的相似程度(包括形态结构和生理功能等),把生物划分为种和属等不同的等级,并对每一类群的形态结构和生理功能等特征进行科学的描述,以弄清不同类群之间的亲缘关系和进化关系。分类的依据是生物在形态结构和生理功能等方面的特征。分类的基本单位是种。分类等级越高,所包含的生物共同点越少;分类等级越低,所包含的生物共同点越多。了解生物的多样性,保护生物的多样性,都需要对生物进行分类。
人为分类法主要是凭借对生物的某些形态结构、功能、习性、生态或经济用途的认识将生物进行分类,而不考虑生物亲缘关系的远近和演化发展的本质联系,因此所建立的分类体系大都属于人为分类体系。例如,将生物分为陆生生物、水生生物;草本植物、木本植物;粮食作物、油料作物等。另外,18世纪瑞典植物学家林奈(1707—1778)以生物能否运动为标准,将生物划分为动物界和植物界的两界系统。他还根据雄蕊的有无、数目,把植物界分为一雄蕊纲、二雄蕊纲等24个纲。16世纪我国李时珍(1518—1593)在他的《本草纲目》一书中将植物分为五部,即草部、谷部、菜部、果部和木部;将动物也分为五部,即虫部、鳞部、介部、禽部和兽部;人另属一部,即人部。又如,亚里士多德根据血液的有无,把动物区分为有血液的动物和无血液的动物两大类,等等。
G. 如何对一株微生物进行分类鉴定和命名
如何对一株微生物进行分类鉴定和命名
(1)常规鉴定
常规鉴定内容有形态特征和理化特性。形态特征包括显微形态和培养特征;理化特性包括营养类型、碳氮源利用能力、各种代谢反应、酶反应和血清学反应等。(2)BIOLOG碳源自动分析鉴定
BIOLOG鉴定系统以微生物对不同碳源的利用情况为基础,检测微生物的特征指纹图谱,建立与微生物种类相对应的数据库。通过软件将待测微生物与数据库参比,得出鉴定结果。(3)分子生物学鉴定
提取细菌基因组DNA,然后PCR扩增16srDNA片段并测序,将结果与GeneBank或者Eztaxon对比分析,一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌,该方法也是目前微生物分类学研究普遍采用的鉴定方法。——源自网络
H. 如何对一株细菌进行种属鉴定
一般来说,对一株从自然界或其他样品中分离纯化的未知菌种的鉴定要做以下几个方面工作。①个体形态观察,进行革兰氏染色,分辨是G(+)菌还是G(-)菌。并观察其形状、大小、有无芽孢及其位置等;②菌种形态观察,主要观察其形态、大小、边缘情况、隆起度、透明度、色泽、气味等特征;③做动力试验,看他能否运动及其鞭毛着生类型(端生、周生);④做生理生化反应及做血清学反应实验。最后根据以上实验项目的结果,通过查阅微生物分类检索表,给未知菌进行命名。